イルミナ5塩基ソリューション

単一のアッセイ。
2つの洞察。

単一のアッセイで5つのDNA塩基を検出し、遺伝学的洞察とエピジェネティックな洞察を同時に提供

メチル化シーケンスの新たなスタンダード

イルミナ5塩基ソリューションは、1回のシーケンスワークフローで、シトシン-グアニン二ヌクレオチド(CpG)部位のアデニン(A)、チミン(T)、シトシン(C)、グアニン(G)、および5-メチルシトシン(5mC)の5つのDNA塩基を直接検出します。またこのソリューションは、ヌクレオチドの多様性とライブラリーの複雑さを維持することで、高いシーケンスアライメント率と情報豊富なデータを提供します。ひとつのライブラリー調製、ひとつのシーケンスラン、ひとつの解析パイプラインが統合され、最適化されたワークフローは、アッセイを複雑にすることなく、デュアルオミクスの洞察をお届けします。

主な特長とメリット

高精度デュアル検出

シーケンスの複雑性を維持する独自の酵素と、リードマッピングの精度向上に最適化されたアルゴリズムの組み合わせにより、信頼度の高いバリアントコーリング(F1スコア99.5%)と全ゲノムバイサルファイトシーケンス(WGBS)に比べて、60%高いCpGカバレッジを実現しました。

比類ないシンプルさと高速さ

サンプルから洞察に至るまで最適化された効率的なワークフローにより、ライブラリー調製は最短6時間30× ゲノムの統合解析は約1時間で完了します。

柔軟性の高い試験デザイン

同じ5塩基ケミストリー内で全ゲノムワークフローとターゲットエンリッチメントワークフローの両方をサポートしているため、アッセイ基本構成を変えることなく、ゲノムワイドな探索や焦点を絞った解析が可能になります。

幅広いサンプル互換性

非損傷性の酵素変換は、DNAの完全性を維持できることから、低品質のゲノムDNA(gDNA)、セルフリーDNA(cfDNA)、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルなど、多様で困難なサンプルタイプで一貫した性能を実現します。

製品データのハイライト

お客様の声

DNA and methylation: Dual insights, single assay

Bekim Sadikovic、PhD、Chief Scientific Officer at EpiSign Inc and Helge Lubenowと、Helge Lubenow、 PhD、Chief Executive Officer at Heidelberg Epignostixに、イルミナ5塩基ソリューションの合理化された単一のマルチオミクスアッセイが、ゲノムとエピゲノムに潜む疾患メカニズムをどのようにして解き明かすのかご紹介いただきました。

アプリケーション

イルミナ5塩基ソリューションは、メチル化と遺伝子バリアント情報を同時に取得できる利点を活かせるアプリケーションに適しており、特に DNA の品質・複雑性・解釈性が重要となる場面で高い有用性を発揮します。主な用途としては、以下が挙げられます。

 

 

従来のNGS*メチル化アッセイに代わる優先ソリューション

 

全ゲノム研究

 

ターゲットエンリッチメント研究

 

cfDNAまたはctDNA*研究を含むリキッドバイオプシー

 

FFPE*サンプルを含む腫瘍プロファイリング

 

cfDNA断片化パターン(フラグメントミクス)の解析

 

EWAS*などの集団研究

 

がん、神経変性、および遺伝子研究などの疾患研究

 

バイオマーカーの発見

 

加齢研究

* cfDNA:セルフリーDNA、ctDNA:循環腫瘍DNA、EWAS:エピゲノムワイド関連解析、FFPE:ホルマリン固定パラフィン包埋、NGS:次世代シーケンス。

ワークフローのハイライト

革新的な化学技術により、DNA の完全性を維持

ライブラリー調製時間6時間未満

30×ゲノムのデュアルデータ解析は約1時間

5塩基ソリューションワークフロー

DNAからシーケンスシステム完了まで約6時間の最適化された全ゲノムライブラリー調製を含む、効率化された5塩基ワークフローが、DNAおよびメチル化のデュアルアノテーションと可視化のための使いやすい解析をお届けします。

1
ライブラリー調製
2
シーケンス
3
データ解析

効率化された 5 塩基ワークフローには、DNA とメチル化のデュアルアノテーションおよびターゲット遺伝子の可視化のための、最適化されたターゲットエンリッチメントライブラリー調製と使いやすい解析が含まれています。

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ライブラリー調製
2
シーケンス
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データ解析

ゲノムとメチロームの詳細はこちら

サムネール

イルミナ5塩基ソリューションの概要では、メチル化検出とバリアントコーリングをひとつの合理化されたワークフローに統合することで、この単一アッセイソリューションがいかにマルチオミクス解析を簡素化するかをご覧ください。

お客様の声

従来のアプローチによって引き起こされるデータの損失を克服する手法の登場にわくわくしています。イルミナ5塩基ソリューションは、非メチル化のCではなく、5mCをTに変換します。このアプローチは、シーケンスの多様性を維持し、使用可能なリードを大幅に増加させ、シグナルを強化することによって、DNAメチル化解析能力を高めてくれました。

専門家の解説を聞く

Multiomic innovation in action

イルミナ5塩基ソリューションを活用し、マルチオミクス、エピジェネティクス、メタゲノミクスの洞察を統合した革新的な非侵襲的サンプリング法による、大腸がん検出における画期的な研究アプローチについて、Dr Daniel Wiseにご解説いただきました。

サムネール

Evaluation of Illumina 5-base sequencing with EpiSign

Dr Bekim Sadikovic、Director of the Molecular Genetics Laboratory at London Health Sciences Centre Research Instituteに、イルミナ5塩基ソリューションの評価から得られた洞察をご共有いただきました。

お問い合わせ

イルミナ5塩基ソリューションが、2つの異なる遺伝およびエピジェネティクスシーケンスアッセイをどのように置き換え、時間や予算を節約できるかをご覧ください。

Illumina 5-Base DNA Prep

ゲノム全体のゲノムバリアントとメチル化イベントを同時に探索します。

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Illumina 5-Base DNA Prep

Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichment

より深く、費用対効果の高い解析のための特定のゲノム領域でのターゲットシーケンス。

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Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichment