ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織やその他の低品質のサンプルからRNAをシーケンスするための再現性と経済性を兼ね備えたソリューションを提供します。わずか10 ngのトータルRNAから得られる精度
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
旧TruSeq RNAアクセスライブラリー調製キット（カタログ番号RS-301-2001およびRS-301-2002）が、TruSeq RNA Exomeとして生まれ変わりました。製品構成が変更になっています。新しい構成では、ライブラリー調製、インデックスアダプター、濃縮試薬、エクソームパネルなどの主要構成品を別途購入できます。以前カタログ. No. RS-301-2001またはカタログ No. RS-301-2002、以下のコンポーネントを購入：濃縮のためのTruSeq RNAライブラリー調製（カタログ番号20020189）、TruSeq RNA濃縮（カタログ番号20020490）、エクソームパネル（カタログ番号20020183）、以下のインデックスアダプターセクションのアイテム1つ。
TruSeq RNA Exome（旧TruSeq RNAアクセスライブラリー調製キット）は、トータルRNAを既知のストランド由来のテンプレート分子に変換し、コーディングRNAを配列特異的にキャプチャーします。そのため、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織などの品質の低いサンプルから単離されたヒトRNAを解析できる低コストのソリューションとなります。
TruSeq RNA Exomeでは、RNAコーティング領域にフォーカスしたRNAシーケンス（RNA-Seq）ライブラリーを分解サンプルから作成することができます。これらの重要な情報が含まれた領域のみにフォーカスすることで、トータルRNAシーケンスで必要とされるリード深度はわずかでありながら、検出力を最大限にすることができます。その結果、RNAインプット量の低減、サンプルスループットの向上、および費用効率の高いトランスクリプトーム解析が実現します。1～4プレックスの濃縮反応をサポートするのに十分な試薬が含まれます。
| アッセイ時間 | 約2日 |
|---|---|
| Automation capability | Liquid handling robots |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
| コンテンツ仕様 | コーディング・トランスクリプトーム/RNAエクソームをキャプチャー |
| 説明 | 正確なストランド情報とサンプル入力要件の軽減により、コーディング・トランスクリプトームの明確で包括的なビューを研究者に提供します。 |
| ハンズオンタイム | 約11時間 |
| インプット量 | 新鮮/凍結検体から10 ngのトータルRNA、またはFFPE検体から20 ngのトータルRNA |
| システム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 作用機序 | コーディングRNAをターゲットとするビオチン化キャプチャープローブ。RNAにポリA鎖は不要。 |
| 手法 | Exome sequencing, mRNA sequencing |
| マルチプレックス | 最大24のシングル、96のコンビナトリアル（CD）デュアル |
| Nucleic acid type | RNA |
| Specialized sample types | Low-input samples, FFPE tissue |
| Species category | ヒト |
| Strand specificity | Stranded |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts, Transcript variants |
イルミナは、お客様のワークフローを柔軟にするモジュラー式の注文製品方式を採用しています。 ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター、エクソームパネル構成品は別売りになります。
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | 5 to 16 samples per run (based on 25 million reads per sample) |
2 x 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | Samples per run (dual flow cell): S1: 96, S2: 96, S4: 192 (currently limited by available index combinations) |
2 × 100 bp |
| NovaSeq 6000 System | Samples per run (dual flow cell): S1: 96, S2: 96, S4: 192 (currently limited by available index combinations) |
2 × 100 bp |
劣化したFFPE組織やその他の低品質サンプルから高品質の結果が得られるFFPE RNAシーケンスソリューションを見つけてください。
RNAシーケンス（RNA-Seq）により、がんの遺伝子発現とトランスクリプトームの変化を検出し、新しいがん遺伝子転写物を同定します。
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
| TruSeq RNA Exome | Illumina RNA Prep with Enrichment | Illumina Stranded mRNA Prep | |
|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | 約2日 | <9時間 | 6.5時間 |
| Automation capability | Liquid handling robots | Liquid handling robots | Liquid handling robots |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | |
| コンテンツ仕様 | コーディング・トランスクリプトーム/RNAエクソームをキャプチャー | Illumina Exome Panelと併用する場合、コーディング・トランスクリプトームをキャプチャー | コーディング・トランスクリプトームをストランド情報でキャプチャー |
| 説明 | 正確なストランド情報とサンプル入力要件の軽減により、コーディング・トランスクリプトームの明確で包括的なビューを研究者に提供します。 | ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織およびその他の低品質サンプルを含む幅広いサンプルタイプおよびインプットからの標的転写産物の検出と発見を可能にする、再現性のある経済的なソリューション | 正確なストランド情報を用いたコーディング・トランスクリプトーム解析用のシンプルで費用対効果の高いソリューション |
| ハンズオンタイム | 約11時間 | <2時間 | <3時間 |
| インプット量 | 新鮮/凍結検体から10 ngのトータルRNA、またはFFPE検体から20 ngのトータルRNA | 10 ng RNA、20 ng FFPE RNA | 標準品質トータルRNA25～1,000 ng |
| システム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeqシステム, NovaSeq 6000 System | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 作用機序 | コーディングRNAをターゲットとするビオチン化キャプチャープローブ。RNAにポリA鎖は不要。 | ビーズ結合トランスポソーム | ポリAキャプチャー、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加 |
| 手法 | Exome sequencing, mRNA sequencing | mRNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment | mRNA sequencing |
| マルチプレックス | 最大24のシングル、96のコンビナトリアル（CD）デュアル | 最大384のユニークデュアルインデックス | 最大384のユニークデュアルインデックス |
| Nucleic acid type | RNA | RNA | RNA |
| Specialized sample types | Low-input samples, FFPE tissue | Blood, Low-input samples, FFPE tissue | Not FFPE-compatible, Low-input samples |
| Species category | ヒト | ヒト, Virus | Mammalian, ウシ, マウス, ヒト, ラット |
| Strand specificity | Stranded | Non-stranded | Stranded |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー |
| バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
融合遺伝子の効率的な発見
TruSeq RNA Exomeは融合ジャンクションに特有なプローブを設計する必要なく、発現した融合遺伝子転写物の検出を可能にします。適切に特性化されたBCR-ABL融合遺伝子は、2,500万リードでUniversal Human Reference RNA （UHRR）のサンプルにおいて効率的に検出されます。
エボラ出血熱と性感染症
エボラウイルス疾患（EVD）生存者である男性が、エボラ出血熱の治療を受けて退院してから6か月に、女性パートナーにエボラウイルスを感染させた結果、この女性はこの疾患のために亡くなりました。この生存者の精液は従来の手段による検査では陰性でしたが、著者らは、Illumina TruSeq RNA Access Kitとカスタムプローブを使用してこの精液サンプルのEBOV RNAを濃縮できました。
TruSeq® RNA Library Prep for Enrichment (48 Samples)
20020189
48のライブラリー調製用試薬が含まれます。インデックスアダプター、エンリッチメントパネル、およびエンリッチメント試薬は別売りです。
List Price:
Discounts:
TruSeq® RNA Enrichment (12 enrichments)
20020490
TruSeq RNA Library Prep for Enrichmentと組み合わせると、12の濃縮反応に十分です。ライブラリー調製、インデックスアダプター、プローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)
20020492
48の個別RNAサンプルを調製するための24のインデックス（インデックス：2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19）のうち12を含みます。
List Price:
Discounts:
TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)
20020493
48の個別RNAサンプルを調製するための24のインデックス（インデックス：1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27）のうち12が含まれます。
List Price:
Discounts:
Illumina Exome Panel – Enrichment Oligos Only
20020183
イルミナDNA Prep with Enrichmentとペアで8回の濃縮反応、TruSeq RNA Exomeとペアで12回の反応、イルミナRNA prep with enrichmentとペアで32回の反応に十分です。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
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製品名
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単価
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリを準備するための、高速で統合されたワークフロー。
NextSeq 1000/2000システムの試薬は、使いやすいカートリッジと複数のフローセル構成を備えており、柔軟なシーケンスオプションが可能です。
mRNAからシーケンスライブラリーを調製し、ストランド特異的情報でコーディングトランスクリプトームを明確に把握します。
ヒト、マウスおよびホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織を含むさまざまな生物種やサンプルタイプに対応した、堅牢でスケーラブルな全トランスクリプトーム解析（RNA-Seq）ソリューション。
Reagent v2.5 Kitは、初期の蛍光強度を維持する耐久性のあるフローセルを使用しており、以前のバージョンと比較して安定性と性能が向上しています。
幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス配列ライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフロー。
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
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