AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2
がんとの関連性が確認されている50個の遺伝子のホットスポットを調べる標的研究パネル。
続きを読む...
パネル
ライブラリー調製
インデックスアダプター
アクセサリー製品
合計：
製品のハイライト
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2は、Catalogue of Somatic Mutations in Cancer（COSMIC）1データベースで特定されたように、がんとの関連が知られている50の遺伝子のホットスポット領域にわたる体細胞変異を研究するためのターゲットリシーケンスアッセイです。主な特徴には以下があります：
関連する遺伝子コンテンツ
- 50のがん遺伝子と腫瘍抑制遺伝子から約2800のCOSMIC変異をターゲット
高速かつ合理的なワークフロー
- わずか1 ngの高品質サンプルまたは10 ngのホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプルから、1日でシーケンス可能なライブラリーを調製
正確なデータ
- ローカルまたはクラウドベースの解析を使用して、5%バリアントアリル頻度までの体細胞変異を検出
Cancer HotSpot Panelは、AmpliSeq for Illumina Polymerase Chain reaction（PCR）ベースのライブラリー調製、イルミナのSequencing by Synthesis（SBS）次世代シーケンス（NGS）テクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。
このパネルにより、肺、結腸、乳房、卵巣、黒色腫、前立腺など、複数のがんタイプ内で高感度なバリアント検出が可能になります。すぐに使えるパネルにより、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化にかかる時間と労力を節約できます。
よく一緒に購入される製品
仕様
推奨プロジェクト
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| iSeq 100 System | ランあたり16サンプル（最低カバレッジ500×を想定） | 2 × 150 bp |
| MiniSeq System | ランあたりのサンプル数：中出力：32、高出力：96（最低カバレッジ500×を想定） | 2 × 150 bp |
| MiSeq System | ランごとのサンプル（試薬キットバージョン別）：v2 nano：4、v2 micro：16、v2：60、v3：96（最低カバレッジ500×を想定） | 2 × 150 bp |
製品比較
| AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | TruSight Tumor 15 | |
|---|---|---|---|---|
| がんの種類 | 固形腫瘍 | 固形腫瘍 | 固形腫瘍 | 固形腫瘍 |
| アッセイ時間 | 5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） | 5～6時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） | 5～6時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） | |
| マルチプレックス | 96のデュアルインデックスの組み合わせ | 96のデュアルインデックスの組み合わせ | 96のデュアルインデックスの組み合わせ | |
| 方法 | アンプリコンシーケンス, ターゲットDNAシーケンス | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲットDNAシーケンス | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲットDNAシーケンス | アンプリコンシーケンス, ターゲットDNAシーケンス |
| 核酸タイプ | DNA | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA |
| 生物種カテゴリー | ヒト | ヒト | ヒト | ヒト |
| 説明 | 50のがん関連遺伝子のホットスポット領域に関する身体解析研究。 | 固形腫瘍がんに関連する52の遺伝子の体細胞解析研究。 |
製品資料
AmpliSeq for Illumina Oncology Panels on the iSeq 100 System
Application Note | PDF < 1 MB
Automated Solutions for AmpliSeq for Illumina Sequencing Panels
Application Note | HTML
Data Sheet | HTML | 5 versions
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel Gene List
product_file | EXCEL < 1 MB
Application Note | PDF | 5 versions
マニュアルとサポート情報
Index Adapters Pooling Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Direct FFPE DNA Kitリファレンスガイド Documentation
Illumina Adapter Sequences Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2チェックリスト Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2の資料 Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2消耗品および機器 Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2リファレンスガイド Documentation
AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression Panel
>20,000ヒトRefSeq遺伝子の発現レベルを測定するターゲットパネル。
参考文献
- Kingsmore S. Catalogue of Somatic Mutations in Cancer – ホームページ。http://cancer.sanger.ac.uk/cosmic. 2017年10月25日にアクセス。