AmpliSeq for Illumina
製品

AmpliSeq for Illumina Custom Panels

研究目標に最適化されたカスタムターゲットリシーケンスパネルの作成

コンピューター画面を確認するサイエンティスト

NGS研究向けにカスタムコンテンツを設計・注文

既製のパネルに含まれていない特定の遺伝子やターゲットに焦点を当てたカスタムパネルを作成します。無料のウェブベースツール「DesignStudioアッセイデザインツール」を使用し、目的のターゲット領域を指定して、研究に最適なカスタムパネルコンテンツを取得します。

サムネール

AmpliSeq for Illumina Custom Panelsの主な特長

AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel

シーケンス固有のターゲットまたは興味のあるゲノムコンテンツに最適化されたターゲットカスタムリサーチパネル。 

主な特長とメリット

シンプルなカスタマイズ

DesignStudioアッセイデザインツールのシンプルなユーザーインターフェース、ロバストなアルゴリズム、動的フィードバックを活用し、迅速かつ簡単にカスタムパネルを構築できます。

柔軟なコンテンツ設計

完全なカスタムパネルの作成や、Ready-to-UseパネルまたはCommunityパネルにターゲットを追加して拡張可能。

カスタムDNAオプション

標準DNAおよびFFPE組織の解析向けに、1プールあたり最大3,072アンプリコン、1パネルあたり最大12,288アンプリコンを含むパネルを設計することができます。

カスタムRNAオプション

20,000件のRefSeq遺伝子から選択して、1回のアッセイでわずか12～12,000件のターゲットの遺伝子発現を測定できます。

少量インプットサンプルタイプ

ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織のような解析が難しいサンプルでも、最小限のインプット量で高いカバレッジ均一性を実現し、高品質なデータを取得することができます。

迅速なライブラリー調製

わずか1.5時間のハンズオンタイムと最短5時間のワークフローにより、オンターゲットかつ高い均一性を実現した増幅ライブラリーを調製できます。

  • データシート PDF < 1 MB
    2 バージョン

AmpliSeq for Illumina Custom Panelの設計プロセス

AmpliSeq for Illumina Custom Panelを作成するには、DesignStudioアッセイデザインツールを使用し、アッセイタイプ、種、サンプルタイプ、最大アンプリコン長などのパラメーターを選択します。次に、対象となる遺伝子または座標を指定してターゲットを追加します。ターゲットは、あらかじめロードされたリファレンスゲノムに基づいて選択することも、カスタムリファレンスゲノムをアップロードすることもできます。

アンプリコンの設計には、最適化されたアルゴリズムがGC含量、特異性、カバレッジなどの要素を考慮します。候補となるアンプリコンは、推定成功スコアを用いて視覚化し、評価します。設計内のパネル内でアンプリコンをフィルタリング、追加、または削除することもできます。視覚化とQCを行った後、パネルを注文できます。

DesignStudioアッセイデザインツールの詳細はこちら
サムネール

AmpliSeq for Illuminaのご紹介

さまざまなサンプルタイプから得られたAmpliSeq for Illuminaのロバストな性能についてご覧ください。

ウェビナーを視聴する

AmpliSeq for Illumina Custom Panelのワークフロー

1
コンテンツを選択

ユーザーフレンドリーなアッセイデザイン：

AmpliSeq for Illuminaカスタムパネルのオプション：

2
ライブラリー調製
3
シーケンス
4
解析

カスタムアッセイデザインサービス

イルミナのコンシェルジュによる設計サポートにより、カバレッジを向上させ、アドオンまたはヒト以外の生物種の設計を実現します。イルミナのコンシェルジュチームが、プロジェクト全体の管理、in silicoカバレッジ評価、設計支援サービスを一貫して実施します。

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Research design team in collaboration

AmpliSeq for Illuminaカスタムパネルに関するよくある質問

DesignStudioアッセイデザインツールにサインアップまたはログインして、新しい設計を開始してください。あらかじめロードされたリファレンスゲノムを選択し、目的のゲノム領域を追加します。AmpliSeq for Illumina Ready-to-UseまたはCommunity Panelsのコンテンツを活用したい場合、製品マニフェストファイルをDesignStudioツールに直接アップロードし、カスタマイズの起点として利用することができます。詳細はこちら.

統合サンプルバーコードを使用することで、1回のシーケンスランあたり最大96個のサンプルをプールできます。ただし、実際にプールできるサンプル数は、アンプリコン数とカバレッジの望ましい深度によって異なります。DesignStudioアッセイデザインツールには、これらのパラメーターを計算するオンラインツールが搭載されています。

BaseSpace Public Dataにて、AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panelおよびその他のAmpliSeq for Illumina PanelsのBaseSpace Sequence Hubデモデータセットをご覧いただけます。

いいえ。DesignStudioアッセイデザインツールは、高い信頼性のあるアンプリコン設計を行うことができ、これまでにないアンプリコンのマルチプレックス性能を実現してきましたが、設計やサンプルインプットの特性が異なるため、各設計の性能は実際に検証する必要があります。事前検査済みの > 5Kの遺伝子カタログからカスタムパネルを作成するには、AmpliSeq for Illumina On-Demand Panelsをご利用ください。

ザ・ には、DesignStudio Assay Design Toolを使用するためのステップバイステップガイドが含まれています。DesignStudioについてサポートが必要な場合は、イルミナテクニカルサポートにお問い合わせください。ご注文に関してサポートが必要な場合は、営業担当者までお問い合わせください。

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補足資料

アンプリコンシーケンス

PCRアンプリコンのウルトラディープシーケンスを行うことで、1回のアッセイで数百のターゲットゲノム領域をコスト効率よく解析します。

ターゲットリシーケンス

遺伝子プロファイリング研究用に事前に設計されたパネルまたはカスタム設計されたパネルを使用して、特定の遺伝子またはゲノムの関心領域を選択してシーケンスします。

お問い合わせ

AmpliSeq for Illumina製品の詳細については、お気軽にお問い合わせください。