Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichment

5つのDNA塩基(A、T、G、C、および5mC)のターゲット検出のための単一アッセイで、ゲノムバリアントとメチル化イベントの2つの洞察を提供します。

< 3 days DNA to data Library prep time* < 11 hours * Based on processing 24 samples manually; includes DNA shearing (if applicable), and library quantification. Normalization and pooling time not included.

アッセイ時間

1–20 ng cell-free DNA 50–100 ng genomic DNA

インプット量

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2026年5月まで、最初のライブラリー調製キットが25%割引になります。
数量限定:1 

概要

Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichmentは、高感度なアプローチにより1回のサンプル調製とシーケンスランからDNAバリアントとメチル化変化の両方を検出できます。ライブラリー調製から解析までの費用対効果の高いワークフローを使用する、一石二鳥のターゲットアッセイです。

  • 高感度で5-メチルシトシン(5mC)とDNAバリアントをデュアル検出

  • 最適化されたパネルデザインによりメチル化ターゲットと非メチル化ターゲットをバイアスなくキャプチャー

  • ターゲットゲノムとメチローム洞察における柔軟なカスタマイズ

  • わずか1ngのセルフリーDNAからの最適なライブラリー回収率

  • すべてのシーケンスリードから正確な5塩基に関する洞察

1回のアッセイで2つの洞察

ライブラリー調製から解析までの統合ワークフローにより、1回のアッセイでDNAバリアントとメチル化の変化を検出―─サンプル分割は必要ありません。

高感度の検出

低インプットサンプルから低頻度バリアントとメチル化を同時に検出します。また、関心領域にカバレッジを集中させることでシーケンスコストを削減することも可能です。

効率的カスタマイズ

直感的なDesignStudioプラットフォームを使用して、Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichment用にカスタマイズされたデュアルオミクスパネルを作成します。

仕様

必要な製品

Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichmentでは、DRAGEN二次解析を使用する必要があります。DRAGEN解析には、ローカルDRAGENサーバー、Illumina Connected AnalyticsまたはBaseSpace Sequence Hubクラウドを介してアクセスできます。インデックスアダプターはイルミナで別途販売しています。

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アプリケーション

Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichmentは、ライブラリー調製から解析までの効率的で費用対効果の高いワークフローで正確な5塩基の洞察を提供しながら、単一のカスタマイズ可能なアッセイで、低インプットサンプルからDNAバリアントとメチル化の高感度のデュアル検出を可能にします。

ワークフローの例

1
ライブラリー調製

Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichment

関連するアプリケーションと手法

製品比較

Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichment Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment Illumina DNA Prep with Enrichment Infinium Custom Methylation Kit
Assay time < 3 days DNA to data
Library prep time* < 11 hours
* Based on processing 24 samples manually; includes DNA shearing (if applicable), and library quantification. Normalization and pooling time not included.
約8.5~9.5時間 約6.5時間
自動化機能 Liquid handling robot(s) Liquid handling robot(s) 自動化アレイローダー
Automation details Automation protocols are in development and will be added to the automation page when available. 利用可能な自動化方法を見る
Content specifications Custom panels Custom: 0.5 - 15 Mb genomic content of interest, with Illumina Custom Enrichment Panels and Illumina Custom Enrichment Panel v2
Fixed panels: Content varies by panel.
Description A streamlined assay for targeted detection of genomic variants and methylation events from the same sequencing reads. High-quality data is enabled by a novel enzymatic method and optimized analysis. Focus on specific targets of interest using hybrid-capture enrichment and custom-designed panels. A fast, flexible, and scalable cfDNA library preparation kit for highly sensitive mutation detection 低いDNAインプットやさまざまなサンプルタイプから、全エクソーム、カスタム、固定パネルターゲットシーケンスなど、さまざまな実験用のシーケンスライブラリーを約6.5時間で調製します。 
Input quantity 1–20 ng cell-free DNA
50–100 ng genomic DNA
cfDNA 10~30 ng 高品質ゲノムDNA 10~1,000 ng、FFPE DNA 50~1,000 ng (血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください)。 250 ng DNA
システム NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx システム研究(RUO)モード, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx システム研究(RUO)モード, NovaSeq 6000 System MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx システム研究(RUO)モード, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム iScan
Mechanism of action Enzymatic conversion of 5-methylcytosine to thymine, ligation-based addition of adapters and indexes, mechanical shearing of genomic DNA, hybridization-based target capture ビーズ結合トランスポソームおよびハイブリッドキャプチャー化学
手法 カスタムシーケンス, メチル化シーケンス, ターゲット濃縮 カスタムシーケンス, ターゲットDNAシーケンス, ターゲット濃縮 カスタムシーケンス, ターゲットDNAシーケンス, エクソームシーケンス, ターゲット濃縮 メチル化アレイ
Multiplexing Up to 384-plex indexing. 4-plex enrichment 最大384のユニークデュアルインデックスを使用可能。最大12プレックスの濃縮前プーリングをテスト。
核酸の種類 DNA DNA DNA DNA
対応サンプルタイプ 血液, 少量インプットサンプル, セルフリーDNA セルフリーDNA 血液, 少量インプットサンプル, FFPE組織, 唾液 血液, セルフリーDNA, 唾液
生物種カテゴリー Any species, ヒト ヒト その他, ヒト マウス, ヒト
Species details Supports custom panel design for a wide variety of species.
Users can upload custom reference genome to run Illumina 5-base assay/analysis. Not all species have been tested and specifications are only applicable to human samples.
テクノロジー シーケンス シーケンス シーケンス マイクロアレイ
バリアントクラス 体細胞バリアント, 差異的メチル化シトシン, 生殖細胞系列バリアント, 1塩基変異(SNV), 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV) 融合遺伝子, 体細胞バリアント, 1塩基変異(SNV), 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV) 1塩基変異多型(SNP), ヘテロ接合性欠失(LOH), 体細胞バリアント, 生殖細胞系列バリアント, 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV) 差異的メチル化シトシン

選択ツール:

Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichmentのライブラリー調製ステップ

最適化されたライゲーションベースのライブラリー調製には、シンプルなワンステップの5mCからT塩基への変換が含まれ、最小限のタッチポイントで11時間以内に完了します。これにはDNA断片化(該当する場合)とライブラリー定量の時間が含まれます。ノーマライゼーションとプーリングの時間は含まれていません。

新規ケミストリーにより単一の酵素ステップで5mCをTに直接変換

(A) Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichmentは、ワンステップの酵素プロセスを使用して5mCのみをTに変換します。これにより、(B) 非メチル化CをTに変換する従来のバイサルファイトシーケンシングや市販の酵素メチル化シーケンス(EM-Seq)よりもヌクレオチドの多様性が高くなります。

リソース

サムネール

イルミナ5塩基ソリューションとともにDNAとメチル化を解読

イルミナの副社長兼アッセイR&D責任者Fiona Kaperが、革新的5塩基ソリューションによるマルチオミクス解析の簡素化と拡張について語ります。イルミナの5塩基ケミストリーが、1回のアッセイでゲノムとエピゲノムの2つの洞察を可能にし、いかに卓越した精度、簡素性、およびスケールで遺伝子バリアントとDNAメチル化のデータを提供するかをご覧ください。

ライブラリー調製 (1)

Illumina® 5-Base DNA Prep with Enrichment (24 Samples)

20140366

Includes library prep, enrichment and methylation detection reagents for preparing 24 libraries (6, 4-plex enrichment reactions) manually. Analyze data on the cloud using DRAGEN apps on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub or on premise with DRAGEN Server. Perform data visualization using Illumina connected Multiomics (option). Design panel through DesignStudio. Purchase indexes and enrichment probe panel separately.

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Custom panels (3)

Illumina Custom Enrichment Panel V2 (32 µl, 120 bp)

20073953

Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの2本ストランドカスタムパネル設計を可能にし、32 µl(Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると濃縮反応8回分に十分な量)の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。

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カスタマイズ

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Illumina Custom Enrichment Panel V2 (384 µl, 120 bp)

20073952

Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの2本ストランドカスタムパネル設計を可能にし、384 µl(Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると濃縮反応96回分に十分な量)の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。

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カスタマイズ

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Illumina Custom Enrichment Panel V2 (1536 µl, 120 bp)

20111339

Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 1536 µl of material (sufficient for 384 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.

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カスタマイズ

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インデックスアダプター (5)

Illumina Unique Dual Indexes, LT (48 indexes, 48 samples)

20098166

Illumina Unique Dual Indexes, LT (48 indexes, 48 samples)

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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選択中の製品一覧

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よくある質問(FAQ)

Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichmentは、ワンステップの酵素プロセスを使用して5mCをTに変換して、従来のバイサルファイト処理よりも高いヌクレオチド多様性をもたらします。最適化されたライゲーションベースのライブラリー調製の後に、カスタマイズされたパネルデザインによるターゲットキャプチャーベースのエンリッチメントを行います。このソリューションを特殊な解析と組み合わせると、1回のアッセイで5mCとゲノムバリアントを同時に検出できるようになります。

Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichmentは、ターゲット領域の簡単なカスタマイズにより、シンプルでスケーラブルかつコスト効率の高い1つのワークフローで高感度のメチル化プロファイリングとバリアント検出を実現します。

Illumina 5-Base DNA Prep with Enrichmentにはカスタムパネルデザインが必要であり、Illumina Custom Enrichment Panel v2と互換性があります。パネルはDesignStudioソフトウェアを使用して設計および注文することができます。特殊な設計アルゴリズムは、メチル化ターゲットと非メチル化ターゲットの両方を効率的にキャプチャーする5mCからT塩基への変換に対応しています。非メチル化シトシンを変換するバイサルファイトシーケンシングなどの手法用に作られたパネルとは互換性がありません。

DRAGEN二次解析では、革新的な5塩基アルゴリズムを使用して、単一のデータセットからゲノムとメチロームの両方の正確なアノテーションを提供します。簡単なチェックボックスオプションで、DRAGEN Enrichmentパイプライン内のメチル化レポート作成機能が有効になります。

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NovaSeq Xシリーズのご購入

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