AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2は、Catalogue of Somatic Mutations in Cancer（COSMIC）1データベースで特定されたように、がんとの関連が知られている50の遺伝子のホットスポット領域にわたる体細胞変異を研究するためのターゲットリシーケンスアッセイです。主な特徴には以下があります：
Cancer HotSpot Panelは、AmpliSeq for Illumina Polymerase Chain reaction（PCR）ベースのライブラリー調製、イルミナのSequencing by Synthesis（SBS）次世代シーケンス（NGS）テクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。
このパネルにより、肺、結腸、乳房、卵巣、黒色腫、前立腺など、複数のがんタイプ内で高感度なバリアント検出が可能になります。すぐに使えるパネルにより、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化にかかる時間と労力を節約できます。
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| iSeq 100 System | ランあたり16サンプル（最低カバレッジ500×を想定） | 2 × 150 bp |
| MiniSeq System | ランあたりのサンプル数：中出力：32、高出力：96（最低カバレッジ500×を想定） | 2 × 150 bp |
| MiSeq System | ランごとのサンプル（試薬キットバージョン別）：v2 nano：4、v2 micro：16、v2：60、v3：96（最低カバレッジ500×を想定） | 2 × 150 bp |
| AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | AmpliSeq for Illumina Focus Panel | AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 | TruSight Tumor 15 | |
|---|---|---|---|---|
| サンプルタイプ | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織 |
AmpliSeq for Illumina Oncology Panels on the iSeq 100 System
Application Note | PDF < 1 MB
Automated Solutions for AmpliSeq for Illumina Sequencing Panels
Application Note | HTML
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel Gene List
product_file | EXCEL < 1 MB
Data Sheet | HTML | 5 versions
Sample identification with the AmpliSeq for Illumina Sample ID Panel
Application Note | PDF < 1 MB
Index Adapters Pooling Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2 Checklist Documentation
AmpliSeq for Illumina Direct FFPE DNA Kit Reference Guide Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 Support - Documentation & Literature
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2 Consumables & Equipment Documentation
Illumina Adapter Sequences Documentation
AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2 Reference Guide Documentation
