Myeloid Panelでは、血液悪性腫瘍に関連するバイオマーカーを研究するための単一アッセイで、血液サンプルと骨髄サンプルからのDNAとRNAの両方を同時に解析できます。このパネルでは、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、骨髄増殖性腫瘍(MPN)、慢性骨髄性白血病(CML)、慢性骨髄単球性白血病(CMML)、および若年性骨髄単球性白血病(JMML)などの主要な骨髄疾患に関連するターゲットをカバーしています。主な特徴には以下があります:
Myeloid Panelは、AmpliSeq for Illumina Polymerase Chain reaction(PCR)ベースのライブラリー調製、Illumina sequencing by synthesis(SBS)、NGSテクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。
すぐに使えるパネルにより、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化にかかる時間と労力を節約できます。
装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
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MiniSeq System | ランごとのサンプル(中出力):DNA 4個、RNA 32個、組み合わせたサンプル3個(>95%、最低カバレッジ500倍) ランあたりのサンプル数(高出力):12 DNA、96 RNA、11の混合サンプル(>95%、最低カバレッジ500倍に基づく) |
2 x 151 bp 2 x 151 bp |
MiSeq System | v2試薬を用いたランごとのサンプル:7 DNA、60 RNA、6サンプルの組み合わせ v3試薬によるランごとのサンプル数:12のDNA、96のRNA、11の混合サンプル |
2 x 151 bp 2 x 151 bp |
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | TruSight Myeloid Sequencing Panel | |
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がんの種類 | 血液学的 | 固形腫瘍 | 血液学的 |
アッセイ時間 | 5.5~7.5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) | 5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) | 8時間 |
インプット量 | 20 ngの高品質DNA、10 ngの高品質RNA (プールあたり10ngを推奨) |
50 ng | |
コンテンツ仕様 | 69の遺伝子(関連する40の主要なDNAターゲット遺伝子、29のRNA融合ドライバー遺伝子、5つの遺伝子発現レベル)にわたるバイオマーカーをターゲットとする | 骨髄性悪性腫瘍に関連する54の遺伝子をターゲットとする。プローブは、がん抑制遺伝子および変異ホットスポットから568のアンプリコンを増幅する。 | |
ハンズオンタイム | 1.5時間未満 | 1.5時間未満 | 3時間 |
マルチプレックス | 最大96プレックス | 96のデュアルインデックスの組み合わせ | 最大96プレックス |
方法 | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲットDNAシーケンス | アンプリコンシーケンス, ターゲットDNAシーケンス | アンプリコンシーケンス, ターゲットDNAシーケンス |
核酸タイプ | RNA, DNA | DNA | DNA |
生物種カテゴリー | ヒト | ヒト | ヒト |
説明 | 骨髄がんに関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。 | 50のがん関連遺伝子のホットスポット領域に関する身体解析研究。 | 骨髄性悪性腫瘍における体細胞変異検出研究用。 |
Automated Solutions for AmpliSeq for Illumina Sequencing Panels
Application Note | HTML
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel Data Sheet
Data Sheet | HTML