2020年5月13日
英国政府は、COVID-19にかかりやすい遺伝的要因を明らかにすることを目的とした新しいヒトゲノムイニシアチブを発表しました。このイニシアチブは、イルミナの長期パートナーであるGenomics Englandが主導し、Genetics of Mortality in Critical Care(GenOMICC)コンソーシアムおよびNational Health Service(NHS)と協力しています。イルミナは、この取り組みのためにシーケンスを提供し、ゲノミクスを通じてパンデミックの理解を深めることを非常に誇りに思っています。
COVID-19の世界的パンデミックは一部の人にとって生命を脅かすが、すべての人が感染しているわけではないため、ヒトゲノム全体を読むことで、各人のウイルスに対する反応に影響を与えるバリエーションを特定できる可能性があります。この研究では、COVID-19の集中治療室に入院した英国全土の患者20,000人のゲノムを比較します。これらのゲノムは、100,000 Genomes Projectのゲノムや、軽度から中等度の疾患を持つ患者の15,000の新しいゲノムシーケンスと比較されます。イルミナは35,000のゲノムすべてをシーケンスし、そのコストを共有します。
先月初旬、GenOMICC研究は英国国立衛生研究所のCOVID緊急プロジェクトの一つとみなされ、すでに複数の病院から重症患者を募集しています。 今週のニュースでは、エジンバラ大学、複数のNHS施設、イルミナシーケンスラボが推進するヒト全ゲノムシーケンス解析のためのゲノミクスイングランドの専門知識と施設を活用します。また、この研究の結果は、100,000 GenomesプロジェクトおよびUK Biobankからの広範なデータにもリンクされます。これには、これらの参加者のCOVID-19症例も含まれます。 すべてのデータは英国の安全なデータセンターに保管され、研究者が迅速に利用できるようになります。
この画期的なヒトゲノム研究は、一部のCOVID-19患者が軽度の感染を経験し、他の患者が集中治療を必要とする理由と、一部の患者がヒーロー的な対策にもかかわらず死亡する理由を説明するのに役立ちます。しかし、ウイルスゲノムのシーケンスを中心とした他の研究も、パンデミックの重要な手がかりとなっています。GenOMICC / Genomics Englandの研究は、サンガーセンター(CoG-UK Consortiumと呼ばれています)を介して並行ウイルスシーケンス座標にリンクされています。このセンターは最近、シーケンスされた10,000のウイルスゲノムのマイルストーンを完了しました。
英国の大規模なウイルスゲノム研究と世界をリードする集団シーケンスプログラムで構成されるゲノム研究の取り組みは、COVID-19をより深く理解し、将来の流行やパンデミックに対する戦略的計画と迅速な対応に情報を提供する新しいリソースを世界に提供します。