AmpliSeq for Illumina Childhood Cancer Panel

小児および若年成人のがんに関連する203の遺伝子を調べるためのターゲットパネル。

5~6時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない)

アッセイ時間

<1.5時間

ハンズオンタイム

10 ngの高品質DNAまたはRNA

インプット量

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概要

AmpliSeq Childhood Cancer Panel for Illuminaは、小児および若年成人がんに関連する体細胞バリアントの包括的評価のためのターゲットリシーケンスソリューションを提供します。

主な特長

  • 包括的な遺伝子コンテンツ - ホットスポット、一塩基バリアント(SNV)、インデル、コピー数バリアント(CNV)、遺伝子融合など、203の遺伝子にわたる複数のバリアントタイプを ターゲットにします

  • 迅速で合理化されたワークフロー - 血液、骨髄、またはホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルからわずか10 ngの高品質DNAまたはRNAで、1日でシーケンスライブラリーを 調製します

  • 正確なデータ - ローカルまたはクラウドベースの解析を使用して、5%までの頻度で体細胞変異 を検出

AmpliSeq Childhood Cancer Panel for Illuminaは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応(PCR)ベースのライブラリー調製、イルミナの合成シーケンス(SBS)次世代シーケンス(NGS)テクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です

このすぐに使えるパネルは、白血病、脳腫瘍、肉腫など、複数の小児がんタイプのバリアントを検出し、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化に関連する時間と労力を節約します。


仕様


必要な製品

AmpliSeq for Illumina RNA Panelsを使って作業する際は、トータルRNAをcDNAに変換する時にAmpliSeq cDNA Synthesis for Illuminaが必要となります。

AmpliSeq Library Equalizer for Illuminaは、AmpliSeq for Illuminaライブラリー調製法を使用する際、ライブラリーをノーマライズするための使いやすいソリューションです。

AmpliSeq for Illumina Sample ID Panelは、ヒトSNPジェノタイピングパネルで、研究サンプルごとに固有のIDを生成するために使用します。このパネルには、検証済みのSNPをターゲットとする8つのプライマーペアと、1つの性別決定ペアがあり、1つの追加のピペット操作ステップのみを必要とする簡単なワークフローがあります。

AmpliSeq for Illumina Direct FFPE DNAは、脱パラフィンやDNA精製を必要とせずに、AmpliSeq for Illuminaプロトコールを使用してFFPE組織からのDNA調製とライブラリー構築を可能にします。

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パネル (1)

AmpliSeq™ for Illumina® Childhood Cancer Panel

20028446

小児および若年成人がんに関連する体細胞バリアントを評価するターゲットパネル。24個のサンプルに十分に対応します。Library Prep試薬、インデックスアダプター、アクセサリー製品は別売りです。

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ライブラリー調製 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

384ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。

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インデックスアダプター (5)

AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

96サンプルにラベル表示できる96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬とプローブパネルは別売りです。

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

イルミナ、セットA、セットB、セットCおよびセットDの4セットのAmpliSeq CDインデックスが含まれます。各セットには96サンプルにラベルを付けるのに十分な96、8 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。

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アクセサリー製品 (4)

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

AmpliSeq for Illumina RNA Panels(AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom RNA PanelまたはCommunity RNA Panelsなど)で作業する場合、全RNAをcDNAに変換するための反応ミックスと酵素ブレンドが含まれます。反応の数はパネルによって異なります(例:AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom Panelについては1キットあたり100反応、AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panelについては1キットあたり200反応)。

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

AmpliSeq for Illuminaライブラリーをシーケンス用に調製する場合のライブラリーノーマライゼーション用のビーズと試薬が含まれます。

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AmpliSeq™ for Illumina® Sample ID Panel

20019162

AmpliSeq Library PLUS for Illuminaとペアにすると、96反応に十分な8つの一塩基多型(SNP)ターゲットプライマーペアと1つの性差別プライマーペアが含まれます。迅速かつ正確なサンプル同定を可能にします。ライブラリー調製、プローブパネル、インデックスアダプターは別途ご購入ください。

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AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

AmpliSeq for Illuminaプロトコールを使用したライブラリー構築のために、非染色スライドマウントFFPE組織からDNAを調製するための24の反応を含み、脱パラフィンやDNA精製は必要ありません。

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選択中の製品一覧

製品名

数量

Unit Price

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

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