TruSight Tumor 170

同一FFPEサンプル中のDNAおよびRNAの変異をターゲットとする包括的な次世代シーケンスアッセイ。 Read More...
製品の選択

TruSight Tumor 170キット、NextSeq対応(24サンプル)

OP-101-1003

TruSight Tumor 170キット(24サンプル)

OP-101-1004

Product Highlights

一般的な固形がんと関連する170遺伝子をカバーするようにデザインされた次世代シーケンサーアッセイであるTruSight Tumor 170は、DNAとRNAを同時に解析できる濃縮ベースのターゲットパネルであり、幅広い範囲の遺伝子や変異型をカバーしています。この包括的なパネルにより、がんの遺伝学的洞察を深めることができます。

  • がん関連変異の包括的なカバレッジ
    DNAとRNAを用いて、融合、スプライスバリアント、挿入や欠失、一塩基変異(SNV)、および増幅を1回のアッセイで評価できるため、サンプル使用量、時間、およびコストにおける効率性が向上します。
  • 低品質サンプルから精確な結果1
    わずか40 ngのDNAおよびRNAから5%の変異アリル頻度の変異を検出でき、貴重なホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルから最大限の結果が得られます。
  • 効率的な統合ワークフロー
    DNAおよびRNAは、DNA断片化やcDNA合成後、統合されたワークフローで同時に調製されます。

仕様

手法特異的なワークフロー例

 
TruSight Tumor 170 Fusion and Splice Variants Calling Performance with FFPE Samples and Cell Lines1,2
Sample DV200 Reported Variant Detected Variant
FFPE_Brain N/A EGFR VIII Splice Variant EGFR VIII Splice Variant
Cell Line_Prostate 95.5 ARv7 Splice Variant ARv7 Splice Variant
Cell Line_Gastric 93 MET Exon 14 Skipping Splice Variant MET Exon 14 Skipping Splice Variant
FFPE_Prostate 28.7 TMPRSS2-ERG, TMPRSS2-GNPT fusions TMPRSS2-ERG, TMPRSS2-GNPT fusions
FFPE_Ewing's 48.9 EWSR1-FLI1 fusion EWSR1-FLI1 fusion
FFPE_Lung 73.3 EML4-ALK fusion EML4-ALK fusion
CellLine_Lung 93 CCDC6-RET fusion CCDC6-RET fusion
FFPE_Breast 81 RPS6KB1-VMP1, RPS6KB1-DIAPH3, CCDC170-ESR1 fusions RPS6KB1-VMP1, RPS6KB1-DIAPH3, CCDC170-ESR1 fusions
FFPE_Lung4 95 FGFR3-TACC3 fusions FGFR3-TACC3 fusions
TruSight Tumor 170 Amplification Calling Performance with FFPE Samples1,3
Sample Reported Amplification Reported Amplification Level Detected Amplification Detected Amplification Level
FFPE_Lung1 PIK3CA 2.4 PIK3CA 2.7
FFPE_Lung2 FGFR1 2.4 FGFR1 2.9
FFPE_Stomach1 CDK6 2.3 CDK6 1.7
FFPE_Colon BRCA2 2.2 BRCA2 2.0
FFPE_Bone FGF19 1.4 FGF19 2.9
FFPE_Stomach2 MET 1.5 MET 1.4
FFPE_Breast RPS6KB1 2.4 RPS6KB1 2.4
FFPE_Lung3 MYC 2.2 MYC 2.8
FFPE_Lung4 CCNE1 2.1 CCNE1 2.2
FFPE_Lung5 EGFR 2.2 EGFR 4.5
FFPE_Lung6 CCND1 2.3 CCND1 2.9
FFPE_Brain2 PDGFRA 2.3 PDGFRA 2.9

関連製品

TruSight Tumor 15

シンプルで迅速なワークフローにより、1回のアッセイで、一般に固形がんでよくみられる15の変異遺伝子に焦点を絞ったシーケンスパネルです。


TruSight RNA Pan-Cancer

FFPEを含むあらゆる種類のRNAサンプルにおける遺伝子発現、変異および融合について1,385に及ぶがん遺伝子をターゲットとします。


TruSight RNA Fusion Panel

TruSight RNA Fusion Panelでは、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルやその他のがんサンプルにおいて融合遺伝子を包括的に検出できます。


参考文献
  1. 社内開発結果より。社内資料2016年9月
  2. DV 200は性能測定基準です。
  3. 増幅の一致は性能測定基準です。