Illumina UD Indexes

ユニークデュアル（UD）インデックスにより、スループットの向上とコスト削減メリットをもたらすマルチプレックス可能なハイクオリティなライブラリーの調製が可能になります。

2025年1月30日は、IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A–D（カタログ番号20027213、20027214、20042666、20042667）およびIDT for Illumina RNA UD Indexes Sets A–D（カタログ番号20040553、20040554、20040555、20040556）をご注文いただける最終日です。

Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A–D（カタログ番号20091654、20091656、20091658、20091660）およびIllumina RNA UD Indexes Sets A–D（カタログ番号20091655、20091657、20091659、20091661）への移行を推奨します。

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概要
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概要

Illumina UD Indexesにより、データ品質を損なうことなく、ラン1回あたりのサンプルのシーケンスを大幅に増加させます。

主な特長

384のユニークデュアルインデックス（UDI）でマルチプレックスを行うことによりシーケンスコストを削減
インデックスホッピングのレベルと影響を最小限に抑える
解析中のデマルチプレックス精度を向上
1回のランで複数のサンプルを同時にシーケンスすることでスループットを向上

機能拡張

マルチプレックスのためのライブラリー調製時にUDIを使用することで、イルミナのシーケンスプラットフォーム全体で、最も正確なデマルチプレックスとシーケンスを確かなものにします。お客様のニーズを満たすため、イルミナは、装置とライブラリー調製キットの両互換性を拡張するUDIを提供しています。

仕様

システム	MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, MiniSeq System, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NextSeq 500システム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム
作用機序	ライゲーションベースのアダプター：IDT for Illumina TruSeq RNA and DNA UD Indexes v2、PCRベースのアダプター：Illumina DNA/RNA UD Indexes Set A-D and IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set A-D、ライゲーションおよび PCR ベースのアダプター Illumina RNA UD Indexes Set A-D and IDT for Illumina RNA UD Indexes Set A-D
マルチプレックス	Illumina UD Indexes and IDT for Illumina UD Indexes: Illumina TruSeg Indexes用最大384プレックスIDT：最大96プレックス

必要な製品

別途、ライブラリー調製、濃縮、およびプローブパネルの試薬を注文する必要があります。

互換性のあるライブラリー調製キット：
Illumina RNA UD Indexes Set A-D and IDT for Illumina RNA UD Indexes Set A-D

Illumina Stranded Total RNA Library Prep
Illumina Stranded mRNA Library Prep

Illumina DNA/RNA UD Indexes Set A-D and IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set A-D

Illumina DNA Prep
Illumina DNA Prep with Enrichment
Illumina DNA PCR-Free Prep
Illumina RNA Prep with Enrichment
Illumina RNA Prep
Nextera XT DNA Library Preparation Kit

IDT for Illumina TruSeq RNA UD Indexes v2

TruSeq Stranded mRNA
TruSeq Stranded Total RNA

IDT for Illumina TruSeq DNA UD Indexes v2

TruSeq DNA Nano
TruSeq DNA PCR-Free

/ 件

図

ユニークデュアルインデックスは完全にユニークインデックスを持つ

リソース

インデックスホッピングの洞察 | イルミナウェビナー

Gary Schroth, PhDが、インデックスホッピングについて紹介し、ライブラリー調製のベストプラクティスに従うことでインデックスホッピングレベルを最小限に抑える方法と、ユニークデュアルインデックスの組み合わせを使用してインデックスホッピングリードを削除する方法について説明します。

正確なデマルチプレックス

ユニークデュアルインデックスは、他のインデックス戦略に比べても最も高い精度で、サンプルあたりのコストやシーケンスライブラリーを削減します。

シーケンス：合成によるシーケンス（SBS）の紹介

イルミナのシーケンスワークフローを3次元で詳細に探索します。サンプル調製からクラスター生成、独自のSBSプロセスによるフローセルでのシーケンス、データ解析までを行います。

インデックス誤割り当ての影響

インデックススイッチングに関連するシーケンスリードの誤割り当てを回避するためのヒントとベストプラクティス。

インデックスアダプター (18)

Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20091655

Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples) には、96サンプルおよびRNA Index Anchorプレートのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製試薬は別途ご購入ください。

List Price:

Discounts:

Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20091657

Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルおよびRNA Index Anchorプレートのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製試薬は別途ご購入ください。

List Price:

Discounts:

Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20091659

Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルおよびRNA Index Anchorプレートのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製試薬は別途ご購入ください。

List Price:

Discounts:

Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20091661

Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルおよびRNA Index Anchorプレートのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製試薬は別途ご購入ください。

List Price:

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

List Price:

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

List Price:

Discounts:

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

List Price:

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20040553

96サンプルおよびRNAインデックスアンカープレートのラベリングに十分な96、10 bpインデックスを含みます。Illumina Stranded Total RNA PrepおよびStranded mRNA Prep Kitと併用します。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。

List Price:

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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20040554

List Price:

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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20040555

List Price:

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IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20040556

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

List Price:

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

List Price:

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042666

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

List Price:

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042667

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040871

96サンプルにラベルを貼るのに十分な96、8 bpのインデックスを含み、TruSeq Stranded mRNAおよびTruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kitと互換性があります。バージョン2には、プレート20022371内の192のインデックスオリゴのうち8つの改善が含まれており、残りの184は変更されていません。ライブラリー調製およびプローブパネルは別売りです。

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IDT for Illumina – TruSeq DNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)

20040870

96サンプルのラベリングに十分な96個の8 bpのインデックスを含み、TruSeq NanoおよびTruSeq PCR-Free Library Prep Kitと互換性があります。バージョン2には、プレート20022370内の192のインデックスオリゴのうち8つの改善が含まれており、残りの184は変更されていません。ライブラリー調製およびプローブパネルは別売りです。

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よくある質問（FAQ）

イルミナアダプターシーケンスドキュメントには、インデックス付きアダプターシーケンスとその他すべてのアダプターシーケンスがリスト化されています。

はい。アンカープレートは、RNAライブラリー調製キットに必要であり、Illumina RNA UD Indexes Sets A-DおよびIDT for Illumina RNA UD Indexes Sets A-Dにすでに含まれています。

インデックスホッピングのレベルは、Illumina DNA/RNA UD Indexesで変わりませんが、インデックスホッピングされたリードは、バイオインフォマティクス的にデマルチプレックスデータから除去することができます。

ユニークデュアルインデックスは、ライブラリー調製中に、DNAの各断片の両端に完全にユニークで無関係なインデックス配列を追加します。これにより、シングルランにおいて、多数のライブラリーをプーリングし、同時にシーケンスできます。他のインデックス手法と比較して、ユニークデュアルインデックスは、ホップされたリードをフィルタリングすることでインデックスホッピングを軽減します。

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