このパネルは、ヒトおよび動物のリザーバーから得られた既知および新規のコロナウイルス225種の特性評価とゲノムサーベイランスをサポートします。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Pan-Coronavirus Panel（Pan-CoV）は、既知のヒトおよび動物コロナウイルスと、ヒトに感染する可能性のある近縁の新型コロナウイルスの検出とシーケンスを可能にします。これには、複数のコロナウイルス株やさまざまな既知の動物宿主のリファレンスゲノムにまたがるハイブリッドキャプチャーオリゴが含まれています。
Illumina RNA Prep with Enrichmentと組み合わせることで、Pan-Coronavirus Panelは、既知の225種類のヒトおよび動物コロナウイルスの全ゲノムシーケンス（WGS）を可能にします。ターゲットエンリッチメントアプローチは、ウイルスゲノム全体の変異やバリアントをキャプチャーし、新型コロナウイルス株のシーケンスや株間の組み換えの検出を可能にします。
このパネルは、以下のような複数のアプリケーションに使用できます。
Pan-Coronavirus Panelは、ライブラリー調製・ターゲットエンリッチメント・次世代シーケンス（NGS）・強力なデータ解析を含む包括的なワークフローに統合でき、ロバストな信頼性の高いウイルス結果を得るためのシンプルな手段を提供します。
| アッセイ時間 | ライブラリー調製時間9時間未満 |
|---|---|
| 自動化機能 | 自動液体分注システム |
| 説明 | Pan-Coronavirus Panelは、さまざまな動物宿主における200を超える既知および新型コロナウイルス株の検出と全ゲノムシーケンスを可能にする統合ワークフローの一部です。 |
| ハンズオンタイム | ライブラリー調製時間<2時間 |
| インプット量 | 10～100 ng |
| システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, MiniSeq System |
| 作用機序 | オンビーズタグメンテーションとそれに続くシングルハイブリダイゼーションステップ |
| 手法 | 全ゲノムシーケンス, ターゲット濃縮 |
| マルチプレックス | ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル |
| 核酸の種類 | RNA |
| 生物種カテゴリー | ウイルス |
| ストランド特異性 | ストランド情報なし |
| テクノロジー | シーケンス |
Illumina RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation（16または96サンプル）は、インデックス付きアダプターとともに別途注文する必要があります。イルミナDNA/RNA インデックスセットA、B、C、またはDをご使用いただけます。
IDT for Illumina DNA/RNA UD IndexesのセットA～D（20027213、20027214、20042666、20042667）は販売終了となりましたので、Illumina DNA/RNA UD IndexesのセットA～D（20091654、20091656、20091658、20091660）のご注文をお勧めしています。
ハイブリッドキャプチャーによるターゲットエンリッチメントにより、既知のヒトおよび動物コロナウイルス225種と、密接に関連する新型コロナウイルスの検出とシーケンスが可能になり、動物リザーバーのサーベイランス・感染の追跡・治療やワクチンの開発が可能になります。
Pan-Coronavirus Panel
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| MiSeqシステム | MiSeq試薬キットv2を使用した6～12サンプル（1～2Mリード/サンプル） |
2 x 150 bp |
| NextSeq 550システム | NextSeq 500/550中間出力キットを使用した65～130サンプル（1～2Mリード/サンプル） |
2 x 150 bp |
| NextSeq 1000システム | P2試薬キットを使用した100～200サンプル（1～2Mリード/サンプル） |
2 x 150 bp |
| NextSeq 2000システム | P2試薬キットを使用した100～200サンプル（1～2Mリード/サンプル） |
2 x 150 bp |
NGSは、コロナウイルスやその他の新たな感染症病原体の新規株を特定することにより、効果的なゲノムサーベイランス戦略をサポートします。
NGSは、新型コロナウイルスのバリアントの同定、COVID-19伝播トラッキングなどを可能にします。コロナウイルスシーケンスの様々な目的に応じたNGS法を比較してください。
NGSを使用して、新規の微生物の発見、感染拡大の監視、食料源の分析などを行うことができます。
| Pan-Coronavirus Panel | Viral Surveillance Panel | イルミナ呼吸器ウイルス濃縮キット | |
|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | ライブラリー調製時間9時間未満 | ライブラリー調製時間9時間未満 | ライブラリー調製時間9時間未満 |
| 自動化機能 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
| 説明 | Pan-Coronavirus Panelは、さまざまな動物宿主における200を超える既知および新型コロナウイルス株の検出と全ゲノムシーケンスを可能にする統合ワークフローの一部です。 | Illumina RNA Prep with EnrichmentによるViral Surveillance Panelは、66種類のRNAおよびDNAウイルス病原体のウイルス感染拡大の検出とモニタリングをサポートする最適化されたワークフローを提供します。 | SARS-CoV-2およびその他の一般的な呼吸器系ウイルスを検出および解析するための合理化されたワークフロー。アグノスティックなデザインにより、関心のある複数のサンプルタイプにわたる病原性ウイルスの広範な同定が可能です。 |
| ハンズオンタイム | ライブラリー調製時間<2時間 | ライブラリー調製時間<2時間 | ライブラリー調製時間<2時間 |
| インプット量 | 10～100 ng | 10～100 ng | 10～100 ng |
| システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, MiniSeq System | MiSeqシステム, iSeq 100システム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, MiniSeq System, MiSeq i100 Plusシステム, MiSeq i100システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, MiniSeq System, MiSeq i100 Plusシステム, MiSeq i100システム |
| 作用機序 | オンビーズタグメンテーションとそれに続くシングルハイブリダイゼーションステップ | オンビーズタグメンテーションとそれに続くシングルハイブリダイゼーションステップ | オンビーズタグメンテーションとそれに続くシングルハイブリダイゼーションステップ |
| 手法 | 全ゲノムシーケンス, ターゲット濃縮 | ターゲットDNAシーケンス, 全ゲノムシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 | ターゲットDNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 |
| マルチプレックス | ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル | ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル | ユニークデュアルインデックスで1回のランで最大384サンプル |
| 核酸の種類 | RNA | DNA, RNA | DNA, RNA |
| 生物種カテゴリー | ウイルス | ウイルス | ヒト, ウイルス |
| ストランド特異性 | ストランド情報なし | ストランド情報なし | |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
実験に必要なカバレッジに到達するために必要な試薬とシーケンスランを決定するのに役立つ計算機。
パネルが対象とするコロナウイルス株
Pan-Coronavirus Panelには、ヒトおよび動物の既知のコロナウイルス225種をキャプチャーするハイブリッドキャプチャーオリゴが含まれています。
宿主関連コロナウイルスゲノム
Pan-Coronavirus Panelには、さまざまな既知の動物宿主が含まれています。
コロナウイルス科リードのエンリッチメント
Pan-Coronavirus Panelは、さまざまなウイルスコピー数インプットでテストされたすべてのライブラリーでコロナウイルス科リードの濃縮に成功しました。
コロナウイルスゲノムカバレッジの向上
Pan-Coronavirus Panelによる濃縮後の10 ng UHRにおける合成ウイルスRNAコントロール（SARS-CoV-2およびHCoV229E）のカバレッジ中央値。リード深度（上）とリード長（下）の増加により、ゲノムカバレッジが改善されました。リード長は36、74、100、149 bpにトリミングしました。
Pan-Coronavirus Panel, RUO 96 Rxns
20088155
イルミナRNA Prep with Enrichmentキットとペアにすると、32、3プレックスの濃縮反応に十分なウイルスサーベイランスパネルが含まれます。ライブラリー調製およびエンリッチメントキットとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (16 Samples)
20040536
16のライブラリー（16、1プレックスエンリッチメント反応）を調製および濃縮するための試薬が含まれます。エンリッチメントプローブパネル、精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (96 Samples)
20040537
96ライブラリー（32、3プレックスエンリッチメント反応）を調製および濃縮するための試薬が含まれます。エンリッチメントプローブパネル、精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027213
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027214
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042666
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042667
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
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製品名
数量
単価
製品名
カタログ番号
量
単価
パネルはエンリッチメントプローブで構築されており、ほとんどのバリアントを効果的にキャプチャーできます。さらに、Pan-Coronavirus Panelは、さまざまな動物由来の225種類のコロナウイルスの遺伝型を濃縮するように設計されており、ほとんどの新型コロナウイルスをキャプチャーすることが期待されます。例えば、Pan-Coronavirus Panelは、Omicronバリアントより前に設計されましたが、高いカバレッジで全ゲノムを濃縮することが明らかになりました（詳細はデータシートを参照）。
はい、Pan-Coronavirus Panelは、環境サンプルやさまざまな動物由来のサンプルに対応するように設計されています。実際、このパネルは、コウモリ・廃水・コロナウイルスの宿主候補など、多様性のあるサンプルタイプからコロナウイルスのシーケンスに使用されます。パネルを最大限に活用するには、入手可能な最高品質のRNAを使用してください。
無料のDRAGEN Microbial Enrichment Plusがあり、コンティグを組み立て、ゲノムカバレッジ/深度の解析など、さまざまな出力結果を得ることができます。
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
包括的で最新のエクソームエンリッチメントパネルを含む、高性能で高速かつ信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスソリューションです。
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジ形式で提供され、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフローセル構成を備えています。
ユニークデュアル（UD）インデックスにより、スループットの向上とコスト削減メリットをもたらすマルチプレックス可能なハイクオリティなライブラリーの調製が可能になります。
低DNAインプット要件で、小規模ゲノム、PCR アンプリコン、プラスミド、cDNA シーケンス用のDNAライブラリーを調整するための90分のワークフローを提供します。
幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス配列ライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフロー。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
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