このターゲットRNAシーケンスパネルは、がん発生部位に関係なく、複数のがんの種類での融合遺伝子を検出する費用対効果の高いソリューションです。507の融合遺伝子に関連する遺伝子を網羅する単一アッセイにより、研究者は、新しい融合遺伝子パートナーを同定する機能により、血液、骨髄、およびホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルにおいて既知のがん関連融合遺伝子の大半を評価できます。
装置上の融合遺伝子コールは、NGSベースの融合検出をラボに提供し、追加のバイオインフォマティクスのサポートはありません。この解析では、検出された融合遺伝子、関連する疾患関連(Mitelmanデータベースで同定)、融合遺伝子をサポートするリードのエビデンスに関するリストを提供します。
このアッセイは、わずか20 ngのホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)RNAまたは10 ngの胎児DNA断片量トータルRNAのインプットに対応します。TruSight RNA Fusion Panelは、がん研究における融合遺伝子の研究のための高感度で再現性のある経済的なソリューションを提供します。
装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
---|---|---|
MiniSeq System | 1ランあたりのサンプル数:中出力:2~3、高出力:8(1サンプルあたり300万リードに基づく) | 2 × 76 bp(推奨最大値) |
MiSeq System | v3試薬で1ランあたり8サンプル(1サンプルあたり300万リードに基づく) | 2 × 76 bp(推奨最大値) |
NextSeq 550 System | 1ランあたり24サンプル(中出力、1サンプルあたり300万リードに基づく) | 2 × 76 bp(推奨最大値) |
TruSight RNA Fusion Panel | TruSight Tumor 170 | AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | |
---|---|---|---|---|
がんの種類 | 固形腫瘍 | 固形腫瘍 | 固形腫瘍 | 固形腫瘍 |
アッセイ時間 | 2.5日 | 約2日(ライブラリー調製) | 5~6時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) | 5~6時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) |
インプット量 | 10 ngトータルRNA、20~100 ng FFPE RNA | 40 ngのDNAおよび/またはRNA | ||
ハンズオンタイム | 11時間 | 約10.5時間 | 1.5時間未満 | 1.5時間未満 |
核酸タイプ | RNA | RNA, DNA | DNA, RNA | DNA, RNA |
生物種カテゴリー | ヒト | ヒト | ヒト | ヒト |
TruSight RNA Fusion Panel Gene List
product_file | EXCEL < 1 MB
Brochure | PDF 6 MB
Data Sheet | PDF 1 MB