NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
TruSeq Stranded Total RNAは、シーケンスによるトータルRNA解析用に合理化された、費用対効果の高いスケーラブルなソリューションでトランスクリプトームの明瞭な全体像を提供します。
TruSeq Stranded Total RNA
ヒト、マウスおよびホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織を含むさまざまな生物種やサンプルタイプに対応した、堅牢でスケーラブルな全トランスクリプトーム解析（RNA-Seq）ソリューション。
11.5時間
アッセイ時間
5.5時間
ハンズオンタイム
高品質トータルRNA0.1～1 ug 低品質のサンプルは、さらなる最適化を必要とする場合があります。
インプット量
TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit with Ribo-Zero Human/Mouse/Rat（カタログ番号 RS-122-2201, RS-122-2202、RS-122-2203）およびTruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit with Ribo-Zero Gold（カタログ番号 RS-122-2301, RS-122-2302、RS-122-2303）は、それぞれTruSeq Stranded Total RNA Human/Mouse/RatおよびTruSeq Stranded Total RNA Goldに名称が変更されました。製品構成が変更になっています。ライブラリー調製およびインデックスアダプターの製品は（キットではなく）別々に購入する必要があります。
概要
ストランドの配向を精確に測定する全トランスクリプトーム解析
低品質のDNA/RNAやFFPEサンプルなどの幅広いサンプルに対応するTruSeq Stranded Total RNAには、TruSeq RNAテクノロジーのすべての利点とRibo-ZeroリボソームRNA削減ケミストリーが組み合わさっています。本製品は、ストランドの配向の精確な測定と、均一なカバレッジかつ高い信頼度での代替転写産物や遺伝子融合、アリル特異的発現などの特徴の発見により、コーディングRNAおよび複数の形態のノンコーディングRNAの解析を可能にします。
幅広い試験デザインに対応する柔軟なソリューション
TruSeq Stranded Total RNAは、特定の試験デザインのニーズに合うように複数のバージョンが用意されています。
高速で自動化に適したワークフロー
イルミナシーケンス用のライブラリーを1日で調製します。Illumina Qualified Methodは、 当社のパートナーを通じてさまざまな自動化プラットフォームで利用できます。
仕様
| アッセイ時間 | 11.5時間 |
|---|---|
| Automation capability | Liquid handling robot(s) |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
| コンテンツ仕様 | コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー |
| 説明 | 全トランスクリプトームシーケンシング研究用。トータルRNAバージョンは細胞質rRNAを除去し、トータルRNA Goldバージョンは細胞質およびミトコンドリアrRNAを除去します。 |
| ハンズオンタイム | 5.5時間 |
| インプット量 | 高品質トータルRNA0.1～1 ug 低品質のサンプルは、さらなる最適化を必要とする場合があります。 |
| システム | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 作用機序 | ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR |
| 手法 | Whole-transcriptome sequencing |
| マルチプレックス | ロースループットキット：最大12のサンプルをプールします。または、セットAとセットBを併せて最大24のサンプルをプールします。, ハイスループットキット：コンビナトリアルデュアルインデックスまたはユニークデュアルインデックスのいずれかを使用して、96個のインデックスサンプルを調製 |
| Nucleic acid type | RNA |
| Specialized sample types | FFPE tissue |
| Species category | マウス, ヒト, ラット |
| 生物種詳細 | rRNAの除去：ヒト、マウス、ラットのrRNAを除去 |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
必要な製品
イルミナは、お客様のワークフローを柔軟にするモジュラー式の注文製品方式を採用しています。以下のインデックスを含んだライブラリー調製製品を注文することができます。
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件
アプリケーション
ワークフローの例
ライブラリー調製
TruSeq Stranded Total RNA
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | RNA profiling: 6-20 samples per run (based on 20 million reads per sample) |
2 x 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | RNA profiling (samples per run, dual flow cell): S1: 160, S2: 320, S4: 768. Limited by index combinations (dual). Based on 20 million reads. |
≤ 2 × 100 bp |
関連するアプリケーションと手法
RNA-Seqは、次世代シーケンサー（NGS）を使用してトランスクリプトーム全体の発現を解析し、既知または新規の特徴を検出し、RNAを定量化することを可能にします。
劣化したFFPE組織やその他の低品質サンプルから高品質の結果を得るFFPE RNAシーケンスソリューションを見つけてください。
ドキュメント
比較する
| TruSeq Stranded Total RNA | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | 11.5時間 | 約7時間 | |||
| Automation capability | Liquid handling robot(s) | Liquid handling robot(s) | |||
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る | ||||
| コンテンツ仕様 | コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー | コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー | |||
| 説明 | 全トランスクリプトームシーケンシング研究用。トータルRNAバージョンは細胞質rRNAを除去し、トータルRNA Goldバージョンは細胞質およびミトコンドリアrRNAを除去します。 | 低RNAインプットや低品質サンプルから全トランスクリプトームシーケンシング対応ライブラリーを調製し、幅広いRNA-Seqアプリケーションをサポートします。豊富なトランスクリプトーム解析を容易にするため、複数種からrRNAとグロビンRNAを単一チューブで除去するRibo-Zero Plusが含まれています。 | |||
| ハンズオンタイム | 5.5時間 | <3時間 | |||
| インプット量 | 高品質トータルRNA0.1～1 ug 低品質のサンプルは、さらなる最適化を必要とする場合があります。 | 標準品質のRNA検体にはトータルRNA 1～1,000 ng、最適パフォーマンスとFFPE検体にはトータルRNA 10 ng以上を推奨 | |||
| システム | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | |||
| 作用機序 | ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR | 酵素によるrRNA除去、ライゲーションベースのアダプターおよびインデックスの追加 | |||
| 手法 | Whole-transcriptome sequencing | Whole-transcriptome sequencing, Metatranscriptome sequencing | |||
| マルチプレックス | ロースループットキット：最大12のサンプルをプールします。または、セットAとセットBを併せて最大24のサンプルをプールします。, ハイスループットキット：コンビナトリアルデュアルインデックスまたはユニークデュアルインデックスのいずれかを使用して、96個のインデックスサンプルを調製 | 最大384のユニークデュアルインデックス | |||
| Nucleic acid type | RNA | RNA | |||
| Specialized sample types | FFPE tissue | Microbiome samples, Low-input samples, FFPE tissue | |||
| Species category | マウス, ヒト, ラット | マウス, ヒト, ラット, Bacteria | |||
| 生物種詳細 | rRNAの除去：ヒト、マウス、ラットのrRNAを除去 | Ribo-Zero Plusは、ヒト細胞質およびミトコンドリアrRNA・マウスrRNA・ラットrRNA・細菌（大腸菌および枯草菌）rRNA・ヒトβグロビン転写産物を含む複数種から豊富な転写産物を除去します Ribo-Zero Plus Microbiomeは、Ribo-Zero Plusが除去した転写産物だけでなく、多様な微生物種、ATCC MSA-2002、MSA-2005、MSA-2006を含む複数種から豊富な転写産物を除去します | |||
| テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | |||
| バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
高品質なストランド情報
RNA発現量の一貫して正確な測定は、テクニカルレプリケート間の高い再現性に反映されます。これらのFFPE組織のテクニカルレプリケートは高い一致率を示し、堅牢なライブラリー調製性能を示しています。軸はlog2（FPKM）です。R2 値を示しています。
トランスクリプト全体で均一なカバレッジ
TruSeq Stranded Total RNAは、新鮮凍結腫瘍（FF、上図）とFFPE腫瘍（下図）、および一致する正常乳房組織の両方において、上位1000個の発現転写産物全体に優れたカバレッジを提供し、アライメントされたストランドの>98%のリードを実現します。X軸：転写産物に沿った位置、Y軸 = 混合リードのカバレッジ率。
ライブラリー調製 (4)
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Human/Mouse/Rat (48 Samples)
20020596
ヒト、マウス、およびラットのrRNAを枯渇させるRiboZeroビーズ、RNAをcDNAに転写するPCRマスターミックス、および48のサンプル調製用の試薬が含まれます。インデックスアダプターと精製ビーズは別売りです。
List Price:
Discounts:
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Human/Mouse/Rat (96 Samples)
20020597
ヒト、マウス、およびラットのrRNAを枯渇させるRiboZeroビーズ、RNAをcDNAに転写するPCRマスターミックス、および48のサンプル調製用の試薬が含まれます。インデックスアダプターと精製ビーズは別売りです。
List Price:
Discounts:
TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Gold (48 Samples)
20020598
ヒト、マウス、ラットのrRNAとミトコンドリアrRNAを枯渇させるRiboZeroビーズ、RNAをcDNAに転写するPCRマスターミックス、48サンプル調製用の試薬が含まれます。インデックスアダプターは別売りです。インデックスアダプターと精製ビーズは別売りです。
List Price:
Discounts:
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Gold (96 Samples)
20020599
ヒト、マウス、ラットのrRNAとミトコンドリアrRNAを枯渇させるRiboZeroビーズ、RNAをcDNAに転写するPCRマスターミックス、48サンプル調製用の試薬が含まれます。インデックスアダプターは別売りです。インデックスアダプターと精製ビーズは別売りです。
List Price:
Discounts:
インデックスアダプター (3)
TruSeq RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)
20020492
48の個別RNAサンプルを調製するための24のインデックス（インデックス：2、4、5、6、7、12、13、14、15、16、18、19）のうち12を含みます。
List Price:
Discounts:
TruSeq RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)
20020493
48の個別RNAサンプルを調製するための24のインデックス（インデックス：1、3、8、9、10、11、20、21、22、23、25、27）のうち12が含まれます。
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)
20040871
96サンプルにラベルを貼るのに十分な96、8 bpのインデックスを含み、TruSeq Stranded mRNAおよびTruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kitと互換性があります。バージョン2には、プレート20022371内の192のインデックスオリゴのうち8つの改善が含まれており、残りの184は変更されていません。ライブラリー調製およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
アクセサリー製品 (1)
Illumina Ribo-Zero plus rRNA Depletion Kit (96 Samples)
20037135
ヒト、マウス、ラット、細菌、およびグロビン転写産物からリボソームRNAを枯渇させるためのRibo-Zero Plus枯渇モジュールが96サンプル含まれています。精製ビーズ、ライブラリー調製試薬、インデックスアダプターは別売りです。ライブラリー調製試薬を含む完全なキットについては、Ribo-Zero Plusキット付きIllumina Stranded Total RNAを注文してください。
List Price:
Discounts:
サービス (1)
TruSeq Total RNA Training
15044069
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選択中の製品一覧
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製品一覧
製品名
カタログ番号
量
単価
-
カタログ番号:数量:
MiSeq Reagent Kit v3
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。
NextSeq 500/550 v2.5 Kit
Reagent v2.5 Kitは、初期の蛍光強度を維持する耐久性のあるフローセルを使用しており、以前のバージョンと比較して安定性と性能が向上しています。
TruSight Hereditary Cancer Panel
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
TruSeq Stranded mRNA
mRNAからシーケンスライブラリーを調製し、ストランド特異的情報でコーディングトランスクリプトームを明確に把握します。
TruSeq RNA Exome
ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織やその他の低品質のサンプルからRNAをシーケンスするための再現性と経済性を兼ね備えたソリューションを提供します。わずか10 ngのトータルRNAから得られる精度
Illumina RNA Prep with Enrichment
幅広いサンプルタイプとRNAインプット量から、エンリッチメントおよびインデックス配列ライブラリーを生成するための、高速で統合されたワークフロー。
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel
最大1200の関心ゲノムターゲットのシーケンスに最適化されたターゲット化されたカスタムRNA研究パネル。
使用制限ラベルライセンス：本製品とその使用は、Max Planck Gesellschaft氏が所有する米国および米国外で発行済みおよび/または申請中の1件以上の特許出願の対象であり、New England Biolabs, Inc.に独占的にライセンス供与され、Illumina, Inc.に二次ライセンス供与されています。Illumina, Inc.、その関連会社、またはその認定再販業者および販売業者から本製品を購入すると、購入者（購入者が学術団体であるか営利団体であるかは問わず）が購入した製品数および製品の構成品を使用する譲渡不可の権利が購入者に譲渡されます。本製品の購入は、前述の特許または製品の製造を意図する特許出願のいかなる主張に基づくライセンスも譲渡するものではありません。購入者は、本製品またはその構成品を第三者あるいはその他の者に販売または譲渡したり、以下の商業目的で使用することはできません。（1）製品またはその構成品を製造に使用する、または（2）ヒトまたは動物の治療または予防目的で製品またはその構成品を使用する。
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