NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
Infinium Custom Methylation Kitには、Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipと試薬が含まれており、研究者や商業ユーザーが重要なエピジェネティック研究アプリケーションのための画期的なアッセイを開発できます。
Infinium Custom Methylation Kit
大規模でターゲットを絞ったエピジェネティックなアプリケーション向けに完全にカスタマイズ可能なメチル化マイクロアレイ。
24サンプル （１アレイあたり）
サンプル数
概要
ハイスループットワークフロー
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipは、更新されたInfinium自動化プロトコールとバイサルファイト変換のための自動ワークフローを備えた24サンプル形式で提供されます。これらの機能により、ワークフローの効率が向上し、サンプル処理のコストを削減できるので、ユーザーは年間数十万サンプルまでの運用を拡張できます。
ハイスループットワークフロー
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipは、更新されたInfinium自動化プロトコールとバイサルファイト変換のための自動ワークフローを備えた24サンプル形式で提供されます。これらの機能により、ワークフローの効率が向上し、サンプル処理のコストを削減できるので、ユーザーは年間数十万サンプルまでの運用を拡張できます。
ハイスループットワークフロー
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipは、更新されたInfinium自動化プロトコールとバイサルファイト変換のための自動ワークフローを備えた24サンプル形式で提供されます。これらの機能により、ワークフローの効率が向上し、サンプル処理のコストを削減できるので、ユーザーは年間数十万サンプルまでの運用を拡張できます。
Infinium Custom Methylation Kitの主な機能
仕様
必要な製品
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip-24キットの購入が必要です。各キットには、2つのBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイゼーション、ラベリング、検出用の試薬が含まれています。
iScanシーケンスシステムが必要です。
Infiniumプロトコールのすべての必須ステップを網羅する、3日間のハンズオン指導のためのオプションの入門コースを購入可能です。これには、サンプルおよびBeadChip調製、サンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価および解析が含まれます。
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件
アプリケーション
Infinium Custom Methylation Kitでは、一般的な疾患研究、がん研究、エピジェネティックなエイジング、およびニュートリエピジェノミクスなどの商業的および学術的なエピジェネティックアプリケーションのために、ゲノムのターゲット領域におけるDNAメチル化を測定するカスタムハイスループットアッセイを作成できます。
ワークフローの例
関連するアプリケーションと手法
イルミナは、エピジェネティックな修飾とその遺伝子制御への影響を研究するためのソリューションを提供します。
ゲノムワイドなDNAメチル化解析は、NGSを使用して高い透明性を得るか、マイクロアレイを使用してサンプルあたりのコストを最小限に抑えることができます。
マイクロアレイを用いた大規模なジェノタイピングにより、大規模なコホートまたは母集団における疾患リスクに関連するバリアントを同定することができます。
比較する
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングでき、キットの比較や共有も可能です。
目的の遺伝子（複数可）をターゲットとするシーケンスパネルまたはマイクロアレイを特定します。
DesignStudio Custom Assay Design Tool
DesignStudioは、研究者がカスタムジェノタイピングのマイクロアレイプローブやカスタムシーケンシングアッセイを設計・注文するためのウェブベースのアッセイ設計ツールです。
図
Infinium IおよびIIアッセイにより、CpG部位の幅広いカバレッジが可能
イルミナのメチル化BeadChipは、Infinium IアッセイとInfinium IIアッセイの両方を採用しており、全体的なカバレッジの幅を広げています。(A) Infinium I プローブ設計では、CpG座位ごとに2種類のビーズ (メチル化状態と非メチル化状態用にそれぞれ 1 種類)を使用します。（B）Infinium IIプローブの設計では、両方の州で1ビーズタイプを使用しています。
設計と製造プロセス
研究者はイルミナのテクニカルデザインチームやカスタマーサービスチームと協力し、BeadChipマーカーの内容を改良し、注文と生産プロセスを調整します。
- Zhou L, Ng HK, Drautz-Moses DI, et al. Systematic evaluation of library preparation methods and sequencing platforms for high-throughput whole genome bisulfite sequencing. Sci Rep. 2019;9(1):10383. Published 2019 Jul 17. doi:10.1038/s41598-019- 46875-5
リソース
柔軟でスケーラブルなInfiniumワークフローのご紹介
Infinium Methyl Custom-24 Kit (48 Spl)
20042146
Infinium HTS iSelect Methyl Custom Beadchip、48サンプル
サービス (1)
Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site
20015273
Infiniumプロトコールの必須ステップをユーザーに理解してもらうための3日間のハンズオンインストラクション。コースでは、サンプルとBeadChip調製、iScanシステムを使用したサンプルスキャン、アレイ解析ソフトウェアを使用した一次データ評価と解析に関するハンズオントレーニングを提供します。
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よくある質問（FAQ）
Infinium HTS iSelect Custom BeadChipには、メチル化EPIC BeadChipで利用可能な標準SNPコントロールが含まれています。
GenomeStudio Methylation Moduleは、ベータ値を抽出し、Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipデータのサンプル クラスタリング分析を提供します。現時点では、BeadArray Controls Reporterソフトウェアツールはサポートされていません。
特に、SeSAMeなどのバイオコンダクタには、強化されたノーマライゼーションと視覚化のオプションを提供する多くのフリーウェアアプリケーションがあります。イルミナは、これらのフリーウェアソリューションのサポートを直接提供しません。
いいえ、Illumina LIMSは現時点ではInfinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChipsをサポートしていません。
いいえ、FFPEサンプルは現在サポートされていません。
手動および自動フォーマットのZymo Research EZ-96 Methylation-Lightning MagPrep Kitは、Infinium Methylationアッセイの上流での使用に対応しています。詳細については、このテクニカルノートを参照してください。
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件
MiSeq Reagent Kit v3
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンスアプリケーションに対応する、高速で、統合されたライブラリー調製のワークフロー。
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
広範囲のCpGアイランド、遺伝子、エンハンサーをカバーするロバストなメチル化プロファイルマイクロアレイ。遺伝性疾患や希少疾患の研究、がん研究、分類に最適です。
Infinium Mouse Methylation BeadChip
多様なマウス系統の高分解能エピジェネティック解析用にメチローム全体で285Kを超えるマーカーを表示します。
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