NextSeq 500/550 v2シーケンス試薬（カタログ No. OP-101-1003 and 20018621）、TruSight Tumor 170 plus Pierian Interpretation report（カタログ No. 20032628）、TruSight Tumor 170 with NextSeq v2.5 Reagents plus Pierian interpretation reports（カタログ 番号：20032629）。TruSight Tumor 170 plus Watson for Genomics（カタログ No. 20018622）も廃止されました。解析が必要な場合は、引き続きIBMと直接連携することができます。 推奨代替製品：NextSeq v2.5試薬（カタログ No. 20028821）およびTruSight Tumor 170 Kit（24サンプル）（カタログ No. OP-101-1004）。
TruSight Tumor 170
同じホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプルのDNAおよびRNAバリアントをターゲットにした包括的な次世代シーケンサー（NGS）アッセイ。
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製品のハイライト
TruSight Tumor 170は、一般的な固形腫瘍に関連する170の遺伝子をカバーするように設計された次世代シーケンサーアッセイで、DNAとRNAを同時に解析するエンリッチメントベースのターゲットパネルで、幅広い遺伝子とバリアントタイプをカバーします。包括的な性質により、ラボはがんの遺伝学を深く理解することができます。
- がん関連バリアントの包括的なカバレッジ
DNAとRNAを使用した1つのアッセイで、融合、スプライスバリアント、挿入/欠失、および一塩基バリアント（SNV）、増幅を評価することで、サンプルの使用、時間、およびコストの効率が向上します。
- 低品質サンプルからの正確な結果 1
DNAおよびRNAインプットがわずか40 ng、変異アリル頻度がわずか5%のバリアント検出により、貴重なホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプルから最大限の結果が得られます。 - 統合された合理化されたワークフロー
DNAとRNAは、DNAせん断/cDNA合成後の統合ワークフローと並行して調製されます。
高速で自動化に適したワークフロー
イルミナシーケンス用のライブラリーを1日で調製します。Illumina Qualified Methodは、当社のパートナーを通じてさまざまな自動化プラットフォームで利用できます。
よく一緒に購入される製品
仕様
推奨プロジェクト
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | ランあたりのサンプル数（高出力）：16（8 DNA + 8 RNA）、DNAのみの場合は10、RNAのみの場合は16 | 2 × 101 bp（最大推奨） |
Case Studies
Accurate Identification of Cancer Biomarkers Paves the Way for Personalized Medicine
TruSight Tumor 170 Panel enables translational researchers to seek answers to multiple questions in one assay.
Read InterviewAlmac Leverages TruSight Tumor 170
Learn how Almac uses TruSight Tumor 170 in clinical cancer research for pharmaceutical and biotech clients.
Read Article科学ポスター
AACR 2017：FFPEサンプルを用いたTruSight Tumor 170と固形腫瘍プロファイリング解析性能
FFPE包埋サンプルからの標準抽出は、イルミナが抽出したサンプルの>95%に十分な材料（40 ng）を提供します。このデータから、TruSight Tumor 170パネルは、さまざまな品質のサンプルの>85%、およびキットの推奨値に含まれる品質メトリクスを持つサンプルの>95%で、合格サンプルQCデータを生成する堅牢なアッセイであることがわかります。
AACR 2017：FFPE DNAサンプル中の小さなヌクレオチド変異と遺伝子増幅のためのTruSight Tumor 170
TruSight Tumor 170は、FFPE組織から抽出されたDNAから体細胞バリアント（小さなバリアントおよびCNV）を検出するための高い感度と特異性を達成できます。
AACR 2017：FFPE RNA腫瘍サンプル中の融合およびスプライスバリアント用TruSight Tumor 170
この研究では、RNA発現との関連で検出限界を調べることで、TruSight Tumor 170がRNAバリアントで高感度と特異性を提供し、インプット1 ngあたり5コピーの転写産物を呼び出すことが示されています。
製品資料
Assessing DNA and RNA Quality from FFPE Samples for TruSight Tumor 170
White Paper | PDF < 1 MB
Detection of low-frequency variants in cfDNA using TruSight Tumor 170 with the TruSight UMI Toolkit
Application Note | PDF 2 MB
Application Note | PDF 2 MB
Data Sheet | PDF | 6 versions
product_file | EXCEL < 1 MB
TruSight RNA Pan-Cancer
血液、骨髄、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織など多種多様なRNAサンプルを用いる遺伝子発現、バリアント検出、および融合検出の研究のために1,385のがん遺伝子をターゲットとします。
参考文献
- ベータ研究。社内資料。2017年3月。