DRAGEN二次解析

正確で包括的、効率的な解析

NGSデータを処理してゲノム発見を最大化する一連のバイオインフォマティクスパイプライン

サムネール

イルミナDRAGENのご紹介

イルミナのDRAGEN(Dynamic Read Analysis for GENomics)二次解析は、あらゆる規模と分野のラボが強力な最先端のデータ解析ツールでゲノムの価値を最大化することを可能にします。DRAGEN二次解析は、研究ニーズを満たすために、複数の導入オプション、アプリケーション、パイプラインを備えた、正確で包括的、かつ高効率のバイオインフォマティクスを提供します。 

主な機能と利点

正確な結果

非常に正確な結果で自信を持って解析できます。DRAGENは、Precision FDA Truth Challenge v2ベンチマークデータを使用して99.84%の精度スコアを達成しました。1 

包括的なソリューション

最大30のオープンソースツールに代わる単一のソリューションで、全ゲノム、エクソーム、メチローム、トランスクリプトームを解析します。  

効率的な解析

サポートされているすべてのコーラーで、34×ゲノムを約30分で処理します。2 DRAGEN ORA圧縮により、FASTQファイルサイズを最大5倍に縮小します。DRAGEN二次解析の結果、ゲノムデータ解析に2つの世界速度記録がもたらされました。3,4

コスト効率

内蔵のロスレスデータ圧縮により、ストレージコストを80%削減します5。事前設定されたワークフローにより、解析パイプラインの開発にかかる時間と費用を削減できます。


マルチプラットフォームアクセシビリティ

データや専門知識がどこにあっても、お会いしましょう。DRAGEN二次解析は、オンプレミスサーバー、クラウド、またはNextSeq 1000およびNextSeq 2000シーケンスシステム、NovaSeq Xシリーズに直接搭載して利用できます。

合理化された統合

イルミナのシーケンサーと簡単に統合できるため、シーケンスから下流の三次解析までのワークフローを合理化できます。

主要な解析アプリとパイプライン

DRAGEN二次解析は幅広いアプリケーションをサポートし、1つのソリューションで多くの実験タイプを包括的にカバーします。主なアプリケーション:  

  • 生殖細胞系列(全ゲノムおよびエンリッチメント)
  • 体細胞(全ゲノムおよび濃縮、腫瘍のみおよび腫瘍正常)
  • RNA
  • メチル化

DRAGEN二次解析 には、入力データファイルを受け入れ、パイプラインの異なる段階で出力ファイルを作成できる汎用性の高いパイプラインセットが含まれます。 

woman on a computer

展開オプション

オンプレミスサーバー、クラウドベース、または装置上のソリューションを介してDRAGEN二次解析にアクセスします。複数の導入オプションにより、正確性、スピード、柔軟性を損なうことなく、解析ニーズをサポートします。 

DRAGEN[二次]解析を用いて、約50%のコスト削減を実現しました。計算時間に関しては、手動法に比べてほぼ2倍の速度です。

DRAGEN二次解析を用いた進歩

遺伝性疾患から腫瘍学、ファーマコゲノミクスなど、DRAGEN二次解析は、あらゆる分野のラボがNGSオペレーションをスケールアップし、革新的なゲノム解析を実現するのに役立ちます。

注目のリソース

詳細またはお問い合わせ

DRAGEN二次解析機能の詳細、注文方法、製品ドキュメントの検索。また、専門家に相談して、質問に対する回答を得ることもできます。 

参考文献

  1. Truth Challenge V2: マップが難しい領域のショートリードとロングリードからバリアントを呼び出す。precision.fda.gov/challenges/10. 2020年11月3日にアクセス。
  2. Illumina. DRAGENがPrecisionFDAベンチマークデータのデータ精度に新たなスタンダードをもたらす。イルミナの機械学習とDRAGENグラフによるバリアントコールパフォーマンスの最適化。illumina.com/science/genomics-research/articles/dragen-shines-again-precisionfda-truth-challenge-v2.html。2023年3月22日にアクセス。
  3. BioITワールド。Children’s Hospital of Philadelphia, Edicoは、二次解析スピードで世界記録を達成しました。bio-itworld.com/ news/2017/10/23/children-s-hospital-of-philadelphia-edico-set-world-record-for-secondary-analysis-speed。2017年10月23日発行。2022年3月14日にアクセス。
  4. サンディエゴユニオントリビューン。Rady Children’s Instituteはギネスの世界記録を樹立しています。sandiegouniontribune.com/95899028-132.html. 2018年2月12日発行。2022年3月14日にアクセス。