DRAGEN二次解析

正確で包括的、効率的な解析

NGSデータを処理してゲノム探索を最大化する一連のバイオインフォマティクスパイプライン

サムネール

Illumina DRAGENのご紹介

Illumina DRAGEN(Dynamic Read Analysis for GENomics)の二次解析は、あらゆる規模と分野のラボが、強力で最先端のデータ解析ツールでゲノムの価値を最大化することを可能にします。DRAGEN二次解析は、研究ニーズを満たすために、複数の導入オプション、アプリケーション、パイプラインを備えた、正確で包括的、かつ高効率のバイオインフォマティクスを提供します。

主な特長とメリット

正確な結果

非常に正確な結果で信頼性の高い解析。DRAGENは、Precision FDA Truth Challenge v2ベンチマークデータを使用して99.89%の精度スコアを達成しました。1

包括的なソリューション

単一のソリューションが最大30のオープンソースツールに代わり、全ゲノム、エクソーム、メチローム、トランスクリプトームを解析します。 

効率的な解析

サポートされているすべてのコーラーで、40×ゲノムを34分以内に処理します。2 DRAGEN ORA圧縮により、FASTQファイルサイズを1/5に縮小できます。DRAGEN二次解析は、ゲノムデータ解析で2つの世界最速記録を達成しました。3,4

高い費用対効果

ビルトインのロスレスデータ圧縮により、ストレージコストを80%削減します5。事前構成済みのワークフローにより、解析パイプラインの開発にかかる時間と費用を削減できます。


Multiplatform accessibility

お客様のデータや専門分野独自のニーズに応えます。DRAGEN二次解析は、オンプレミスサーバー、クラウド、またはNovaSeq Xシリーズ、NextSeq 1000およびNextSeq 2000システム、MiSeq i100シリーズに直接組み込んで利用できます。

合理的な統合

イルミナのシーケンサーと簡単に統合できるため、シーケンスから下流の三次解析までのワークフローを合理化できます。

主要な解析アプリとパイプライン

DRAGEN二次解析は、幅広いアプリケーションをサポートし、1つのソリューションで多くの実験タイプを包括的にカバーします。主なアプリケーション:  

  • 生殖系列(全ゲノムおよびエンリッチメント)
  • 体細胞(全ゲノムおよびエンリッチメント、Tumor-onlyおよび正常部位)
  • RNA
  • メチル化

DRAGEN二次解析には、入力データファイルを受け入れ、パイプラインのさまざまな段階で出力ファイルを作成できる汎用性の高いパイプラインセットが含まれます。 

woman on a computer

DRAGEN[二次]解析を用いて、約50%のコスト削減を実現しました。計算に関しては、手動のほぼ2倍の速度です。

DRAGEN二次解析で前進する

遺伝性疾患から腫瘍学、ファーマコゲノミクスなど、DRAGEN二次解析は、あらゆる分野のラボがNGSオペレーションをスケールアップし、革新的なゲノム解析を実現できるよう支援します。

ゲノミクスは世界の主要な死因を阻止できるか?

DRAGEN二次解析は、Cardio-CAREがデータ処理時間を短縮し、データストレージのフットプリントを80%削減し、9,000人以上の参加者を対象とした研究のWGSデータを迅速に解析するのに役立っています。 

注目のリソース

詳細またはお問い合わせ

DRAGEN二次解析の機能、注文方法、製品ドキュメントの検索についての詳細をご覧ください。また、スペシャリストに相談して、質問に対する回答を得ることもできます。 

参考文献

  1. Illumina. DRAGEN sets new standard for data accuracy in PrecisionFDA benchmark data. Optimizing variant calling performance with Illumina machine learning and DRAGEN graph. illumina.com/science/genomics-research/articles/dragen-shines-again-precisionfda-truth-challenge-v2.html. 2023年3月22日にアクセス。
  2. イルミナ社内データ、2024年 DRAGENサーバー v4.3を使用して計算されたランタイム。構造バリアント、リピート伸長、ターゲットコーラーのフルスイートコーリングが含まれます。
  3. BioIT World. Children’s Hospital of Philadelphia, Edico set world record for secondary analysis speed. bio-itworld.com/ news/2017/10/23/children-s-hospital-of-philadelphia-edico-set-world-record-for-secondary-analysis-speed. 2017年10月23日発行。2022年3月14日にアクセス。
  4. San Diego Union Tribune. Rady Children’s Institute sets Guinness world record. sandiegouniontribune.com/95899028-132.html. 2018年2月12日発行。2022年3月14日にアクセス。