MiniSeqシステムで利用可能な試薬およびライブラリー調製キットバンドル

MiniSeq試薬とライブラリー調製キットを一緒にご注文いただくと、さらにお得で便利です。アイテム20005611を選択し、カートに追加します。 

TruSight RNA Pan-Cancer Panel

血液、骨髄、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織など多種多様なRNAサンプルを用いる遺伝子発現、バリアント検出、および融合検出の研究のために1,385のがん遺伝子をターゲットとします。 続きを読む...
製品の選択

TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A

RS-303-1002

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TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B

RS-303-1003

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TruSight RNA Pan-Cancer Set A MiniSeq Kit

20005611

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Trusight RNA Pan-Cancer Oligo Panel

20046104

価格
 
 

製品のハイライト

TruSight RNA Pan-Cancer Panelは、がんトランスクリプトームの包括的な解析を可能にします。以下を提供します。

  • 遺伝子発現情報、バリアントコーリング、既知および新規の遺伝子融合パートナーとの融合遺伝子検出
  • FFPEを含む幅広いサンプルタイプに最適化された低インプットプロトコール
  • がんパスウェイの包括的な視点
  • デスクトップシーケンサーでの低コストなRNAシーケンス(RNA-Seq)
高感度で低コストなターゲットシーケンス

TruSight RNA Pan-Cancer Panelは、遺伝子発現の定量的測定だけでなく、既知および新規の遺伝子融合パートナーとの遺伝子融合の検出を可能にします。このパネルは、わずか10 ngのトータルRNAインプット(またはFFPEサンプルから20 ng)に対応しています。関連遺伝子のサブセットに焦点を当てることで、ベンチトップシーケンサーで高感度のRNA-Seqが可能になり、あらゆるラボでNGSへのコスト効率の高いアクセスが可能になります。

直感的なクラウドベースのデータ解析

BaseSpace RNA-Seq Alignment Appを使用してデータ解析を実行できます。この直感的なツールは、融合遺伝子コーリングとバリアント検出を実行して、遺伝子発現プロファイルを作成することで、がん研究者に包括的なソリューションを提供します。

TruSight RNA Pan-Cancerサンプルデータセット

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MiSeqデータ

10 ngのヒト参照RNA(UHR)、ヒト参照脳RNA(脳)、細胞株RNA(MCF7)、および20 ngの乳房腫瘍FFPE RNA(BT)を、TruSight RNA Pan-Cancer Panelを用いて調製し、MiSeqシステムでシーケンスしました。BaseSpace Sequence HubでRNA-Seq Alignment AppとSTARアライナーを使用して、リードマッピングと融合遺伝子コールを実施しました。

プロジェクト詳細について

MiniSeqデータ

TruSight RNA Pan-Cancer Panelを使用して、ヒト参照RNA(HBRRおよびUHRR)、細胞株RNA(MCF7)、および乳房腫瘍のRNAサンプルを調製し、MiniSeqシステムで2x76bpリード長、シングルインデックスで8サンプルをシーケンスしました。総収量(ng)は4.2 Gbで、塩基の96.8%がQ30以上でした。

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仕様

推奨プロジェクト

装置 推奨サンプル数 リード長
MiniSeq System 1ランあたりのサンプル数:中出力:2~3、高出力:8(1サンプルあたり300万リードに基づく) 2 × 75 bp(推奨最大値)
MiSeq System v3試薬で1ランあたり8サンプル(1サンプルあたり300万リードに基づく) 2 × 75 bp(推奨最大値)

製品比較

TruSight RNA Pan-Cancer TruSight RNA Fusion Panel
アッセイ時間 2.5日 2.5日
インプット量 10 ngトータルRNA, 20~100 ng FFPE RNA 10 ngトータルRNA、20~100 ng FFPE RNA
コンテンツ仕様 1,385のターゲット遺伝子と21,043の標的エクソン領域を有する腫瘍横断型パネルです。がん遺伝子融合に関与する507の遺伝子を含みます。 507のがん関連融合遺伝子と7,690のエクソンをターゲットとする遺伝子融合パネル
ハンズオンタイム 11時間 11時間
生物種カテゴリー ヒト ヒト
説明 複数のがんタイプにおける遺伝子融合、バリアント、遺伝子発現の変化に関する研究を可能にするがん関連RNA転写産物の包括的な評価。

メソッド別のワークフロー例

 

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