AmpliSeq for Illumina Focus Panel

固形腫瘍との関連が判明している52種の遺伝子を調べるターゲットDNA/RNA研究パネル。 続きを読む...
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パネル

AmpliSeq℠ Focus Panel for Illumina®

20019164

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Ampliseq℠ for Illumina® Focus Panel MiSeq Kit

20024183

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ライブラリー調製

AmpliSeq™ Library PLUS for Illumina®(反応回数24回)

20019101

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AmpliSeq™ Library PLUS for Illumina®(反応回数96回)

20019102

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AmpliSeq™ Library PLUS for Illumina®(反応回数384回)

20019103

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インデックスアダプター

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina®(24インデックス、24サンプル)

20019104

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina®(384インデックス、384サンプル)

20031676

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アクセサリー製品

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

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AmpliSeq™ for Illumina® Sample ID Panel

20019162

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AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

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製品のハイライト

AmpliSeq for Illumina Focus Panelは、固形腫瘍との関連性が知られている52の遺伝子のバイオマーカー解析のためのターゲットリシーケンスアッセイです。Focus Panelを使用すると、研究者はDNAとRNAの両方を同時に解析できます。主な特徴には以下があります:

関連する遺伝子コンテンツ
  • 固形腫瘍に関連する52の遺伝子にわたるバイオマーカーをターゲットにする
高速かつ合理的なワークフロー
  • わずか1 ngの高品質サンプルまたは10 ngのホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)インプットサンプルから、1日でシーケンス可能なライブラリーを調製
正確なデータ
  • ローカルまたはクラウドベースの解析を使用して、5%までの頻度で体細胞変異を検出

Focus Panelは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応(PCR)ベースのライブラリー調製、イルミナの合成によるシーケンス(SBS)次世代シーケンス(NGS)テクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。

このすぐに使えるパネルは、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化の時間と労力を節約します。

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仕様

推奨プロジェクト

装置 推奨サンプル数 リード長
iSeq 100 System 1ランあたり8サンプル(最低カバレッジ500×を想定) 2 × 150 bp
MiniSeq System ランあたりのサンプル数:中出力:16、高出力:48(最低カバレッジ500×を想定) 2 × 150 bp
MiSeq System ランごとのサンプル(試薬キットバージョン別):v2 micro:8、v2:30、v3:48(最低カバレッジ500×を想定) 2 × 150 bp

製品比較

AmpliSeq for Illumina Focus Panel AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 TruSight Tumor 15
がんの種類 固形腫瘍 固形腫瘍 固形腫瘍 固形腫瘍
アッセイ時間 5~6時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) 5~6時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) 5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない)
コンテンツ仕様 52のがん遺伝子のDNAおよびRNAターゲット 161のがん遺伝子のDNAおよびRNAターゲット
ハンズオンタイム 1.5時間未満 1.5時間未満 1.5時間未満
マルチプレックス 96のデュアルインデックスの組み合わせ 96のデュアルインデックスの組み合わせ 96のデュアルインデックスの組み合わせ
方法 アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲットDNAシーケンス アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲットDNAシーケンス アンプリコンシーケンス, ターゲットDNAシーケンス アンプリコンシーケンス, ターゲットDNAシーケンス
核酸タイプ DNA, RNA DNA, RNA DNA DNA
生物種カテゴリー ヒト ヒト ヒト ヒト
説明 固形腫瘍がんに関連する52の遺伝子の体細胞解析研究。 50のがん関連遺伝子のホットスポット領域に関する身体解析研究。

サポートデータと図

 

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