TruSeq Stranded Total RNA
ヒト、マウス、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織を含むさまざまな種やサンプルタイプに対応する、堅牢で拡張性の高い全トランスクリプトーム解析（RNA-Seq）ソリューションです。
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ライブラリー調製
インデックスアダプター
サービス
TruSeqトータルRNAトレーニング
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合計：
製品のハイライト
TruSeq Stranded Total RNAは、シーケンスによるトータルRNA解析のための合理化されたコスト効率の高いスケーラブルなソリューションにより、トランスクリプトームの明確なビューを提供します。
ストランドオリエンテーションの正確な測定による全トランスクリプトーム解析
TruSeq Stranded Total RNAは、低品質のDNA/RNAやホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプルなど、幅広いサンプルと互換性があり、TruSeq RNAテクノロジーのすべての利点とRibo-ZeroリボソームRNA削減ケミストリーを組み合わせています。この製品は、鎖の配向、均一なカバレッジ、代替転写産物、遺伝子融合、アリル特異的発現などの特徴の信頼性の高い発見を正確に測定することで、コーディングRNAおよび複数の形態のノンコーディングRNAの解析を可能にします。
種の適合性
TruSeq Stranded Total RNAは、ヒト、マウス、ラットのシーケンス用に設計されていますが、さまざまな真核生物種に適用できる可能性があります。
幅広い研究デザインに対応する柔軟なソリューション
TruSeq Stranded Total RNAは、特定の研究デザインのニーズに合うように複数のバージョンで提供されています。
- TruSeq Stranded Total RNA Human/Mouse/Ratは細胞質rRNAを除去
- TruSeq Stranded Total RNA Goldは、細胞質とミトコンドリアの両方のrRNAを除去します
- トータルRNAキットは、イルミナのIDT - TruSeq RNA UD Indexesの新しいユニークデュアル（UD）インデックスキットとも互換性があり、最大96のサンプルのマルチプレックスが可能です。
高速で自動化に適したワークフロー
イルミナシーケンス用のライブラリーを1日で調製します。Illumina Qualified Methodは、当社のパートナーを通じてさまざまな自動化プラットフォームで利用できます。
よく一緒に購入される製品
仕様
推奨プロジェクト
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | RNAプロファイリング：ランあたり6～20サンプル（サンプルあたり2,000万リードに基づく） トランスクリプトーム解析：ランあたり2～8サンプル（サンプルあたり5,000万リードに基づく） |
2 x 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | RNAプロファイリング（ランごとのサンプル、デュアルフローセル）：S1：160、S2：320、S4：768. インデックスの組み合わせ（デュアル）によって制限されます。2,000万リードに基づく。 トランスクリプトーム解析（ランごとのサンプル、デュアルフローセル）：S1：64、S2：128、S4：400. インデックスの組み合わせ（デュアル）によって制限されます。5,000万リードに基づく。 |
≤ 2 × 100 bp |
製品比較
| TruSeq Stranded Total RNA | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome | |
|---|---|---|
| インプット量 | 高品質トータルRNA0.1～1 ug 低品質のサンプルは、さらなる最適化を必要とする場合があります。 | |
| コンテンツ仕様 | コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー | |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス |
| マルチプレックス | ロースループットキット：最大12のサンプルをプールします。または、セットAとセットBを併せて最大24のサンプルをプールします。, ハイスループットキット：コンビナトリアルデュアルインデックスまたはユニークデュアルインデックス（近日発売）のいずれかを使用して、96個のインデックスサンプルを調製 | |
| 作用機序 | ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR | |
| 生物種カテゴリー | ヒト | 細菌, ヒト |
| 自動化に関する互換性 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit with Ribo-Zero Human/Mouse/Rat（カタログ No. RS-122-2201, RS-122-2202、RS-122-2203）およびTruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit with Ribo-Zero Gold（カタログ 番号RS-122-2301, RS-122-2302、RS-122-2303）は、それぞれ TruSeq Stranded Total RNA Human/Mouse/RatおよびTruSeq Stranded Total RNA Goldと呼ばれています。製品構成が変更になっています。新しい構成では、ライブラリー調製試薬とインデックスアダプターは別々に購入できます。個々の購入で利用可能なコンポーネントのリストは、“Select Product（製品の選択）”セクションにあります。
高品質なストランド情報
RNA存在量の一貫した正確な測定は、テクニカルレプリケート間の高い再現性によって反映されます。これらのFFPE組織の技術的複製は高い一致性を示し、安定したライブラリー調製性能を示しています。軸はlog2（FPKM）です。R 2値が表示されます。
トランスクリプト全体の均一なカバレッジ
TruSeq Stranded Total RNAは、>98%のアライメントされたストランドリードで、新鮮凍結腫瘍（FF、上）とFFPE腫瘍（下）、およびマッチングした正常乳房組織の両方で、上位1,000位の転写産物の優れたカバレッジを提供します。X軸：転写産物に沿った位置、Y軸=結合リードのカバー範囲の割合。
製品資料
Robust low-input RNA sequencing with TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Gold
Application Note | HTML
Data Sheet | PDF | 5 versions
TruSeq RNA Exome
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織やその他の低品質のサンプルからRNAをシーケンスするための再現性と経済性を兼ね備えたソリューションを提供します。わずか10 ngのトータルRNAから得られる精度
Illumina DNA Prep with Enrichment
カスタムパネル、固定パネル、全エクソーム濃縮のためのターゲットリシーケンスを提供する幅広いアプリケーションに対応した迅速な統合ワークフロー。
限定使用ラベルライセンス：本製品とその使用は、Max Planck Gesellschaftが所有する米国および海外で発行および/または申請中の1件以上の特許出願の対象であり、New England Biolabs, Inc.に独占的にライセンスされ、Illumina, Inc.にサブライセンスされています。 Illumina, Inc.、その関連会社、またはその認定再販業者および販売業者から本製品を購入すると、購入者は購入者（購入者が学術団体であるか営利団体であるかは問わない）が購入した製品および製品のコンポーネントを使用する譲渡不可の権利を購入者に譲渡します。本製品の購入は、前述の特許または製品の製造に直接適用される特許出願のいかなる主張に基づくライセンスも譲渡するものではありません。購入者は、本製品またはその構成品を第三者に販売または譲渡したり、以下の商業目的で使用したりすることはできません。（I）製造における製品またはその構成品の使用、または（2）ヒトまたは動物における治療または予防目的での製品またはその構成品の使用。