RNAエクソームキャプチャーシーケンス

RNAコード領域にフォーカスして、RNA-Seq検出力を最大化

RNAエクソームキャプチャーシーケンスの紹介

費用対効果、正確で感度の高いRNAエクソーム解析を、たとえ難しいサンプルであっても、融合遺伝子の検出力を損なうことなく達成します。多くのRNAエクソームシーケンス法は、既知の転写産物の定義済みの数にフォーカスするか、またはコストの高いディープシーケンスを必要とします RNAエクソームキャプチャーシーケンスは、RNA-Seqとエクソームの濃縮を組み合わせることによって、このような課題を解決します。

この方法は、トランスクリプトームのコーディング領域のみをキャプチャーして、より高いスループットを可能にし、非エクソームキャプチャー法に比べてより低いシーケンス深度しか必要としません。シーケンスに特化したRNAエクソームのキャプチャーは、ポリA鎖の存在に依存しません。このため、RNAエクソームキャプチャーシーケンスは、低品質のサンプルまたは限られた出発物質によるRNA-Seqに最適です。

RNAエクソームキャプチャーシーケンスの利点

トランスクリプトームのコード領域を分離すると、全RNAシーケンスのリード深度の何分の1かで検出力が最大になります。

高いサンプルスループットとコスト効率を実現

手頃なコストで高価値なコンテンツを提供することにフォーカス

ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)の組織を始めとする、劣化したサンプルからでも、高品質なデータを達成

必要なサンプルインプット量が小さい(全RNAで僅か10 ng)一方で、高い感度を維持

サムネール

NGSによるトランスクリプトーム解析

イルミナの著名なサイエンティストであるGary P. Schroth, PhDが、RNA-Seqテクノロジーの進歩について解説します。最新のRNAライブラリー調製方法により、シングルセルやFFPE組織などの困難なサンプルからのトランスクリプトーム解析がどのように可能になるかをご覧ください。

RNAエクソームキャプチャーシーケンスワークフロー

イルミナは、ライブラリー調製からデータ解析、生物学的解釈までのプロセス全体を簡略化する、RNAエクソームキャプチャーワークフローを提供します。

注目の製品

Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit

ヒト、マウス、ラット、細菌サンプルにおけるリボソームRNAおよびヒトグロビンmRNAの除去を可能にするスタンドアロンキット。

Illumina RNA Prep with Enrichment

幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス付きシーケンスライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフローです。

関連ソリューション

がん研究

NGSを用いた、ゲノミクスベースのがん研究へのアプローチを探索。がんの生物学に新しい洞察を開くために役立つツールを検索

複雑な疾患ゲノム

自己免疫、心臓疾患、神経系の疾患、精神系疾患などの研究を分子レベルで前進させるNGSソリューションを検索してください。

RNAシーケンス検討事項

遺伝子発現プロファイリング、ターゲットRNA発現、small RNA解析など、それぞれのRNA-Seq実験タイプによって、必要とされるリード長や深度は異なります。この記事では、実験において考慮すべき点をレビューし、試験デザインに役立つリソースを提供します。

補足資料

RNA-Seqデータ解析

使いやすいソフトウェアツールにより、バイオインフォマティクスの経験の有無に関係なく、生物学者のmRNA-Seqデータ解析が簡素化されます。

シングルセルRNAシーケンス

バルクサンプリングでマスクされることの多い細胞の違いを考察し、高感度のシングルセルシーケンスの手法を探索します。

お問い合わせ

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