Illumina Protein Prep

SOMAmerテクノロジーとイルミナのシーケンスおよび解析を備えたこの自動NGSベースのプロテオミクスソリューションは、9,500種類のヒトタンパク質を2.5日で検出し定量します。

Illumina Protein Prepはアーリーアクセスが利用できます。
革新的なソリューションのアーリーアクセスが、9.5Kのユニークなヒトタンパク質パネルを用いた血漿および血清サンプルで利用可能になりました。

概要

Illumina Protein Prepは、NGSリードアウトによるSOMAmerベースのプロテオミクスアッセイを使用して、200を超える生物学的パスウェイにわたるヒトタンパク質の探索と定量化を可能にします。 

主な特長

  • 単一の血漿または血清サンプルから、NovaSeqシステムによるNGSリードアウトで、9,500種類のユニークなヒトタンパク質ターゲットの解析が可能です

  • わずか4時間のハンズオンタイムでサンプルから結果まで2.5日未満 

  • DRAGEN二次解析とIllumina Connected Multiomicsとの統合解析

厳格な検証

Illumina Protein Prepアッセイで使用されるSOMAmer試薬は、形状特異性とポリイオン競合によって厳密に特性評価され、質量分析やELISA(酵素結合免疫吸着アッセイ)などの別の手法で確認されています。 

高感度、ダイナミック、精確

SOMAmer試薬は、約5.5%*のCVを備えた市場をリードする再現性と、10 logダイナミックレンジを超えるフェムトモーラー感度を提供します。  

*健康なドナーからのサンプルを用いて算出されたCV中央値の予測値。

ハイスループットのスケーラビリティ

ワークフロー全体が単一のプラットフォームで自動化され、シームレスに統合された二次解析パイプラインと包括的な三次解析ソリューションにより、週あたり最大340のサンプルと44のコントロールを処理するエンドツーエンドのソリューションを提供します。 

仕様

必要な製品

Illumina Protein Prep Automation System(カタログ番号20116818)。 
1回限りの購入が必要です。このアッセイは、Illumina Protein Prep Automation Systemを使用して自動化する必要があります。Illumina Protein Prepサービスパートナーの詳細については、お近くのイルミナアカウントマネージャーにお問い合わせください。 

 

ご希望のインプットサンプルタイプに基づいて、血漿または血清アッセイのいずれかを選択します。

Illumina Protein Prep 9.5K Plasma、96 Reactions(カタログ番号20137827)、またはIllumina Protein Prep 9.5K Serum、96 Reactions(カタログ番号20137828)。

 

96反応キットごとにインデックスプレートを1つ選択します。 

Illumina DNA/RNA UD Indexes(96インデックス、96サンプル) 

Set A(カタログ番号:20141196)

Set B(カタログ番号:20141197)

Set C(カタログ番号:20141198)

Set D(カタログ番号:20141199)

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アプリケーション

Illumina Protein Prepは、バイオマーカーの探索や集団遺伝学の研究など、プロテオミクスの発見や定量化アプリケーション向けに、9,464種類のユニークなヒトタンパク質の検出が可能なシーケンス対応のライブラリーを提供します。    

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

Illumina Protein Prep

Illumina Protein Prepは、Sequence by SynthesisケミストリーとSOMAmer試薬を組み合わせて、包括的なNGSベースのアッセイを実現します。ワークフロー全体がIllumina Protein Prep Automation Systemで自動化されます。

 

2
シーケンス
3
解析

Dragen Protein Quantification

完全なノーマライゼーションとタンパク質発現定量化のために、統合された二次解析パイプラインがシーケンス後に自動で起動します。

Illumina Connected Multiomics

インタラクティブな視覚化と統計解析機能を備えた強力なオミクス解析ソフトウェアで、より深い生物学的洞察を解き放つことができます。

 

プロジェクトの推奨事項

装置 推奨サンプル数 リード長
NovaSeq 6000システム

S4 35cでフローセルあたりの反応192回

40Mリード、1 ×15

NovaSeq Xシステム

10B 100cでフローセルあたりの反応192回
25B 100cでフローセルあたりの反応384回

40Mリード、1 ×15

関連するアプリケーションと手法

ドキュメント

製品資料
サポートドキュメント

この製品では専用サポートセクションは現在ご利用いただけません

Overview of the Illumina Protein Prep solution

Illumina Protein Prep ソリューションの概要

ヒト血清または血漿サンプルをSomaScanアッセイに投入してから、Illumina Protein Prep Automation Systemで自動化されたライブラリー調製が行われ、最終的にNovaSeqシステムでシーケンシングされます。

Protein-capture using the SOMAScan assay

SOMAScanアッセイを使用したタンパク質のキャプチャー

SOMAmer Reagents(青)には、光切断可能なリンカーとビオチンが含まれています。ストレプトアビジンビーズに結合し、特定のタンパク質をキャプチャーし、ビオチン(黄色)でタグ付けします。UV光はリンカーを破壊し、SOMAmer-タンパク質複合体を放出します。SOMAmer-タンパク質複合体は新しいビーズにキャプチャーされ、NGSを使用した定量のために溶出されます。

lllumina Protein Prep NGS conversion chemistry

lllumina Protein Prep NGS変換ケミストリー

SomaScanアッセイの後、SOMAmer試薬の量はハイブリダイゼーションベースのアプローチを使用してバーコード付きシーケンス対応ライブラリーに変換されます。

よくある質問(FAQ)

SOMAmerテクノロジー(アプタマーをベースにした手法)はタンパク質のキャプチャーに使用されます。詳細については、このページの図タブにある「SOMAScanアッセイを使用したタンパク質のキャプチャー」をご覧ください。

ヒト血漿および血清サンプル。

Illumina Protein Prep 9.5Kアッセイは、9,464種類のユニークなヒトタンパク質を検出します。 このパネルは、腫瘍学、神経学、炎症、循環器学など、主要な生物学的経路に関与するタンパク質の検出に使用できます。

二次解析では、タンパク質定量ファイル(ADAT)とDRAGEN QCレポートが作成されます。

二次解析の詳細については、データノーマライゼーションのテクニカルノートをお読みください。 

はい。このアッセイは、Illumina Protein Prep Automation Systemを使用して自動化する必要があります。

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NovaSeq Xシリーズのご購入

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。

NovaSeq Xシリーズ試薬キット

NovaSeq Xシリーズ用試薬キットには、試薬カートリッジ、バッファーカートリッジ、フローセル、Lyoインサート、プレロードバッファー、ライブラリーチューブストリップが含まれます。

NovaSeq 6000試薬キット

すぐに使用できる充填された試薬カートリッジとフローセルからなるNovaSeq 6000システム用試薬キットです。

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