高精度変異検出のための迅速で柔軟、かつスケーラブルなcfDNAライブラリー調製キットです。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichmentは、cfDNAサンプルから少量の変異を検出するための高感度ライブラリー調製ソリューションです。このワークフローには、エラー補正と偽陽性を減らすための分子バーコード（UMI）が含まれており、低頻度変異の正確で高感度な検出を可能にします。合成ケミストリーによる当社の最速、最高品質、最もロバストなシーケンス、XLEAP-SBSケミストリーは、NextSeq 2000（P4フローセル）およびNovaSeq Xシステムで使用可能になりました。
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichmentは、保管期間を6か月に延長したり、詳細な変更通知が可能になり、ラボの効率を高める製品特性を強化しています。
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichmentは、わずか約2.5～3時間のハンズオンタイムで、約8.5～9.5時間でシーケンス対応ライブラリーを調製するための高速ワークフローを提供します。研究者は、cfDNAの抽出からシーケンスまで1日で完了できます。NextSeq 550システムでのシーケンスに推奨されるリード長は2 × 149 bpです。NextSeq 2000、NovaSeq 6000、およびNovaSeq Xシステムでのシーケンスの場合、推奨されるリード長は2 × 151 bpです。
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichmentは、SNV、CNV、バリアントとしてのIndel、遺伝子融合などの低頻度バリアントを検出します。このキットは、わずか20 ngのcfDNAから90%以上の感度で、たった0.2%のアリル頻度を持つ小さなバリアントを同定します。
このキットは、シーケンサーから洞察まで手動タッチポイントがないオプションを備えた統合ワークフローの一部です。（1）cfDNAから始まり、（2）イルミナのミディアムスループットおよびハイスループットシステムでシーケンスし、（3）DRAGEN for ILMN cfDNA Prep with Enrichmentアプリを使用して高精度のバリアントコールを行い、（4）Illumina Connected Insightsを使用した自動研究レポート案の作成によるバリアント解釈のオプションがあります。
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichmentは、コンテンツの移植性向上において、イルミナ、またはIntegrated DNA Technologies（IDT）社の一本鎖DNA（ssDNA）やTwist Bioscience社の二本鎖DNA（dsDNA）などのサードベンダーのユーザー指定濃縮オリゴヌクレオチドと互換性があります。本キットは、55～2,000 kb ssDNAおよび70～2,000 kb dsDNAのパネルコンテンツに対応し、柔軟な試験デザインを可能にします。
Illumina Custom Enrichment Panel v2 は、ターゲットカバレッジを最適化するための動的なフィードバックを提供し、関心のあるコンテンツに固有のパネルを作成するために推奨されるソリューションです。DesignStudio ソフトウェアは、カスタムシーケンスパネルを作成するための、無料で使いやすいウェブベースのアッセイデザインツールです。
| 分析感度 | 20ngでの分析感度：90%以上（1塩基変異（SNV）0.2%以上およびインデル0.5%以上） |
|---|---|
| Analytical sensitivity | 20ngでの解析特異度：99.98%以上（1塩基変異（SNV）0.2%以上およびIndel 0.5%以上） |
| アッセイ時間 | 約8.5～9.5時間 |
| 説明 | 高精度変異検出のための迅速で柔軟、かつスケーラブルなcfDNAライブラリー調製キット |
| ハンズオンタイム | 約2.5〜3時間 |
| インプット量 | 10～30 ng cfDNA |
| システム | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000 System |
| 手法 | カスタムシーケンス, ターゲットDNAシーケンス, ターゲット濃縮 |
| 核酸の種類 | DNA |
| 対応サンプルタイプ | セルフリーDNA |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | 融合遺伝子, 体細胞バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） |
ワークフローを完了するには、上記のインデックスプレートが必要です。手動および自動ワークフローには専用のSKUがあります。Illumina Custom Enrichment Panel v2は、DesignStudioを使用して設計された120 bpの二本鎖プローブパネルで、ハイブリダイゼーションキャプチャー用のエンリッチメントオリゴが含まれています。
研究者は、リキッドバイオプシーNGSアッセイを使用して、がん患者の血液中に存在する腫瘍由来のバイオマーカーを検出し、特徴づけることができます。
イルミナのシーケンステクノロジーとマイクロアレイテクノロジーは、DNAからRNA解析、エピジェネティクスなど、がんゲノム研究の応用分野を幅広くサポートしています。
ターゲットエンリッチメントは、ハイブリダイゼーションを使用して目的のゲノム領域を捕捉します。ターゲットエンリッチメントについて、また、複数サンプルを一度に評価するためにどのように使用できるかについて学ぶ。
| Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment | Illumina DNA Prep with Enrichment | TruSight Oncology 500 ctDNA v2 | |
|---|---|---|---|
| 分析感度 | 20ngでの分析感度：90%以上（1塩基変異（SNV）0.2%以上およびインデル0.5%以上） | ≥ 90% (SNV, ≥ 0.2% VAF), ≥ 95% (SNV hotspots, ≥ 0.2% VAF), | |
| Analytical sensitivity | 20ngでの解析特異度：99.98%以上（1塩基変異（SNV）0.2%以上およびIndel 0.5%以上） | 99.995%以上（小さなバリアント、VAF0.5%以上） | |
| アッセイ時間 | 約8.5～9.5時間 | 約6.5時間 | 3〜4日：精製された核酸からバリアント結果まで |
| 説明 | 高精度変異検出のための迅速で柔軟、かつスケーラブルなcfDNAライブラリー調製キット | 低いDNAインプットやさまざまなサンプルタイプから、全エクソーム、カスタム、固定パネルターゲットシーケンスなど、さまざまな実験用のシーケンスライブラリーを約6.5時間で調製します。 | 液体生検サンプル（血漿からのctDNA）の包括的ゲノムプロファイリングにより、非侵襲的な研究方法を実現します。この液体生検アプローチは、組織ベースのCGPを補完する低侵襲性サンプル収集アプローチを使用して、腫瘍内および腫瘍間の不均一性に関する知見を提供します。 |
| ハンズオンタイム | 約2.5〜3時間 | 約2時間, 約2時間 |
～1.5時間：自動ワークフロー ～2.5時間：手動ワークフロー |
| インプット量 | 10～30 ng cfDNA | 高品質ゲノムDNA 10～1,000 ng、FFPE DNA 50～1,000 ng （血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください）。 | 20 ng cfDNA（血漿4 ml） |
| システム | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000 System | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム | NextSeq 2000 System, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 手法 | カスタムシーケンス, ターゲットDNAシーケンス, ターゲット濃縮 | カスタムシーケンス, ターゲットDNAシーケンス, エクソームシーケンス, ターゲット濃縮 | ターゲットDNAシーケンス, ターゲット濃縮 |
| 核酸の種類 | DNA | DNA | DNA |
| 対応サンプルタイプ | セルフリーDNA | 血液, 少量インプットサンプル, FFPE組織, 唾液 | 血中循環腫瘍DNA, 血液 |
| 生物種カテゴリー | ヒト | その他, ヒト | ヒト |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | 融合遺伝子, 体細胞バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | 1塩基変異多型（SNP）, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 生殖細胞系列バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV）, 血液腫瘍変異負荷（bTMB）, 血液マイクロサテライト不安定性（bMSI）, 遺伝子再構成 |
*システム互換性：P4およびP3フローセルはテスト済み
リキッドバイオプシーサンプルのマルチオミクス解析
Cell-Free DNA Prep with Enrichmentライブラリー調製キット
転移性前立腺がんにおけるcfDNAの全エクソームシーケンス – 顧客向けプレゼンテーション資料
必要とするDNAインプット量を減らし、ハンズオンタイムを短縮しながら、小さなヌクレオチドバリアント検出の感度を向上
リヨンで開催されたEACR Liquid Biopsies 2024会議で録画されたイルミナのプレゼンテーションです。この短いビデオ（16分）では、Anna Babayanがリキッドバイオプシー研究に利用できるソリューションをご紹介します。
プローブデザインからデータ解析まで、複数のターゲットシーケンスアプリケーションに対応する包括的なソリューション 当社のカスタム設計パネルはGCが豊富でシーケンスが難しい領域をカバーし、高い均一性とカバレッジを保証します。
Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Ligation (16 Samples)
20104105
Illumina認定の自動化メソッドを使用した16のライブラリー、または手動による24のライブラリーの調製のためのライゲーションベースのライブラリー調製が含まれます。濃縮試薬およびエンリッチメントパネルは含まれません。UMIインデックスアダプターは別売りで、ライブラリー調製に必要です。調製方法に基づいて選択してください。データ解析に関する注意：Cell-Free DNA：ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment Appのデータを、Illumina Connected AnalyticsまたはBaseSpace Sequence HubでDRAGENにより追加料金なしで解析できます。クラウドプラットフォームの基本契約が必要です。データストレージは含まれません。FFPE DNA：DRAGEN EnrichmentおよびDRAGEN Somaticでの解析は含まれません。
List Price:
Discounts:
Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Ligation (96 Samples)
20104106
Illumina認定の自動化メソッドを使用した96のライブラリー、または手動による120のライブラリーの調製のためのライゲーションベースのライブラリー調製が含まれます。エンリッチメント試薬およびエンリッチメントパネルは含まれません。UMIインデックスアダプターは別売りで、ライブラリー調製に必要です。調製方法に基づいて選択してください。データ解析に関する注意：Cell-Free DNA：ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment Appのデータを、Illumina Connected AnalyticsまたはBaseSpace Sequence HubでDRAGENにより追加料金なしで解析できます。クラウドプラットフォームの基本契約が必要です。データストレージは含まれません。FFPE DNA：DRAGEN EnrichmentおよびDRAGEN Somaticでの解析は含まれません。
List Price:
Discounts:
Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Enrichment (16 Reactions)
20104107
Illumina認定の自動化メソッドを使用した合計16の反応、または手動による24の反応で使用可能な、Illumina Cell-FreeおよびFFPE DNA Prepライブラリーの濃縮用高速濃縮試薬が含まれます。ライブラリー調製試薬およびエンリッチメントパネルは含まれません。UMIインデックスアダプターは別売りで、ライブラリー調製に必要です。調製方法に基づいて選択してください。Cell-Free DNA：濃縮時の反応ごとに1～4サンプル。ILMN Cell-Free DNA Prep with EnrichmentのデータをIllumina Connected AnalyticsまたはBaseSpace Sequence HubでDRAGENにより追加料金なしで解析できます。クラウドプラットフォームの基本契約が必要です。データストレージは含まれません。FFPE DNA：全エクソームエンリッチメントあたり4サンプル。DRAGEN EnrichmentおよびDRAGEN Somaticでの解析は含まれません。
List Price:
Discounts:
Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep with Enrichment, Ligation (192 Samples, 4-plex), Cloud Analysis
20104103
4プレックス濃縮（1回の濃縮反応に4つのライブラリーをプーリング）を使用して、Illumina認定の自動化メソッドを使用した192のライブラリー、または手動による240のライブラリーの調製のためのライゲーションベースのライブラリー調製および高速濃縮試薬が含まれます。UMIインデックスアダプターは別売りで、ライブラリー調製に必要です。調製方法に基づいて選択してください。エンリッチメントパネルは含まれていません。データ解析に関する注意：Cell-Free DNA：ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichmentのデータを、Illumina Connected AnalyticsまたはBaseSpace Sequence HubでDRAGENにより追加料金なしで解析できます。クラウドプラットフォームの基本契約が必要です。データストレージは含まれません。FFPE DNA：DRAGEN EnrichmentおよびDRAGEN Somaticでの解析は含まれません。
List Price:
Discounts:
Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep with Enrichment, Ligation (192 Samples, 4-plex), On-premises
20104104
4プレックス濃縮（1回の濃縮反応に4つのライブラリーをプーリング）を使用して、Illumina認定の自動化メソッドを使用した192のライブラリー、または手動による240のライブラリーの調製のためのライゲーションベースのライブラリー調製および高速濃縮試薬が含まれます。UMIインデックスアダプターは別売りで、ライブラリー調製に必要です。調製方法に基づいて選択してください。エンリッチメントパネルは含まれていません。10,000 Gb、1年間のDRAGENサーバーライセンスが含まれています。セルフリーDNA解析にはIllumina DRAGEN v4 Serverが必要です。
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (32 µl, 120 bp)
20073953
Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの二本鎖カスタムパネルデザインを可能にし、32 µl（Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると8濃縮反応に十分な量）の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (384 µl, 120 bp)
20073952
Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの二本鎖カスタムパネルのデザインを可能にし、384 µl（Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると96濃縮反応に十分な量）の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (1536 µl, 120 bp)
20111339
Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの2本ストランドカスタムパネル設計を可能にし、1,536 µl（Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると濃縮反応384回分に十分な量）の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20034701
UMI DNA Index Anchors（プレート = 20027219、箱 = 20032119） + Nextera対応 Unique Dual Index A（販売キット = 20027213、プレート = 20025019、箱 = 20026121）
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20034702
UMI DNA Index Anchors（プレート = 20027219、箱 = 20032119） + Nextera対応 Unique Dual Index B（販売キット = 20027214、プレート = 20025080、箱 = 20026930）
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set A for Automation
20066404
96サンプルの標識するのに十分なIDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set A for Automation 1箱 と、96 IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automation1箱が同梱されています。
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set B for Automation
20063213
96サンプルの標識に十分な96 IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set B for Automation1箱と、96 IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automation1箱が同梱されています。
List Price:
Discounts:
Illumina UMI DNA/RNA UD v3 indexes Set A, Ligation (96 indexes, 96 Samples)
20126235
Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set A sufficient for labeling 96 samples and one box of 96 IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors.
List Price:
Discounts:
Illumina UMI DNA/RNA UD v3 indexes Set B, Ligation (96 indexes, 96 Samples)
20126237
Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set B sufficient for labeling 96 samples and one box of 96 IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors.
List Price:
Discounts:
Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment Training
20122119
This 2-day introductory course is designed to familiarize new users with the Illumina cfDNA Prep with Enrichment workflow through detailed hands- on instruction. Participants will learn all essential steps in the workflow, including manual library preparation, enrichment, sequencing, and data analysis.
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製品名
数量
単価
製品名
カタログ番号
量
単価
NovaSeq 6000システムで強力なハイスループットシーケンス研究を実行。データ出力と時間をプロジェクトのニーズにマッチング。
すぐに使用できる充填された試薬カートリッジとフローセルからなるNovaSeq 6000システム用試薬キットです。
FFPE組織から、すべての主要バリアントクラスに加え、重要なバイオマーカー（TMB、MSI、HRD）を網羅する大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現します。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
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