TruSight Oncology 500 ctDNA v2

主要な免疫腫瘍学遺伝子シグネチャ（TMB、MSI）に加えて、血漿中のctDNAからすべての主要なバリアントクラスを検出できる腫瘍横断型パネルでCGPを可能にします。

データシート PDF 1 MB

8 バージョン

精製された核酸からバリアントレポートまで<4日

アッセイ時間

ライブラリー調製および濃縮時間約2.5時間

ハンズオンタイム

cfDNA 20 ng（血漿4 ml）

インプット量

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新たにリリースされた感度が向上したTruSight Oncology 500 ctDNA v2では、より少ないcfDNAインプット量でターンアラウンドタイムを短縮し、ワークフローを合理化できます。

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概要

TruSight Oncology 500 ctDNA v2は、腫瘍横断型NGSアッセイであり、研究用の血中循環腫瘍DNA（ctDNA）の包括的な施設内ゲノムプロファイリング（CGP）を可能にします。

UMIベースのハイブリッドキャプチャーライブラリー調製とディープシーケンスを使用して、侵襲性が最小限の血液サンプルからの低cfDNA インプット（20 ng）で高感度かつ正確な検出（SNVでは0.2% VAF）を実現します。
主要なバリアントクラス（SNV、MNV、Indel、CNV、遺伝子再構成）にわたるDNAバリアントと、主要ながん免疫遺伝子シグネチャ（TMB、MSI）を評価する523の遺伝子をターゲット
NovaSeq Xシリーズへの拡張により、変革的な経済性、40%近いシーケンスラン時間の短縮、より広範なバッチサイズ（4～48サンプル）が実現します
高度なケミストリーと自動化に優しいキットとメソッドでワークフローを合理化することで、ライブラリー調製を1日で完了し、さらに濃縮と合計ターンアラウンドタイムを3～4日にすることができます。
DRAGEN二次解析は、Illumina Connected Analyticsにより、オンプレミスまたはクラウドでの高速バリアントコーリングアルゴリズムを強化。イルミナのConnected Insights*またはVelseraの統合レポートを使用して洞察にアクセス。

*国によってはご利用いただけない場合があります。Illumina Connected Insightsは、第三者のナレッジソースへのAPIコールを介してユーザー定義の三次解析をサポートします。

包括的なポートフォリオでCGPを実現

TruSight Oncology 500製品ラインで、実行可能な変更を同定する可能性を最大化します。

TruSight Oncology 500 ctDNA v2

TruSight Oncology 500アッセイと同様のDNAパネル内容で、血漿中の血中循環腫瘍DNA（ctDNA）を解析します。

TruSight Oncology 500

FFPE腫瘍組織から関連DNAおよびRNAがんバイオマーカーを評価します。ゲノム不安定性スコア（GIS）を評価するアクセサリーキットが追加され、これにはHRDが含まれます。^†

TruSight Oncology 500 High Throughputアッセイ

TruSight Oncology 500と同じパネル内容と組織インプットタイプを用いて、一度に最大192のサンプルをバッチ処理できます。

TruSight Oncology 500製品ラインの詳細はこちら

^†HRDは、TruSight Oncology 500 HRDキットをTruSight Oncology 500キットに追加した場合にのみ利用できます。日本ではご利用いただけません。

仕様

分析感度	95%以上（小さなバリアント、VAF0.5%以上）
分析特異度	99.995%以上（小さなバリアント、VAF0.5%以上）
アッセイ時間	精製された核酸からバリアントレポートまで<4日
Automation capability	Liquid handling robots
自動化の詳細	利用可能な自動化方法を見る
Cancer type	Pan-cancer, Solid tumor
コンテンツ仕様	合計1.94 Mbのパネルサイズに対する523遺伝子（完全コード配列）をターゲットとして選択。 • 免疫腫瘍学バイオマーカーのカバレッジ：TMBおよびMSI • ガイドラインの適用範囲：複数の固形腫瘍タイプに関する主要ガイドラインを幅広く網羅 • 臨床試験のカバレッジ：600件を超える臨床試験（2023年2月現在、Pierian臨床ナレッジベースに基づく）
説明	液体生検サンプル（血漿からのctDNA）の包括的ゲノムプロファイリングにより、がん研究アプリケーション用の固形腫瘍のプロファイリングのための非侵襲的方法を提供します。この液体生検アプローチは、組織ベースのCGPを補完する低侵襲性サンプル収集アプローチを使用して、腫瘍内および腫瘍間の不均一性に関する洞察を提供します。
遺伝子カウント	DNA遺伝子523個
ハンズオンタイム	ライブラリー調製および濃縮時間約2.5時間
インプット量	cfDNA 20 ng（血漿4 ml）
システム	NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System
作用機序	ハイブリッドキャプチャー化学
手法	Targeted DNA sequencing, Target enrichment
Multiplexing	NovaSeq X: 4 on 1.5B, 24 on 10B, NovaSeq 6000: 8 on S2, 24 on S4 using Xp-4-Lane workflow, 192 indexes maximum
Nucleic acid type	DNA
Sample throughput	4-48 samples/run
Specialized sample types	Circulating tumor DNA, Blood
Species category	ヒト
テクノロジー	イルミナシーケンサー
バリアントクラス	Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)

必要な製品

TruSight Oncology 500 ctDNA v2をランするには、以下が必要です。

TruSight Oncology 500 ctDNA v2キット（Velseraの有無を問わない）
NovaSeq 6000システム
NovaSeq 6000試薬キットは、スループットのニーズに応じて異なるフローセルオプションを備えています。オプション：NovaSeq Xpワークフローでは、各フローセルレーンに独立にロードできる柔軟性を実現します。

DRAGENパイプラインで解析するには、以下が必要です。

ローカル解析用のDRAGENサーバーライセンス、または
クラウド解析のためのIllumina Connected AnalyticsサブスクリプションとiCredit

最終的なバリアントレポートを作成するには、以下が必要です。

Illumina Connected Insights^* 、または
Velsera Clinical Genomics Workspace^†または
その他の市販オプション

^* 国によってはご利用いただけない場合があります。Illumina Connected Insightsは、第三者のナレッジソースへのAPIコールを介してユーザー定義の三次解析をサポートします。

^† Velseraの旧称はPierianです。その他の市販オプションもあります。

/ 件

アプリケーション

ワークフローの例

ライブラリー調製

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 Assay

シーケンス

解析

バリアントコール：

洞察とレポート作成：

Illumina Connected Insights^†

Velsera Clinical Genomics Workspaceソフトウェア

^*NovaSeq 6000Dx（RUOモード）のオンボード互換性は近日公開予定です。

^†国によってはご利用いただけない場合があります。Illumina Connected Insightsは、第三者のナレッジソースへのAPIコールを介してユーザー定義の三次解析をサポートします。

プロジェクトの推奨事項

装置	Recommended number of samples	Read length
NovaSeq 6000 System	24 samples per run (S4 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage	2 × 150 bp
NovaSeq 6000 System	8 samples per run (S2 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage	2 × 150 bp
NovaSeq X System	NovaSeq X Series, 4 samples per run (1.5B flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage	2 × 150 bp
NovaSeq X System	NovaSeq X Series, 8 samples per run (10B flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage	2 × 150 bp

ドキュメント

製品資料

Liquid Biopsy and NGS: Driving translational clinical research to the next level
アプリケーションノート PDF < 1 MB

- English
- Simplified Chinese
テクニカルノート PDF < 1 MB

2 バージョン

TruSight Oncology 500 ctDNA Gene List
product_file EXCEL < 1 MB

- English
- Chinese (Simplified)
製品情報シート PDF < 1 MB

2 バージョン

TruSight Oncology 500 portfolio
パンフレット PDF 6 MB

- English
- Japanese
アプリケーションノート PDF < 1 MB

2 バージョン

- English
- Japanese
テクニカルノート PDF < 1 MB

2 バージョン

データシート PDF 1 MB

8 バージョン

- English
- French
- German
- Italian
- Japanese
- Korean
- Spanish
データシート PDF 1 MB

7 バージョン

サポートドキュメント

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Local Analysis Software v2.1文書

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software v1.2文書

TruSight Oncology 500 ctDNA消耗品および機器

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software v2.6文書

ICA上のDRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software v1.2

DRAGEN Analysis Workflows製品文書

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA v1.1 Local Analysisソフトウェア文書

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software v2.5文書

TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software Documentation

ICA文書上のDRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software v2.1.1

TruSight Oncology 500 ctDNAリファレンスガイド

TruSight Oncology 500 ctDNAチェックリスト

TruSight Oncology 500 ctDNAサポートドキュメント

比較する

	TruSight Oncology 500 ctDNA v2	TruSight Oncology 500	TruSight Oncology 500 High Throughput
分析感度	95%以上（小さなバリアント、VAF0.5%以上）
分析特異度	99.995%以上（小さなバリアント、VAF0.5%以上）
アッセイ時間	精製された核酸からバリアントレポートまで<4日	サンプルから結果まで4～5日	サンプルから結果まで4～5日
Automation capability	Liquid handling robots	Liquid handling robots	Liquid handling robots
自動化の詳細	利用可能な自動化方法を見る	利用可能な自動化方法を見る	利用可能な自動化方法を見る
Cancer type	Pan-cancer, Solid tumor	Pan-cancer, Solid tumor	Pan-cancer, Solid tumor
コンテンツ仕様	合計1.94 Mbのパネルサイズに対する523遺伝子（完全コード配列）をターゲットとして選択。 • 免疫腫瘍学バイオマーカーのカバレッジ：TMBおよびMSI • ガイドラインの適用範囲：複数の固形腫瘍タイプに関する主要ガイドラインを幅広く網羅 • 臨床試験のカバレッジ：600件を超える臨床試験（2023年2月現在、Pierian臨床ナレッジベースに基づく）	523の遺伝子からのDNAおよび55の遺伝子からのRNAのターゲットシーケンス、合計1.94 Mbのパネルサイズ。MSIおよびTMB測定を含みます。オプションのTruSight Oncology 500 HRDキット（日本ではご利用いただけません）には、Myriad Geneticsによる包括的ゲノム不安定性スコア（LOH+TAI+LST）により相同組換え欠損を評価するための、約25,000のSNPが含まれます。	523の対象遺伝子からのDNAおよび55の遺伝子からのRNAのターゲットシーケンス、合計1.94Mbのパネルサイズ。MSIおよびTMB測定を含みます。
説明	液体生検サンプル（血漿からのctDNA）の包括的ゲノムプロファイリングにより、がん研究アプリケーション用の固形腫瘍のプロファイリングのための非侵襲的方法を提供します。この液体生検アプローチは、組織ベースのCGPを補完する低侵襲性サンプル収集アプローチを使用して、腫瘍内および腫瘍間の不均一性に関する洞察を提供します。	FFPE組織からの包括的ゲノムプロファイリングを可能にし、NextSeq 550システムまたはNextSeq 550Dx システム（研究（RUO）モード）で実行し、一度に最大8サンプルをバッチ処理できるアッセイ。	NovaSeq 6000 システムまたはNovaSeq 6000Dx システム（研究（RUO）モード）を使用した合理化されたワークフローから、ガイドラインおよび>1,000件の臨床試験における主要なバイオマーカーを同定するためのハイスループットの包括的なNGSアッセイ。免疫腫瘍学バイオマーカーのMSIおよびTMBのカバレッジが含まれます。
遺伝子カウント	DNA遺伝子523個
ハンズオンタイム	ライブラリー調製および濃縮時間約2.5時間	自動ワークフロー約2.5時間。手動ワークフロー約10.5時間。	自動ワークフロー約2.5時間。手動ワークフロー約10.5時間。
インプット量	cfDNA 20 ng（血漿4 ml）	DNA 40 ngおよび/またはRNA 40 ng	DNA 40 ngおよび/またはRNA 40～80 ng
システム	NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System	NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 500 Desktop Sequencer	NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System
作用機序	ハイブリッドキャプチャー化学
手法	Targeted DNA sequencing, Target enrichment	Targeted DNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment	Targeted DNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment
Multiplexing	NovaSeq X: 4 on 1.5B, 24 on 10B, NovaSeq 6000: 8 on S2, 24 on S4 using Xp-4-Lane workflow, 192 indexes maximum	最大8プレックス	最大16プレックス（SPフローセル）、32プレックス（S1フローセル）、72プレックス（S2フローセル）、192プレックス（S4フローセル）
Nucleic acid type	DNA	DNA, RNA	DNA, RNA
Sample throughput	4-48 samples/run		1ランあたり16～192サンプル
Specialized sample types	Circulating tumor DNA, Blood	FFPE tissue	FFPE tissue
Species category	ヒト	ヒト	ヒト
テクノロジー	イルミナシーケンサー	イルミナシーケンサー	イルミナシーケンサー
バリアントクラス	Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)	Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Novel transcripts, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants	Gene fusions, Somatic variants, Novel transcripts, Structural variants, Transcript variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs)

^* Pierianの臨床ナレッジベースに基づく（2023年2月現在）。

^* RUOモードのNovaSeq 6000Dx システムには、二次解析用に別途、スタンドアロンのDRAGENサーバーが必要です。

^* NovaSeq 6000Dx（RUOモード）のオンボード互換性は近日公開予定

図

低VAFでのヌクレオチドバリアント検出

一塩基変異ごとに既知のバリアントアリル頻度（VAF）の合成コントロールサンプルを0.20%～0.50%の範囲のVAFになるよう希釈し、TruSight Oncology 500 ctDNA v2で解析。

低VAFでのIndel検出

挿入または欠失ごとに既知のVAFの合成コントロールサンプルを0.20%～0.50%の範囲のVAFになるよう希釈し、TruSight Oncology 500 ctDNA v2で解析。

腫瘍/正常コーリングと比較してTMB相関が高い

TSO 500 ctDNA v2のTumor-onlyワークフローでは、生殖細胞系列およびCHバリアントのフィルターに高度なバイオインフォマティクスを活用することで、腫瘍/正常ワークフローと比較して、非常に一致率の高いbTMBが得られます。

がん免疫研究における高感度MSI検出

マイクロサテライト不安定性（MSI）を既知の高MSIステータス（サンプル1～3）の3つの細胞株で評価したところ、0.3%の腫瘍分画まで検出され、最大約2,300のホモポリマー部位を評価することができました。

CNVの解析性能、増幅についてはLOD ≥1.3倍、欠失については≤0.6倍

開始コピー数が少ないことから、検出下限により速く到達し、相対的なMYC検出率は低下。イルミナ社内データ、2023年

LODで検出した遺伝子再構成の解析性能（0.5%）

VAFは、支持リードの総数をブレークポイントの2つの側面の高い方の深度で割ることで算出。イルミナ社内データ、2023年

リソース

TruSight Oncology 500 ctDNA v2

イルミナは、TruSight Oncology 500 ctDNA v2により、循環腫瘍の解析を改善しました。動画で新機能と利点をご覧ください。

TruSight Oncology 500ポートフォリオのパンフレット

TruSight Oncology 500製品ポートフォリオの詳細について興味をお持ちですか？

概要パンフレットをダウンロードいただけます。

イルミナは日本国立がん研究センターと協力し、アジアにおける主要な死因に対処しています

ゲノム情報に基づいた個別化治療の開発を加速するためのこの共同の取り組みについてご覧ください。

マニュアル調製 (12)

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (24 samples)

20105899

TSO 500 ctDNA v2マニュアルキット

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (24 samples)

20105901

Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC Manual Kit

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (24 samples)

20105902

Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC Manual Kit

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (24 samples) plus Velsera Interpretation Report

20105905

TSO 500 ctDNA v2 Manual Kit + Velsera Interpretation Report

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Velsera Interpretation Report, for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (24 samples)

20105907

Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC Manual Kit + Velsera Interpretation Report

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Velsera Interpretation Report, for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (24 samples)

20105908

Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC Manual Kit + Velsera Interpretation Report

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit (48 samples)

20039252

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit（DNAライブラリー調製および濃縮試薬を含む）にNovaSeq用試薬は含まれていません。

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit plus Velsera Interpretation Report (16 indexes, 48 Samples)

20043410

ライブラリー調製と濃縮試薬、およびデータ解釈レポート（Velsera Clinical Genomics Workspaceソフトウェア使用）が含まれます。NovaSeqシステム用試薬は含まれていません。

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit, for use with NovaSeq 6000 S2 (48 samples)

20101995

TSO500 ctDNAとNovaSeq 6000 S2 Core消耗品のコンビネーションSKU

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit, for use with NovaSeq 6000 S4 (48 samples)

20101998

TSO500 ctDNAとNovaSeq 6000 S4 Core消耗品のコンビネーションSKU

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit for use with NovaSeq 6000 S2 plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 samples)

20102000

Combination SKU for TSO500 ctDNA and the NovaSeq 6000 S2 Core consumables + Velsera report

List Price:

Discounts:

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit for use with NovaSeq 6000 S4 plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 samples)

20102001

Combination SKU for TSO500 ctDNA and the NovaSeq 6000 S4 Core consumables + Velsera report

List Price:

Discounts:

インデックスアダプター (4)

IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034701

UMI DNA Index Anchors（プレート = 20031416、箱 = 20032620） + Nextera対応 Unique Dual Index A（販売キット = 20027213、プレート = 20025019、箱 = 20026121）

List Price:

Discounts:

IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034702

IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors Set B

List Price:

Discounts:

IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set A for Automation

20066404

96 IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set A for Automationの箱1箱が同梱されており、96サンプルにラベル表示でき、96 IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automationの箱1箱が同梱されています。

List Price:

Discounts:

IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set B for Automation

20063213

イルミナの96 IDT - UMI DNA/RNA UD Indexes Set B for Automationの1箱入りで、イルミナの96 IDT - UMI DNA Index Anchors for Automationのラベルに十分な量です。

List Price:

Discounts:

試薬 (4)

NovaSeq 6000 S2 Reagent Kit v1.5 (300 cycles)

20028314

NovaSeq 6000システムの300サイクルランをサポートするS2フローセル1個、バッファーカートリッジ1個、クラスターカートリッジ1個、シーケンスカートリッジ1個が含まれます。

List Price:

Discounts:

NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5 (300 cycles)

20028312

NovaSeq 6000システムでの300サイクルランをサポートするS4フローセル1個、バッファーカートリッジ1個、クラスターカートリッジ1個、シーケンスカートリッジ1個が含まれます。

List Price:

Discounts:

NovaSeq X Series 1.5B Reagent Kit (300 Cycle)

20104705

この試薬キットは、NovaSeq Xシリーズ1.5Bフローセル（2レーン付き）1点と試薬消耗品が備えられており、NovaSeq XおよびNovaSeq X Plusシステムでのシングルフローセル300サイクルのランをサポートします。

List Price:

Discounts:

NovaSeq X Series 10B Reagent Kit (300 Cycle)

20085594

この試薬キットは、NovaSeq Xシリーズ10Bフローセル（8レーン付き）1点と試薬消耗品が備えられており、NovaSeq XおよびNovaSeq X Plusシステムでのシングルフローセル300サイクルのランをサポートします。

List Price:

Discounts:

ソフトウェアおよびインフォマティクスオプション (15)

Illumina DRAGEN Server v4

20051343

初年度Avance Exchangeサポートが含まれます。年間DRAGENライセンスの購入が必要です。

List Price:

Discounts:

ICA Basic Annual Subscription

20044874

Illumina Connected Analytics (ICA) Basic Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、パッケージ化されたツールへのアクセスなど、TSO500をご使用のお客様を対象としたICAへの一年間のアクセスが含まれています。

お問い合わせ

List Price:

Discounts:

ICA Professional Annual Subscription

20044876

Illumina Connected Analytics (ICA) Professional Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、パッケージ化されたツールへのアクセス、およびツール、パイプライン、データウェアハウス、ノートブックで構成されるカスタマイズされたワークフローの作成機能を含むICAへの一年間のアクセスが含まれます。

お問い合わせ

List Price:

Discounts:

ICA Enterprise Annual Subscription

20038994

Illumina Connected Analytics (ICA) Enterprise Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、カスタムおよびパッケージ化された解析ツール、データ保管およびマイニング用のベースモジュールなどを含むICA Enterpriseへの一年間のアクセスが含まれます。ICA Enterpriseには、オプションとしてHIPPAA BAA（米国のみ）、シングルサインオン（SSO）、およびサービスレベル契約（SLA）も含まれます。

お問い合わせ

List Price:

Discounts:

ICA Enterprise Service and Compliance Add-on (applies to Basic only)

20066830

Illumina Connected Analytics (ICA) Enterprise Service and Compliance Add-on。本製品は、ICA Basic Annual Subscriptionを対象とした一年間のサービスで、HIPPAA BAA（米国のみ）、シングルサインオン（SSO）、およびサービスレベル契約（SLA）が含まれます。

お問い合わせ

List Price:

Discounts:

Illumina Analytics - 1 iCredit

20042038