RNAコーディング領域にフォーカスして、RNA-Seqの検出力を最大限に高める

配列特異的なキャプチャーにより、高精度かつ高感度なRNAエクソーム解析を実現

キャプチャーベースのRNAエクソームシーケンス

遺伝子融合の検出力を損なわず、難しいサンプルでもコスト効率よく、高精度で高感度なRNAエクソーム解析が行えます。現在のRNAエクソームシーケンス法では、設定された既知の転写産物だけにターゲットを絞るか、費用のかさむディープシーケンスが必要となることもあります。キャプチャーベースのRNAエクソームシーケンスでは、エクソーム濃縮法とRNA-Seqを組み合わせることで、これらの問題を解消しました。

この手法では、トランスクリプトームのコーディング領域だけをキャプチャーするため、より低いシーケンス深度でこれまでにない高スループットが実現します。Poly-Aテールの有無に左右されず、配列特異的なRNAエクソームをキャプチャーすることができるキャプチャーベースのRNAエクソームシーケンスは、低品質のサンプルや出発物質のインプット量が限られたサンプルを使ったRNA-Seqに最適な手法です。

トランスクリプトームコーディング領域を抽出することにより、わずかなリード深度で行うtotal RNAシーケンスの検出力を最大限に高めます。

  • 高いサンプルスループットとコスト効率性を実現
  • 重要なコンテンツにフォーカスして、コストを削減
  • FFPE組織など分解されたサンプルから質の高いデータを提供
  • わずか10ngの少ないtotal RNAインプット量で高感度なシーケンスを実施
Advantages of RNA Exome Capture Sequencing
NGSによるトランスクリプトーム解析

イルミナのサイエンティストDr. Gary Schrothが、最新のRNA-Seqテクノロジーをご紹介します。シングルセルやFFPE組織など難しいサンプルでのトランスクリプトーム解析を可能にする新しいRNAライブラリー調製法をご覧ください。

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Transcriptome Analysis with NGS screenshot

イルミナの1塩基合成(SBS)ケミストリーは最も幅広く利用されるNGSテクノロジーであり、世界中で得られるシーケンスデータの90%以上がこのテクノロジーに基づいて産出されています。*

傑出したデータ品質に加え、統合されたRNAエクソームキャプチャーワークフローでは、ライブラリー調製からデータ解析や生物学的解釈までのプロセス全体がシンプルに行えます。

をクリックすると、ワークフローの各ステップで使用する製品が確認できます。

TruSeq RNA Access

FFPE由来など分解されたサンプルの少ないインプット量でのRNAエクソームシーケンスが低コストで行えるオールインソリューションです。遺伝子と転写産物の存在量を精確に測定し、RNAエクソームに関する既知の機能と新たな機能のいずれも検出します。

TruSight RNA Pan-Cancer

腫瘍学で重要な1,385遺伝子をターゲットとし、FFPE由来などあらゆるタイプのRNAサンプルで遺伝子発現、バリアント、および遺伝子融合が検出できます。

NextSeq Series

フレキシブルなパワーとシンプルな操作で全ゲノムシーケンス、エクソームシーケンス、または、トランスクリプトームシーケンスが行えます。ランあたり5~16のRNAエクソームをキャプチャーしたサンプルの解析が可能です。

HiSeq Series

生産規模のパワーを特長とし、最大のスループットと最小のコストで生産規模のゲノム研究が行えます。ランあたり最大24のRNAエクソームライブラリーを解析できます。

TopHat Alignment App

リードをマップし、リファレンス遺伝子およびトランスクリプトの存在量を予測し、融合物を選択的にコールします。

Cufflinks Assembly & Differential Expression (DE) App

新規のトランスクリプトをアセンブルし、新規のトランスクリプトとリファレンストランスクリプトの差次的発現解析を行います。

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がん研究
Cancer Research

NGSを利用したゲノムベースのがん研究アプローチを検討して、がんの生物学に関する新たな洞察の解明に役立つツールを見つけてください。 がんゲノム研究の詳細を見る。

複雑な疾患の研究
Complex Disease Research

免疫学から神経科学や高スループットゲノム学などに至る分野で複雑な疾患の研究を進めるためのNGSソリューションを見つけてください。 複雑な疾患ゲノムの詳細を見る。

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FFPEサンプルからの遺伝子解析
FFPEサンプルからの遺伝子解析

RNAキャプチャーテクノロジーを活用し、FFPEのような分解サンプルから、高品質な結果を得ることができます。

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RNAシーケンス ライブラリー調製キット 製品ガイド
RNAシーケンス ライブラリー調製キット 製品ガイド

RNAシーケンスに関するキットの選択に迷ったとき、RNAシーケンスを始めるときなどに本ガイドをご活用ください。

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RNAシーケンスを始める前に
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初心者の疑問を分かりやすく解説した次世代シーケンサー入門ガイドをご活用ください。

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「NGSでできること」を網羅した冊子、アプリケーションガイド
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Gene Panel and Array Finder
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*Data calculations on file. Illumina, Inc., 2015