NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
Infinium Mouse Methylation BeadChip Kitは、専門家が選定した包括的なカバレッジと高いサンプルスループットのユニークな組み合わせを提供します。
Infinium Mouse Methylation BeadChip
多様なマウス系統の高分解能エピジェネティック解析用のメチローム全体の> 28.5万マーカーが特徴です。
アレイあたり12サンプル
サンプル数
Fixed markers: 285k
マーカー数
概要
遺伝子領域にわたる包括的なカバレッジ
Infinium Mouse Methylation BeadChipは、CpGアイランド、翻訳開始部位、エンハンサー、インプリントされた座位、およびその他の領域をバランスよくカバーします。Infinium HDケミストリーにより、メチル化DNAキャプチャー法にしばしば関連するバイアスの制約に関係なく、コンテンツを選択することができます。
高いアッセイ再現性
Infinium Mouse Methylation BeadChipは、テクニカルレプリケートで> 98%の再現性を達成し、全ゲノムバイサルファイトシーケンスデータと高い相関関係を示します。
幅広いアプリケーション
エピゲノム全体の関連研究、異種移植片実験、前臨床研究などを可能にします。
仕様
| Assay type | Infinium HD Methylation |
|---|---|
| Automation capability | Automated array loader |
| インプット量 | 250 ng DNA |
| システム | iScan |
| 手法 | Methylation array |
| Nucleic acid type | DNA |
| Number of markers | Fixed markers: 285k |
| サンプル数 | アレイあたり12サンプル |
| サンプルタイプの詳細 | 新鮮/凍結組織に使用できます。DACなどの外因性化学物質によって誘導されるDNAメチル化の変化を解析します。 |
| Specialized sample types | Blood, FFPE tissue, Saliva |
| Species category | マウス |
| テクノロジー | Microarray |
| バリアントクラス | Differentially methylated cytosines |
必要な製品
ニーズに適したサンプルスループットを提供するInfinium Mouse Methylation BeadChipキット構成をお選びください。
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件
アプリケーション
Infinium Mouse Methylation BeadChipは、エピゲノムワイド関連解析、前臨床研究、異種移植研究など、幅広いマウスエピジェネティックな解析研究にパワーを与えます。
ワークフローの例
関連するアプリケーションとメソッド
マイクロアレイや次世代シーケンサー（NGS）テクノロジーを用いたゲノムワイドなメチル化プロファイリング研究は、メチル化の機能的影響に関する新たな洞察をもたらします。
イルミナは、エピジェネティックな解析のためのソリューションを提供します。ツールを使用し、 エピジェネティックな修飾と遺伝子制御に対するその影響を研究します。
Learn how to profile gene expression changes for a deeper understanding of biology.
主なアプリケーションノート
ドキュメント
製品資料
サポートドキュメント
図
Infinium IアッセイデザインとInfinium IIアッセイデザインを用いた幅広いカバレッジ
アレイは、Infinium IアッセイとInfinium IIアッセイの両方を使用します。Infinium Iアッセイの設計では、CpG座位ごとに2種類のビーズタイプを使用し、メチル化状態と非メチル化状態にそれぞれ1種類ずつ使用します。Infinium IIの設計では1種類のビーズタイプを使用し、ハイブリダイゼーション後の一塩基伸長ステップでメチル化状態が決定されます。
Illumina GenomeStudioソフトウェアによる統合データ分析
GenomeStudio Softwareは、あらゆるプラットフォームでDNAメチル化解析をサポートします。データはヒートマップなどの直感的なグラフィックで表示されます。
比較する
| Infinium Mouse Methylation BeadChip | Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit | |
|---|---|---|
| Assay type | Infinium HD Methylation | Infinium HD Methylation |
| Automation capability | Automated array loader | Automated array loader |
| インプット量 | 250 ng DNA | 250 ng DNA |
| システム | iScan | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 550Dx in Research Mode, iScan |
| 手法 | Methylation array | Methylation array |
| Nucleic acid type | DNA | DNA |
| Number of markers | Fixed markers: 285k | ~ 930k |
| サンプル数 | アレイあたり12サンプル | アレイあたり8サンプル |
| サンプルタイプの詳細 | 新鮮/凍結組織に使用できます。DACなどの外因性化学物質によって誘導されるDNAメチル化の変化を解析します。 | |
| Specialized sample types | Blood, FFPE tissue, Saliva | Blood, FFPE tissue |
| Species category | マウス | ヒト |
| テクノロジー | Microarray | Microarray |
| バリアントクラス | Differentially methylated cytosines | Differentially methylated cytosines |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
リソース
Infinium Mouse Methylation BeadChipについて知っておくべき10のこと
Dr. Wanding Zhouが、マウス研究者のためのこの強力なツールの概要を紹介します。
専門家がイルミナのメチル化アレイデータを解析するための戦略について議論します。
Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit (24 samples)
20041558
2つの12サンプルBeadChipと、24のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出のための試薬が含まれます。インプットには≥ 250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。
List Price:
Discounts:
Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit (48 samples)
20041559
4つの12サンプルBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれます。インプットには≥ 250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。
List Price:
Discounts:
Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit (96 samples)
20041560
8つの12サンプルBeadChipと、96のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出のための試薬が含まれます。インプットには≥ 250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。
List Price:
Discounts:
Infinium Mouse Methylation275k-12+ v1.0 Kit (24 Samples)
20041561
2つの12サンプルBeadChipと、24のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出のための試薬が含まれます。DesignStudioを使用して追加の3K～10Kマーカーでコンテンツをカスタマイズするか、コンソーシアムブースターとして利用可能なアドオンコンテンツのリストから選択します。インプットには≥ 250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。
Infinium Mouse Methylation 275k-12+ v1.0 Kit (48 Samples)
20041562
4つの12サンプルBeadChipと、48のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれます。DesignStudioを使用して追加の3K～10Kマーカーでコンテンツをカスタマイズするか、コンソーシアムブースターとして利用可能なアドオンコンテンツのリストから選択します。インプットには≥ 250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。
Infinium Mouse Methylation275k-12+ v1.0 Kit (96 Samples)
20041563
8つの12サンプルBeadChipと、96のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出のための試薬が含まれます。DesignStudioを使用して追加の3K～10Kマーカーでコンテンツをカスタマイズするか、コンソーシアムブースターとして利用可能なアドオンコンテンツのリストから選択します。インプットには≥ 250 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。
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よくある質問（FAQ）
スタンダードなInfiniumメチル化プロトコールを使用すると、1サンプルあたり最低250 ngのインプットで高品質のインタクトなゲノムDNAを想定した場合、GenomeStudio Methylation Module Softwareによってアレイ上の96%以上のSiteを検出する必要があります。
GenomeStudio Methylation Moduleは、Infinium Mouse Methylation BeadChipデータのベータ値を抽出し、クラスター化を行います。GenomeStudioでは、Mouse Methylation BeadChipを用いたノーマライゼーションはサポートしていません。また、現時点では、BeadArray Controls Reporterソフトウェアツールはサポートされていません。
SeSAMeなどのバイオコンダクタには、強化されたノーマライゼーションと視覚化のオプションを提供する多くのフリーウェアアプリケーションがあります。イルミナは、これらのフリーウェアソリューションのサポートを直接提供しません。
SNPはBeadChipに含まれているため、研究者は品質管理の追加レベルとして、サンプルのDNAフィンガープリントを生成できます。特異的に、Mouse Methylation BeadChipには、解析対象DNAの系統由来の同定に役立つSNPプローブが含まれています。詳細については、Infinium HD Methylation Assay Reference Guideを参照してください。BeadChipのSNPアッセイはアッセイガイドに記載されておらず、GenomeStudio Methylation Moduleに簡潔に記載されています。
イルミナは5-hMcのアレイを検証していません。しかし、Infinium HumanMethylation450KおよびMethylationEPIC BeadChipを5-hMc分析に使用した文献があり、このプロトコールは、Infinium Mouse Methylation BeadChipでも機能する可能性があります。
詳細については、Nazor KL, Boland MJ, Bibikova M, et al.を参照してください。ヒト多能性幹細胞における単一塩基分解能での5mCと5hmCの両方の定量とマッピングのための低コストアレイベース技術TAB-Arrayの応用。Genomics. 2014;104(5):358-367. doi: 10.1016/j.ygeno.2014.08.014
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件
MiSeq Reagent Kit v3
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリを準備するための、高速で統合されたワークフロー。
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
広範囲のCpGアイランド、遺伝子、エンハンサーをカバーするロバストなメチル化プロファイルマイクロアレイ。遺伝性疾患や希少疾患の研究、がん研究、分類に最適です。
Infinium FFPE QCおよびDNA Restoration Kits
Infiniumアレイベースのアッセイで使用するためのサンプル品質の評価と分解FFPE DNAサンプルの修復。
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