TruSight RNA汎がんパネル
血液、骨髄、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織など多種多様なRNAサンプルを用いる遺伝子発現、バリアント検出、および融合検出の研究のために1,385のがん遺伝子をターゲットとします。
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MiniSeq試薬とライブラリー調製キットを一緒に注文すると、さらなる節約と利便性が実現します。アイテム20005611 を選択し、カートに追加します。
TruSight RNA Pan-Cancerパネルは、がんトランスクリプトームの包括的な解析を提供します。以下を提供します。
TruSight RNA Pan-Cancerパネルは、遺伝子発現の定量的測定だけでなく、既知の遺伝子融合パートナーと新規の遺伝子融合パートナーの両方による遺伝子融合の検出を可能にします。このパネルは、わずか10 ngのトータルRNAインプット（またはFFPEサンプルから20 ng）に対応しています。関連遺伝子のサブセットに焦点を合わせることで、ベンチトップシーケンサーで高感度のRNA-Seqが可能になり、あらゆるラボでコスト効率の高いNGSへのアクセスが可能になります。
解析はBaseSpace RNA-Seq Alignment Appを使って行うことができます。この直感的なツールは、融合コールとバリアント検出を実行し、遺伝子発現プロファイルを提供し、がん研究者に包括的なソリューションを提供します。
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10 ngのヒトリファレンスRNA（UHR）、ヒトリファレンス脳RNA（Brain）、細胞株RNA（MCF7）、および20 ngの乳房腫瘍FFPE RNA（BT）を、TruSight RNA Pan-Cancer Panelを使用して調製し、MiSeqシステムシーケンスしました。BaseSpace Sequence Hub上のSTARアライナーとRNA-Seq Alignmentアプリを使用して、リードマッピングと融合コールを実施しました。
ヒトリファレンスRNA（HBRRおよびUHRR）、細胞株RNA（MCF7）、および乳がんRNAサンプルを、TruSight RNA Pan-Cancerパネルを使用して調製し、8サンプルを、シングルインデックスで2x76bpのリード長でMiniSeqシステムシーケンスしました。総収量は4.2 Gbで、塩基の96.8%がQ30以上でした。
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| MiniSeq System | ランあたりのサンプル数：中出力：2～3、高出力：8（サンプルあたり300万リードに基づく） | 2 × 75 bp（最大推奨） |
| MiSeq System | v3試薬で1ランあたり8サンプル（1サンプルあたり300万リードに基づく） | 2 × 75 bp（最大推奨） |
| TruSight RNA Pan-Cancer | TruSight RNA Fusion Panel | |
|---|---|---|
| アッセイ時間 | 2.5日 | |
| インプット量 | 10 ngトータルRNA, 20～100 ng FFPE RNA | |
| コンテンツ仕様 | 1,385のターゲット遺伝子と21,043の標的エクソン領域を有する腫瘍横断型パネルです。がん遺伝子融合に関与する507の遺伝子を含みます。 | |
| ハンズオンタイム | 11時間 | |
| 生物種カテゴリー | ヒト | ヒト |
| 説明 | 複数のがんタイプにおける遺伝子融合、バリアント、遺伝子発現の変化に関する研究を可能にするがん関連RNA転写産物の包括的な評価。 |
Evaluating RNA Quality from FFPE Samples
Technical Note | PDF 1 MB
Data Sheet | PDF < 1 MB
TruSight RNA Pan-Cancer Sequencing Panel Gene List
Product Information Sheet | EXCEL < 1 MB
小さなゲノム、PCRアンプリコン、プラスミド、またはcDNAのシーケンスライブラリーをわずか90分で調製し、DNAインプットの必要性を抑えます。
