MiniSeq試薬とライブラリー調製キットを一緒にご注文いただくと、さらにお得で便利です。アイテム20005611を選択し、カートに追加します。
TruSight RNA Pan-Cancer Panelは、がんトランスクリプトームの包括的な解析を可能にします。以下を提供します。
TruSight RNA Pan-Cancer Panelは、遺伝子発現の定量的測定だけでなく、既知および新規の遺伝子融合パートナーとの遺伝子融合の検出を可能にします。このパネルは、わずか10 ngのトータルRNAインプット(またはFFPEサンプルから20 ng)に対応しています。関連遺伝子のサブセットに焦点を当てることで、ベンチトップシーケンサーで高感度のRNA-Seqが可能になり、あらゆるラボでNGSへのコスト効率の高いアクセスが可能になります。
BaseSpace RNA-Seq Alignment Appを使用してデータ解析を実行できます。この直感的なツールは、融合遺伝子コーリングとバリアント検出を実行して、遺伝子発現プロファイルを作成することで、がん研究者に包括的なソリューションを提供します。
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10 ngのヒト参照RNA(UHR)、ヒト参照脳RNA(脳)、細胞株RNA(MCF7)、および20 ngの乳房腫瘍FFPE RNA(BT)を、TruSight RNA Pan-Cancer Panelを用いて調製し、MiSeqシステムでシーケンスしました。BaseSpace Sequence HubでRNA-Seq Alignment AppとSTARアライナーを使用して、リードマッピングと融合遺伝子コールを実施しました。
TruSight RNA Pan-Cancer Panelを使用して、ヒト参照RNA(HBRRおよびUHRR)、細胞株RNA(MCF7)、および乳房腫瘍のRNAサンプルを調製し、MiniSeqシステムで2x76bpリード長、シングルインデックスで8サンプルをシーケンスしました。総収量(ng)は4.2 Gbで、塩基の96.8%がQ30以上でした。
装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
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MiniSeq System | 1ランあたりのサンプル数:中出力:2~3、高出力:8(1サンプルあたり300万リードに基づく) | 2 × 75 bp(推奨最大値) |
MiSeq System | v3試薬で1ランあたり8サンプル(1サンプルあたり300万リードに基づく) | 2 × 75 bp(推奨最大値) |
TruSight RNA Pan-Cancer | TruSight RNA Fusion Panel | |
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アッセイ時間 | 2.5日 | 2.5日 |
インプット量 | 10 ngトータルRNA, 20~100 ng FFPE RNA | 10 ngトータルRNA、20~100 ng FFPE RNA |
コンテンツ仕様 | 1,385のターゲット遺伝子と21,043の標的エクソン領域を有する腫瘍横断型パネルです。がん遺伝子融合に関与する507の遺伝子を含みます。 | 507のがん関連融合遺伝子と7,690のエクソンをターゲットとする遺伝子融合パネル |
ハンズオンタイム | 11時間 | 11時間 |
生物種カテゴリー | ヒト | ヒト |
説明 | 複数のがんタイプにおける遺伝子融合、バリアント、遺伝子発現の変化に関する研究を可能にするがん関連RNA転写産物の包括的な評価。 |
Evaluating RNA Quality from FFPE Samples
Technical Note | PDF 1 MB
Data Sheet | PDF < 1 MB
TruSight RNA Pan-Cancer Sequencing Panel Gene List
Product Information Sheet | EXCEL < 1 MB
シーケンスライブラリーqPCR定量ガイド Documentation
TruSight RNA Pan-Cancer Panel Documentation
TruSight RNA Pan-Cancer Panel Checklist Documentation
TruSight RNA Pan-Cancer Panel Reference Guide Documentation
TruSight RNA Pan-Cancer Panel Consumables & Equipment Documentation