TruSight Myeloid Sequencing Panel

このシーケンス研究パネルは、AML、MDS、MPN、CML、CMML、JMMLなどの骨髄性悪性腫瘍に関連するバリアントをターゲットにしています。 続きを読む...
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TruSight Myeloid Sequencing Panel(96サンプル)

FC-130-1010

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TruSeq Custom Amplicon Index Kit(96インデックス、384サンプル)

FC-130-1003

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TruSeqカスタムアンプリコンフィルタープレート(1プレート)

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TruSeqインデックスプレートフィクスチャーおよびカラーキット(各2)

FC-130-1007

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製品のハイライト

TruSight Myeloid Sequencing Panelは、骨髄性悪性腫瘍の体細胞バリアントを同定するために、専門家が定義したコンテンツと実証済みの次世代シーケンス(NGS)テクノロジーを使用しています。

パネルの内容は、血液がん疾患で定評のある専門家のコンソーシアムによってデザインされ、以下の領域で頻繁に変異する遺伝子をターゲットにしています。

  • 急性骨髄性白血病(AML)
  • 骨髄異形成症候群(MDS)
  • 骨髄増殖性腫瘍(MPN)
  • 慢性骨髄性白血病(CML)
  • 慢性骨髄単球性白血病(CMML)
  • 若年性骨髄単球性白血病(JMML)

TruSight Myeloid Sequencing Panelは、発がん性ホットスポットがカバーされる15の完全遺伝子(エクソンのみ)と39の追加遺伝子を対象とし、骨髄性悪性腫瘍に関与することが知られている主要遺伝子を1回の検査で包括的に評価します。その結果、研究者が液体腫瘍のプロファイルを作成できる、正確で費用対効果の高いソリューションが実現します。

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TruSight Myeloidライブラリーは、デスクトップシーケンサーでランし、MiSeq ReporterまたはLocal Run Manager AmpliconワークフローとSomatic Variant Callerでアライメントとバリアントコーリングを実行するのに最適です。その後、BaseSpace Variant Interpreterを使用してフィルタリングとアノテーションを行うことができます

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仕様

推奨プロジェクト

装置 推奨サンプル数 リード長
MiniSeq System ランあたりのサンプル数:中出力:2~3、高出力:8(> 500xカバレッジの95%アンプリコンに基づく) 2 × 150 bp(最大推奨)
MiSeq System v3試薬で1ランあたり8サンプル(> 500xカバレッジの95%アンプリコンに基づく) 2 × 150 bp(最大推奨)
NextSeq 550 System ランあたりのサンプル数:中出力:48、高出力:96(> 500xカバレッジの95%アンプリコンに基づく) 2 × 150 bp(最大推奨)

製品比較

TruSight Myeloid Sequencing Panel AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2
がんの種類 血液学的 血液学的 固形腫瘍
アッセイ時間 8時間 5.5~7.5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) 5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない)
インプット量 50 ng 20 ngの高品質DNA、10 ngの高品質RNA
(プールあたり10ngを推奨)
コンテンツ仕様 骨髄性悪性腫瘍に関連する54の遺伝子をターゲットとする。プローブは、がん抑制遺伝子および変異ホットスポットから568のアンプリコンを増幅する。 69の遺伝子(関連する40の主要なDNAターゲット遺伝子、29のRNA融合ドライバー遺伝子、5つの遺伝子発現レベル)にわたるバイオマーカーをターゲットとする
ハンズオンタイム 3時間 1.5時間未満 1.5時間未満
マルチプレックス 最大96プレックス 最大96プレックス 96のデュアルインデックスの組み合わせ
核酸タイプ DNA RNA, DNA DNA
生物種カテゴリー ヒト ヒト ヒト
説明 骨髄性悪性腫瘍における体細胞変異検出研究用。 骨髄がんに関連する40種のDNA遺伝子、29種のRNA融合ドライバー遺伝子、5種の遺伝子発現レベルを調べるターゲットパネル。 50のがん関連遺伝子のホットスポット領域に関する身体解析研究。

メソッドごとのワークフロー例

 
TruSight Myeloid Sequencing Panel Gene List
ABL1 CEBPA HRAS MYD88 SF3B1
ASXL1 CSF3R IDH1 NOTCH1 SMC1A
ATRX CUX1 IDH2 NPM1 SMC3
BCOR DNMT3A IKZF1 NRAS SRSF2
BCORL1 ETV6/TEL JAK2 PDGFRA STAG2
BRAF EZH2 JAK3 PHF6 TET2
CALR FBXW7 KDM6A PTEN TP53
CBL FLT3 キット PTPN11 U2AF1
CBLB GATA1 KRAS RAD21 WT1
CBLC GATA2 MLL RUNX1 ZRSR2
CDKN2A GNAS MPL SETBP1  

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