NovaSeq Xシリーズのご購入
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。
SomaSeq Discoveryは、NGSリードアウトによるSOMAmerベースのプロテオミクスアッセイを使用して、200を超える生物学的パスウェイにわたるヒトタンパク質の検出と定量化を可能にします。
Illumina SomaSeq Discovery
SOMAmerテクノロジーとイルミナシーケンスを使用した自動プロテオミクスソリューションにより、9,500種類のヒトタンパク質を2.5日で正確かつ再現性高く定量
概要
主な特長
厳密なバリデーション
Illumina SomaSeq Discoveryアッセイで使用されるSOMAmer試薬は、形状特異性とポリイオン競合によって厳密に特性評価され、質量分析法やELISA（酵素結合免疫吸着アッセイ）などの別の手法で確認されています。
高感度、ダイナミック、精確
SOMAmer試薬は、約5.5%*のCVを備えた市場をリードする血中再現性と、10-logダイナミックレンジを超えるフェムトモーラー感度を提供します。
*ドナーからの血漿サンプルを用いて算出されたCV中央値の予測値。
ハイスループットのスケーラビリティ
ワークフロー全体が単一のプラットフォームで自動化され、シームレスに統合された二次解析パイプラインと包括的な三次解析ソリューションにより、1週間で最大340のサンプルと44のコントロールを処理可能。ハイスループットな研究のためのエンドツーエンドのソリューションを提供します。
仕様
| アッセイ時間 | 約2.5日 |
|---|---|
| 自動化機能 | Liquid handling robot(s) |
| 自動化の詳細 | Illumina Protein Prepアッセイは、カスタムTecan Fluent 780であるIllumina Protein Prep Automation System上で完全に自動化されており、デッキ上のアッセイを完全に自動化するために必要な部品が装備されています。 |
| コンテンツ仕様 | SomaSeq Discoveryアッセイは、 約9,500のユニークなヒトタンパク質ターゲットを持つ最大の NGSベースのプロテオミクスパネルです |
| 説明 | ヒトの分泌タンパク質、細胞内タンパク質、細胞外タンパク質にまたがる受容体、キナーゼ、成長因子、ホルモンなどの主要な分子標的の解析のための、ソマアフィニティベースのNGSベースのプロテオミクスアッセイ |
| ハンズオンタイム | ～4時間 |
| インプット量 | 55 μLのヒト血漿または血清 |
| システム | NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム |
| 作用機序 | Illumina Protein Prepは、SomaScanアッセイを使用して、アプタマーをベースにしたタンパク質キャプチャーした後、イルミナライブラリー調製を行います。Illumina Protein Prep Automation Systemは、デッキのアッセイワークフロー全体を自動化します |
| 手法 | NGSベースのプロテオミクス |
| マルチプレックス | Illumina Protein Prep Automation Systemではバッチあたり96の反応が実行されます。NovaSeq X 25Bフローセルでは最大384の反応が実行でき、NovaSeq X 10BフローセルおよびNovaSeq 6000 S4フローセルでは最大192の 反応が実行できます。 |
| サンプルタイプの詳細 | ヒト血漿または血清サンプルに対応 |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| テクノロジー | シーケンス |
必要な製品
Illumina SomaSeq Automation System（カタログ番号20116818）。
1回限りの購入が必要です。このアッセイは、Illumina SomaSeq Automation Systemを使用して自動化する必要があります。Illumina SomaSeq Discoveryサービスパートナーの詳細については、イルミナアカウントマネージャーにお問い合わせください。
ご希望のインプットサンプルタイプに基づいて、血漿または血清アッセイのいずれかを選択します。
Illumina SomaSeq Discovery Plasma、96反応（カタログ番号：20137827）、またはIllumina SomaSeq Discovery Serum、96反応（カタログ番号：20137828）。
96反応キットごとにインデックスプレートを1つ選択します。
Illumina DNA/RNA UD Indexes（96インデックス、96サンプル）
Set A（カタログ番号：20141196）
Set B（カタログ番号：20141197）
Set C（カタログ番号：20141198）
Set D（カタログ番号：20141199）
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件
アプリケーション
SomaSeq Discoveryは、バイオマーカーの探索や集団遺伝学の研究など、プロテオミクスの探索や定量化アプリケーション向けに、約9,500種類の固有のヒトタンパク質の検出が可能なシーケンス対応のライブラリーを提供します。
ワークフローの例
ライブラリー調製
Illumina Protein Prep
Illumina Protein Prepは、Sequence by SynthesisケミストリーとSOMAmer試薬を組み合わせて、包括的なNGSベースのアッセイを実現します。本ワークフローは、Illumina Protein Prep Automation Systemで自動化されています。
シーケンス
包括的なマルチオミクスプロジェクトのための前例のないスケーラビリティとシーケンス深度を実現します。
ハイスループットアプリケーションのためのロバストでスケーラブルなシーケンスを実現。
解析
DRAGEN Protein Quantification
統合された二次解析パイプラインがシーケンス後に自動で起動し、完全なノーマライゼーションとタンパク質発現定量化を実現します。
Illumina Connected Multiomics
インタラクティブな視覚化と統計解析を特徴とする強力なオミクス解析ソフトウェアで、生物学的洞察を深めましょう。
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NovaSeq 6000システム | S4 35cで1フローセルあたり192反応 |
40Mリード、1 × 15 |
| NovaSeq Xシステム | 10B 100cでフローセルあたりの反応192回 |
40Mリード、1 × 15 |
関連するアプリケーションと手法
図
SomaSeqソリューションの概要
サンプルは、SOMAmer試薬で処理された後、Illumina SomaSeq Automation Systemで自動化されたIllumina SomaSeq Discoveryで処理され、NovaSeq Systemでシーケンスされます。
SOMAmerプロテオミクスを用いたタンパク質キャプチャー
SOMAmer Reagents（青）には、光切断可能なリンカーとビオチンが含まれています。ストレプトアビジンビーズに結合し、特定のタンパク質をキャプチャーし、ビオチン（黄色）でタグ付けします。UV光はリンカーを破壊し、SOMAmer-タンパク質複合体を放出します。SOMAmer-タンパク質複合体は新しいビーズにキャプチャーされ、NGSを使用した定量のために溶出されます。
SomaSeq Discovery NGS変換化学
SOMAmerプロテオミクスの後、SOMAmer試薬の量はハイブリダイゼーションベースのアプローチを使用してバーコード付きシーケンス対応ライブラリーに変換されます。
リソース
イルミナのSomaSeqソリューション：プロテオミクスにおける新しい標準
SomaSeq Discoveryソリューション：プロテオミクスにおける新しい標準
NGSベースのSomaSeq Discoveryソリューションでプロテオミクスの次の時代を切り拓きましょう。ハイスループットの検出力、市場をリードする性能、統合解析を活用して、NovaSeq 6000システムおよびNovaSeq Xシステムで次のプロテオミクスのブレークスルーを加速させます。
Illumina SomaSeq Discoveryによるプレシジョンプロテオミクス
SomaSeq Discoveryによるプレシジョンプロテオミクス
SomaSeq Discoveryは、優れた特異性を備えたハイスループットのプロテオミクスの洞察を提供し、1つのサンプルから9,500を超える固有のヒトタンパク質の正確な検出を可能にします。厳密に検証されたSOMAmer試薬を搭載したこのソリューションは、ほぼ同じタンパク質であっても、研究者が自信を持ってタンパク質を同定して定量化することができ、バイオマーカーの発見と創薬の加速に役立ちます。
進化するプロテオミクスの展望：HUPO World CongressでのStuart Cordwell教授インタビュー
進化するプロテオミクスの展望
HUPO World Congressにおいて、University of SydneyのMass SpectrometryディレクターであるStuart Cordwell博士（PhD）が、プロテオミクスの今後の方向性と、再現性、広いダイナミックレンジ、およびSOMAmerベースのツールがなぜプレシジョンメディシンにおけるより効果的なバイオマーカー探索を支えるかを掘り下げて語ります。
Illumina SomaSeq Discoveryによる質量分析法の補完
プロテオミクスワークフロー：親和性と質量分析法
HUPO World Congressにおいて、University of SydneyのStuart Cordwell博士（PhD）が、質量分析法とアフィニティプロテオミクスが臨床プロテオミクスを発展させるためにどのように互いを補完するかを検証します。Cordwell博士は、臨床的な知見を共有し、スケーラブルで再現性の高いバイオマーカー探索を支援するよう設計されたNGSベースのアプローチであるSomaSeq Discoveryを紹介します。
スケーラブルなマルチオミクス解析のためのNGSベースのプロテオミクス
スケーラブルなNGSベースのプロテオミクス
HUPO World Congressにおいて、イルミナのバイスプレジデント兼アッセイ研究開発部門長を務めるFiona Kaper（PhD）が、マルチオミクスの中核となる、スケーラブルで信頼性の高いプロテオミクスのビジョンを共有します。Kaperは、質量分析法を補完するワークフローにおいて、信頼性の高い大規模なバイオマーカー探索を可能にするエンドツーエンドのNGSベースのプラットフォームであるSomaSeq Discoveryを紹介します。
ライブラリー調製 (2)
Illumina Protein Prep 9.5K, Plasma, 96-Reactions
20137827
Illumina Protein Prep 9.5K、血漿（96反応）
Illumina Protein Prep 9.5K, Serum, 96-Reactions
20137828
Illumina Protein Prep 9.5K、Serum、96反応
オートメーション (1)
Illumina SomaSeq Automation System
20116818
このパッケージは、Illumina SomaSeq Discovery assayの自動化をお考えのお客様をサポートします。SomaSeq Discovery assayプロトコールを実行するためのTecan Fluent OEM自動化システム、ロボットアクセサリー、アッセイを実行するためのコントロールソフトウェアが含まれています。
インデックスアダプター (4)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes v3, Set A, Auto (96 Indexes 96 samples)
20141196
自動化での96のサンプルのラベル付けに十分な96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set Aが1箱含まれています
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes v3, Set B, Auto (96 Indexes 96 samples)
20141197
自動化での96のサンプルのラベル付けに十分な96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set Bが1箱含まれています
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes v3, Set C, Auto (96 Indexes 96 samples)
20141198
自動化での96のサンプルのラベル付けに十分な96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set Cの箱が1箱含まれています。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes v3, Set D, Auto (96 Indexes 96 samples)
20141199
自動化での96のサンプルのラベル付けに十分な96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set Dが1箱含まれています
List Price:
Discounts:
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よくある質問（FAQ）
SOMAmer試薬は、化学修飾された小さなアプタマー（8～20 kDa）で、3次元タンパク質構造に結合します。完全な合成試薬なので、バッチ間の性能が一貫しています。また、その明確な化学的性質により、非免疫原性のターゲットや、現在は抗体で標的とされていないエピトープにも結合することができます。SOMAmerテクノロジーの詳細はこちら
SOMAmerテクノロジー（アプタマーをベースにした手法）はタンパク質のキャプチャーに使用されます。詳細については、このページの図タブにある「SOMAmerプロテオミクスを用いたタンパク質キャプチャー」をご覧ください。
ヒト血漿および血清サンプル。
SomaSeq Discoveryアッセイは、約9,500種類の固有のヒトタンパク質を検出します。このパネルは、腫瘍学、神経学、炎症、循環器学など、主要な生物学的パスウェイに関与するタンパク質の検出に使用できます。
二次解析では、タンパク質定量ファイル（ADAT）とDRAGEN QCレポートが作成されます。
二次解析の詳細については、データノーマライゼーションのテクニカルノートをお読みください。
はい、このアッセイは、Illumina SomaSeq Automation Systemを使用して自動化する必要があります。
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件
NovaSeq X Series Reagent Kits
NovaSeq Xシリーズ用試薬キットには、試薬カートリッジ、バッファーカートリッジ、フローセル、Lyo インサート、プレロードバッファー、ライブラリーチューブストリップが含まれます。
NovaSeq 6000システムのご購入
NovaSeq 6000システムで強力なハイスループットシーケンス研究を実行。データ出力と時間をプロジェクトのニーズにマッチング。
NovaSeq 6000試薬キット
すぐに使用できる充填された試薬カートリッジとフローセルからなるNovaSeq 6000システム用試薬キットです。
Illumina Connected Multiomics
Illumina Connected Multiomicsは、マルチオミクスデータ解析と大規模な視覚化を可能にする、強力で直感的なクラウドベースのソリューションです。
Illumina Stranded mRNA Prep
高精度なストランド情報により、タンパク質コーディングトランスクリプトームを正確かつバイアスなく検出する、迅速かつコスト効率に優れたワークフローです。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションに対応するライブラリー調製を実現する、高速で統合されたワークフローです。
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