NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Plus Enrichmentは、ヒト全エクソームシーケンス（WES）実現に向けた費用対効果が高く、信頼できるソリューションを提供します。このキットの内容：
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
包括的で最新のエクソームエンリッチメントパネルを含む、高性能で高速かつ信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスソリューションです。
6.5時間
アッセイ時間
約2時間
ハンズオンタイム
50～1,000 ngの高品質ゲノムDNA（直接血液および唾液については、リファレンスガイドを参照）
インプット量
概要
単一のベンダーによるシンプルなワークフローソリューション
この全エクソームシーケンスキットには、ライブラリー調製およびハイブリダイゼーション試薬、クリーンアップ/サイズ選択ビーズ、インデックスが含まれます。このキットには、Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panelも含まれており、公開データベースで報告されたバリアントのターゲット領域カバレッジが改善されています。
仕様
| アッセイ時間 | 6.5時間 |
|---|---|
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
| コンテンツ仕様 | 37.5 Mbのコーディングコンテンツ（RefSeq、CCDS、ClinVarおよびACMG病原性/病原性の可能性の高いバリアントの99%以上、COSMIC Cancer Gene Census）、OMIM |
| 説明 | 費用対効果と信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスのための最新のエクソームコンテンツの集中エンリッチメントプローブパネルを備えた、エンリッチメントワークフローによる高速で使いやすいライブラリー調製。 |
| ハンズオンタイム | 約2時間 |
| インプット量 | 50～1,000 ngの高品質ゲノムDNA（直接血液および唾液については、リファレンスガイドを参照） |
| システム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム及びハイブリッドキャプチャー化学 |
| 手法 | Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment |
| マルチプレックス | 最大12プレックスの濃縮前プーリングをテスト。キット構成は、最大192サンプルのマルチプレックスをサポートします。最大384まで可能です。 |
| Nucleic acid type | DNA |
| オンターゲットリード | 内部テストの平均パフォーマンスに基づき平均約90% |
| サンプルタイプ | Blood, Saliva |
| Species category | ヒト |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| 均一性 | 91%以上（5 Gbで20xのカバレッジ）内部テストの平均パフォーマンスに基づく |
| バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
必要な製品
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment Kitには、ライブラリー調製、濃縮、濃縮プローブパネル、精製ビーズ、インデックスアダプター試薬が含まれます。必要に応じて、別のインデックスセットを選択します。
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panelは、ミトコンドリアDNAバリアントの濃縮とシーケンスを可能にするオプションの固定コンテンツスパイクインパネルです。
直接血液をインプットするには、Flex Lysis Reagent Kitが必要です。
Infinium MIDI Heatblock Insertは、SciGene HybEx Microheatingシステムに適合し、濃縮ステップに必要です。
/
結果
アプリケーション
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、サンプルからレポート作成までのサポートを可能にする、迅速で包括的なエンドツーエンドの全エクソームシーケンスソリューションです。
ワークフローの例
ライブラリー調製
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
解析
すべての国で利用できるわけではありません。Illumina Connected Insightsは、第三者のナレッジソースへのAPIコールを介してユーザー定義の三次解析をサポートします。
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 2000 System | Samples per run (by flow cell type): P2: 19, P3: 57 (based on 50× mean target coverage, 42M reads, 4.2 Gb of data) |
2 × 101 bp |
| NovaSeq 6000 System | Samples per run by flow cell type: SP: 34, S1: 69, S2: 176, S4: 428 based on 50× mean target coverage, 42M reads, 4.2 Gb of data. Note: S4: 428 requires NovaSeq Xp workflow or additional indexes. |
2 × 101 bp |
関連するアプリケーションとメソッド
Whole-exome sequencing is used to investigate protein-coding regions of the genome to uncover genetic influences on disease and population health.
様々な複雑な遺伝的疾患の研究を加速する、アレイおよび次世代シーケンスの包括的ソリューション。
イルミナのシーケンステクノロジーとマイクロアレイテクノロジーは、DNAからRNA解析、エピジェネティクスなど、がんゲノム研究の応用分野を幅広くサポートしています。
本製品の用途例
ドキュメント
製品資料
比較する
| Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | Illumina DNA Prep with Enrichment | |
|---|---|---|
| アッセイ時間 | 6.5時間 | 約6.5時間 |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る |
| コンテンツ仕様 | 37.5 Mbのコーディングコンテンツ（RefSeq、CCDS、ClinVarおよびACMG病原性/病原性の可能性の高いバリアントの99%以上、COSMIC Cancer Gene Census）、OMIM |
エクソーム：45 Mbのエクソンコンテンツ（RefSeq、CCDS、およびEnsemblコーディングコンテンツ98％以上） カスタム：対象ゲノムコンテンツ0.5～15 Mb 固定パネル：コンテンツはパネルによって異なります。 |
| 説明 | 費用対効果と信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスのための最新のエクソームコンテンツの集中エンリッチメントプローブパネルを備えた、エンリッチメントワークフローによる高速で使いやすいライブラリー調製。 | 低いDNAインプットやさまざまなサンプルタイプから、全エクソーム、カスタム、固定パネルターゲットシーケンスなど、さまざまな実験用のシーケンスライブラリーを約6.5時間で調製します。 |
| ハンズオンタイム | 約2時間 | 約2時間, 約2時間 |
| インプット量 | 50～1,000 ngの高品質ゲノムDNA（直接血液および唾液については、リファレンスガイドを参照） | 高品質ゲノムDNA 10～1,000 ng、FFPE DNA 50～1,000 ng （血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください）。 |
| システム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム及びハイブリッドキャプチャー化学 | ビーズ結合トランスポソームおよびハイブリッドキャプチャー化学 |
| 手法 | Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment | Custom sequencing, Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment |
| マルチプレックス | 最大12プレックスの濃縮前プーリングをテスト。キット構成は、最大192サンプルのマルチプレックスをサポートします。最大384まで可能です。 | 最大384のユニークデュアルインデックスを使用可能。最大12プレックスの濃縮前プーリングをテスト。 |
| Nucleic acid type | DNA | DNA |
| オンターゲットリード | 内部テストの平均パフォーマンスに基づき平均約90% | エクソームパネルでは≥85%（サンプルデータセットの結果。実際のパフォーマンスは異なる場合があります） |
| サンプルタイプ | Blood, Saliva | Blood, Low-input samples, FFPE tissue, Saliva |
| Species category | ヒト | Other, ヒト |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー |
| 均一性 | 91%以上（5 Gbで20xのカバレッジ）内部テストの平均パフォーマンスに基づく | 90%以上（4 Gbで20xのカバレッジ、エクソームパネルの場合） |
| バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
Exome 2.5パネルの性能向上
ライブラリーは、Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentを使用して、1.5時間または16時間のハイブリダイゼーション時間で付属のExome 2.5 Panelまたは1.5時間のハイブリダイゼーション時間でIllumina Exome Panel（IEP, 20020183）を使用して構築および濃縮されました。濃縮されたライブラリーをNovaSeq 6000システムでシーケンスし、DRAGEN Enrichment Appを用いて解析しました。
シリコにおける高いデータベースターゲットカバレッジ率
Exome 2.5 PanelおよびExome Panelのベッドファイルを、リストされた公開データベースと比較し、重複率を決定し、報告しました。
公開データベースにおける疾患関連バリアントの優れたカバレッジ
1.5時間（オレンジ）または16時間（青）のハイブリダイゼーション時間を使用したIllumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、公開データベースの≥ 20倍のターゲットで高い平均カバレッジ率を示しています。
リソース
エクソームキット (2)
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, (S) Tagmentation Set B (96 Samples, 12-plex)
20077595
Illumina DNA Prep with Enrichmentライブラリー調製および濃縮試薬、Twist Bioscience for Illumina Exome 2.0 Plus Panel、Illumina Purification Beads、IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set B、96ライブラリーの全エクソーム濃縮のためのタグメンテーション（8、12プレックス濃縮反応）が含まれます。
List Price:
Discounts:
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, (S) Tagmentation Set D (96 Samples, 12-plex)
20077596
Illumina DNA Prep with Enrichmentライブラリー調製および濃縮試薬、Twist Bioscience for Illumina Exome 2.0 Plus Panel、Illumina Purification Beads、IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set D、96ライブラリーの全エクソーム濃縮のためのタグメンテーション（8、12プレックス濃縮反応）が含まれます。
List Price:
Discounts:
パネル (1)
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel
20093180
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel、96サンプル用の32 ulの試薬が含まれます（ハイブリダイゼーション反応8回、1反応あたり12サンプル）。このパネルは、Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus EnrichmentキットのExome 2.0 Plus Panelと併用でき、ヒトエクソームとミトコンドリアDNAの両方を全ゲノムライブラリーから混ぜ合わせて濃縮することができます。Mitochondrial Panelは、Exome 2.0 Plus Panel製品の付属製品として販売されています。
List Price:
Discounts:
アクセサリー製品 (8)
Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)
20018706
Illumina DNA PrepおよびIllumina DNA Prep with Enrichmentで血液サンプルを処理するための試薬が含まれます。ライブラリー調製、濃縮、濃縮プローブパネル、およびインデックスアダプター試薬は別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Infinium MIDI Heatblock Insert
BD-60-601
Nextera Flex for Enrichmentのハイブリダイゼーションステップに必要なSciGene Hybex Microheatingシステム用のヒートブロックインサートです。
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 100mL
20060057
ライブラリーのクリーンアップとサイズ選択用のビーズ100 mL容器が1個含まれています。ライブラリー調製試薬および濃縮試薬、プローブパネル、インデックスは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 400mL
20060058
ライブラリーのクリーンアップとサイズ選択用のビーズ100 mL容器4個が含まれます。ライブラリー調製試薬および濃縮試薬、プローブパネル、インデックスは別売りです。
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よくある質問
はい、10～49 ngのgDNAインプットを使用できます。しかし、このプロトコールでは、最終のプレエンリッチメントライブラリーの収量が< 50 ngにノーマライズされないため、エンリッチメント前後のライブラリーの定量化とノーマライゼーションが必要です。
このプロトコールは、EDTA採血管に採取した新鮮血液で検証されています。他の抗凝固薬も使用することができますが、このキットを使用する際には保証されません。
このプロトコールは、Oragene DNA Saliva採取チューブでのみ採取された唾液について検証されています。
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panelは、ミトコンドリアゲノム（chrM）の16,659塩基対（bp）と37の遺伝子をカバーするように設計されたオプションの固定コンテンツパネルで、ミトコンドリアDNA（mtDNA）バリアントの濃縮とシーケンスを可能にします。このパネルをIllumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentプロトコールのスパイクインパネルとして使用し、実験にChrMのカバレッジを追加します。
旧称Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichmentは、現在、Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment（カタログ番号 20077595および20077596）に名称が変更されています。エクソームパネルオリゴは変更されていませんが、含まれるインデックスはイルミナDNA/RNA UDインデックスに 更新されています。
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結果
MiSeq Reagent Kit v3
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
90分間のワークフローで、DNAインプットの必要性が低く、小さなゲノム、PCRアンプリコン、プラスミド、cDNAシーケンス用のDNAライブラリーを調製できます。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
Illumina DNA Prep with Enrichment
幅広いターゲットシーケンスアプリケーションにシーケンス対応DNAライブラリーを提供する、高速で統合されたワークフロー。
TruSight Hereditary Cancer Panel
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
Illumina UD Indexes
ユニークデュアル（UD）インデックスにより、スループットの向上とコスト削減メリットをもたらすマルチプレックス可能なハイクオリティなライブラリーの調製が可能になります。
Illumina RNA Prep with Enrichment
幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス配列ライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフロー。
製品情報のリクエスト
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