AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel

骨髄がんに関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。 続きを読む...
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パネル

AmpliSeq#@ for Illumina® Myeloid Panel

20024478

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ライブラリー調製

AmpliSeq™ Library PLUS for Illumina®(反応回数24回)

20019101

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AmpliSeq™ Library PLUS for Illumina®(反応回数96回)

20019102

価格
 
 

AmpliSeq™ Library PLUS for Illumina®(反応回数384回)

20019103

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インデックスアダプター

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina®(24インデックス、24サンプル)

20019104

価格
 
 

AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

価格
 
 

AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina®(384インデックス、384サンプル)

20031676

価格
 
 
アクセサリー製品

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

価格
 
 

AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

価格
 
 

製品のハイライト

Myeloid Panelでは、血液悪性腫瘍に関連するバイオマーカーを研究するための単一アッセイで、血液サンプルと骨髄サンプルからのDNAとRNAの両方を同時に解析できます。このパネルでは、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、骨髄増殖性腫瘍(MPN)、慢性骨髄性白血病(CML)、慢性骨髄単球性白血病(CMML)、および若年性骨髄単球性白血病(JMML)などの主要な骨髄疾患に関連するターゲットをカバーしています。主な特徴には以下があります:

価値の高いコンテンツ
  • CEBPAやFLT3-ITDsなどの困難なターゲットを含む69の遺伝子のバイオマーカーをターゲットにします
高速かつ合理的なワークフロー
  • わずか10 ngの高品質DNAとRNAから、1日でシーケンス可能なライブラリーを調製
正確なデータ
  • ローカルまたはクラウドベースの解析を使用して、5%までの頻度で体細胞変異を検出

Myeloid Panelは、AmpliSeq for Illumina Polymerase Chain reaction(PCR)ベースのライブラリー調製、Illumina sequencing by synthesis(SBS)、NGSテクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。

すぐに使えるパネルにより、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化にかかる時間と労力を節約できます。

AmpliSeq for Illuminaの詳細はこちら

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仕様

推奨プロジェクト

装置 推奨サンプル数 リード長
MiniSeq System ランごとのサンプル(中出力):DNA 4個、RNA 32個、組み合わせたサンプル3個(>95%、最低カバレッジ500倍)
ランあたりのサンプル数(高出力):12 DNA、96 RNA、11の混合サンプル(>95%、最低カバレッジ500倍に基づく)
2 x 151 bp
2 x 151 bp
MiSeq System v2試薬を用いたランごとのサンプル:7 DNA、60 RNA、6サンプルの組み合わせ
v3試薬によるランごとのサンプル数:12のDNA、96のRNA、11の混合サンプル
2 x 151 bp
2 x 151 bp

製品比較

AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 TruSight Myeloid Sequencing Panel
がんの種類 血液学的 固形腫瘍 血液学的
アッセイ時間 5.5~7.5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) 5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) 8時間
インプット量 20 ngの高品質DNA、10 ngの高品質RNA
(プールあたり10ngを推奨)
50 ng
コンテンツ仕様 69の遺伝子(関連する40の主要なDNAターゲット遺伝子、29のRNA融合ドライバー遺伝子、5つの遺伝子発現レベル)にわたるバイオマーカーをターゲットとする 骨髄性悪性腫瘍に関連する54の遺伝子をターゲットとする。プローブは、がん抑制遺伝子および変異ホットスポットから568のアンプリコンを増幅する。
ハンズオンタイム 1.5時間未満 1.5時間未満 3時間
マルチプレックス 最大96プレックス 96のデュアルインデックスの組み合わせ 最大96プレックス
方法 アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲットDNAシーケンス アンプリコンシーケンス, ターゲットDNAシーケンス アンプリコンシーケンス, ターゲットDNAシーケンス
核酸タイプ RNA, DNA DNA DNA
生物種カテゴリー ヒト ヒト ヒト
説明 骨髄がんに関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。 50のがん関連遺伝子のホットスポット領域に関する身体解析研究。 骨髄性悪性腫瘍における体細胞変異検出研究用。

サポートデータと図

 

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