TruSeq RNA Exome

ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織やその他の低品質のサンプルからRNAをシーケンスするための再現性と経済性を兼ね備えたソリューションを提供します。わずか10 ngのトータルRNAから得られる精度 続きを読む...
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ライブラリー調製

TruSeq® RNA Library Prep for Enrichment(48サンプル)

20020189

価格
 
 

エンリッチメント

TruSeq® RNA Enrichment(12濃縮)

20020490

価格
 
 

インデックスアダプター

TruSeq RNA Single Indexes Set A(12インデックス、48サンプル)

20020492

価格
 
 

TruSeq RNA Single Indexes Set B(12インデックス、48サンプル)

20020493

価格
 
 

パネル

Illumina Exome Panel-濃縮オリゴ専用

20020183

価格
 
 
アクセサリー製品

Illumina® Free Adapter Blocking Reagent(12反応)

20024144

Illumina® Free Adapter Blocking Reagent(48反応)

20024145

製品のハイライト

TruSeq RNA Exome(旧TruSeq RNAアクセスライブラリー調製キット)は、トータルRNAを既知のストランド由来のテンプレート分子に変換し、コーディングRNAを配列特異的にキャプチャーします。そのため、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織などの品質の低いサンプルから単離されたヒトRNAを解析できる低コストのソリューションとなります。

  • 費用効果とフォーカス — ヒトトランスクリプトームコーディング領域だけにフォーカスすることで、少ないシーケンス深度で検出力が最大限になります。
  • 難しいサンプルからの高品質データ — ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織サンプルなどの分解サンプルからのRNAシーケンスに最適化されています。
  • 量が限られた出発物質サンプル — 高感度を維持しながら、必要なサンプル量を大幅に低減(新鮮サンプルまたは凍結サンプルの場合はわずか10 ngのトータルRNA、分解サンプルの場合は20 ngのトータルRNA)。

TruSeq RNA Exomeでは、RNAコーティング領域にフォーカスしたRNAシーケンス(RNA-Seq)ライブラリーを分解サンプルから作成することができます。これらの重要な情報が含まれた領域のみにフォーカスすることで、トータルRNAシーケンスで必要とされるリード深度はわずかでありながら、検出力を最大限にすることができます。その結果、RNAインプット量の低減、サンプルスループットの向上、および費用効率の高いトランスクリプトーム解析が実現します。1~4プレックスの濃縮反応をサポートするのに十分な試薬が含まれます。

イルミナのリボソームのRNA除去プロトコールの総合的評価を読む

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仕様

推奨プロジェクト

装置 推奨サンプル数 リード長
NextSeq 550 System 1ランあたり5~16サンプル(1サンプルあたり2,500万リードに基づく) 2 x 75 bp
NovaSeq 6000 System 1ランあたりのサンプル(デュアルフローセル):S1:96、S2:96、S4:192(現在、利用可能なインデックスの組み合わせによって制限されています) 2 × 100 bp
NovaSeq 6000 System 1ランあたりのサンプル(デュアルフローセル):S1:96、S2:96、S4:192(現在、利用可能なインデックスの組み合わせによって制限されています) 2 × 100 bp

製品比較

TruSeq RNA Exome Illumina RNA Prep with Enrichment Illumina Stranded mRNA Prep
アッセイ時間 約2日
インプット量 新鮮/凍結検体から10 ngのトータルRNA、またはFFPE検体から20 ngのトータルRNA
コンテンツ仕様 コーディング・トランスクリプトーム/RNAエクソームをキャプチャー
ストランド特異性 ストランド化 Non-Stranded ストランド化
ハンズオンタイム 約11時間
マルチプレックス 最大24のシングル、96のコンビナトリアル(CD)デュアル
作用機序 コーディングRNAをターゲットとするビオチン化キャプチャープローブ。RNAにポリA鎖は不要。
生物種カテゴリー ヒト ウイルス, ヒト ウシ, 哺乳類, ヒト
自動化に関する互換性 自動液体分注システム 自動液体分注システム 自動液体分注システム
説明 正確なストランド情報とサンプル入力要件の軽減により、コーディング・トランスクリプトームの明確で包括的なビューを研究者に提供します。

旧TruSeq RNAアクセスライブラリー調製キット(カテゴリ番号RS-301-2001およびRS-301-2002)は、現在はTruSeq RNA Exomeとして生まれ変わりました。製品構成が変更になっています。新しい構成では、ライブラリー調製、インデックスアダプター、濃縮試薬、エクソームパネルなどの主要構成品を別途購入できます。これまでに、カタログ番号 RS-301-2001、またはカタログ番号 RS-301-2002をお買い上げいただいる場合は、以下の構成品をご購入ください:濃縮のためのTruSeq RNAライブラリー調製(カタログ番号20020189)、TruSeq RNA濃縮(カタログ番号20020490)、エクソームパネル(カタログ番号20020183)、以下のインデックスアダプターセクションのアイテム1つ。

メソッドごとのワークフロー例

 

Customer Stories

Looking Beyond Single-Drug Approaches to Precision Oncology Research

Researchers rely on transcriptomics to uncover multiple drug-susceptible tumorigenic pathways.

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A Tale of Two RNA Library Prep Kits

A critical comparison between two popular TruSeq RNA Library Prep Kits reveals new information of interest to researchers conducting RNA sequencing studies.

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サポートデータと図

融合遺伝子の効率的な発見
サポートデータと図

TruSeq RNA Exomeは融合ジャンクションに特有なプローブを設計する必要なく、発現した融合遺伝子転写物の検出を可能にします。適切に特性化されたBCR-ABL融合遺伝子は、2,500万リードでUniversal Human Reference RNA (UHRR)のサンプルにおいて効率的に検出されます。

 

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