Nextera XT DNA Library Preparation Kit

90分間のワークフローで、DNAインプットの必要性が低く、小さなゲノム、PCRアンプリコン、プラスミド、cDNAシーケンス用のDNAライブラリーを調製できます。

DNA抽出からライブラリーのノーマライズまで約5.5時間。(ライブラリー調製時間:約90分)。

アッセイ時間

15分

ハンズオンタイム

1 ng DNA

インプット量

仕様タブで詳細を確認する

Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20091654、、2009165620091658、20091660)を注文することをお勧めします。IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20027213, 20027214,20042666, 20042667)は製造中止となります。最終注文日は2025年1月30日です。

概要

Nextera XT DNA Library Preparation Kitは、少量のインプットDNA(1 ng)から小さなゲノム、PCRアンプリコン、プラスミド、微生物ゲノム、連結アンプリコン、および二本鎖cDNAのシーケンス用のライブラリーを調製、定量化、およびノーマライズするための迅速かつ簡単なワークフローを提供し、このキットは限られた量で利用できる貴重なサンプルでの使用に適しています。

主な特長

  • わずか90分で、わずか15分のハンズオンタイムで迅速なライブラリー調製が可能

  • サンプルプーリングとシーケンスの前にライブラリーの定量化を排除 

  • イルミナのシーケンスシステムを使用して、8時間以内に迅速な結果を提供

  • PCRアンプリコンの高い均一なカバレッジと正確なコールを実現

  • 小さなゲノムの高品質のde novoアセンブリを産生

  • 1回の実験で最大384のサンプルの処理と独自のバーコード化によりスケーラビリティを実現

本製品は、 イルミナアドバンテージ(TG)製品としてもご利用いただけます。Illumina Advantageの大規模なシーケンス製品は、ロット単位の出荷検査、より長い有効期間、そして事前製品変更通知の提供を特長とし、研究室の効率性を高めます。


仕様


必要な製品

必要な製品:

増幅ライブラリーを精製するためのイルミナ精製ビーズ。

以下のインデックスキットのいずれか:

ビーズベースのノーマライゼーション:

  • Nextera XT V2 Index KitセットA、B、C、またはD 
  • Nextera XT Index Kit(FC-131-1001)

標準ノーマライゼーション:

  • イルミナDNA/RNA UDインデックスセットA、B、C、またはD
/ 結果

アプリケーション

Nextera XT DNA Library Preparation Kitは、低DNAインプット(1 ng)をサポートし、小さなゲノム、PCRアンプリコン、プラスミド用の高品質のシーケンス対応ライブラリーをわずか90分で提供します。

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

Nextera XT DNAライブラリー調製キット


プロジェクトの推奨事項

装置 Recommended number of samples Read length
MiSeq System

Up to 384 samples per run

最大2 × 300 bp

NextSeq 550 System

Up to 384 samples per run

最大2 × 150 bp


関連するアプリケーションとメソッド

比較する

Nextera XT DNA Library Preparation Kit Illumina DNA Prep
アッセイ時間 DNA抽出からライブラリーのノーマライズまで約5.5時間。(ライブラリー調製時間:約90分)。 約3~4時間(DNA抽出からライブラリーのノーマライズまで)
自動化に関する互換性 Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots
自動化の詳細 利用可能な自動化方法を見る 利用可能な自動化方法を見る
説明 DNAローインプット要件で、小規模ゲノム、PCRアンプリコンおよびプラスミド用のシーケンス対応ライブラリーを90分で調製します。

さまざまなサンプルタイプとDNAインプット量に対応する迅速で柔軟なライブラリー調製ワークフローにより、ヒトから微生物の全ゲノムシーケンスまで、幅広いアプリケーションにアクセスできます。 

ハンズオンタイム 15分 1〜1.5時間
インプット量 1 ng DNA 小さなゲノム(微生物など)の場合はDNA 1~500 ng、大きなゲノム(ヒトなど)の場合はDNA 100~500 ng。(血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください)。
システム MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeqシステム, NextSeq 500 Desktop Sequencer MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
作用機序 酵素による断片化 ビーズ結合トランスポソーム
手法 Shotgun Sequencing, Whole-Genome Sequencing, De Novo Sequencing, 16s rRNA Sequencing, Amplicon Sequencing Shotgun Sequencing, Whole-Genome Sequencing, De Novo Sequencing, Amplicon Sequencing
マルチプレックス ユニークにインデックスされた最大384サンプルをプールし、一緒にシーケンスできます。 最大384のユニークデュアル(UD)の組み合わせと96のコンビナトリアルデュアル(CD)の組み合わせ
核酸の種類 DNA DNA
サンプルタイプ Low-Input Samples, Single Cells Blood, Not FFPE-Compatible, Saliva
生物種 Drosophila, すべて, Mammalian, マウス, Yeast, Zebrafish, Fungal, ヒト, ラット, Plant, Virus, Nematode, Bacteria Drosophila, すべて, Mammalian, マウス, Yeast, Zebrafish, ヒト, ラット, Plant, Virus, Nematode, Bacteria
生物種詳細 任意の種に対応 任意の種に対応
ターゲットインサートサイズ 300 bp~1.5 kb 約350 bp
テクノロジー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー
バリアントクラス Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Chromosomal abnormalities, Germline variants, Structural variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)

選択ツール:

高いカバレッジ、正確なコール

Nextera XTキットは、dbSNPデータベース内で確認されたとおり、正確なバリアントコールにより、幅広いアンプリコンサイズにわたって高い均一なカバレッジを実現します。 

大きなアンプリコンの均一なカバレッジ

Nextera XTキットは、(A)高いシーケンスカバレッジ(> 1000×)および(B)ヒトゲノムの高度に可変なノンコーディング領域における大きなアンプリコン(5.1 kb)の位置に沿った正確なバリアントコーリングを示します。

小規模ゲノムの高品質のde novoアセンブリ

Nextera XTキットは、優れたN50スコアと1 ngのゲノムDNAからのカバレッジで、大腸菌ゲノムの高品質のde novoアセンブリを生成します。

リソース

サムネール

Nexteraライブラリー調製のベストプラクティス

このビデオでは、Nexteraライブラリー調製プロセスの主なステップを確認し、最適な結果を得るためのヒントとコツを紹介します。

サムネール

Nextera XT:サンプルの調製と使用

Nextera XTサンプル調製プロセスに関するこのウェビナーでは、プロトコール、重要なステップのベストプラクティス、推奨アプリケーションについて説明します。

ライブラリー調製 (2)

Nextera XT DNA Library Preparation Kit (24 samples)

FC-131-1024

24のライブラリー調製用試薬が含まれます。インデックスアダプターと精製ビーズは別売りです。

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Discounts:

Nextera XT DNA Library Preparation Kit (96 samples)

FC-131-1096

96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。インデックスアダプターと精製ビーズは別売りです。

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Illumina Advantage 製品 (3)

TG Nextera® XT DNA Sample Preparation Kit (96 Samples)

TG-131-1096

各Nextera® XT DNA Sample Preparation Kitには、最大96のサンプル調製に十分な試薬が入っています。

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TG Nextera® XT Index Kit v2 Set A (96 Indices, 384 Samples)

TG-131-2001

Nextera XTサンプル調製用96インデックスのバージョン2(セットA)。

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TG Nextera® XT Index Kit v2 Set B (96 Indices, 384 Samples)

TG-131-2002

Nextera XTサンプル調製用96インデックスのバージョン2(セットB)。

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インデックスアダプター (13)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042666

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042667

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Discounts:

Nextera XT Index Kit v2 Set A (96 indexes, 384 samples)

FC-131-2001

384サンプルのラベリングに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製キットと精製ビーズは別売りです。

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Discounts:

Nextera XT Index Kit v2 Set B (96 indexes, 384 samples)

FC-131-2002

384サンプルにラベル表示できる96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製キットと精製ビーズは別売りです。

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Discounts:

Nextera XT Index Kit v2 Set C (96 indexes, 384 samples)

FC-131-2003

384サンプルのラベリングに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製キットと精製ビーズは別売りです。

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Discounts:

Nextera XT Index Kit v2 Set D (96 indexes, 384 samples)

FC-131-2004

384のサンプルのラベリングに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製キットと精製ビーズは別売りです。

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Nextera XT Index Kit (24 indexes, 96 samples)

FC-131-1001

96サンプルにラベルを貼るのに十分な24、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製ビーズと精製ビーズは別々に購入してください。

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アクセサリー製品 (2)

Illumina Purification Bead, 100mL

20060057

ライブラリーのクリーンアップとサイズ選択用のビーズ100 mL容器が1個含まれています。ライブラリー調製試薬および濃縮試薬、プローブパネル、インデックスは別売りです。

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Illumina Purification Bead, 400mL

20060058

ライブラリーのクリーンアップとサイズ選択用のビーズ100 mL容器4個が含まれます。ライブラリー調製試薬および濃縮試薬、プローブパネル、インデックスは別売りです。

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選択中の製品一覧

製品名

数量

Unit Price

よくある質問(FAQ)

Nexteraタグメンテーションは、すべてのイルミナシーケンスプラットフォームのゲノムDNAからシーケンス対応ライブラリーを調製するためにin vitroトランスポジションを使用します。タグメンテーションテクノロジーは、シングルチューブ酵素反応でシーケンスアダプターでDNAを断片化し、タグ付けします。 

Nexteraケミストリーは、トランスポゾンベースのDNA断片化を使用して、トランスポゾンがDNAを切断し、アダプターでタグ付けします。一方、TruSeqケミストリーは、機械的せん断を使用してDNAを断片化する代替エンリッチメントプロトコールに従います。

Nextera XTライブラリーごとに最大384のサンプルのマルチプレックスが可能です。
/ 結果

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

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