TruSight Tumor 15

固形腫瘍において、15個の通常変異遺伝子を1つのシンプルで、迅速なワークフローで評価するためのフォーカスされた次世代シーケンサー(NGS)パネル。

7時間

アッセイ時間

3.5時間

ハンズオンタイム

FFPE DNA 20 ng 

インプット量

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概要

TruSight Tumor 15は、固形腫瘍において、15個の通常変異遺伝子を評価するNGSアッセイです。 

  • 1回のアッセイで、15の遺伝子を正確で経済的で迅速に評価1 

  • FFPE組織1からの20 ng DNAを使用した、5%の対立遺伝子頻度での体細胞バリアントの検出

  • バイオインフォマティクスのリソースを最小限に抑えた解釈しやすいレポート 

  • 既存のラボ業務へのシームレスな統合 

関連遺伝子コンテンツ

コンテンツは、業界団体によって引用された遺伝子や遺伝子領域、独立したコンソーシアムの出版物や後期薬剤臨床試験による情報に基づいて厳選されています。コンテンツには、固形腫瘍への関与が実証されている1塩基変異(SNV)およびIndelが含まれます。

包括的なワークフロー

TruSight Tumor 15は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)による単一の反復遺伝子検査に代わる、シンプルで迅速なワークフローで15個の遺伝子を評価します。装置上のレポート作成ソフトウェアまたはTruSight Tumor 15 BaseSpace Sequence Hubアプリでデータを解析します。  

加速する腫瘍プロファイリング

わずか3.5時間のハンズオンタイムで、DNAからデータに約36時間で移行します。複数の腫瘍タイプにわたるサンプル成功率を最大化し、限られたサンプルとリソースを節約します。 


仕様


必要な製品

TruSight Tumor 15 MiSeqまたはMiniSeq Kitの購入、あるいはTruSight Tumor 15 (Library Prep Only)の購入が必要です。すべての製品は24サンプル分です。TruSight Tumor 15 (Library Prep Only)を購入する場合は、システム用のシーケンス試薬も別途購入する必要があります。

TruSight Tumor 15 MiSeq Kitには、MiSeq Software v2.6以降またはIllumina Annotation Engineが必要です。ファイルのダウンロード

/ 結果

アプリケーション

TruSight Tumor 15は、単一のアッセイで固形腫瘍に通常関連する15の遺伝子の体細胞バリアントを評価する包括的なワークフローソリューションであり、ラボはNGSの力を利用して腫瘍形成に関与する可能性が最も高い遺伝子に焦点を当て、FFPE DNAから低頻度バリアントを自信を持って解析することができます。 

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

TruSight Tumor 15


プロジェクトの推奨事項

装置 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System

Samples per run: mid output: 2-3, high output: 8 (based on 93.5% of the bases covered at 500x minimum)

2 × 150 bp(推奨最大値)

MiSeq System

8 samples per run with v3 reagents (based on 93.5% of the bases covered at 500x minimum)

2 × 151 bp(推奨最大値)


関連するアプリケーションとメソッド

比較する

TruSight Tumor 15 TruSight Tumor 170
アッセイ時間 7時間 約2日
自動化の詳細 利用可能な自動化方法を見る 利用可能な自動化方法を見る
Cancer type Pan-cancer, Solid tumor Solid tumor
コンテンツ仕様 固形腫瘍に関連する15の遺伝子から250アンプリコンを増幅 170の遺伝子の完全なコード配列を濃縮するプローブ。151の遺伝子における1塩基変異(SNV)、小さな挿入、および欠失、59の遺伝子における増幅、および55の遺伝子における融合+スプライスバリアントの呼び出し。
説明

20 ng DNAを用いた固形腫瘍の15の一般的な変異遺伝子に対するNGSアッセイ。 

DNAとRNAの両方からのバリアントコーリング情報を使用して、固形腫瘍の包括的な体細胞バリアント検出研究を実施します。
ハンズオンタイム 3.5時間 約10.5時間
インプット量

FFPE DNA 20 ng 

40 ngのDNAおよび/またはRNA
システム MiSeq Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 500 Desktop Sequencer, HiSeq 2500
手法 Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing Targeted DNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment
マルチプレックス 1~24プレックス 両方のインデックスセットを使用したDNAに最大32プレックス、RNAに最大16プレックス
Nucleic acid type DNA DNA, RNA
サンプルタイプ FFPE tissue Low-input samples, FFPE tissue
Species category ヒト ヒト
テクノロジー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー
バリアントクラス Somatic variants, Insertions-deletions (indels) Gene fusions, Somatic variants, Structural variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)

選択ツール:

TruSight Tumor 15ケミストリー

TruSight Tumor 15アッセイは、マルチプレックスPCR法を採用しており、高い精度と感度が得られます。

TruSight Tumor 15 遺伝子リスト
AKT1 GNA11 NRAS
BRAF GNAQ PDGFRA
EGFR KIT PIK3CA
ERBB2 KRAS RET
FOXL2 MET TP53

TruSight Tumor 15 MiSeq Kit

OP-101-1001

ライブラリー調製キット1個と、24サンプルに十分なMiSeq試薬3個が含まれます。

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Discounts:

TruSight Tumor 15 (Library Prep Only)

OP-101-1002

24サンプルに十分なライブラリー調製キットが1つ含まれています。

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Discounts:

TruSight Tumor 15 MiniSeq Kit

20005610

ライブラリー調製キット1個と24サンプルに十分なMiniSeq試薬3個が含まれます。

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製品名

数量

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よくある質問(FAQ)

TruSight Tumor 15は、MiniSeqシステムおよびMiSeqシステム(v3ケミストリー)、MiSeqDx装置(研究(RUO)モード、v3ケミストリー)でサポートされています。他のイルミナシステムでのシーケンスは可能ですが、テストは行っていません。

TruSight Tumor 15キットには、以下のサーマルサイクラーの使用を推奨します。TruSight Tumor 15リファレンスガイドに記載されている推奨ランプレート設定に従ってください。

  • Bio-Rad C1000

  • Bio-Rad S1000 

  • Applied Biosystems GeneAmp PCR System 9700

  • Applied Biosystems Veritiサーマルサイクラー 

  • Eppendorf Mastercycler ep Gradient

  • Eppendorf Mastercycler ep Gradient-S 

  • Bio-Rad C1000、Applied Biosystems GeneAmp PCR System 9700、Eppendorf MasterCycler ep Gradientは、社内で検証済みです

TruSight Tumor 15は、MiniSeq、MiSeq、MiSeq Dx(v3ケミストリー)システムでアンプリコンシーケンスとターゲットDNAシーケンスを使用して、固形腫瘍で15個の通常変異遺伝子をターゲットとしています。TruSight Tumor 170は、NextSeq 500、NextSeq 550システム上で、ターゲットエンリッチメントおよびターゲットDNAやRNAシーケンスを用いて170の遺伝子をターゲットにします。 

はい、サンプルランサンプルプロジェクトを表示できます。 データにアクセスするには、BaseSpace Sequence Hubへのログインが必要です。

/ 結果

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

参考文献

1. 社内計算データ Illumina, Inc. 2016.

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