RNA-Seqは、がんの遺伝子発現と腫瘍の進行をドライブする融合遺伝子に関する実用的な情報を提供します。
がんRNAシーケンス（RNA-Seq）で遺伝子発現とトランスクリプトームの変化をモニタリングすることは、腫瘍の分類と進行を理解するうえで有用です。がんは多くの遺伝的変化を積み重ねますが、通常、腫瘍の進行に寄与するものはごくわずかです。がんRNA-Seqは以下についてサイエンティストを支援することができます。
非常に明確に定義されたワークフローで、何千もの査読済み科学論文に裏付けられたバルクRNA-Seqをご活用ください。RNA-Seqは、使いやすさと導入コストの低さにより、RNA-SeqはNGSを初めて使用する人々のために高品質のトランスクリプトームデータを得るための理想的な方法です。
がん細胞には多くの変異が認められますが、がんの発症と進行に寄与するのはごくわずかです。研究者は、バルクRNA-Seqを使用して、ゲノムによって生成されるRNA転写産物一式を完全に調べることができます。RNA-Seq実験のデータは、変異がトランスクリプトームの変化をもたらし、それががんを促進するかどうか、またはパッセンジャー変異として機能するかどうかを明らかにすることができます。
RNA-Seqは、がんにおいてアップレギュレーションまたはダウンレギュレーションされているパスウェイを明らかにすることができます。この機能的情報は、精密治療のための分子ターゲットの同定に不可欠です。例えば、アップレギュレートされたパスウェイをターゲットにすることは、腫瘍増殖を抑制する一般的な方法です。
がんサンプルと非がん組織間のトランスクリプトームの違いに関する研究は、がんサブタイプの区別、変異の影響の評価、バイオマーカーの同定、およびその他の変数に有用であることなどが明らかになっています。
Bulk バルクRNA-Seqでは、モデルシステムにおける免疫療法または過去の組織検体を用いたレトロスペクティブ研究など、新規がん治療に対する生物学的反応に関連する遺伝子やパスウェイを同定することができます。
バルクRNA-Seqでは、1回のアッセイで既知と新規の特性を検出できるほか、予備知識の有無に関わらず、転写産物アイソフォーム、融合遺伝子、一塩基変異およびその他の特性を検出できます。
シングルセルRNAシーケンスの詳細をご覧になり、個々の細胞のトランスクリプトームを調べて、細胞間バリエーションを高解像度で見てみましょう。
mRNA-Seqが、既知および新規の転写産物アイソフォーム、融合遺伝子、その他の特性、ならびにアレル特異的発現をどのようにして同定し、コーディングトランスクリプトームの全体像の把握にいかに役立つかをご覧ください。
トータルRNA-Seqがどのようにして遺伝子と転写産物の量を精確に測定し、既知および新規のトランスクリプトームの特性を同定するかをご覧ください。
トランスクリプトームとエピトープの細胞インデックス（CITE-Seq）
単一細胞リードアウト内で細胞表面タンパク質とトランスクリプトームデータを同時に定量化するためのCITE-Seq独自の利点について探ります。
空間トランスクリプトミクスにより、どのように構造と活性を関連付けるための組織切片にマッピングされた遺伝子発現パターンのトポグラフィー配置が得られるかを探ります。
がん研究手法に関するガイドは、幅広いがん研究アプリケーションのためのシンプルで包括的なワークフローを紹介した40ページ以上にわたる包括的なリソースです。このガイドには、シングルセルシーケンス、空間シーケンス、メチル化プロファイリング、マルチオミクス、セルフリーRNAシーケンスなどが含まれます。
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Illumina Stranded mRNA Prepは、ライブラリー調製とハイブリダイゼーション試薬、包括的なエクソームプローブパネル、クリーンアップとサイズ選択ビーズ、インデックスを含む、高性能で高速、かつ完全な全エクソームシーケンスキットです。
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plusは、コーディングRNAと複数形態の非コーディングRNAの解析にすぐれた性能を発揮します。
Illumina RNA Prep for Enrichment
Illumina RNA Prep with Enrichmentは、オンビーズタグメンテーションテクノロジーとそれに続くシンプルなシングルハイブリダイゼーションを使用して、RNAベースのライブラリー調製および濃縮のための超高速ワークフローを提供します。
NextSeq 1000および2000システムは、コスト効率に優れ、使いやすいミッドスループットのベンチトップシーケンサーは、新たなアプリケーションをサポートする極めて高い柔軟性を備えています。
NovaSeq Xシリーズは、膨大なアプリケーションを幅広く提供することで、生産規模でのデータ集約型の手法を可能にします。
DRAGEN RNAおよびDRAGEN RNA Differential Expressionアプリ
DRAGEN RNAおよびDRAGEN RNA Differential Expressionアプリでは、アライメント、定量化、融合遺伝子検出、差次的遺伝子発現解析など、NGSデータの精確で包括的かつ効率的な解析が可能です。
Correlation Engineは、インタラクティブなオミクスのナレッジベースであり、生物学的コンテキストにおいて、プライベートなオミクスデータを高度にキュレーションされた公開データに当てはめます。
がん研究のためのRNA融合イベントを同定する簡単なワークフロー
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研究者らは、RNA-Seqを用いて、ノンコーディングlncRNAがどのようにがんの特定、測定および治療に利用できるかを解明しています。
ターゲットRNAシーケンスは、特定のがん遺伝子および対象の転写産物の発現を解析します。
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