mRNAシーケンス

既知の転写産物と新規の転写産物の両方を検出し、転写産物の量を測定し、コーディングトランスクリプトームの包括的な情報を提供します。

Front view of a female scientist pipetting clear liquid into tube; reagent cartridge, box, and plates in the foreground; NextSeq 1000/2000 instruments in the background.

mRNAシーケンスの紹介

mRNAシーケンス(mRNA-Seq)は、疾患状態や生物学的プロセスのトランスクリプトームの解析メソッドとして、また広範な研究デザインにおいて、急速に注目を集めています。mRNA-Seqは、遺伝子発現を定量化する高感度で正確な手段であることに加えて、既知および新規の転写アイソフォーム、遺伝子融合、その他の特徴、ならびにアリル特異的発現を同定することができます。次世代シーケンサー(NGS)ベースのmRNA-Seqは、過去の知識のフィルターによる制限を受けない、コーディングトランスクリプトームの全体像を提供します。

mRNAシーケンスの利点

mRNA-Seqには、トランスクリプトームの解析において多くの利点があります

広いダイナミックレンジを提供し、遺伝子発現の倍率変化を高感度かつ高精度に測定

既知の転写産物および新規の転写産物の両方の特徴をキャプチャー

幅広い生物種に適用可能

トランスクリプトームの正確で高解像度な情報

比率圧縮は遺伝子発現アレイのよく知られた技術的制限であり、ダイナミックレンジを減少させ、測定された転写変化をマスキングまたは変化させることがあります1–3。一方、mRNA-Seqはこのバイアスに左右されず、より包括的で正確な遺伝子発現変化の測定が可能です。

さらに、mRNA-Seqではストランドの情報を得ることができるため、アンチセンス発現の検出が可能になり、オーバーラップする転写物をより正確に定量化でき、アライメント可能なリードの割合が増加します。

注目のmRNA-Seqワークフロー

1
ライブラリー調製
2
シーケンス
3
データ解析
RNA sequencing methods guide cover. Close up image of a female scientist pipetting clear liquid into tube; NextSeq 1000/2000 reagent cartridge and sample plate on the lab bench.

RNAシーケンス手法ガイド

このガイドは、ターゲットパネルから全トランスクリプトームまで、RNAプロファイリングのためのソリューションを提供します。イルミナのRNA-Seqワークフローは、ライブラリー調製、シーケンス、データ解析を統合し、トランスクリプトーム研究をサポートします。

RNAライブラリー調製

RNA-Seqライブラリー調製の進歩は、トランスクリプトーム研究に革命をもたらしています。当社の強化されたRNAシーケンスライブラリー調製ポートフォリオは、mRNA-SeqからトータルRNA-Seqまで、複数のタイプのシーケンス研究に及びます。これらのソリューションは、迅速なターンアラウンドタイム、幅広い研究の柔軟性、およびシーケンスのスケーラビリティを可能にします。

Female scientist holding a single pipette in one hand and a tube in the other.

包括的なmRNA-Seqワークフロー

イルミナは、ライブラリー調製からデータ解析、生物学的解釈までのプロセス全体を簡素化するmRNAシーケンスワークフローを提供します。

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お問い合わせ

mRNA-Seqのソリューションの詳細については、お気軽にお問い合わせください。

参考文献

  1. Shi L, Tong W, Su Z, et al. Microarray scanner calibration curves: characteristics and implications. BMC Bioinformatics. 2005;6 Suppl 2:S11.
  2. Naef F, Socci ND, Magnasco M. A study of accuracy and precisions in oligonucleotide arrays: extracting more signal at large concentrations. Bioinformatics. 2003;19:178-184.
  3. Yuen T, Wurmbach E, Pfeffer RL, Ebersole BJ, Sealfon SC. Accuracy and calibration of commercial oligonucleotide and custom cDNA microarrays. Nucleic Acids Res. 2002;30:e48.