AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel

骨髄がんと関連する40のDNA遺伝子、29のRNAドライバー融合遺伝子、および5つの遺伝子発現レベルを調べるためのターゲットパネル。Read More...
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Panel

AmpliSeq™ for Illumina® Myeloid Panel

20024478

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Library Prep

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

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Index Adapters

AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina® (96 Indexes, 96 Samples)

20019105

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アクセサリー製品

Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

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Product Highlights

Myeloid Panelでは、血液系腫瘍と関連するバイオマーカーを調べるために、血液や骨髄から抽出されたDNAとRNAを1回で同時に解析することが可能です。このパネルでは、以下に挙げる主要な骨髄疾患と関連するターゲットが網羅されています:急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、骨髄増殖性腫瘍(MPN)、慢性骨髄性白血病(CML)、慢性骨髄単球性白血病(CMML)、および若年性骨髄単球性白血病(JMML)。主な機能:

価値の高いコンテンツ
  • ターゲットはCEBPAやFLT3-ITDのような難しいターゲットを含む69の遺伝子にわたるバイオマーカー
迅速かつ効率的なワークフロー
  • わずか10 ngの高品質DNA/RNAから1日でシーケンス可能なライブラリーを調製
正確なデータ
  • ローカル解析またはクラウド解析によって5%までの低頻度の体細胞変異を検出

Myeloid Panelは、AmpliSeq for Illuminaのポリメラーゼ連鎖反応(PCR)ベースのライブラリー調製、イルミナのSequencing by Synthesis(SBS)、NGS技術、および自動解析を含む統合ワークフローの一部です。

このカタログパネルを使用すれば、ターゲットの同定、プライマーの設計、およびパネルの最適化にかかる時間と労力を抑えることができます。

AmpliSeq for Illuminaの詳細はこちら

Frequently Purchased Together

仕様

推奨プロジェクト

装置 推奨サンプル数 リード長
MiniSeq System Samples per run (mid output): 4 DNA, 32 RNA, 3 combined samples (based on >95% at 500x minimum coverage)
Samples per run (high output): 12 DNA, 96 RNA, 11 combined samples (based on >95% at 500x minimum coverage)
2 x 151 bp
2 x 151 bp
MiSeq System Samples per run with v2 reagents: 7 DNA, 60 RNA, 6 combined samples
Samples per run with v3 reagents: 12 DNA, 96 RNA, 11 combined samples
2 x 151 bp
2 x 151 bp

製品比較

AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 TruSight Myeloid Sequencing Panel
Assay Time 5.5 – 7.5 hours (library prep only; doesn't include library quantification, normalization, or pooling time) 5 hours (library prep only; doesn't include library quantification, normalization, or pooling time) 8 hours
Cancer Type Hematologic Pan-Cancer, Solid Tumor Hematologic
Content Specifications Targets biomarkers across 69 genes (40 key DNA target genes, 29 RNA fusion driver genes, and 5 gene expression levels) Hotspot regions of 50 genes with known associations to cancer Targets 54 genes associated with myeloid malignancies. Probes amplify 568 amplicons from tumor suppressor genes and mutational hotspots.
Description Targeted panel to study 40 DNA genes, 29 RNA fusion driver genes, and 5 gene expression levels associated with myeloid cancers. Somatic analysis research into hotspot regions of 50 cancer-related genes. For somatic mutation detection studies in myeloid malignancies.
Hands-On Time < 1.5 hours < 1.5 hours 3 hours
Input Quantity 20 ng high-quality DNA; 10 ng high-quality RNA
(10 ng recommended per pool)
1–100 ng (10 ng recommended per pool) 50 ng
Method Amplicon Sequencing , Targeted DNA Sequencing , Targeted RNA Sequencing Amplicon Sequencing , Targeted DNA Sequencing Amplicon Sequencing , Targeted DNA Sequencing
Multiplexing Up to 96-plex 96 dual index combinations Up to 96-plex
Nucleic Acid Type DNA, RNA DNA DNA
Specialized Sample Types Blood, Bone Marrow, Not FFPE-Compatible Blood, FFPE Tissue Not FFPE-Compatible
Species Category Human Human Human

手法特異的なワークフロー例

 

参考データおよび図

 

関連製品

TruSight Oncology 500

Tumor mutational burden (TMB)、マイクロサテライト不安定性(MSI)などを含むさまざまなバリアントタイプをターゲットとしたアッセイで、低品質サンプルからの解析も可能。


AmpliSeq for Illumina Comprehensive Cancer Panel

がんとの関連が判明している409の遺伝子のエクソン領域を調べるためのターゲットパネル。


AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel

特定のターゲットまたは目的のゲノムコンテンツに最適化されたターゲットカスタムパネル。