新しいイルミナRNA UDインデックスセットA-D (20091655、、2009165720091659、20091661）を注文することをお勧めします。IDT for Illumina RNA UD Indexes Sets A-D (20040553, 20040554, 20040555, 20040556)は廃止されており、最終注文日はPON2023-1440で発表されているように2025年1月30日です。
Illumina Stranded mRNA Library Prepトレーニング
20044765
Illumina Stranded mRNA Prepは、効率化を実現したRNA-Seqソリューションであり、トランスクリプトームを明確かつ網羅的に解析することができます。さまざまなサンプルタイプに柔軟に対応し、トータルRNA25 ngという少ないインプット量に対応できます。Illumina Stranded mRNA Prepは、ストランドの向きを精確に測定することができます。また、均一なカバレッジを実現し、未知のアイソフォーム、遺伝子融合、アリル特異的発現といったさまざまな特徴を確実に検出することができます。
Illumina Stranded mRNA Prepは、優れたpolyAキャプチャ効率とカバレッジ均一性を提供するために最適化されています。コーディングトランスクリプトームの正確で偏りのない検出に必要なシーケンス深度を最小限に抑えます。Illumina Stranded mRNA Prepは、2011年以降9,926を超える論文で引用されているTruSeqライゲーションテクノロジーに基づいています。
Illumina Stranded Total RNA Prepは、25 ng～1000 ngの幅広いRNAインプットをサポートします。*
この情報により、アンチセンス転写の検出が可能になり、転写産物のアノテーションが強化され、アライメント効率が向上します。
イルミナシーケンス用のライブラリーを1日で調製します。Illumina Qualified Methodは、当社のパートナーが提供するさまざまな自動化プラットフォームで利用できます。
1回のランで最大384のサンプルとシーケンスをマルチプレックスします。
RNA-Seqは、ソートリーダーにとってますます最適なプラットフォームとなり、特定の時点でトランスクリプトームの詳細なスナップショットを提供します。定量PCRよりも多くの利点があります。
*FFPEサンプルには対応していません
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | 中出力：5 高出力：16 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 75 bp |
| NextSeq 2000 System | P2：16 P3：40 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | SP：32 S1：64 S2: 164 S4：384 （サンプルあたり25Mリードに基づく） |
2 × 75 bp |
| Illumina Stranded mRNA Prep | TruSeq Stranded mRNA | TruSeq RNA Library Prep Kit v2 | Illumina RNA Prep with Enrichment | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus | |
|---|---|---|---|---|---|
| ストランド特異性 | ストランド化 | ストランド化 | Non-Stranded | Non-Stranded | ストランド化 |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, 一塩基多型（SNP） | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, 一塩基多型（SNP） | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, 一塩基多型（SNP） | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, 一塩基多型（SNP） | 新規転写産物, トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, 一塩基多型（SNP） |
| 自動化に関する互換性 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
左 - イルミナストランドmRNA調製のパフォーマンスメトリクス。右 - Illumina Stranded mRNA PrepをTruSeq Stranded mRNAと比較しました。Illumina Stranded mRNA Prepは、特に25 ng UHR RNAの入力で優れた性能を示しました。BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.30Mリードにサブサンプリングし、解析しました。重複は、4Mサブサンプルペアエンドリードパスフィルター（PF）で報告されます。
Illumina Stranded mRNA Prepは、TruSeq Stranded mRNAと比較して、低RNAインプットでより大きな遺伝子検出を可能にします。検出された遺伝子の数は、30MのサブサンプリングされたペアエンドリードPFで報告されます。イルミナのStranded mRNA Prepと同様に、1xカバレッジで検出されるより多くの遺伝子は、より高い感度の指標です。
Illumina Stranded mRNA Prepは、（A）100 ng UHR RNAの等価インプット、および（B）100 ng UHR RNAよりも25 ngの低インプットで、TruSeq Stranded mRNAとの高い一致データを生成します。
Illumina Stranded mRNA Prepは、（A）25 ng UHR RNAのテクニカルレプリケートと（B）25 ng UHR RNAと100 ng UHR RNAのインプット量の間で高いデータ一致を達成します。ライブラリーを2 × 74 bpでシーケンスし、30Mリードにサブサンプリングしました。データ解析は、BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1を使用して実施されました。
イルミナStranded mRNA Prepは、ハンズオンタイムを短縮した迅速なワークフローを実現します。時間は、使用する機器、処理されたサンプル数、自動化手順、またはユーザー体験によって異なる場合があります。
Brochure | PDF 1 MB
Illumina library preparation solutions
Brochure | PDF 2 MB
NextSeq 1000 and NextSeq 2000 RNA sequencing solution
Application Note | PDF < 1 MB
Application Note | PDF < 1 MB
Best practices for read trimming for Illumina Stranded mRNA and Total RNA workflows
Technical Note | PDF < 1 MB
Illumina Stranded mRNA Prep, Ligation
Data Sheet | PDF < 1 MB
Illumina Stranded mRNA Prep Ligation Checklist Documentation
Illumina Stranded mRNA Prep Ligation Reference Guide Documentation
Illumina Stranded mRNA Prep Ligation Documentation
Illumina Stranded mRNA Prep Ligation Consumables & Equipment Documentation
すべて イルミナDNA RNA UDインデックス Support すべて Illumina Stranded mRNA Prep Ligation Support
次世代シーケンサー（NGS）の運用を開始し、急速に拡大するラボのためのデータ管理および簡素化されたバイオインフォマティクス。
コーディングおよびノンコーディングトランスクリプトーム研究用の広範な種類のサンプルから迅速にライブラリーを調製して、非常に優れた柔軟性を持って研究を行うことができます。