当社のストランド型トータルRNAライブラリー調製ソリューションは、ヒト、マウス、ラット、植物のシーケンス用に設計されていますが、さまざまな真核生物種に適用できる可能性があります。次の表は、ラボテスト済みでイルミナが完全にサポートしている、isilicoでテストされている、またはお客様が作業していると報告した微生物の一覧です。イルミナは、お客様から報告された結果に基づいてrRNAの除去を保証することはできません。
RNA-Seqは、次世代シーケンサーを使用してトランスクリプトーム全体の発現を解析し、研究者が既知または新規の特徴を検出し、RNAを定量化することを可能にします。
詳細はこちら| サンプル | ターゲットrRNA |
|---|---|
| ヒト細胞質rRNA | 28S, 18S、5.8秒、5S |
| ヒトミトコンドリアrRNA | 12S, 16S |
| ヒトβグロビン転写産物 | HBA1, HBA2、HBB、HBG1, HBG2 |
| マウス&ラットrRNA | 16S, 28S |
| グラム（-）細菌rRNA | 大腸菌：5S, 16S, 23S |
| Gram(+) Bacterial rRNAs | 枯草菌：5S, 16S, 23S |
| 生物 | ラボテスト済み | In silicoテスト済み | 顧客報告 | コメント |
|---|---|---|---|---|
| ミツバチ（Apis mellifera） | 可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| 鶏肉（ガラスガラス） | 5S, 18S、28SのrRNAを除去。ミトコンドリアrRNAは検査されていません。 | |||
| 腸管猫 | 18S rRNAを除去します。その他のrRNAは検査されていません。 | |||
| Colletotrichum higginsianum | 28Sおよび5.8S rRNAを除去します。5S rRNAは除去されません。18S rRNAは評価しなかった。 | |||
| Copepod種 | 28Sおよび18S rRNAを除去します。その他のrRNAは評価しなかった。 | |||
| 牛 | ||||
| ジクロステリウム・ディスコイデウム | 高品質のRNAから28Sおよび18S rRNAを除去します。小さなrRNAは除去されません。 | |||
| 犬 | ||||
| フェレット（Mustela putorius） | ||||
| Finch（カルポダカスメキシカヌス） | 5Sおよび18S rRNAを除去します。18S rRNAは除去されません。ミトコンドリアrRNAは検査されていません。 | |||
| イチジク（トリボリウムカスタイン） | ||||
| カエル（Xenopus） | ||||
| フルーツフライ（ショウジョウバエ） | 5S rRNAまたは28S rRNAの'右'断片は除去されません。 | |||
| 真菌（Aspergillus niger） | 18S rRNAの300 nt領域は、分解したサンプルからは除去されません。可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| 真菌（バシディオミセテ） | 可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| 真菌（カンジダアルビカンス） | ||||
| 真菌（Cryptococcus neoformans） | 5.8Sまたは5S rRNAは除去されません。可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| 真菌（Yarrowia lipolytica） | 5.8Sまたは5S rRNAは除去されません。可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| 馬（馬） | ||||
| ヒト | 血液を除くすべての組織。血液検体にはTruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Globinを使用します。 | |||
| 昆虫（Rhodnius prolixus） | 可能な限り最高品質のRNAを使用してください。ミトコンドリアrRNAが除去されていません。 | |||
| ランプリー | 可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| 海洋スポンジ（Crambe crambe） | 可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| サル（マカク、カニクイザル） | ||||
| サル（アフリカングリーン、Chlorocebus sabaeus） | ||||
| サル（アカゲザル、マカカムラタ） | ||||
| 蚊（アノフェル蛇科） | 18S rRNAを除去します。5S、5.8S、および12S, 16SミトコンドリアrRNAは除去されません。28S rRNAは検査されていません。 | |||
| マウス | 血液を除くすべての組織。血液検体にはTruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Globinを使用します。 | |||
| 線虫（C. elegans） | 可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| 新生物（ノトフタルムスビリデセン） | 5.8Sまたは5S rRNAを除去できない場合があります。可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| 熱帯熱マラリア原虫プラズマ | 5.8Sまたは5S rRNAは除去されません。可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| ポカリイデス | 28Sおよび18S rRNAを除去します。すべての5S rRNAを除去できない場合があります。 | |||
| ラット | 血液を除くすべての組織。血液検体にはTruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Globinを使用します。 | |||
| サーモン（サルモサラー） | 18S、5.8S、および5S rRNAを除去します。28S rRNAは除去されません。ミトコンドリアrRNAは評価しなかった。 | |||
| アネモネ（Nematostella vectensis） | 可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| ブタ | 28S, 18S、5.8Sおよび5S rRNAを除去。 | |||
| トキソプラズマゴンディ | 高品質のRNAを使用します。 | |||
| ブルセイトリパノソーマ | 28Sおよび18S rRNAを除去します。その他のrRNAは評価しなかった。 | |||
| ウェルシュオニオン（アリウムフィスチュロサム） | 18S rRNAを除去します。その他のrRNAは検査されていません。 | |||
| Zebrafish（Danio rerio） |
| 生物 | ラボテスト済み | In silicoテスト済み | 顧客報告 | コメント |
|---|---|---|---|---|
| ヒト | 血液サンプルのみ。その他のすべての組織には、TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Human/Mouse/RatまたはTruSeq Stranded Total RNA- with Ribo-Zero Goldを使用します | |||
| マウス | 血液サンプルのみ。その他のすべての組織には、TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Human/Mouse/RatまたはTruSeq Stranded Total RNA- with Ribo-Zero Goldを使用します | |||
| ラット | 血液サンプルのみ。その他のすべての組織には、TruSeq Stranded Total RNA-with Ribo-Zero Human/Mouse/RatまたはTruSeq Stranded Total RNA- with Ribo-Zero Goldを使用します |
| 生物 | ラボテスト済み | In silicoテスト済み | 顧客報告 | コメント |
|---|---|---|---|---|
| アラビドプシス | 葉、種、根と互換性があります。 | |||
| ひよこ豆（Cicer arietinum） | 4.5S、16S, 23S葉緑体rRNAおよび18S細胞質rRNAを除去。5S葉緑体および5S細胞質rRNAは除去されません。その他のrRNAは検査されていません。 | |||
| トウモロコシ | 葉、種、根と互換性があります。 | |||
| コットン | ||||
| 真核生物の藻類（クラミドモナス） | 可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| ブドウ | ||||
| 日本のハニーサックル（Lonicera japonica） | ||||
| トウモロコシ | 葉、種、根と互換性があります。 | |||
| ミラーブッシュ（Coprosma repens） | ||||
| Moss（Physcomitrella） | ||||
| プロロセントラム最小値 | 18Sおよび28S rRNAを除去します。その他のrRNAは検査されていません。 | |||
| 米 | 葉、種、根と互換性があります。 | |||
| 大豆 | 葉、種、根と互換性があります。 | |||
| トマト（ソラニウムリコペルシク） | ||||
| ベトナムコリアンダー（ペリシカリアオドラタ） | ||||
| 水クローバー（Marsilea vistita） | ||||
| ウェルシュオニオン | 可能な限り最高品質のRNAを使用してください。 | |||
| コムギ | 葉、種、根と互換性があります。 |
コーディングRNAと複数の形態のノンコーディングRNAの両方を解析し、トランスクリプトームを包括的に把握します。
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目的の遺伝子（複数可）をターゲットとするシーケンスパネルまたはマイクロアレイを特定します。