全ゲノムシーケンス(WGS)
全ゲノムシーケンスとは
全ゲノムシーケンス（WGS）とは、全ゲノム解析の包括的手法です。ゲノム情報は、遺伝性疾患の同定、がんの進行を促す変異の特性の解明、疾患の感染拡大状況の追跡などに役立っています。シーケンスコストの低下と今日のシーケンサーによる大量のデータ作成能力により、全ゲノムシーケンスはゲノム研究の強力なツールとなっています。
この手法は一般的にヒトゲノムのシーケンスに関連していますが、次世代シーケンサー（NGS）技術の拡張性と柔軟性は、農業上重要な家畜、植物、疾患に関連する微生物など、あらゆる種のシーケンスにも同様に有用です。
全ゲノムシーケンスのメリット
- ゲノムの高解像度で塩基単位の全体像を取得
- ターゲット化したアプローチでは見逃される可能性のある大きなバリアントと小さなバリアントの両方を捕捉
- 遺伝子の発現や制御機構をさらに追跡調査するための潜在的な原因バリアントを同定
- 大量のデータを短時間で提供し、新規ゲノムの確立をサポート
妥協のないゲノムの捉え方
エクソームシーケンスやターゲット化されたリシーケンスなど、ゲノムの限られた部分を解析するフォーカスアプローチとは異なり、全ゲノムシーケンスはゲノム全体の包括的像を提供します。原因バリアントの同定や新規ゲノムの確立などの探索に最適です。
全ゲノムシーケンスは、一塩基変異（SNV）、挿入・欠失、コピー数変化、および構造バリアントを検出することができます。近年の技術革新により、最新のゲノムシーケンサーは、これまで以上に効率的に全ゲノムシーケンスを行うことができます。
全ゲノムシーケンスにおける新たなアプリケーションと進歩
イルミナの著名なサイエンティストであるGary Schrothが、イルミナの全ゲノムシーケンスソリューションにおける最新の進歩と、新しいゲノミクステクノロジーの大きな可能性について語ります。
Webセミナーへのアクセス全ゲノムシーケンスの主要な手法
大規模全ゲノムシーケンス
ヒトや動植物などの大型ゲノム（5 Mbより大きい）のシーケンスにより、疾患研究や集団遺伝学に貴重な情報を提供することができます。
小さいゲノムの全ゲノムシーケンス
小型ゲノムシーケンス（5 Mb以下）は、バクテリア、ウイルス、またはその他微生物の全ゲノムをシーケンスするものです。細菌培養を必要とせず、研究者はNGSを使用して何千もの小さな生物のシーケンスを並行して実行できます。
De Novoシーケンス
De novoシーケンスとは、リファレンスシーケンスがない新規ゲノムをシーケンスすることです。NGSは、あらゆる生物種の迅速かつ正確な特性解析を可能にします。
フェージングシーケンス
フェージングシーケンス（ゲノムフェージング）は、相同染色体上のアリルを識別し、全ゲノムハプロタイプを得ることができます。この情報は、遺伝性疾患の研究にとって重要視されます。
ヒト全ゲノムシーケンス
これまで困難だったヒト全ゲノムシーケンスが、かつてないほどシンプルになりました。それは、私たちの遺伝コードを最も詳しく知ることができるものです。
注目の全ゲノムシーケンスワークフロー
この使いやすい3ステップWGSワークフローは、研究室に完全な機能と迅速なソリューションを提供し、すべてのバリアントクラスについて、ゲノム全体にわたる高品質な洞察を提供するものです。
主な製品
Illumina DNA Prep
A fast, integrated workflow for a wide range of applications, from human whole-genome sequencing to amplicons, plasmids, and microbial species.
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NovaSeq Reagent Kit
Reagent kits for the NovaSeq 6000 System provide ready-to-use cartridge-based reagents for cluster generation and SBS.
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MiSeq Reagent Kit
Optimized chemistry to increase cluster density and read length, and improve sequencing quality scores, compared to earlier MiSeq reagent kit versions.
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BaseSpace Sequence Hub and iCredits
Data management and simplified bioinformatics for labs getting started and for rapidly scaling next-generation sequencing operations.
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マルチオミクスで発見力が何倍も向上します
マルチオミクスを使用して、遺伝型と表現型のマッチング精度を高め、単一のオミクスアプローチでは得られない完全な細胞のリードアウトを取得する方法をご覧ください。
マルチオミクスの概要
サイエンティストのWGS使用法
COVID-19感受性の遺伝学を研究する
イルミナは、Genomics Englandが主導する、重症および軽症のCOVID-19患者のゲノムを比較する英国全体の研究に全ゲノムシーケンスを提供します。
マイクロバイオーム研究の時代の到来
全ゲノムショットガンシーケンスとトランスクリプトミクスは、研究者や製薬会社に創薬や開発の精度を高めるためのデータを提供します。
WGSによる白血病サンプルの解析
New England Journal of Medicine誌の研究により、WGSを白血病サンプルの評価に使用すると、核型分析または蛍光in situハイブリダイゼーションに比べてより正確な結果をより短時間で得られることがわかりました。
注目のウェビナー
WGSの新たなアプリケーションと進歩
イルミナの著名なサイエンティストであるGary Schrothが、最新のWGSの進歩と、新しいゲノミクステクノロジーの大きな可能性について語ります。
全ゲノムシーケンスの進歩
インフォマティクスの改善が、どのように全ゲノムシーケンスを進歩させているか、イルミナの完全ロングリードに関する最新情報をご覧ください。
サンプルからゲノム洞察まで
イルミナのソリューションについて、ソフトウェアおよびインフォマティクス製品管理担当VPのMile Leliveltが、重要なゲノム洞察を得るための情報をご紹介します。
補足資料
イルミナのシーケンスプラットフォーム
当社の革新的な次世代シーケンサー（NGS）プラットフォームは、卓越したデータ品質と精度を大規模に提供します。ベンチトップシーケンサーと生産規模のシーケンサーを表示し、適切なプラットフォームの選択に役立つリソースを見つけてください。
Illumina Complete Long Readのご紹介
この新技術は、ゲノムの最も暗い角でも、より明るい光を放ちます。Illumina Complete Long Readは、ゲノムの最も困難な領域の解明に役立ちます。1つのプラットフォームからショートリードとロングリードを可能にすることでロングリードシーケンスへのアクセスを容易にして効率化できます。
テクノロジーと製品について学ぶ
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お客様の分野に合ったコンテンツと製品を見つける
「お気に入りの分野を選択」は、特定分野に関連する詳細なコンテンツや製品をすぐに見つけることができる使い勝手の良い機能です。この設定はIllumina.comのすべてのページの上部から行うことができます。
PhiX Control v3 Libraryとは
このライブラリーは、小型でよく知られているバクテリオファージゲノムであるPhiXに由来しています。ランの品質モニタリングに最適なシーケンスコントロールです。
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