Illumina Protein Prep
SOMAmerテクノロジーとイルミナのシーケンスおよび解析を備えたこの自動NGSベースのプロテオミクスソリューションは、9,500種類のヒトタンパク質を2.5日で検出し定量します。
Illumina Connected Multiomicsは、マルチオミクスデータ解析と大規模な視覚化を可能にする、強力で直感的なクラウドベースのソリューションです。
Illumina Connected Multiomicsは、使いやすいバイオインフォマティクスプラットフォームであり、直感的で視覚的なユーザーインターフェースでNGS、アレイ、および大規模なマルチオミクスデータの解析を合理化します。強力な統計アルゴリズム、豊富な情報の視覚化、インタラクティブなインターフェース、最先端のゲノムツールにより、研究者は高度なインフォマティクスの専門知識の必要なしに、自信をもってデータを解析できます。
Illumina Connected Multiomicsには、ノーマライゼーションおよびノイズ低減用のモデルなど、公開されている業界標準の統計アルゴリズムを使用して構築された解析ツールを活用し、オミクス層全体のパターンを解明します
DRAGEN二次解析からの出力を使いやすい視覚的なインターフェースに統合した、事前設定済みのカスタマイズ可能な解析オプションにより、ユーザーは自信をもって簡単にマルチオミクスデータセットを探索できます
アッセイから洞察までシームレスなマルチオミクスワークフローを提供するために構築されたIllumina Connected Multiomicsは、マルチオミクス解析を単一のスケーラブルなプラットフォームに統合して発見を加速します
| システム | MiSeq System, MiSeqDx Instrument, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx システム研究(RUO)モード, iScan, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム |
|---|---|
| ソフトウェアフォーマット | クラウド |
| テクノロジー | マイクロアレイ, シーケンス |
Illumina Connected Multiomicsは、プロテオミクス、トランスクリプトミクス、エピゲノミクス、ゲノミクス、およびシングルセルや空間解析などのモダリティを含む、広範囲なマルチオミクスアプリケーションにわたって高分解能データ解析を可能にします。
高度にカスタマイズ可能なラボ情報管理システムにより、遺伝子解析ラボはサンプルを追跡し、ワークフローを効率的かつ安全に管理することができます。
使いやすいクラウドベースのゲノムラン管理とバイオインフォマティクスコンピューティングおよびストレージ環境により、で高性能なシーケンスオペレーションを実現します。
NGSデータを精確、包括的かつ効率的に二次解析します。
シーケンサーのシームレスな統合と柔軟なワークフローのための安全でスケーラブルなバイオインフォマティクスプラットフォーム。
BaseSpace Sequence Hubは、一般的なイルミナシーケンス方法に対応したさまざまなNGSデータ分析アプリを提供します。
Illumina Connected Multiomics
強力なクラウドベースのマルチオミクス解析および解釈ソフトウェアで、インタラクティブな視覚化、インフラストラクチャのスケーラビリティ、そして安全なデータ管理を備えた、サンプルから洞察までのワークフローを実現します。
インタラクティブなオミクスのナレッジベースとデータ検索エンジンで、プライベートなオミクスデータを生物学的コンテキストにおいて、高度にキュレーションされた公開データに当てはめます。
完全な組織構造における全トランスクリプトーム解析のための、高解像度シーケンスベースの空間プロファイルテクノロジー。
イルミナの5塩基ゲノムソリューションにより、1回のリードアウトで高精度ゲノムとメチロームの同時発見を実現します。
マルチオミクスプロファイリングを使用して検出力を高め、遺伝型と表現型のマッチング精度を高めます。
Illumina Protein Prepは、University of Coloradoの研究者に、これらのユニークな疾患を調べるための強力で偏りのないツールを提供しています
Illumina Connected Multiomicsは、2つのティアで提供しています。
特定のイルミナのアッセイをサポートする事前設定済みの解析 ワークフローが含まれており、自由に使用できます。スループットに基づいたデータ保存と解析のニーズを満たすために十分なiCreditが必要です。
特定のイルミナのアッセイをサポートする事前設定済みの 解析ワークフローに加えて、イルミナ用の新しいカスタムワークフローを作成したり、サードパーティのアッセイを選択できる機能が含まれています。パスウェイ解析は、Illumina Correlation EngineまたはKEGG Pathwayと統合することにより使用可能になります。年間または月間ライセンスと、スループットに基づいたデータストレージと解析のニーズを満たすのに十分なiCreditを購入する必要があります。
これらのティアの違いについての詳細は、注文タブをご覧ください。
iCreditの詳細については、iCreditの概要ページをご覧ください。
| 機能 | Basic | Professional |
|---|---|---|
| AWSクラウドのイルミナ領域インスタンスで実施 | ||
| Illumina Connectedのご利用無料 Analytics BasicとIllumina BaseSpace Sequence Hub |
||
| DRAGEN出力へのアクセス | ||
| 高度なセキュリティとコンプライアンス | ||
| 初期設定のパイプライン | ||
| カスタムパイプライン | ||
| サードパーティのアッセイサポートを選択 | ||
| パスウェイ解析および統合されたCorrelation Engine | ||
| アクセス | すべてのドメインおよびワークグループメンバー | シートベースのライセンス、ライセンスごとに1人のユーザーを割り当てる |
プロテオミクス
サンプル分布が、主成分解析に基づく2D散布図を用いて視覚化されます。タンパク質のクラスター化のパターンが、系統樹付きヒートマップに表示されます。ドットプロットでは、特定のタンパク質発現に基づきサンプルグループに焦点を当てます。パスウェイは、他方のグループと比較した一方のグループのエンリッチメントを示しています。
シングルセル解析
免疫細胞の種類が、次元削減プロット(UMAPおよびt-SNE)、円グラフ、棒グラフによって視覚化され、古典的単球が高い発現を示しています。表はグラフに基づきクラスター化のバイオマーカーを表示しています。ヒートマップとバブルマップはZ-score分布を示し、比較対照から重要な遺伝子の罹患率を評価しています。遺伝子セット濃縮解析(GSEA)の図は、主要な生物学的KEGGパスウェイを明示しています。
5塩基シーケンス
このプロットは、二次解析出力メトリックファイルに統計を抽出してプロットすることにより、5塩基メチル化QCタスクを使用して作成されました。QCレポートでは、サンプルレベルのQCメトリクスを視覚化し、サンプル、非メチル化コントロール、メチル化コントロールにおけるCpGメチル化の割合など、リードマッピングの品質とDNAメチル化コールの品質を示しています。
空間解析
妊娠マウス脳の手綱領域の詳細。細胞は、データに対して実施されたクラスター化の結果によって色分けされます。UMAPは細胞のクラスター化を示し、円グラフはデータセット内の各クラスターの相対存在量を示しています。
Illumina Protein Prepアッセイデータは、Illumina Connected Multiomicsで紹介されており、生物学的な状況下でプロテオミクスデータをインタラクティブに探索できます。
Illumina Connected Multiomicsの紹介
Illumina Connected Multiomicsは、さまざまなインタラクティブプロット、重要なパターン、バイオマーカー、パスウェイを使用して、生物学的データに命を吹き込みます。
マルチオミクス試験デザイン、アッセイワークフロー、データ統合戦略、実用的なアプリケーションに関する簡潔かつ価値の高い動画の洞察は、Illumina Connected Multiomics YouTubeプレイリストをご覧ください。
Illumina Connected Multiomics - Professional License - Trial
20141939
30-day trial for 1 user to access Illumina Connected Multiomics, including pre-configured workflows, custom workflows, and 100 iCredits for compute and storage.
List Price:
Discounts:
Illumina Connected Software – Basic License
20141940
Basic license to Illumina Connected Software including run planning, DRAGEN pipeline analysis, and pre-configured multiomic pipelines. Includes access to Illumina Connected Multiomics - Basic, Illumina Connected Analytics, and BaseSpace Sequence Hub.
List Price:
Discounts:
Illumina Connected Multiomics - Professional Annual License
20141942
1-year license for 1 user to access Illumina Connected Multiomics, including pre-configured and custom workflows with pathway analysis powered by Correlation Engine. Includes access to BaseSpace and Illumina Connected Analytics.
List Price:
Discounts:
Illumina Connected Multiomics - Professional Monthly License
20156707
1 month license for 1 user to access Illumina Connected Multiomics, including pre-configured and custom workflows with pathway analysis powered by Correlation Engine. Includes access to BaseSpace and Illumina Connected Analytics.
List Price:
Discounts:
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Illumina Connected Multiomicsでは、 バルクプロテオミクス、トランスクリプトミクス、エピゲノミクス、ゲノミクス、シングルセルおよび空間トランスクリプトミクスをサポートしています。
Illumina Connected Multiomicsがサポートするデータ形式については、Illumina Connected Multiomicsのサポート対象データタイプのオンラインヘルプを参照してください。
最新の情報については、資料をご覧ください。
iCredit使用状況の詳細については、BaseSpace Online Help iCreditセクションをご覧ください。
Illumina Connected Software:Illumina iCredit Usage Explorer
できません。Illumina Connected MultiomicsはイルミナAWSインスタンスでのみ利用可能です。ローカルクラウドのインストールについては、info@illumina.comまでお問い合わせください。
はい。Illumina Connected Softwareエコシステムの一環として、Illumina Connected Multiomicsはイルミナのセキュリティファーストインフラストラクチャに準拠しており、プライバシーとソフトウェア要件および規制を順守しています。
Illumina Connected Multiomicsで使用される業界標準の統計アルゴリズムの全リストについては、Illumina Connected Multiomicsで使用される統計をご覧ください。
Illumina Connected Multiomicsは、QA/QC、アノテーション、フィルタリング、ノーマライゼーション、バッチ除去、統計、探索的解析、領域解析、分類、生物学的解釈、パスウェイ解析など、包括的な三次解析を提供します。詳細については、Connected Multiomicsタスクアクションをご覧ください。
Illumina Connected Multiomicsのデモや情報についてはお問い合わせください
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