TruSeq RNA Exome(旧TruSeq RNAアクセスライブラリー調製キット)は、トータルRNAを既知のストランド由来のテンプレート分子に変換し、コーディングRNAを配列特異的にキャプチャーします。そのため、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織などの品質の低いサンプルから単離されたヒトRNAを解析できる低コストのソリューションとなります。
TruSeq RNA Exomeでは、RNAコーティング領域にフォーカスしたRNAシーケンス(RNA-Seq)ライブラリーを分解サンプルから作成することができます。これらの重要な情報が含まれた領域のみにフォーカスすることで、トータルRNAシーケンスで必要とされるリード深度はわずかでありながら、検出力を最大限にすることができます。その結果、RNAインプット量の低減、サンプルスループットの向上、および費用効率の高いトランスクリプトーム解析が実現します。1~4プレックスの濃縮反応をサポートするのに十分な試薬が含まれます。
装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
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NextSeq 550 System | 1ランあたり5~16サンプル(1サンプルあたり2,500万リードに基づく) | 2 x 75 bp |
NovaSeq 6000 System | 1ランあたりのサンプル(デュアルフローセル):S1:96、S2:96、S4:192(現在、利用可能なインデックスの組み合わせによって制限されています) | 2 × 100 bp |
NovaSeq 6000 System | 1ランあたりのサンプル(デュアルフローセル):S1:96、S2:96、S4:192(現在、利用可能なインデックスの組み合わせによって制限されています) | 2 × 100 bp |
TruSeq RNA Exome | Illumina RNA Prep with Enrichment | Illumina Stranded mRNA Prep | |
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アッセイ時間 | 約2日 | ||
インプット量 | 新鮮/凍結検体から10 ngのトータルRNA、またはFFPE検体から20 ngのトータルRNA | ||
コンテンツ仕様 | コーディング・トランスクリプトーム/RNAエクソームをキャプチャー | ||
ストランド特異性 | ストランド化 | Non-Stranded | ストランド化 |
ハンズオンタイム | 約11時間 | ||
マルチプレックス | 最大24のシングル、96のコンビナトリアル(CD)デュアル | ||
作用機序 | コーディングRNAをターゲットとするビオチン化キャプチャープローブ。RNAにポリA鎖は不要。 | ||
生物種カテゴリー | ヒト | ウイルス, ヒト | ウシ, 哺乳類, ヒト |
自動化に関する互換性 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
説明 | 正確なストランド情報とサンプル入力要件の軽減により、コーディング・トランスクリプトームの明確で包括的なビューを研究者に提供します。 |
旧TruSeq RNAアクセスライブラリー調製キット(カテゴリ番号RS-301-2001およびRS-301-2002)は、現在はTruSeq RNA Exomeとして生まれ変わりました。製品構成が変更になっています。新しい構成では、ライブラリー調製、インデックスアダプター、濃縮試薬、エクソームパネルなどの主要構成品を別途購入できます。これまでに、カタログ番号 RS-301-2001、またはカタログ番号 RS-301-2002をお買い上げいただいる場合は、以下の構成品をご購入ください:濃縮のためのTruSeq RNAライブラリー調製(カタログ番号20020189)、TruSeq RNA濃縮(カタログ番号20020490)、エクソームパネル(カタログ番号20020183)、以下のインデックスアダプターセクションのアイテム1つ。
Researchers rely on transcriptomics to uncover multiple drug-susceptible tumorigenic pathways.
Learn MoreA critical comparison between two popular TruSeq RNA Library Prep Kits reveals new information of interest to researchers conducting RNA sequencing studies.
Read InterviewData Sheet | PDF | 5 versions
RNA-Seq Offers Significant Advantages in Immuno-Oncology Research
White Paper | PDF 2 MB
Evaluating RNA Quality from FFPE Samples
Technical Note | PDF 1 MB
Robust low-input RNA sequencing with TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Gold
Application Note | HTML