Infinium Custom Methylation Kit

大規模でターゲットを絞ったエピジェネティックなアプリケーション向けに完全にカスタマイズ可能なメチル化マイクロアレイ。

概要

Infinium Custom Methylation Kitには、Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipと試薬が含まれており、研究者や商業ユーザーが重要なエピジェネティック研究アプリケーションのための画期的なアッセイを開発できます。

ハイスループットワークフロー

Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipは、更新されたInfinium自動化プロトコルとバイサルファイト変換のための自動ワークフローを備えた24サンプル形式で提供されます。これらの機能により、ワークフローの効率が向上し、サンプル処理のコストを削減し、ユーザーは年間数十万サンプルまでのオペレーションを拡張できます。

ハイスループットワークフロー

Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipは、更新されたInfinium自動化プロトコルとバイサルファイト変換のための自動ワークフローを備えた24サンプル形式で提供されます。これらの機能により、ワークフローの効率が向上し、サンプル処理のコストを削減し、ユーザーは年間数十万サンプルまでのオペレーションを拡張できます。

ハイスループットワークフロー

Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipは、更新されたInfinium自動化プロトコルとバイサルファイト変換のための自動ワークフローを備えた24サンプル形式で提供されます。これらの機能により、ワークフローの効率が向上し、サンプル処理のコストを削減し、ユーザーは年間数十万サンプルまでのオペレーションを拡張できます。

Infinium Custom Methylation Kitの主な機能

  • カスタマイズ可能なコンテンツで最大100Kマーカーをサポート

  • シングルCpGレベルでのDNAメチル化の正確な定量測定

  • オプションの自動バイサルファイト変換による迅速なターンアラウンドタイム


仕様


必要な製品

Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip-24キットの購入が必要です。各キットには、2つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。

iScanシーケンスシステムが必要です。

Infiniumプロトコールのすべての必須ステップを網羅する3日間のハンズオン指導のためのオプションの入門コースは、サンプルとBeadChipの準備、サンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析など、購入可能です。

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アプリケーション

Infinium Custom Methylation Kitでは、一般的な疾患研究、がん研究、エピジェネティックな老化、およびナトリピゲノミクスを含む、商業上および学術上のエピジェネティックアプリケーションのために、ゲノムのターゲット領域におけるDNAメチル化を測定するカスタムハイスループットアッセイを作成できます。

ワークフローの例

1
手法
2
スキャン
3
解析

関連するアプリケーションとメソッド

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選択ツール

Infinium IおよびIIアッセイにより、CpG部位の幅広いカバレッジが可能

イルミナのメチル化BeadChipは、Infinium IアッセイとInfinium IIアッセイの両方を採用しており、全体的なカバレッジの幅を広げています。(A)Infinium Iプローブの設計では、CpG遺伝子座ごとに2種類のビーズを使用し、メチル化状態と非メチル化状態にそれぞれ1種類ずつ使用します。(B)Infinium IIプローブの設計では、両方の州で1種類のビーズを使用しています。

設計と製造プロセス

研究者はイルミナの技術設計チームやカスタマーサービスチームと協力して、BeadChipマーカーの内容を改良し、注文と生産プロセスを調整します。

  1. Zhou L, Ng HK, Drautz-Moses DI, et al. ハイスループット全ゲノムバイサルファイトシーケンスのためのライブラリー調製法とシーケンスプラットフォームの系統的評価。 Sci Rep. 2019;9(1):10383。2019年7月17日発行。doi:10.1038/s41598-019- 46875-5

リソース

サムネール
柔軟でスケーラブルなInfiniumワークフローの詳細はこちら

Infinium Methyl Custom-24 Kit (48 Spl)

20042146

Infinium HTS iSelect Methyl Custom Beadchip、48サンプル

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カスタマイズ

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サービス (1)

Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

Infiniumプロトコールの必須ステップをユーザーに理解してもらうための3日間のハンズオンインストラクション。コースでは、サンプルとBeadChip調製、iScanシステムを使用したサンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析に関するハンズオントレーニングを提供します。

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よくある質問(FAQ)

 Infinium HTS iSelect Custom BeadChipには、メチル化EPIC BeadChipで利用可能な標準SNPコントロールが含まれています。

GenomeStudio Methylation Moduleはベータ値を抽出し、Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipデータのサンプルクラスター解析を提供します。BeadArray Controls Reporterソフトウェアツールは、現時点ではサポートされていません。

特に、Bioconductorには、強化されたノーマライゼーションと視覚化オプションを提供するSeSAMeなどの多くのフリーウェアアプリケーションがあります。イルミナはこれらのフリーウェアソリューションを直接サポートしていません。

いいえ、Illumina LIMSは現時点ではInfinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipsをサポートしていません。

いいえ、FFPEサンプルは現在サポートされていません。

手動および自動フォーマットのZymo Research EZ-96 Methylation-Lightning MagPrep Kitは、Infinium Methylationアッセイの上流での使用に対応しています。詳細については、このテクニカルノートの結果を確認してください。 
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NovaSeq Xシリーズの注文

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