TruSeq RNA Exome

ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織やその他の低品質のサンプルからRNAをシーケンスするための再現性と経済性を兼ね備えたソリューションを提供します。わずか10 ngのトータルRNAから得られる精度

約2日

アッセイ時間

約11時間

ハンズオンタイム

新鮮/凍結検体から10 ngのトータルRNA、またはFFPE検体から20 ngのトータルRNA

インプット量

仕様タブで詳細を確認する

旧TruSeq RNAアクセスライブラリー調製キット(カタログ番号RS-301-2001およびRS-301-2002)が、TruSeq RNA Exomeとして生まれ変わりました。製品構成が変更になっています。新しい構成では、ライブラリー調製、インデックスアダプター、濃縮試薬、エクソームパネルなどの主要構成品を別途購入できます。これまでに、カタログ番号 RS-301-2001またはカタログ番号 RS-301-2002をご購入いただいていた場合は、以下の構成品をご購入ください:濃縮のためのTruSeq RNAライブラリー調製(カタログ番号20020189)、TruSeq RNA濃縮(カタログ番号20020490)、エクソームパネル(カタログ番号20020183)、以下のインデックスアダプターセクションのアイテム1つ。

概要

TruSeq RNA Exome(旧TruSeq RNAアクセスライブラリー調製キット)は、トータルRNAを既知のストランド由来のテンプレート分子に変換し、コーディングRNAを配列特異的にキャプチャーします。そのため、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織などの品質の低いサンプルから単離されたヒトRNAを解析できる低コストのソリューションとなります。

主な特長

  • 手頃な価格とフォーカス - ヒトトランスクリプトームコーディング領域を分離することで、シーケンス深度のほんの一部で検出力を最大化

  • 難しいサンプルからの高品質データ - FFPE組織を含む分解サンプルからのRNAシーケンスに 最適化

  • 出発物質が限られているサンプル - 高感度を維持しながら、サンプルインプット要件 を大幅に削減(新鮮または凍結サンプルからはわずか10 ngのトータルRNA、分解サンプルからは20 ngのトータルRNA)

TruSeq RNA Exomeでは、RNAコーティング領域にフォーカスしたRNAシーケンス(RNA-Seq)ライブラリーを分解サンプルから作成することができます。これらの重要な情報が含まれた領域のみにフォーカスすることで、トータルRNAシーケンスで必要とされるリード深度はわずかでありながら、検出力を最大限にすることができます。その結果、RNAインプット量の低減、サンプルスループットの向上、および費用効率の高いトランスクリプトーム解析が実現します。1~4プレックスの濃縮反応をサポートするのに十分な試薬が含まれます。


仕様


必要な製品

イルミナは、お客様のワークフローを柔軟にするモジュラー式の注文製品方式を採用しています。 ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター、エクソームパネル構成品は別売りになります。

/ 結果

アプリケーション

ワークフローの例


プロジェクトの推奨事項

装置 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

5 to 16 samples per run (based on 25 million reads per sample)

2 x 75 bp

NovaSeq 6000 System

Samples per run (dual flow cell): S1: 96, S2: 96, S4: 192 (currently limited by available index combinations)

2 × 100 bp

NovaSeq 6000 System

Samples per run (dual flow cell): S1: 96, S2: 96, S4: 192 (currently limited by available index combinations)

2 × 100 bp


関連するアプリケーションとメソッド

比較する

TruSeq RNA Exome Illumina RNA Prep with Enrichment Illumina Stranded mRNA Prep
アッセイ時間 約2日 <9時間 6.5時間
自動化に関する互換性 Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots Liquid Handling Robots
自動化の詳細 利用可能な自動化方法を見る 利用可能な自動化方法を見る
コンテンツ仕様 コーディング・トランスクリプトーム/RNAエクソームをキャプチャー Illumina Exome Panelと併用する場合、コーディング・トランスクリプトームをキャプチャー コーディング・トランスクリプトームをストランド情報でキャプチャー
説明 正確なストランド情報とサンプル入力要件の軽減により、コーディング・トランスクリプトームの明確で包括的なビューを研究者に提供します。 ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織およびその他の低品質サンプルを含む幅広いサンプルタイプおよびインプットからの標的転写産物の検出と発見を可能にする、再現性のある経済的なソリューション 正確なストランド情報を用いたコーディング・トランスクリプトーム解析用のシンプルで費用対効果の高いソリューション
ハンズオンタイム 約11時間 <2時間 <3時間
インプット量 新鮮/凍結検体から10 ngのトータルRNA、またはFFPE検体から20 ngのトータルRNA 10 ng RNA、20 ng FFPE RNA 標準品質トータルRNA25~1,000 ng
システム NextSeq 550 Desktop Sequencer, HiSeq 3000, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System, HiSeq 4000 MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeqシステム, NovaSeq 6000 System NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
作用機序 コーディングRNAをターゲットとするビオチン化キャプチャープローブ。RNAにポリA鎖は不要。 ビーズ結合トランスポソーム ポリAキャプチャー、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加
手法 mRNA Sequencing, Exome Sequencing Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, mRNA Sequencing mRNA Sequencing
マルチプレックス 最大24のシングル、96のコンビナトリアル(CD)デュアル 最大384のユニークデュアルインデックス 最大384のユニークデュアルインデックス
核酸の種類 RNA RNA RNA
サンプルタイプ Low-Input Samples, FFPE Tissue Blood, Low-Input Samples, FFPE Tissue Not FFPE-Compatible, Low-Input Samples
生物種 ヒト ヒト, Virus Mammalian, ウシ, マウス, ヒト, ラット
Strand specificity Stranded Non-Stranded Stranded
テクノロジー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー
バリアントクラス Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants

融合遺伝子の効率的な発見

TruSeq RNA Exomeは融合ジャンクションに特有なプローブを設計する必要なく、発現した融合遺伝子転写物の検出を可能にします。適切に特性化されたBCR-ABL融合遺伝子は、2,500万リードでUniversal Human Reference RNA (UHRR)のサンプルにおいて効率的に検出されます。

リソース

サムネール

エボラ出血熱と性感染症

エボラウイルス疾患(EVD)生存者である男性が、エボラ出血熱の治療を受けて退院してから6か月に、女性パートナーにエボラウイルスを感染させた結果、この女性はこの疾患のために亡くなりました。この生存者の精液は従来の手段による検査では陰性でしたが、著者らは、Illumina TruSeq RNA Access Kitとカスタムプローブを使用してこの精液サンプルのEBOV RNAを濃縮できました。

ライブラリー調製 (1)

TruSeq® RNA Library Prep for Enrichment (48 Samples)

20020189

48のライブラリー調製用試薬が含まれます。インデックスアダプター、エンリッチメントパネル、およびエンリッチメント試薬は別売りです。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

エンリッチメント (1)

TruSeq® RNA Enrichment (12 enrichments)

20020490

TruSeq RNA Library Prep for Enrichmentと組み合わせると、12の濃縮反応に十分です。ライブラリー調製、インデックスアダプター、プローブパネルは別売りです。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

インデックスアダプター (2)

TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)

20020492

48の個別RNAサンプルを調製するための24のインデックス(インデックス:2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19)のうち12を含みます。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)

20020493

48の個別RNAサンプルを調製するための24のインデックス(インデックス:1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27)のうち12が含まれます。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

パネル (1)

Illumina Exome Panel – Enrichment Oligos Only

20020183

イルミナDNA Prep with Enrichmentとペアで8回の濃縮反応、TruSeq RNA Exomeとペアで12回の反応、イルミナRNA prep with enrichmentとペアで32回の反応に十分です。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびインデックスアダプターは別売りです。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

表示されている結果 : /

選択中の製品一覧

製品名

数量

Unit Price

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

製品情報のリクエスト

当社の製品およびサービスに関する情報、または当社のテクノロジーに関するご質問がございましたら、ぜひお問い合わせください。