Allen Instituteの研究者は、mRNA-Seqを用いて個々の神経細胞における遺伝子発現を解析し、V1神経細胞を分類しました。
mRNAシーケンス(mRNA-Seq)は、疾患状態や生物学的プロセスのトランスクリプトームの解析メソッドとして、また広範な研究デザインにおいて、急速に注目を集めています。mRNA-Seqは、遺伝子発現を定量化する高感度で正確な手段であることに加えて、既知および新規の転写アイソフォーム、遺伝子融合、その他の特徴、ならびにアリル特異的発現を同定することができます。次世代シーケンサー(NGS)ベースのmRNA-Seqは、過去の知識のフィルターによる制限を受けない、コーディングトランスクリプトームの全体像を提供します。
mRNA-Seqには、トランスクリプトームの解析において多くの利点があります
比率圧縮は遺伝子発現アレイのよく知られた技術的制限であり、ダイナミックレンジを減少させ、測定された転写変化をマスキングまたは変化させることがあります1–3。一方、mRNA-Seqはこのバイアスに左右されず、より包括的で正確な遺伝子発現変化の測定が可能です。
さらに、mRNA-Seqではストランドの情報を得ることができるため、アンチセンス発現の検出が可能になり、オーバーラップする転写物をより正確に定量化でき、アライメント可能なリードの割合が増加します。
インプット量わずか25 ngの標準(未分解)RNAを利用してコーディングトランスクリプトームを解析できるシンプルでスケーラブル、費用対効果が高く、1日で完了できる迅速ソリューション。
これらの費用対効果が高く、ユーザーフレンドリーなミッドスループットのベンチトップシーケンサーは、mRNA-Seqに加えて、現在および将来のさまざまなアプリケーションにも対応しています。
mRNAシーケンスのための、最速で最もシンプルなベンチトップ型システム
アライメント、定量化、および融合遺伝子検出を行います。
DRAGEN Differential Expression
差次的な遺伝子発現解析が可能です。
このガイドは、ターゲットパネルから全トランスクリプトームまで、RNAプロファイリングのためのソリューションを提供します。イルミナのRNA-Seqワークフローは、ライブラリー調製、シーケンス、データ解析を統合し、トランスクリプトーム研究をサポートします。
RNA-Seqライブラリー調製の進歩は、トランスクリプトーム研究に革命をもたらしています。当社の強化されたRNAシーケンスライブラリー調製ポートフォリオは、mRNA-SeqからトータルRNA-Seqまで、複数のタイプのシーケンス研究に及びます。これらのソリューションは、迅速なターンアラウンドタイム、幅広い研究の柔軟性、およびシーケンスのスケーラビリティを可能にします。
イルミナは、ライブラリー調製からデータ解析、生物学的解釈までのプロセス全体を簡素化するmRNAシーケンスワークフローを提供します。
Allen Instituteの研究者は、mRNA-Seqを用いて個々の神経細胞における遺伝子発現を解析し、V1神経細胞を分類しました。
Cole Trapnell, PhDが、自身のラボにおけるシングルセルmRNA-Seqの実績と、バイオインフォマティクスツールを誰もが利用できるようにするための取り組みについて論じます。
RNA-Seqに必要なリード長と深度について学び、実験デザインに役立つリソースを見つけることができます。
mRNA-Seqで遺伝子発現の変化をモニタリングすることにより、研究者は疾患の予後や治療への反応性を予測するバイオマーカーの同定が可能です。
RNA-Seqを用いた遺伝子発現プロファイリング研究により、遺伝的および環境的要因がどのように広範な疾患に関与するかを視覚化することができます。
ユーザーフレンドリーなソフトウェアツールにより、バイオインフォマティクスの経験に関係なく、生物学者のRNA-Seqデータ解析が簡素化されます。
バルクサンプリングでマスクされることの多い細胞の違いを考察し、高感度のシングルセルシーケンスの手法を探索します。
ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)とその他の低品質サンプルのRNA-Seqは、疾患研究に貴重な知見を提供します。
すべてのイルミナシーケンスシステムはペアエンドシーケンスが可能で、新規RNA転写物や遺伝子融合などの検出を容易にします。
mRNA-Seqのソリューションの詳細については、お気軽にお問い合わせください。