セルフリーDNA（cfDNA）から、523のがん関連遺伝子の複数のバリアントタイプを同定するNGSベースのアッセイ。高深度シーケンス、分子バーコード（UMI）、超高速のIllumina DRAGEN Server v4を搭載したNovaSeq 6000システムのパワーを活用し、高い感度と特異度によりcfDNAからの包括的なゲノムプロファイリングを可能にします。

血漿中の包括的なゲノムプロファイリングを実現

1塩基変異（SNV）、Indel、コピー数バリアント（CNV）、DNAフュージョン、TMB、MSIの検出に、TruSight Oncology 500と同じDNAコンテンツを有する

迅速かつ正確なバリアント検出を実現

DRAGENによる迅速かつ高度なバリアントコーリングアルゴリズムを搭載

信頼度の高い結果を取得

ハイブリッドキャプチャーケミストリー、UMIと高深度のカバレージ、高度なエラー補正によりバリアントコーリングを改善し、アーチファクトを低減します。

NovaSeq 6000システムのパワーを活用

血漿中の低頻度バリアント検出に必要なシーケンス深度でcfDNA解析を可能にします

TruSight Oncology 500製品ファミリーについて

TruSight Oncology 500製品ファミリー

この製品ファミリーの3つのアッセイはすべて、ガイドラインや臨床試験において重要なバイオマーカーを同定するために設計されています。

TruSight Oncology 500アッセイ

TruSight Oncology 500アッセイを使用して、FFPE腫瘍組織から主ながんバイオマーカーを同定します。

TruSight Oncology 500 High-Throughputアッセイ

TruSight Oncology 500アッセイと同じバイオマーカーを有し、組織サンプルを用いて、一度に最大192のサンプルをバッチ処理できます。

TruSight Oncology 500 ctDNAアッセイ

TruSight Oncology 500 ctDNAアッセイは、血漿検体から血中循環腫瘍DNAを解析します。

よく一緒に購入される製品

仕様

推奨プロジェクト

装置	推奨サンプル数	リード長
NovaSeq 6000 System	ランあたり24サンプル（S4フローセル）、8億ペアエンドリード、35,000xのカバレッジ	2 × 150 bp
NovaSeq 6000 System	ランあたり8サンプル（S2フローセル）、8億ペアエンドリード、35,000xのカバレッジ	2 × 150 bp

製品比較

	TruSight Oncology 500 ctDNA v2	TruSight Oncology 500	TruSight Oncology 500 High-Throughput
システム互換性	NovaSeq 6000	NextSeq 550Dx（研究（RUO）モード）, NextSeq 500, NextSeq 550	研究モードでのNovaSeq 6000Dx , NovaSeq 6000
テクノロジー	シーケンス	シーケンス	シーケンス
バリアントクラス	コピー数バリアント（CNV）, 挿入・欠失（Indel）	トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, コピー数バリアント（CNV）, 挿入・欠失（Indel）	トランスクリプトバリアント, 遺伝子融合, コピー数バリアント（CNV）, 挿入・欠失（Indel）
核酸タイプ	DNA	RNA, DNA	RNA, DNA
生物種カテゴリー	ヒト	ヒト	ヒト

^*Pierian Clinicalのナレッジベースに基づく（2023年2月現在）。

^*RUOモードのNovaSeq 6000Dxシステムには、二次解析用に別途、スタンドアロンのDRAGENサーバーが必要です。

^*NovaSeq XとNovaSeq 6000 Dxの互換性は2024年にリリース予定です。

ライブラリー調製：

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 Assay

効率的なシーケンス：

データ解析：

バリアントコーリング：

DRAGEN二次解析：DRAGENサーバーを介したオンプレミス

DRAGEN二次解析：Illumina Connected Analytics（ICA）を介したクラウドベース

洞察とレポート作成：

Velsera Clinical Genomics Workspaceソフトウェア

^*Novaseq XとNovaSeq 6000Dx（RUOモード）の互換性は2024年にリリース予定です。

^†国によってはご利用いただけない場合があります。Illumina Connected Insightsは、API経由で第三者の知識ソースにアクセスし、ユーザー定義の三次解析をサポートします。

よくある質問

TruSight Oncology 500 ctDNA v2と他のTruSight Oncologyアッセイとの違いは何ですか？

TruSight Oncology 500 ctDNA v2は超高感度かつ合理的な固形腫瘍用リキッドバイオプシーアッセイで、4日以内に血漿サンプルからのCGPを可能にします。一方、TruSight Oncology 500およびTruSight Oncology 500 High-Throughputは、組織サンプルからのCGPを可能にします。その他の違いについては、TruSight Oncologyアッセイの比較表をご参照ください。

TruSight Oncology 500 ctDNA v2ライブラリーでは、どの解析ソフトウェアを使用できますか？

TruSight Oncology 500 ctDNA v2解析ワークフローでは、DRAGEN v4またはv3サーバーまたはIllumina Connected Analyticsプラットフォームで実行される装置外のソフトウェアを使用して、高レベルのサンプルメトリクス、検出されたバリアント、TMBおよびMSIスコアなどのサンプル結果を出力します。三次解析は、Illumina Connected InsightsまたはVelsera CGWのいずれかで実行できます。

BaseSpace Sequence Hub評価アプリは、評価にのみ使用できます。イルミナは、このアプリのテクニカルサポートを提供する義務を負いません。アクセスは30日間に制限されています。

互換性のある解析ソフトウェア製品の詳細はこちらをご覧ください。