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    AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2

    がんとの関連性が確認されている50個の遺伝子のホットスポットを調べる標的研究パネル。

    5時間（時間はライ…

    アッセイ時間

    <1.5時間

    ハンズオンタイム

    1～100 ng、…

    インプット量

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    概要

    AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2は、Catalogue of Somatic Mutations in Cancer（COSMIC）1 データベースで特定されたように、がんとの関連が知られている50の遺伝子のホットスポット領域にわたる体細胞変異を研究するためのターゲットリシーケンスアッセイです。 

    主な特長

    • 関連遺伝子コンテンツ -  50のがん遺伝子と腫瘍抑制遺伝子から約2800のCOSMIC変異をターゲット

    • 迅速で合理化されたワークフロー - わずか1 ngの高品質サンプルまたは10 ngのホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプルから1日でシーケンス対応ライブラリーを調製

    • 正確なデータ - ローカルまたはクラウドベースの解析を使用して、5%バリアントアリル頻度までの体細胞変異を検出

    Cancer HotSpot Panelは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応（PCR）ベースのライブラリー調製、イルミナ合成シーケンス（SBS）次世代シーケンス（NGS）テクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。

    このパネルは、肺、結腸、乳房、卵巣、黒色腫、前立腺など、複数のがんタイプ内で高感度なバリアント検出を可能にします。すぐに使えるパネルにより、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化にかかる時間と労力を節約できます。

    Ampliseq for Illuminaの詳細はこちら

    仕様

    アッセイ時間 5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない）
    がんの種類 汎がん (Pan-cancer), 固形腫瘍
    コンテンツ仕様 がんとの関連性が確認されている50の遺伝子のホットスポット
    説明 50のがん関連遺伝子のホットスポット領域に関する身体解析研究。
    ハンズオンタイム <1.5時間
    インプット量 1～100 ng、プールあたり10 ngを推奨
    システム MiSeqシステム, iSeq 100システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, MiniSeq System
    作用機序 マルチプレックスPCR法
    手法 ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス
    マルチプレックス 96のデュアルインデックスの組み合わせ
    核酸の種類 DNA
    アンプリコン数 合計207（1プール）
    対応サンプルタイプ FFPE組織
    生物種カテゴリー ヒト
    テクノロジー シーケンス
    バリアントクラス 1塩基変異多型（SNP）, 体細胞バリアント, 挿入 欠失（Indel）

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    参考文献

    1. Kingsmore S. Catalogue of Somatic Mutations in Cancer – ホームページ。http://cancer.sanger.ac.uk/cosmic. 2017年10月25日にアクセス。

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