RNAエクソームキャプチャーシーケンス
RNAエクソームキャプチャーの紹介
費用対効果、正確で感度の高いRNAエクソーム解析を、たとえ難しい試料であっても、融合遺伝子検出機能を損なうことなく達成します。多くのRNAエクソームシーケンス法は、既知の転写産物の定義済みの数にフォーカスするか、またはコストの高いディープシーケンシングを必要としますRNAエクソームキャプチャーシーケンスは、RNA-Seqとエクソームの濃縮を組み合わせることによって、このような課題を解決します。
この方法は、トランスクリプトームのコーディング領域のみをキャプチャーして、より高いスループットを可能にし、非エクソームキャプチャー法に比べてより低いシーケンス深度しか必要としません。シーケンスに特化したRNAエクソームのキャプチャーは、ポリA鎖の存在に依存しません。このため、RNAエクソームキャプチャーシーケンスは、低品質の試料または限られた出発物質によるRNA－Seqに最適です。
RNAエクソームキャプチャーシーケンスのメリット
トランスクリプトームのコード領域を分離すると、全RNAシーケンスの読みの深度の何分の1かで検出力が最大になります。
- 高い試料のスループットと高コスト効果が可能
- 手頃なコストで高価値なコンテンツを可能にすることにフォーカス
- ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）の組織を始めとする、劣化した試料からでも、高品質なデータを達成
- 必要な試料投入量が小さく（全RNAで僅か10 ng）、一方高い感度を維持
NGSによるトランスクリプトーム解析
イルミナの著名な科学者、Gary Schroth博士は、RNA-Seqテクノロジーの最新の進歩について説明します。最新のRNAライブラリー調製方法が、単一細胞またはFFPE組織のような難しい試料からのトランスクリプトーム解析を可能にする方法を学習してください。
ビデオを見る
RNAエクソームキャプチャーシーケンスワークフロー
イルミナSequencing By Synthesis（SBS）ケミストリーは、全世界のシーケンスデータの90%を以上生成している、最も広く採用されたNGSテクノロジーです。*
業界をリードするデータ品質に加えて、イルミナは、ライブラリー調製からデータ解析、そして生物学的解釈までのプロセス全体を簡略化する、統合型RNAエクソームキャプチャーワークフローをご提供します。
主な製品
NextSeq 1000 & 2000 Systems
Groundbreaking benchtop sequencers allow you to explore new discoveries across a variety of current and emerging applications, with higher efficiency and fewer restraints.
Learn More
Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit
The stand-alone Illumina Ribo-Zero Plus kit allows for ribosomal RNA removal in human, mouse, rat, and bacterial samples.
Learn More
Illumina RNA Prep with Enrichment
Achieve rapid, targeted interrogation of an expansive number of target genes with exceptional capture efficiency and coverage uniformity.
Learn More関連ソリューション
がん研究
NGSを用いた、ゲノミクスベースのがん研究へのアプローチを探索。がんの生物学に新しい洞察を開くために役立つツールを検索がん研究の詳細
複雑な疾患のゲノミクス
自己免疫やリウマチ疾患、アテローム性動脈硬化症やさまざまな形態の心臓疾患、神経系の疾患、精神系疾患などの疾病研究を分子レベルで前進させる、NGSソリューションを検索。複雑な疾患研究の詳細はこちら。
RNA シーケンス検討事項
遺伝子発現プロファイリング、ターゲットRNA発現、small RNA解析、など、それぞれのRNA-Seq実験によって、必要とされるリード長や深度は異なります。このページでは、実験において考慮すべき点をレビューしています。実験計画にご活用ください。
詳細はこちら
シーケンス手法に関する最新のニュース、事例研究などの情報を電子メールにてご提供します。ぜひご登録ください。
電子メールアドレスを入力してください。
Additional Resources
User-Friendly RNA-Seq Data Analysis
Access user-friendly tools that support a broad range of gene expression and transcriptome analysis studies.
Buyer’s Guide: Simple RNA-Seq Workflows
Evaluating options for next-generation RNA sequencing.
Gene Panel and Array Finder
プロジェクトに適したシーケンスパネルまたはマイクロアレイを使用してさらに研究を進めてください
NextSeq 1000 and NextSeq 2000 single-cell RNA sequencing solution
This cost-effective, flexible workflow measures gene expression in single cells and offers high-resolution analysis to discover cellular differences usually masked by bulk sampling methods. This app note outlines the workflow, provides example study designs and throughput charts, and more.
*データ計算はファイルに保存しています。Illumina, Inc., 2015