TruSeq Stranded mRNAは、トランスクリプトーム解析をコーディングするための合理化されたコスト効率の高いスケーラブルなソリューションを提供します。幅広いサンプルと互換性があります。
アンチセンス転写の検出、転写アノテーションの強化、アライメント効率の向上のためにmRNA鎖の向きを正確に測定できます。高いカバレッジ均一性は、代替転写産物、遺伝子融合、アリル特異的発現などの特徴の発見を強化します。
ストランド情報は、所与のRNA転写産物が2つのDNA鎖のどれから派生したかを識別します。この情報は、特に非ヒトサンプルについて、転写産物アノテーションの信頼性を高めます。鎖起源の同定は、アライメントするリードの割合を増加させ、サンプルあたりのシーケンスコストを削減します。
このワークフローにより、標準サンプルと低品質サンプルの両方の堅牢なインテロゲーションが可能になり、幅広い研究デザインに対応するワークフローが可能になります。
イルミナシーケンス用のライブラリーを1日で調製します。Illumina Qualified Methodは、当社のパートナーを通じてさまざまな自動化プラットフォームで利用できます。
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | RNAプロファイリング：ランあたり13～40サンプル（サンプルあたり1,000万リードに基づく） トランスクリプトーム解析：ランあたり5～16サンプル（サンプルあたり2,500万リードに基づく） |
2 x 75 bp 2 x 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | RNAプロファイリング（ランごとのサンプル、デュアルフローセル）：S1：320、S2:384、S4:768。インデックスの組み合わせ（デュアル）によって制限されます。1,000万リードに基づく。 トランスクリプトーム解析（ランごとのサンプル、デュアルフローセル）：S1：128、S2：256、S4：768. インデックスの組み合わせ（デュアル）によって制限されます。2,500万リードに基づく。 |
≤ 2 × 100 bp ≤ 2 × 100 bp |
| TruSeq Stranded mRNA | Illumina Stranded mRNA Prep | Illumina RNA Prep with Enrichment | |
|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | 約10.5時間 | ||
| インプット量 | 0.1～1 ugのトータルRNAまたは10～100 ngの以前に単離されたmRNA（ポリA鎖を有する種由来） | ||
| コンテンツ仕様 | コーディング・トランスクリプトームをストランド情報でキャプチャー | ||
| ストランド特異性 | ストランド化 | ストランド化 | Non-Stranded |
| ハンズオンタイム | 約4.5時間 | ||
| マルチプレックス | 1～96 | ||
| 作用機序 | オリゴ-dTビーズがポリA鎖をキャプチャー | ||
| 方法 | mRNAシーケンス | mRNAシーケンス | mRNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲットエンリッチメント, ターゲットエンリッチメント |
| 生物種カテゴリー | ウシ, 哺乳類, ヒト | ウシ, 哺乳類, ヒト | ウイルス, ヒト |
| 自動化に関する互換性 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
| 説明 | 正確なストランド情報で、コーディング・トランスクリプトームの明確で包括的なビューを研究者に提供します。 |
以前はTruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit（カタログ No. RS-122-2101, RS-122-2102、RS-122-2103）は現在、TruSeq Stranded mRNAと呼ばれています。製品構成が変更になっています。新しい構成では、ライブラリー調製アダプターとインデックスアダプターは別々に購入できます。個々の購入で利用可能なコンポーネントのリストは、“Select Product（製品の選択）”セクションにあります。
2015年12月のTruSeq Stranded mRNAおよびTotal RNA Library Prep Kitsデータシートの図2
FFPE組織の技術的複製は高い一致率を示し、安定したライブラリー調製性能を示しています。軸はlog2（FPKM）です。R 2値を示します。
Robust low-input RNA sequencing with TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Gold
Application Note | HTML
Data Sheet | PDF | 5 versions
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織やその他の低品質のサンプルからRNAをシーケンスするための再現性と経済性を兼ね備えたソリューションを提供します。わずか10 ngのトータルRNAから得られる精度
ヒト、マウス、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織を含むさまざまな種やサンプルタイプに対応する、堅牢で拡張性の高い全トランスクリプトーム解析（RNA-Seq）ソリューションです。
カスタムパネル、固定パネル、全エクソーム濃縮のためのターゲットリシーケンスを提供する幅広いアプリケーションに対応した迅速な統合ワークフロー。
この製品とその使用は、Max Planck Gesellschaftが所有する米国および海外で発行および/または申請中の1件以上の特許出願の対象であり、New England Biolabs, Inc.に独占的にライセンスされ、Illumina, Inc.にサブライセンスされています。 イルミナ、その関連会社、またはその認定再販業者および販売業者から本製品を購入すると、購入者は購入者（購入者が学術団体であるか営利団体であるかは問わない）が購入した製品および製品のコンポーネントを使用する譲渡不能の権利が購入者に付与されます。本製品の購入は、上記の特許または製品の製造に直接関わる特許出願のいかなる主張に基づくライセンスも譲渡するものではありません。購入者は、本製品またはそのコンポーネントを第三者に販売または譲渡したり、以下の商業目的で使用したりすることはできません。（I）製造における製品またはその構成品の使用、または（2）ヒトまたは動物における治療または予防目的での製品またはその構成品の使用。
