AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel

シーケンス固有のターゲットまたは興味のあるゲノムコンテンツにに最適化されたターゲットカスタムリサーチパネル。

最短5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない)

アッセイ時間

1.5時間未満

ハンズオンタイム

1~100 ng、プールあたり10 ngを推奨

インプット量

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AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panelは、製造中止となったTruSeq Custom AmpliconおよびTruSeq Custom Amplicon Low-Inputキットの推奨代替品です。

概要

さまざまなサンプルタイプにわたる正確なデータ

AmpliSeqケミストリーとイルミナの次世代シーケンサー(NGS)テクノロジーにより、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織など低品質の出発物質からでも抜群のデータ品質を実現します。

関心遺伝子と関心ターゲットのみを含めます

カスタムコンテンツを簡単に設計できるDesignStudioは、無料の使いやすいオンラインツールで、ターゲットや特定の関心ゲノムコンテンツに合わせて最適化されたパネルを作成します。

12から12,000を超えるアンプリコンおよび複数のアンプリコンサイズオプションまで柔軟で調整可能な設計です。

迅速でシンプルなワークフロー

わずか1.5時間のハンズオンタイムで5.5時間のライブラリー調製ワークフローにより効率が向上します。

スケーラブルなソリューション

シーケンスプラットフォーム、データ解析、およびサポートの複数のオプションで、ほぼすべてのスループット要件を満たします。


仕様


必要な製品

AmpliSeq for Illuminaのカスタムワークフローには、カスタムパネル、Library PLUSキット、インデックスアダプターが必要です。

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アプリケーション

ワークフローの例


関連するアプリケーションとメソッド

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AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel AmpliSeq for Illuminaオンデマンド Illumina DNA Prep with Enrichment
アッセイ時間 最短5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) 最短5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) 約6.5時間
コンテンツ仕様 対象カスタムコンテンツ - 最大5 MB 1(24アンプリコン)~500(15,000アンプリコン)遺伝子のカスタムコンテンツ Custom: 0.5 - 15 Mb genomic content of interest, with Illumina Custom Enrichment Panels and Illumina Custom Enrichment Panel v2
Fixed panels: Content varies by panel.
説明 カスタム研究アッセイを使用すれば、特定の遺伝子、領域、または対象バリアントに関する研究に高精度で集中できます。 5,000を超える事前検査済み遺伝子のカスタム研究アッセイを使用すれば、特定の遺伝子、領域、または対象バリアントに関する研究に高精度で集中できます。 低いDNAインプットやさまざまなサンプルタイプから、全エクソーム、カスタム、固定パネルターゲットシーケンスなど、さまざまな実験用のシーケンスライブラリーを約6.5時間で調製します。 
ハンズオンタイム 1.5時間未満 1.5時間 約2時間, 約2時間
インプット量 1~100 ng、プールあたり10 ngを推奨 DNA 1~100 ng 高品質ゲノムDNA 10~1,000 ng、FFPE DNA 50~1,000 ng (血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください)。
システム MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx in Research Mode MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 500 Desktop Sequencer MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
作用機序 マルチプレックスPCR法 マルチプレックスPCR法 ビーズ結合トランスポソームおよびハイブリッドキャプチャー化学
手法 Custom sequencing, Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing, Genotyping by sequencing Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing Custom sequencing, Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment
マルチプレックス 最大96プレックス 最大96プレックス 最大384のユニークデュアルインデックスを使用可能。最大12プレックスの濃縮前プーリングをテスト。
Nucleic acid type DNA DNA DNA
アンプリコン数 12~12,288アンプリコン
反応数 750または3,000回 24または96回 カスタムワークフロー:16または96サンプル
Specialized sample types Blood, FFPE tissue Blood, FFPE tissue Blood, Low-input samples, FFPE tissue, Saliva
Species category すべて, Tomato, ウシ, マウス, イヌ, Rice, ヒツジ, Hamster, Chicken, ブタ, ヒト, トウモロコシ, Soybean ヒト Other, ヒト
生物種詳細 あらゆる種に対応、規定のゲノムが利用可能
テクノロジー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー

DNA Amplicon LRMモジュール

パネル (2)

AmpliSeq™ Custom DNA Panel for Illumina® 

20020495

< 4999アンプリコンで750または3000のサンプルをサポートするカスタムアッセイ。Library PLUSとインデックスアダプターは別売りです。

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カスタマイズ

List Price:

Discounts:

AmpliSeq™ Custom DNA Large Panel for Illumina®

20020497

> 4999アンプリコンで3000サンプルに十分です。Library PLUSとインデックスアダプターは別売りです。

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カスタマイズ

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ライブラリー調製 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

384ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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インデックスアダプター (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

24サンプルのラベル付けに十分な24インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

96サンプルにラベル表示できる96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Discounts:

AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Discounts:

AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬とプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

イルミナ、セットA、セットB、セットCおよびセットDの4セットのAmpliSeq CDインデックスが含まれます。各セットには96サンプルにラベルを付けるのに十分な96、8 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。

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アクセサリー製品 (3)

AmpliSeq™ for Illumina® Sample ID Panel

20019162

AmpliSeq Library PLUS for Illuminaとペアにすると、96反応に十分な8つの一塩基多型(SNP)ターゲットプライマーペアと1つの性差別プライマーペアが含まれます。迅速かつ正確なサンプル同定を可能にします。ライブラリー調製、プローブパネル、インデックスアダプターは別途ご購入ください。

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AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

AmpliSeq for Illuminaプロトコールを使用したライブラリー構築のために、非染色スライドマウントFFPE組織からDNAを調製するための24の反応を含み、脱パラフィンやDNA精製は必要ありません。

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

AmpliSeq for Illuminaライブラリーをシーケンス用に調製する場合のライブラリーノーマライゼーション用のビーズと試薬が含まれます。

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サービス (2)

AmpliSeq for Illumina DNA Library Prep Training

20023392

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お問い合わせ

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AmpliSeq™ for Illumina®, Sequencing Service

20025874

イルミナラボのAmpliSeq for Illuminaカスタムシーケンスプロジェクトで、研究プロジェクトをサポートする96~384のサンプル(サンプルあたりの価格)。プロジェクト前のコンサルティング、イルミナの科学者サポート、実験計画、サンプル出荷の調整、ライブラリー調製とサンプルのQC、シーケンス、BSSHおよび/またはシーケンスランファイルのデータ解析、技術移転、固定パネルまたはカスタムパネル、および消耗品が含まれます。所要時間は6~8週間です。

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NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリを準備するための、高速で統合されたワークフロー。

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