MiniSeqシステムで利用可能な試薬およびライブラリー調製キットバンドル

MiniSeq試薬とライブラリー調製キットを一緒に注文すると、さらなる節約と利便性が実現します。アイテム20005611 を選択し、カートに追加します。

TruSight RNA汎がんパネル

血液、骨髄、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織など多種多様なRNAサンプルを用いる遺伝子発現、バリアント検出、および融合検出の研究のために1,385のがん遺伝子をターゲットとします。 続きを読む...
製品の選択

TruSight RNA汎がんパネルセットA

RS-303-1002

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TruSight RNA汎がんパネルセットB

RS-303-1003

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TruSight RNA Pan-Cancer Set A MiniSeqキット

20005611

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製品のハイライト

TruSight RNA Pan-Cancerパネルは、がんトランスクリプトームの包括的な解析を提供します。以下を提供します。

  • 遺伝子発現情報、バリアントコーリング、既知および新規の遺伝子融合パートナーとの融合検出
  • FFPEを含む幅広いサンプルタイプに最適化されたローインプットプロトコール
  • がんパスウェイの包括的な見解
  • デスクトップシーケンサーでの経済的なRNAシーケンス(RNA-Seq)
高感度で経済的なターゲットシーケンス

TruSight RNA Pan-Cancerパネルは、遺伝子発現の定量的測定だけでなく、既知の遺伝子融合パートナーと新規の遺伝子融合パートナーの両方による遺伝子融合の検出を可能にします。このパネルは、わずか10 ngのトータルRNAインプット(またはFFPEサンプルから20 ng)に対応しています。関連遺伝子のサブセットに焦点を合わせることで、ベンチトップシーケンサーで高感度のRNA-Seqが可能になり、あらゆるラボでコスト効率の高いNGSへのアクセスが可能になります。

直感的なクラウドベースのデータ解析

解析はBaseSpace RNA-Seq Alignment Appを使って行うことができます。この直感的なツールは、融合コールとバリアント検出を実行し、遺伝子発現プロファイルを提供し、がん研究者に包括的なソリューションを提供します。

TruSight RNA汎がんサンプルデータセット

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MiSeqデータ

10 ngのヒトリファレンスRNA(UHR)、ヒトリファレンス脳RNA(Brain)、細胞株RNA(MCF7)、および20 ngの乳房腫瘍FFPE RNA(BT)を、TruSight RNA Pan-Cancer Panelを使用して調製し、MiSeqシステムシーケンスしました。BaseSpace Sequence Hub上のSTARアライナーとRNA-Seq Alignmentアプリを使用して、リードマッピングと融合コールを実施しました。

プロジェクト詳細について

MiniSeqデータ

ヒトリファレンスRNA(HBRRおよびUHRR)、細胞株RNA(MCF7)、および乳がんRNAサンプルを、TruSight RNA Pan-Cancerパネルを使用して調製し、8サンプルを、シングルインデックスで2x76bpのリード長でMiniSeqシステムシーケンスしました。総収量は4.2 Gbで、塩基の96.8%がQ30以上でした。

BaseSpace Sequence Hubでデータを閲覧する:

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仕様

推奨プロジェクト

装置 推奨サンプル数 リード長
MiniSeq System ランあたりのサンプル数:中出力:2~3、高出力:8(サンプルあたり300万リードに基づく) 2 × 75 bp(最大推奨)
MiSeq System v3試薬で1ランあたり8サンプル(1サンプルあたり300万リードに基づく) 2 × 75 bp(最大推奨)

製品比較

TruSight RNA Pan-Cancer TruSight RNA Fusion Panel
アッセイ時間 2.5日
インプット量 10 ngトータルRNA, 20~100 ng FFPE RNA
コンテンツ仕様 1,385のターゲット遺伝子と21,043の標的エクソン領域を有する腫瘍横断型パネルです。がん遺伝子融合に関与する507の遺伝子を含みます。
ハンズオンタイム 11時間
生物種カテゴリー ヒト ヒト
説明 複数のがんタイプにおける遺伝子融合、バリアント、遺伝子発現の変化に関する研究を可能にするがん関連RNA転写産物の包括的な評価。

メソッド別のワークフロー例

 

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