	NextSeq 550システム	NextSeq 2000システムラン1	NextSeq 2000システムラン2
主要ランメトリクス
ペアエンドリードPF	514.2M	518.3M	532.8M
収量	103.9 Gb	103.7 Gb	106.5 Gb
エラー率	0.34%	0.32%	0.30%
二次解析メトリクス
常染色体コール率	95.61%	95.95%	95.94%
アライメントリード（%）	99.15%	99.08%	99.07%
ターゲット領域平均カバレッジ深度	78.05	77.85	78.15
カバレッジ均一性	93.20%	93.23%	93.28%
SNV精度	99.3%	99.3%	99.33%
SNVリコール率	94.1%	94.2%	94.27%
Indel精度	88.0%	89.3%	89.19%
Indelリコール率	83.3%	84.7%	84.75%

バルクmRNAシーケンスの同等性能

	NextSeq 550システム	NextSeq 2000システムラン1	NextSeq 2000システムラン2
メトリクス
ペアエンドリードPF	422.4M	511.6M	523.7M
収量	63.6 Gb	76.76 Gb	78.25 Gb
エラー率	0.27%	0.27%	0.33%
検出した遺伝子の平均数（n=24）	24,355	24,284	24,357

サポートデータと図

NextSeq 550システムを用いたバルクmRNA-Seqの特異的RNAターゲットの定量結果は、y軸にプロットされています。NextSeq 2000システムの結果はx軸にプロットされています。y = xのトレンドラインに沿ってデータの一致が認められます^R2（4つのレプリケートすべてで> 0.99）。

Read length	NextSeq 1000/2000 P1 Reagents	NextSeq 1000/2000 P2 Reagents	NextSeq 2000 P3 Reagents
Output per flow cell^a
1 × 50 bp (P3 only)			60 Gb
2 × 50 bp	10 Gb	40 Gb	120 Gb
2 × 100 bp		80 Gb	240 Gb
2 × 150 bp	30 Gb	120 Gb	360 Gb
2 × 300 bp	60 Gb	180 Gb
Reads CPF	100M	400M (300M for 2 x 300 bp)	1.2B
Quality scores^b
1 × 50 bp	≥ 90% of bases higher than Q30
2 × 50 bp	≥ 90% of bases higher than Q30
2 × 100 bp	≥ 85% of bases higher than Q30
2 × 150 bp	≥ 85% of bases higher than Q30
2 × 300 bp	≥ 75% of bases higher than Q30
Run time
1 × 50 bp			~11 hours
2 × 50 bp	~10 hours	~13 hours	~19 hours
2 × 100 bp		~21 hours	~33 hours
2 × 150 bp	~19 hours	~29 hours	~48 hours
2 × 300 bp	~34 hours	~44 hours

Output specifications based on a single flow cell using Illumina PhiX control library at supported cluster densities. CPF = clusters passing filter.
Quality scores are based on using an Illumina PhiX control library. Performance may vary based on library type and quality, insert size, loading concentration, and other experimental factors

製品資料

NextSeq 1000 and NextSeq 2000 Systems FAQ

FAQ Document | PDF < 1 MB

NextSeq 1000 and NextSeq 2000 single-cell RNA sequencing solution

Application Note | PDF < 1 MB

NextSeq 1000 and NextSeq 2000 RNA sequencing solution

Application Note | PDF < 1 MB

High-resolution, high-throughput spatial transcriptomics of complex tissues

Application Note | PDF 3 MB

NextSeq 1000 and NextSeq 2000 exome sequencing solution

Application Note | PDF < 1 MB

Small whole-genome sequencing on NextSeq 1000 and NextSeq 2000 Systems

Application Note | PDF < 1 MB

16S rRNA sequencing on NextSeq™ 1000 and NextSeq 2000 Systems

Application Note | PDF < 1 MB

Full-length V(D)J immune repertoire sequencing (IR-Seq) on the NextSeq™ 1000 and NextSeq 2000 Systems

Application Note | PDF < 1 MB

Multiplex high-throughput proteomics with exceptional analytical specificity

Technical Note | PDF < 1 MB

Technical Note | PDF | 2 versions

Explore the transcriptome with single-cell resolution

Technical Note | PDF 1 MB

Technical Note | PDF | 3 versions

NextSeq 1000 and NextSeq 2000 Sequencing Systems specification sheet

Data Sheet | PDF < 1 MB

Data Sheet | PDF | 5 versions

マニュアルとサポート情報

NextSeq 1000/2000 Sequencing System Documentation

カスタムプロトコルセレクタ
Generates customized, end-to-end instructions

すべて NextSeq 1000/2000 Sequencing System Support Resources Support

NextSeq 1000/2000試薬

Illumina RNA Prep with Enrichment

卓越したキャプチャー効率とカバレッジの均一性で、膨大な数の標的遺伝子の迅速な探索を実現します。

汎コロナウイルスパネル

このパネルでは、動物の貯留槽のサーベイランスと既知のコロナウイルスのシーケンスのために、既知のコロナウイルス属を少なくとも200種類特性化できます。

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit

包括的で迅速なターゲットエンリッチメントシーケンスにより、SARS-CoV-2株を含む一般的な呼吸器系ウイルスの高感度な検出と特性評価を行います。

TruSeq RNA Exome

ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織やその他の低品質のサンプルからRNAをシーケンスするための再現性と経済性を兼ね備えたソリューションを提供します。わずか10 ngのトータルRNAから得られる精度

Illumina DNA Prep with Enrichment

カスタムパネル、固定パネル、全エクソーム濃縮のためのターゲットリシーケンスを提供する幅広いアプリケーションに対応した迅速な統合ワークフロー。

Exome Sequencing

Whole-exome sequencing is used to investigate protein-coding regions of the genome to uncover genetic influences on disease and population health.

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mRNAシーケンス

NGSを用いたmRNAシーケンス（mRNA-Seq）により、既知および新規の転写産物を同定し、転写産物の量を測定することができます。

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超微量サンプルおよびシングルセル RNA-Seq 解析

With single-cell RNA-Seq, you can study cellular differences often masked by bulk sampling. Explore high- and low-throughput single-cell analysis methods.

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