NovaSeq Xシリーズのご購入
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。
Infinium Custom Methylation Kitには、Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipと試薬が含まれており、研究者や商業ユーザーが重要なエピジェネティック研究アプリケーションのための画期的なアッセイを開発できます。
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip
大規模でターゲットを絞ったエピジェネティックなアプリケーション向けに完全にカスタマイズ可能なメチル化マイクロアレイ。
5760 samples per week max (with 2 iScan systems, 1 AutoLoader 2x, and 2 Tecan robots over an 8-hour day)
サンプルスループット
24サンプル （１アレイあたり）
サンプル数
500-100,000 user defined CpGs add-on capacity
マーカー数
概要
ハイスループットワークフロー
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipは、更新されたInfinium自動化プロトコールとバイサルファイト変換のための自動ワークフローを備えた24サンプル形式で提供されます。これらの機能により、ワークフローの効率が向上し、サンプル処理のコストを削減できるので、ユーザーは年間数十万サンプルまでの運用を拡張できます。
カスタマイズ可能なコンテンツ
最大10万個の追加マーカーでアレイをカスタマイズし、ユニークな研究ツールを作成します。既存の商用アレイ製品またはエピジェネティックなデータベースからコンテンツを選択できます。
実績のあるInfiniumケミストリー
Infinium BeadChip設計により、高度なメチル化プローブのレプリケーションが可能になり、メチル化シーケンス実験で100倍のカバレッジに匹敵する高い再現性が得られます。1
Infinium Custom Methylation Kitの主な機能
仕様
| アッセイの種類 | Infinium HTS |
|---|---|
| 自動化機能 | 自動化アレイローダー |
| Description | Using the DesignStudio Assay Design Tool, this product allows labs to create high-throughput, custom, 24- or 48-sample BeadChips to efficiently and accurately assess methylation for up to 100,000 CpG sites in human and select nonhuman samples. |
| インプット量 | 250 ng DNA |
| システム | iScan |
| 手法 | メチル化アレイ |
| 核酸の種類 | DNA |
| Number of markers | 500-100,000 user defined CpGs add-on capacity |
| サンプル数 | 24サンプル （１アレイあたり） |
| Sample throughput | 5760 samples per week max (with 2 iScan systems, 1 AutoLoader 2x, and 2 Tecan robots over an 8-hour day) |
| 対応サンプルタイプ | 血液, セルフリーDNA, 唾液 |
| 生物種カテゴリー | マウス, ヒト |
| Species details | Select non-human species available on DesignStudio only |
| テクノロジー | マイクロアレイ |
| バリアントクラス | 差異的メチル化シトシン |
必要な製品
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip-24キットの購入が必要です。各キットには、2つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイゼーション、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。
iScanシーケンスシステムが必要です。
Infiniumプロトコールのすべての必須ステップを網羅する、3日間のハンズオン指導のためのオプションの入門コースを購入可能です。これには、サンプルおよびBeadChip調製、サンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価および解析が含まれます。
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件
アプリケーション
Infinium Custom Methylation Kitでは、一般的な疾患研究、がん研究、エピジェネティックなエイジング、およびニュートリエピジェネミクスなどの学術的なエピジェネティックアプリケーション向けに、ゲノムのターゲット領域におけるDNAメチル化を測定するカスタムハイスループットアッセイを作成できます。
ワークフローの例
方法
メチル化アレイにより、1塩基の解像度でゲノム全体のメチル化部位についてハイスループットで定量的な精査が可能になります。
スキャン
iScanマイクロアレイスキャナーは、ハイスループットのBeadChip処理をサポートし、数百から数千に及ぶサンプルを迅速かつ正確にスキャンします。
解析
GenomeStudioソフトウェアは、ユーザーフレンドリーなグラフィカルインターフェースで、マイクロアレイベースのジェノタイピングアッセイのデータ解析のための統合プラットフォームを提供します。
関連するアプリケーションと手法
イルミナは、エピジェネティックな解析のためのソリューションを提供します。ツールを使用し、 エピジェネティックな修飾と遺伝子制御に対するその影響を研究します。
マイクロアレイや次世代シーケンサー（NGS）テクノロジーを用いたゲノムワイドなメチル化プロファイリング研究は、メチル化の機能的影響に関する新たな洞察をもたらします。
マイクロアレイを用いた大規模なジェノタイピングにより、大規模なコホートまたは母集団における疾患リスクに関連するバリアントを同定することができます。
製品比較
| Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip | Infinium Methyl EX iSelect Custom BeadChips | |
|---|---|---|
| アッセイの種類 | Infinium HTS | Infinium EX |
| 自動化機能 | 自動化アレイローダー | Automated array loader, Liquid handling robot(s) |
| Description | Using the DesignStudio Assay Design Tool, this product allows labs to create high-throughput, custom, 24- or 48-sample BeadChips to efficiently and accurately assess methylation for up to 100,000 CpG sites in human and select nonhuman samples. | This product allows labs to create high-throughput, custom, 24- or 48-sample BeadChips to efficiently and accurately assess methylation for up to 100,000 CpG sites in human and select nonhuman samples. |
| インプット量 | 250 ng DNA | 250 ng |
| システム | iScan | iScan System |
| 手法 | メチル化アレイ | Methylation array |
| 核酸の種類 | DNA | DNA |
| Number of markers | 500-100,000 user defined CpGs add-on capacity | 500–100,000 user defined CpGs add-on capacity |
| サンプル数 | 24サンプル （１アレイあたり） | 48 sample and 24 sample beadchips available |
| Sample throughput | 5760 samples per week max (with 2 iScan systems, 1 AutoLoader 2x, and 2 Tecan robots over an 8-hour day) | 16,128 (per week for 48 sample beadchip) |
| 対応サンプルタイプ | 血液, セルフリーDNA, 唾液 | Blood |
| 生物種カテゴリー | マウス, ヒト | Bovine, Mouse, Canine, Human, Equine, Feline |
| Species details | Select non-human species available on DesignStudio only | Select non-human species available on DesignStudio only |
| テクノロジー | マイクロアレイ | Microarray |
| バリアントクラス | 差異的メチル化シトシン |
選択ツール
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
DesignStudio Custom Assay Design Tool
DesignStudioは、研究者らがカスタムマイクロアレイプローブやカスタムシーケンスアッセイを設計・注文するためのウェブベースのアッセイ設計ツールです。
図
Infinium IアッセイおよびInfinium IIアッセイにより、CpG部位の幅広いカバレッジが可能
イルミナのメチル化BeadChipは、Infinium IアッセイとInfinium IIアッセイの両方を採用しており、全体的なカバレッジの幅を広げています。(A) Infinium I プローブ設計では、CpG座位ごとに2種類のビーズ (メチル化状態と非メチル化状態用にそれぞれ 1 種類)を使用します。（B）Infinium IIプローブの設計では、両方の州で1ビーズタイプを使用しています。
設計と製造プロセス
研究者はイルミナのテクニカルデザインチームやカスタマーサービスチームと協力し、BeadChipマーカーの内容を改良し、注文と生産プロセスを調整します。
- Zhou L, Ng HK, Drautz-Moses DI, et al. Systematic evaluation of library preparation methods and sequencing platforms for high-throughput whole genome bisulfite sequencing. Sci Rep. 2019;9(1):10383. Published 2019 Jul 17. doi:10.1038/s41598-019- 46875-5
リソース
柔軟でスケーラブルなInfiniumワークフローのご紹介
カスタムHTSキット (1)
Infinium Methyl Custom-24 Kit (48 Spl)
20042146
Infinium HTS iSelect Methyl Custom Beadchip、48サンプル
カスタムEx キット (5)
Inf Methyl EX iSelect-48 Kit (48 Spl)
20139002
This kit contains 1 custom BeadChip and reagents to process 48 samples throught the Infinium EX Methylation workflow.
Inf Methyl EX iSelect-48 Kit (96 Spl).
20139003
This kit contains 2 custom BeadChips and reagents to process 96 samples throught the Infinium EX Methylation workflow.
Inf Methyl EX iSelect-48 Kit (1152 Spl).
20139004
This kit contains 24 custom BeadChip and reagents to process 1152 samples throught the Infinium EX Methylation workflow.
Inf Methyl EX iSelect-24 Kit (48 Spl).
20139005
This kit contains 2 custom BeadChip and reagents to process 48 samples throught the Infinium EX Methylation workflow.
Inf Methyl EX iSelect-24 Kit (96 Spl).
20139006
This kit contains 4 custom BeadChip and reagents to process 96 samples throught the Infinium EX Methylation workflow.
サービス (1)
Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site
20015273
Infiniumプロトコールの必須ステップをユーザーに理解してもらうための3日間のハンズオンインストラクション。コースでは、サンプルとBeadChip調製、iScanシステムを使用したサンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析に関するハンズオントレーニングを提供します。
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よくある質問（FAQ）
Infinium HTS iSelect Custom BeadChipには、メチル化EPIC BeadChipで利用可能な標準SNPコントロールが含まれています。
メチル化QCでは、GenomeStudio 2011、メチル化モジュール、またはDRAGEN Array Methyl QCをヒト種に使用できます。
現時点では、下流のメチル化解析または非ヒト種の解析には、SeSAMe(https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/sesame.html)、またはその他の第三者のバイオコンダクタツールが推奨されます。
いいえ、Illumina LIMSは現時点ではInfinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipsをサポートしていません。
いいえ、FFPEサンプルは現在サポートされていません。
手動および自動フォーマットのZymo Research EZ-96 Methylation-Lightning MagPrep Kitは、Infinium Methylationアッセイの上流での使用に対応しています。詳細については、このテクニカルノートを参照してください。
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件
MiSeq Reagent Kit v3
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
TruSight Oncology 500 v2
FFPE組織から、すべての主要バリアントクラスに加え、重要なバイオマーカー（TMB、MSI、HRD）を網羅する大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現します。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
広範囲のCpGアイランド、遺伝子、エンハンサーをカバーするロバストなメチル化プロファイルマイクロアレイ。遺伝性疾患や希少疾患の研究、がん研究、分類に最適です。
Infinium Mouse Methylation BeadChip
多様なマウス系統の高分解能エピジェネティック解析用にメチローム全体で285Kを超えるマーカーを表示します。
参考文献
Zhou L, Ng HK, Drautz-Moses DI, et al. Systematic evaluation of library preparation methods and sequencing platforms for high-throughput whole genome bisulfite sequencing. Sci Rep. 2019;9(1):10383. Published 2019 Jul 17. doi:10.1038/s41598-019- 46875-5
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