DRAGEN二次解析

精確で包括的、効率的な解析

NGSデータを処理してゲノム探索を最大化する一連のバイオインフォマティクスパイプライン

サムネール

Illumina DRAGENのご紹介

Illumina DRAGEN(Dynamic Read Analysis for GENomics)の二次解析は、あらゆる規模と分野のラボが、強力で最先端のデータ解析ツールでゲノムの価値を最大化することを可能にします。DRAGEN二次解析(旧称:DRAGEN Bio-IT Platform)は、研究ニーズを満たすために、複数の導入オプション、アプリケーション、パイプラインを備えた、精確で包括的、かつ高効率のバイオインフォマティクスを提供します。 

主な特長とメリット

精確な結果

非常に精確な結果で信頼性の高い解析。DRAGENは、Precision FDA Truth Challenge v2ベンチマークデータを使用して 99.90%の精度1スコアを達成しました。

包括的なソリューション

単一のソリューションが最大30のオープンソースツールに代わり、全ゲノム、エクソーム、メチローム、トランスクリプトームを解析します。 

効率的な解析

サポートされているすべてのコーラーで、40×ゲノムを34分以内に処理します。2 DRAGEN ORA圧縮により、FASTQファイルサイズを1/5に縮小できます。DRAGEN二次解析は、ゲノムデータ解析で2つの世界最速記録を達成しました。3,4

高い費用対効果

ビルトインのロスレスデータ圧縮により、ストレージコストを80%削減します5。事前構成済みのワークフローにより、解析パイプラインの開発および維持にかかる時間と費用を削減できます。 


マルチプラットフォーム対応

お客様のデータや専門性に応じた柔軟な環境で利用できます。DRAGENによる二次解析は、オンプレミスサーバー、クラウド環境、またはNovaSeq Xシリーズ、NextSeq 1000/NextSeq 2000システム、MiSeq i100シリーズ上で直接利用可能です。

合理的な統合

イルミナのシーケンサーと簡単に統合できるため、シーケンスから下流の三次解析までのワークフローを合理化できます。

導入オプション

オンプレミスサーバー、クラウドベース、または装置上のソリューションを介してDRAGEN二次解析にアクセスします。複数の導入オプションにより、精度、スピード、柔軟性を損なうことなく、解析ニーズに応えます。 

主要な解析アプリとパイプライン

DRAGEN二次解析は、幅広いアプリケーションをサポートし、1つのソリューションで多くの実験タイプを包括的にカバーします。主なアプリケーション:

  • 生殖系列(全ゲノムおよびエンリッチメント)
  • 体細胞(全ゲノムおよびエンリッチメント、Tumor-onlyおよび正常部位)
  • RNA
  • メチル化

DRAGEN二次解析には、入力データファイルを受け入れ、パイプラインのさまざまな段階で出力ファイルを作成できる汎用性の高いパイプラインセットが含まれます。

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DRAGEN IGG:集団規模のバリアント発見を強化

DRAGEN Iterative gVCF Genotyper(IGG)は、集団規模のバリアント解析のための画期的なソリューションを提供し、大規模コホートにわたる小規模生殖細胞系列バリアントの迅速で効率的な集約とジェノタイピングを可能にします。スピード、精度、スケーラビリティを考慮して設計されたIGGは、インクリメンタル解析に対応しているため、データセット全体を再処理することなく新しいサンプルバッチを追加できます。

DRAGEN[二次]解析を用いて、約50%のコスト削減を実現しました。計算に関しては、手動のほぼ2倍の速度です。

DRAGEN二次解析で前進する

遺伝性疾患から腫瘍学、ファーマコゲノミクスなど、DRAGEN二次解析は、あらゆる分野のラボがNGSオペレーションをスケールアップし、革新的なゲノム解析を実現できるよう支援します。

ゲノミクスは世界の主要な死因を阻止できるか?

DRAGEN二次解析は、Cardio-CAREがデータ処理時間を短縮し、データストレージのフットプリントを80%削減し、9,000人以上の参加者を対象とした研究のWGSデータを迅速に解析するのに役立っています。 

主なリソース

最先端のイノベーションによる包括的なカバレッジ

DRAGEN v4.4は、ゲノム解析およびマルチオミクス解析に向けた強力な革新機能を備えています。

このリリースでは、Heme WGS、Solid WGS腫瘍-正常、および微小残存病変(MRD)の合理化されたパイプラインの新しい腫瘍学アプリケーションを紹介します。また、最新のアッセイのための最適化された二次解析や、構造バリアントコーリングの改善など、生殖細胞系列や体細胞パイプラインにおける大幅な精度向上も実現します。

オンデマンドウェビナーで、すべての新機能について学び、DRAGEN v4.4がサンプルから洞察までの道のりをどのように加速するかをご覧ください。

詳細またはお問い合わせ

DRAGEN二次解析の機能、注文方法、製品ドキュメントの検索についての詳細をご覧ください。また、ご不明な点がございましたらお気軽にお問い合わせください。 

参考文献

  1. Illumina internal data on file, 2025, accuracy score calculated with DRAGEN v4.4 using benchmark data from Precision FDA Truth Challenge v2 https://precision.fda.gov/challenges/10
  2. Illumina internal data on file, 2024. Run time calculated using DRAGEN v4.3 on DRAGEN server v4. Includes calling Full suite of callers for structural variants, repeat expansions, and targeted callers.
  3. BioIT World. Children’s Hospital of Philadelphia, Edico set world record for secondary analysis speed. bio-itworld.com/ news/2017/10/23/children-s-hospital-of-philadelphia-edico-set-world-record-for-secondary-analysis-speed. Published October 23, 2017. Accessed March 14, 2022.
  4. San Diego Union Tribune. Rady Children’s Institute sets Guinness world record. sandiegouniontribune.com/95899028-132.html. Published February 12, 2018. Accessed March 14, 2022.