AmpliSeq for Illumina Focus Panelは、固形腫瘍との関連性が知られている52の遺伝子のバイオマーカー解析のためのターゲットリシーケンスアッセイです。Focus Panelを使用すると、研究者はDNAとRNAの両方を同時に解析できます。主な特徴には以下があります：
Focus Panelは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応（PCR）ベースのライブラリー調製、イルミナの合成によるシーケンス（SBS）次世代シーケンス（NGS）テクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。
このすぐに使えるパネルは、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化の時間と労力を節約します。
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| iSeq 100 System | 1ランあたり8サンプル（最低カバレッジ500×を想定） | 2 × 150 bp |
| MiniSeq System | ランあたりのサンプル数：中出力：16、高出力：48（最低カバレッジ500×を想定） | 2 × 150 bp |
| MiSeq System | ランごとのサンプル（試薬キットバージョン別）：v2 micro：8、v2：30、v3：48（最低カバレッジ500×を想定） | 2 × 150 bp |
| AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | TruSight Tumor 15 | |
|---|---|---|---|---|
| サンプルタイプ | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織 |
さまざまな品質およびHDサンプルのFFPE組織から抽出されたDNAをAmpliSeq for Illumina Focus Panelを用いて評価し、MiniSeqおよびMiSeqシステムでシーケンスしました。Cqは、FFPE組織からDNAが分離される品質の指標です。
ホルマリン固定HDサンプルからのDNAをAmpliSeq for Illumina Focus Panelを用いて評価し、MiniSeqおよびMiSeqシステムでシーケンスしました。結果は、予想される検出バリアント頻度間の100%の一致を示しました。
AmpliSeq for Illumina Oncology Panels on the iSeq 100 System
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Analytical performance of the AmpliSeq for Illumina Focus Panel with FFPE samples
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Automated Solutions for AmpliSeq for Illumina Sequencing Panels
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AmpliSeq for Illumina Focus Panel Gene List
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Ampliseq for Illumina Focus Panel Data Sheet
Data Sheet | HTML
Sample identification with the AmpliSeq for Illumina Sample ID Panel
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AmpliSeq for Illumina Focus Panel Reference Guide Documentation
Index Adapters Pooling Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Focus Panel Checklist Documentation
AmpliSeq for Illumina Direct FFPE DNA Kit Reference Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Focus Panel Consumables & Equipment Documentation
Illumina Adapter Sequences Documentation
AmpliSeq for Illumina Focus Panel Support - Documentation & Literature
>20,000ヒトRefSeq遺伝子の発現レベルを測定するターゲットパネル。
