NovaSeq Xシリーズの注文
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
主要な免疫腫瘍学遺伝子シグネチャ(TMB、MSI)に加えて、血漿中のctDNAからすべての主要なバリアントクラスを検出できる腫瘍横断型パネルでCGPを可能にします。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
この製品は出荷できる国が制限されています。 出荷の可否を確認するには、 出荷する国を選択してください 。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 is now available with improved sensitivity using lower cfDNA input, a faster turnaround time, and a more streamlined workflow.
TruSight Oncology 500 ctDNA v2は、腫瘍横断型NGSアッセイであり、研究用の血中循環腫瘍DNA(ctDNA)の包括的な施設内ゲノムプロファイリング(CGP)を可能にします。
UMIベースのハイブリッドキャプチャーライブラリー調製とディープシーケンスを使用して、低インプット(20 ng)で高感度かつ正確な検出(SNVでは0.2% VAF)を実現します。
DRAGEN二次解析は、Illumina Connected Analyticsにより、オンプレミスまたはクラウドでの高速バリアントコーリングアルゴリズムを強化。イルミナのConnected Insights*またはVelseraの統合レポートを使用して洞察にアクセス。
高度なケミストリーと広範なワークフローの最適化により、ライブラリー調製を1日で完了し、さらに濃縮することで4日未満のトータルターンアラウンドタイムを実現します。自動化に適したキットと手法で効率性の向上を実現。
*国によってはご利用いただけない場合があります。Illumina Connected Insightsは、第三者のナレッジソースへのAPIコールを介してユーザー定義の三次解析をサポートします。
TruSight Oncology 500製品ラインで、実行可能な変更を同定する可能性を最大化します。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2
TruSight Oncology 500アッセイと同様のDNAパネル内容で、血漿中の血中循環腫瘍DNA(ctDNA)を解析します。
FFPE腫瘍組織から関連DNAおよびRNAがんバイオマーカーを評価します。ゲノム不安定性スコア(GIS)を評価するアクセサリーキットが追加され、これにはHRDが含まれます。†
TruSight Oncology 500 High Throughputアッセイ
TruSight Oncology 500と同じパネル内容と組織インプットタイプを用いて、一度に最大192のサンプルをバッチ処理できます。
†HRDは、TruSight Oncology 500 HRDキットをTruSight Oncology 500キットに追加した場合にのみ利用できます。日本ではご利用いただけません。
Cancer type | Pan-Cancer, Solid Tumor |
---|---|
Method | Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing |
Specialized sample types | Circulating Tumor DNA, Blood |
Variant class | Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
アッセイ時間 |
精製された核酸からバリアントレポートまで<4日 |
インプット量 |
cfDNA 20 ng(血漿4 ml) |
コンテンツ仕様 |
合計1.94 Mbのパネルサイズに対する523遺伝子(完全コード配列)をターゲットとして選択。 • 免疫腫瘍学バイオマーカーのカバレッジ:TMBおよびMSI • ガイドラインの適用範囲:複数の固形腫瘍タイプに関する主要ガイドラインを幅広く網羅 • 臨床試験のカバレッジ:600件を超える臨床試験(2023年2月現在、Pierian臨床ナレッジベースに基づく) |
システム | NovaSeq 6000 System |
テクノロジー | イルミナシーケンサー |
ハンズオンタイム |
ライブラリー調製および濃縮時間約2.5時間 |
マルチプレックス | Xp-4レーンワークフローを使用して、S2で最大8、S4で最大24、最大16インデックス |
作用機序 | ハイブリッドキャプチャー化学 |
分析感度 | 95%以上(小さなバリアント、VAF0.5%以上) |
分析特異度 | 99.995%以上(小さなバリアント、VAF0.5%以上) |
核酸の種類 | DNA |
生物種 | ヒト |
説明 |
液体生検サンプル(血漿からのctDNA)の包括的ゲノムプロファイリングにより、がん研究アプリケーション用の固形腫瘍のプロファイリングのための非侵襲的方法を提供します。この液体生検アプローチは、組織ベースのCGPを補完する低侵襲性サンプル収集アプローチを使用して、腫瘍内および腫瘍間の不均一性に関する洞察を提供します。 |
遺伝子カウント | DNA遺伝子523個 |
TruSight Oncology 500 ctDNA v2をランするには、以下が必要です。
DRAGENパイプラインで解析するには、以下が必要です。
最終的なバリアントレポートを作成するには、以下が必要です。
* 国によってはご利用いただけない場合があります。Illumina Connected Insightsは、第三者のナレッジソースへのAPIコールを介してユーザー定義の三次解析をサポートします。
† Velseraの旧称はPierianです。その他の市販オプションもあります。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 Assay
*Novaseq XとNovaSeq 6000Dx(RUOモード)の互換性は2024年にリリース予定です。
†国によってはご利用いただけない場合があります。Illumina Connected Insightsは、第三者のナレッジソースへのAPIコールを介してユーザー定義の三次解析をサポートします。
装置 | Recommended number of samples | Read length |
---|---|---|
NovaSeq 6000 System | 24 samples per run (S4 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage |
2 × 150 bp |
NovaSeq 6000 System | 8 samples per run (S2 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage |
2 × 150 bp |
次世代シーケンサーは腫瘍の分子基盤の深い洞察を提供し、個別化医療の実現に貢献することができます。
次世代シーケンサーは、免疫腫瘍学の研究者が免疫療法反応因子や腫瘍の免疫回避メカニズムに関する知見を得ることを可能にします。
Our clinical cancer research solutions deliver accurate genomic information, and enable labs to analyze multiple genes in a single test.
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 | TruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 High Throughput | |
---|---|---|---|
Cancer type | Pan-Cancer, Solid Tumor | Pan-Cancer, Solid Tumor | |
Method | Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing | Target Enrichment, Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing | |
Specialized sample types | Circulating Tumor DNA, Blood | FFPE Tissue | |
Variant class | Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Gene fusions, Transcript variants, Single nucleotide variants (SNVs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Novel transcripts, Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants | |
アッセイ時間 |
精製された核酸からバリアントレポートまで<4日 |
サンプルから結果まで4~5日 |
サンプルから結果まで4~5日 |
インプット量 |
cfDNA 20 ng(血漿4 ml) |
DNA 40 ngおよび/またはRNA 40 ng |
DNA 40 ngおよび/またはRNA 40~80 ng |
コンテンツ仕様 |
合計1.94 Mbのパネルサイズに対する523遺伝子(完全コード配列)をターゲットとして選択。 • 免疫腫瘍学バイオマーカーのカバレッジ:TMBおよびMSI • ガイドラインの適用範囲:複数の固形腫瘍タイプに関する主要ガイドラインを幅広く網羅 • 臨床試験のカバレッジ:600件を超える臨床試験(2023年2月現在、Pierian臨床ナレッジベースに基づく) |
523の遺伝子からのDNAおよび55の遺伝子からのRNAのターゲットシーケンス、合計1.94 Mbのパネルサイズ。MSIおよびTMB測定を含みます。 オプションのTruSight Oncology 500 HRDキット(日本ではご利用いただけません)には、Myriad Geneticsによる包括的ゲノム不安定性スコア(LOH+TAI+LST)により相同組換え欠損を評価するための、約25,000のSNPが含まれます。 |
523の対象遺伝子からのDNAおよび55の遺伝子からのRNAのターゲットシーケンス、合計1.94Mbのパネルサイズ。MSIおよびTMB測定を含みます。 |
システム | NovaSeq 6000 System | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 500 Desktop Sequencer | |
テクノロジー | イルミナシーケンサー | イルミナシーケンサー | |
ハンズオンタイム |
ライブラリー調製および濃縮時間約2.5時間 |
自動ワークフロー約2.5時間。 手動ワークフロー約10.5時間。 |
自動ワークフロー約2.5時間。 手動ワークフロー約10.5時間。 |
マルチプレックス | Xp-4レーンワークフローを使用して、S2で最大8、S4で最大24、最大16インデックス | 最大8プレックス |
最大16プレックス(SPフローセル)、32プレックス(S1フローセル)、72プレックス(S2フローセル)、192プレックス(S4フローセル) |
作用機序 | ハイブリッドキャプチャー化学 | ||
分析感度 | 95%以上(小さなバリアント、VAF0.5%以上) | ||
分析特異度 | 99.995%以上(小さなバリアント、VAF0.5%以上) | ||
核酸の種類 | DNA | DNA, RNA | |
生物種 | ヒト | ヒト | |
説明 |
液体生検サンプル(血漿からのctDNA)の包括的ゲノムプロファイリングにより、がん研究アプリケーション用の固形腫瘍のプロファイリングのための非侵襲的方法を提供します。この液体生検アプローチは、組織ベースのCGPを補完する低侵襲性サンプル収集アプローチを使用して、腫瘍内および腫瘍間の不均一性に関する洞察を提供します。 |
FFPE組織からの包括的ゲノムプロファイリングを可能にし、NextSeq 550システムまたはNextSeq 550Dx システム(研究(RUO)モード)で実行し、一度に最大8サンプルをバッチ処理できるアッセイ。 |
NovaSeq 6000 システムまたはNovaSeq 6000Dx システム(研究(RUO)モード)を使用した合理化されたワークフローから、ガイドラインおよび>1,000件の臨床試験における主要なバイオマーカーを同定するためのハイスループットの包括的なNGSアッセイ。免疫腫瘍学バイオマーカーのMSIおよびTMBのカバレッジが含まれます。 |
遺伝子カウント | DNA遺伝子523個 |
* Pierianの臨床ナレッジベースに基づく(2023年2月現在)。
* RUOモードのNovaSeq 6000Dx システムには、二次解析用に別途、スタンドアロンのDRAGENサーバーが必要です。
* NovaSeq XとNovaSeq 6000 Dxの互換性は2024年にリリース予定です。
低VAFでの一塩基変異検出
一塩基変異ごとに既知のバリアントアリル頻度(VAF)の合成コントロールサンプルを0.20%~0.50%の範囲のVAFになるよう希釈し、TruSight Oncology 500 ctDNA v2で解析。
低VAFでのIndel検出
挿入または欠失ごとに既知のVAFの合成コントロールサンプルを0.20%~0.50%の範囲のVAFになるよう希釈し、TruSight Oncology 500 ctDNA v2で解析。
腫瘍/正常コーリングと比較してTMB相関が高い
TSO 500 ctDNA v2のTumor-onlyワークフローでは、生殖細胞系列およびCHバリアントのフィルターに高度なバイオインフォマティクスを活用することで、腫瘍/正常ワークフローと比較して、非常に一致率の高いbTMBが得られます。
がん免疫研究における高感度MSI検出
マイクロサテライト不安定性(MSI)を既知の高MSIステータス(サンプル1~3)の3つの細胞株で評価したところ、0.3%の腫瘍分画まで検出され、最大約2,300のホモポリマー部位を評価することができました。
CNVの解析性能、増幅についてはLOD ≥1.3倍、欠失については≤0.6倍
開始コピー数が少ないことから、検出下限により速く到達し、相対的なMYC検出率は低下。 イルミナ社内データ、2023年
LODで検出した遺伝子再構成の解析性能(0.5%)
VAFは、支持リードの総数をブレークポイントの2つの側面の高い方の深度で割ることで算出。イルミナ社内データ、2023年
TruSight Oncology 500 ctDNA v2
イルミナは、TruSight Oncology 500 ctDNA v2により、循環腫瘍の解析を改善しました。動画で新機能と利点をご覧ください。
TruSight Oncology 500ポートフォリオのパンフレット
TruSight Oncology 500製品ポートフォリオの詳細について興味をお持ちですか?
イルミナは日本国立がん研究センターと協力し、アジアにおける主要な死因に対処しています
ゲノム情報に基づいた個別化治療の開発を加速するためのこの共同の取り組みについてご覧ください。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (24 samples)
20105899
TSO 500 ctDNA v2マニュアルキット
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (24 samples)
20105901
Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC Manual Kit
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (24 samples)
20105902
Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC Manual Kit
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (24 samples) plus Velsera Interpretation Report
20105905
TSO 500 ctDNA v2 Manual Kit + Velsera Interpretation Report
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Velsera Interpretation Report, for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (24 samples)
20105907
Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC Manual Kit + Velsera Interpretation Report
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Velsera Interpretation Report, for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (24 samples)
20105908
Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC Manual Kit + Velsera Interpretation Report
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit (48 samples)
20039252
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit(DNAライブラリー調製および濃縮試薬を含む)にNovaSeq用試薬は含まれていません。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit plus Velsera Interpretation Report (16 indexes, 48 Samples)
20043410
ライブラリー調製と濃縮試薬、およびデータ解釈レポート(Velsera Clinical Genomics Workspaceソフトウェア使用)が含まれます。NovaSeqシステム用試薬は含まれていません。
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit, for use with NovaSeq 6000 S2 (48 samples)
20101995
TSO500 ctDNAとNovaSeq 6000 S2 Core消耗品のコンビネーションSKU
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit, for use with NovaSeq 6000 S4 (48 samples)
20101998
TSO500 ctDNAとNovaSeq 6000 S4 Core消耗品のコンビネーションSKU
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit for use with NovaSeq 6000 S2 plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 samples)
20102000
Combination SKU for TSO500 ctDNA and the NovaSeq 6000 S2 Core consumables + Velsera report
List Price:
Discounts:
TruSight Oncology 500 ctDNA Kit for use with NovaSeq 6000 S4 plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 samples)
20102001
Combination SKU for TSO500 ctDNA and the NovaSeq 6000 S4 Core consumables + Velsera report
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20034701
UMI DNA Index Anchors(プレート = 20031416、箱 = 20032620) + Nextera対応 Unique Dual Index A(販売キット = 20027213、プレート = 20025019、箱 = 20026121)
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20034702
IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors Set B
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set A for Automation
20066404
96 IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set A for Automationの箱1箱が同梱されており、96サンプルにラベル表示でき、96 IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automationの箱1箱が同梱されています。
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set B for Automation
20063213
イルミナの96 IDT - UMI DNA/RNA UD Indexes Set B for Automationの1箱入りで、イルミナの96 IDT - UMI DNA Index Anchors for Automationのラベルに十分な量です。
List Price:
Discounts:
NovaSeq 6000 S2 Reagent Kit v1.5 (300 cycles)
20028314
NovaSeq 6000システムの300サイクルランをサポートするS2フローセル1個、バッファーカートリッジ1個、クラスターカートリッジ1個、シーケンスカートリッジ1個が含まれます。
List Price:
Discounts:
NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5 (300 cycles)
20028312
NovaSeq 6000システムでの300サイクルランをサポートするS4フローセル1個、バッファーカートリッジ1個、クラスターカートリッジ1個、シーケンスカートリッジ1個が含まれます。
List Price:
Discounts:
Illumina DRAGEN Server v4
20051343
初年度Avance Exchangeサポートが含まれます。年間DRAGENライセンスの購入が必要です。
List Price:
Discounts:
ICA Basic Annual Subscription
20044874
Illumina Connected Analytics (ICA) Basic Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、パッケージ化されたツールへのアクセスなど、TSO500をご使用のお客様を対象としたICAへの一年間のアクセスが含まれています。
ICA Professional Annual Subscription
20044876
Illumina Connected Analytics (ICA) Professional Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、パッケージ化されたツールへのアクセス、およびツール、パイプライン、データウェアハウス、ノートブックで構成されるカスタマイズされたワークフローの作成機能を含むICAへの一年間のアクセスが含まれます。
ICA Enterprise Annual Subscription
20038994
Illumina Connected Analytics (ICA) Enterprise Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、カスタムおよびパッケージ化された解析ツール、データ保管およびマイニング用のベースモジュールなどを含むICA Enterpriseへの一年間のアクセスが含まれます。ICA Enterpriseには、オプションとしてHIPPAA BAA(米国のみ)、シングルサインオン(SSO)、およびサービスレベル契約(SLA)も含まれます。
ICA Enterprise Service and Compliance Add-on (applies to Basic only)
20066830
Illumina Connected Analytics (ICA) Enterprise Service and Compliance Add-on。本製品は、ICA Basic Annual Subscriptionを対象とした一年間のサービスで、HIPPAA BAA(米国のみ)、シングルサインオン(SSO)、およびサービスレベル契約(SLA)が含まれます。
Illumina Analytics - 1 iCredit
20042038
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics Starter Pack - 1,000 iCredits
20042039
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 5,000 iCredits
20042040
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 50,000 iCredits
20042041
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 100,000 iCredits
20042042
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Connected Insights-Annual Subscription
20090137
Illumina Connected Insights‒Oncology Genome Equivalent Sample-VCF
20090138
Illumina Connected Insights‒Oncology Genome Equivalent Sample-VCF
20090138
Illumina Connected Insights‒Training and Onboarding
20092376
Informatics Professional Services
20071787
No Products!
Informatics Professional Services
20071787
Illumina Connected Insights‒Training and Onboarding
20092376
表示されている結果 : /
製品名
数量
Unit Price
製品名
カタログ番号
量
単価
TruSight Oncology 500 ctDNA v2は超高感度かつ合理的な固形腫瘍用リキッドバイオプシーアッセイで、4日以内に血漿サンプルからのCGPを可能にします。TruSight Oncology 500 ctDNA v2は、従来のTruSight Oncology 500 ctDNAアッセイと比較して、低いcfDNAインプットを使用するだけでなく、より短いターンアラウンドタイム、より合理化されたワークフローにより、感度を向上させます。TruSight Oncology 500およびTruSight Oncology 500 High-Throughputは、組織サンプルからのCGPを可能にします。その他の違いについては、TruSight Oncologyアッセイの比較表を参照してください。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2解析ワークフローでは、DRAGEN v4またはv3サーバーまたはIllumina Connected Analyticsプラットフォームで実行される装置外のソフトウェアを使用して、高レベルのサンプルメトリクス、検出されたバリアント、TMBおよびMSIスコアなどのサンプル結果を出力します。三次解析は、Illumina Connected InsightsまたはVelsera CGWのいずれかで実行できます。
BaseSpace Sequence Hub評価アプリは、評価にのみ使用できます。イルミナは、このアプリのテクニカルサポートを提供する義務を負いません。アクセスは30日間に制限されています。
互換性のある解析ソフトウェア製品の詳細はこちらをご覧ください。
DRAGENサーバー上での解析には、24ライブラリーのS4ランで約20~24時間、8ライブラリーのS2ランで約9~12時間かかります。
はい、ご自身のソフトウェアで解析できます。ただし、その場合は、イルミナからテクニカルサポートを直接提供することはできません。
>90%の感度と>95%の特異性で、SNVに対して約0.2%のVAF検出を達成するには、約20 ngのcfDNAインプットが推奨されます。ただし、アッセイが受容可能なcfDNAのインプット範囲は10~30 ngです。
当社の製品およびサービスに関する情報、または当社のテクノロジーに関するご質問がございましたら、ぜひお問い合わせください。
ご提供いただいた個人情報は、お客様へのサポート、サービス、および販売活動の目的にのみ使用させていただきます。