NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Plant
このRNA-Seqライブラリー調製ワークフローで、植物トランスクリプトームの全体像を把握しましょう。植物の葉、種、根の組織からrRNAを除去します。
Catカタログ 番号RS-122-2401, RS-122-2402、RS-122-2403が変更されました。新しい構成では、ライブラリー調製試薬とインデックスアダプターを別途購入することができます。個別に購入が可能な構成品リストは、「製品を選択する」セクションにあります。
概要
精確なストランド情報による高品質全トランスクリプトーム解析
RNA-Seqテクノロジーは、コーディングRNAと複数の形態のノンコーディングRNAの両方にわたって、均一なカバレッジでストランド配向の精確な測定を可能にし、代替転写産物、アンチセンス発現、アリル特異的発現などの特徴の信頼度の高い発見を導きます。TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Plantは、TruSeq RNAライブラリー調製の利点とRibo-ZeroリボソームRNA還元ケミストリーを組み合わせ、全トランスクリプトーム解析のための堅牢でスケーラブルなソリューションを提供します。
さまざまな植物種にわたる効率的なリボソームRNA削減、研究デザイン
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Plantは、葉、種子、根の組織から細胞質、ミトコンドリア、および葉緑体リボソームRNAを迅速かつ特異的に除去します。これらの製品は、 アラビドプシスのタリアナ、米、トウモロコシなどの複数の植物種での使用が検証されており、幅広い追加種で効率的なrRNA除去を実現します。
仕様
| Automation capability | Liquid handling robots |
|---|---|
| コンテンツ仕様 | コーディングRNAと複数のノンコーディングRNA形態をキャプチャー |
| インプット量 | 植物サンプルから抽出した高品質のトータルRNA 0.1～1 ug |
| システム | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 作用機序 | ビーズベースのrRNA除去、cDNA合成、PCR |
| 手法 | Whole-transcriptome sequencing |
| マルチプレックス | ロースループットキット：最大12のサンプルをプールします。または、セットAとセットBを併せて最大24のサンプルをプールします。, ハイスループットキット：コンビナトリアルデュアルインデックスまたはユニークデュアルインデックスのいずれかを使用して、96個のインデックスサンプルを調製 |
| Nucleic acid type | RNA |
| Species category | Plant |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
必要な製品
イルミナは、お客様のワークフローを柔軟にするモジュラー式の注文製品方式を採用しています。以下のインデックスのいずれかを持つライブラリー調製製品を注文することができます。
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結果
アプリケーション
ワークフローの例
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | RNA Profiling: 6-20 samples per run (based on 20 million reads per sample) |
2 x 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | RNA Profiling (samples per run, dual flow cell): S1: 160, S2: 320, S4: 768. Limited by index combinations (dual). Based on 20 million reads. |
≤ 2 × 100 bp |
関連するアプリケーションとメソッド
農業におけるゲノムシーケンスは、食糧供給の改善、持続可能な環境の確保、種保存のサポートに役立ちます。
RNA-Seqは、次世代シーケンサー（NGS）を使用してトランスクリプトーム全体の発現を解析し、既知または新規の特徴を検出し、RNAを定量化することを可能にします。
コーディングRNAと複数のノンコーディングRNAの両方を解析し、トランスクリプトームを包括的に把握します。
本製品の用途例
ドキュメント
ライブラリー調製 (2)
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Plant (48 Samples)
20020610
RiboZeroビーズが植物サンプルから細胞質、ミトコンドリア、および葉緑体rRNAを枯渇させ、PCRマスターミックスがRNAをcDNAに転写し、48サンプル調製用の試薬を含みます。インデックスアダプターと精製ビーズは別売りです。
List Price:
Discounts:
TruSeq® Stranded Total RNA Library Prep Plant (96 Samples)
20020611
RiboZeroビーズが植物サンプルから細胞質、ミトコンドリア、および葉緑体rRNAを枯渇させ、PCRマスターミックスがRNAをcDNAに転写し、48サンプル調製用の試薬を含みます。インデックスアダプターと精製ビーズは別売りです。
List Price:
Discounts:
インデックスアダプター (4)
TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)
20019792
TruSeq Stranded RNA HT Kit 96 Samples Adapter Plate Box
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes (24 Indexes, 96 Samples)
20020591
TruSeq Stranded mRNAおよびTruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kitで使用できる新しいユニークデュアルインデックス（UDI）。UDIキットはプレート形式で提供され、96サンプルに対応する24のUDIが4セット含まれています。
IDT for Illumina – TruSeq DNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)
20040870
96サンプルのラベリングに十分な96個の8 bpのインデックスを含み、TruSeq NanoおよびTruSeq PCR-Free Library Prep Kitと互換性があります。バージョン2には、プレート20022370内の192のインデックスオリゴのうち8つの改善が含まれており、残りの184は変更されていません。ライブラリー調製およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina – TruSeq RNA UD Indexes v2 (96 Indexes, 96 Samples)
20040871
96サンプルにラベルを貼るのに十分な96、8 bpのインデックスを含み、TruSeq Stranded mRNAおよびTruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kitと互換性があります。バージョン2には、プレート20022371内の192のインデックスオリゴのうち8つの改善が含まれており、残りの184は変更されていません。ライブラリー調製およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
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選択中の製品一覧
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製品一覧
製品名
カタログ番号
量
単価
-
カタログ番号:数量:
MiSeq Reagent Kit v3
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
NextSeq 500/550 v2.5 Kits
試薬v2.5キットは、開始蛍光強度を維持する弾力性のあるフローセルを使用しており、以前のバージョンと比較して安定性とパフォーマンスが向上しています。
TruSight Hereditary Cancer Panel
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin
リボソームRNAとグロビンmRNAを1ステップで除去する効率的なワークフローで、血液由来RNAから全トランスクリプトームシーケンスライブラリーを調製します。
TruSeq Stranded Total RNA
ヒト、マウスおよびホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織を含むさまざまな生物種やサンプルタイプに対応した、堅牢でスケーラブルな全トランスクリプトーム解析（RNA-Seq）ソリューション。
TruSeq Stranded mRNA
mRNAからシーケンスライブラリーを調製し、ストランド特異的情報でコーディングトランスクリプトームを明確に把握します。
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