AmpliSeq for Illumina Focus Panelは、固形腫瘍との関連性が知られている52の遺伝子のバイオマーカー解析のためのターゲットリシーケンスアッセイです。Focus Panelを使用すると、研究者はDNAとRNAの両方を同時に解析できます。主な特徴には以下があります:
Focus Panelは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応(PCR)ベースのライブラリー調製、イルミナの合成によるシーケンス(SBS)次世代シーケンス(NGS)テクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。
このすぐに使えるパネルは、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化の時間と労力を節約します。
装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
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iSeq 100 System | 1ランあたり8サンプル(最低カバレッジ500×を想定) | 2 × 150 bp |
MiniSeq System | ランあたりのサンプル数:中出力:16、高出力:48(最低カバレッジ500×を想定) | 2 × 150 bp |
MiSeq System | ランごとのサンプル(試薬キットバージョン別):v2 micro:8、v2:30、v3:48(最低カバレッジ500×を想定) | 2 × 150 bp |
AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | TruSight Tumor 15 | |
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がんの種類 | 固形腫瘍 | 固形腫瘍 | 固形腫瘍 | 固形腫瘍 |
アッセイ時間 | 5~6時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) | 5~6時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) | 5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) | |
コンテンツ仕様 | 52のがん遺伝子のDNAおよびRNAターゲット | 161のがん遺伝子のDNAおよびRNAターゲット | ||
ハンズオンタイム | 1.5時間未満 | 1.5時間未満 | 1.5時間未満 | |
マルチプレックス | 96のデュアルインデックスの組み合わせ | 96のデュアルインデックスの組み合わせ | 96のデュアルインデックスの組み合わせ | |
方法 | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲットDNAシーケンス | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲットDNAシーケンス | アンプリコンシーケンス, ターゲットDNAシーケンス | アンプリコンシーケンス, ターゲットDNAシーケンス |
核酸タイプ | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA | DNA |
生物種カテゴリー | ヒト | ヒト | ヒト | ヒト |
説明 | 固形腫瘍がんに関連する52の遺伝子の体細胞解析研究。 | 50のがん関連遺伝子のホットスポット領域に関する身体解析研究。 |
AmpliSeq for Illumina Oncology Panels on the iSeq 100 System
Application Note | PDF < 1 MB
Analytical performance of the AmpliSeq for Illumina Focus Panel with FFPE samples
Application Note | PDF < 1 MB
Automated Solutions for AmpliSeq for Illumina Sequencing Panels
Application Note | HTML
Ampliseq for Illumina Focus Panel Data Sheet
Data Sheet | HTML
AmpliSeq for Illumina Focus Panel Gene List
product_file | EXCEL < 1 MB
Application Note | PDF | 5 versions
AmpliSeq for Illumina Focus Panelリファレンスガイド Documentation
Index Adapters Pooling Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Direct FFPE DNA Kitリファレンスガイド Documentation
Illumina Adapter Sequences Documentation
AmpliSeq for Illumina Focus Panelチェックリスト Documentation
AmpliSeq for Illumina Focus Panel消耗品および機器 Documentation