TruSight Oncology 500 ctDNA

マイクロサテライト不安定性(MSI) やTumor Mutational Burden(TMB)を含む、血漿サンプルから複数の体細胞バリアントタイプをターゲットとするアッセイです。Read More...
製品の選択
Library Prep

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit (48 samples)

20039252

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit plus PierianDx Interpretation Report (16 indexes, 48 Samples)

20043410


Reagents

NovaSeq 6000 S2 Reagent Kit v1.5 (300 cycles)

20028314

NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5 (300 cycles)

20028312

NovaSeq XP 4-Lane Kit v1.5

20043131

NovaSeq 6000 S2 Reagent Kit (300 cycles)

20012860

NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit (300 cycles)

20012866

NovaSeq Xp 4-Lane Kit

20021665


Software Options

Illumina DRAGEN Server v3

20040619


Services

TruSight Oncology 500 ctDNA training

20045347

アクセサリー製品

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software, Level 1, 1 Year License

20042100

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software, Level 2, 1 Year License

20042101

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software, Level 3, 1 Year License

20042102

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software, Level 4, 1 Year License

20042103

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software, Level 5, 1 Year License

20042104

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software, Level 6, 1 Year License

20042105

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software, Level 7, 1 Year License

20042106

DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA Analysis Software, Level 8, 1 Year License

20042107

製品のハイライト

TruSight Oncology ctDNA は血漿サンプルから施設内での包括的ゲノムプロファイリングを可能にするがん種横断的なNGSアッセイです。

この幅広いパネルは、重要な免疫腫瘍学(IO)バイオマーカーを含む、組織検体から解析するTruSight Oncology 500とTruSight Oncology 500 High-ThroughputのDNAパネルと同じコンテンツで設計され、組織検体が使用できない場合、または組織検体の結果を補完するものとして使用されます。

血漿からの包括的ゲノムプロファイリングが可能

  • 主要なガイドラインや臨床試験に準じたがん種横断的包括的ゲノムプロファイリングアッセイ
  • TruSight Oncology 500アッセイ同様、523遺伝子を含む
  • SNVs, Indels, CNVs, 融合遺伝子および免疫腫瘍学バイオマーカーを解析

統合されたワークフローによる施設内での包括的ゲノムプロファイリングの実施

  • 合理化されたcfDNAからバリアントコール結果までの5日間ワークフロー
  • Dragenサーバーと解析ソフトウェアによる高速バリアントコールアルゴリズムの実現
  • Pierian DxのClinical Genomics Workspaceによる結果解釈レポートの提供が可能

信頼できる結果の提供

  • ハイブリッドキャプチャーケミストリー、分子バーコード(UMI) と精巧なエラー修正機能提供により信頼性の高い結果を得る
  • 分子バーコード(UMI)採用で高感度のバリアント検出を実現
  • NovaSeq 6000でディープシーケンスを実現し、 v1.5 試薬使用でシーケンスコストを削減

免疫腫瘍学への洞察を含むリキッドバイオプシーからの価値提供

  • 血中の頻度の低い変異検出に必要な感度と特異性を得る
  • 組織サンプルの入手に頼らず、リキッドバイオプシーによる包括的ゲノムプロファイリングの実現
  • TMBやMSIなどの免疫腫瘍学バイオマーカー報告に最適な1.94Mbのパネルサイズ
TruSight Oncology 500製品ポートフォリオの詳細はこちら

TruSight Oncology 500製品ファミリー

このファミリーに含まれる3つのアッセイはすべて、主要ガイドラインや臨床試験に含まれる重要なバイオマーカーを検出するように設計されています。

TruSight Oncology 500アッセイ

FFPE検体から関連がんバイオマーカーを解析できます。

TruSight Oncology 500 High-Throughputアッセイ

TruSight Oncology 500アッセイ同様、組織検体から同じバイオマーカーを検出し、一回192サンプルまで解析できます。

TruSight Oncology 500 ctDNA アッセイ

血漿検体から血中ctDNAを対象に、TruSight Oncology 500アッセイのDNAパネルと同じ遺伝子を解析します。

Frequently Purchased Together

仕様

推奨プロジェクト

装置 推奨サンプル数 リード長
NovaSeq 6000 System 24 samples per run (S4 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage 2 × 150 bp
NovaSeq 6000 System 8 samples per run (S2 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage 2 × 150 bp

製品比較

TruSight Oncology 500 ctDNA TruSight Oncology 500 TruSight Oncology 500 High-Throughput
Cancer Type Pan-Cancer Pan-Cancer Pan-Cancer
Content Specifications Targeted selection of 523 genes (full coding sequence) for a total of 1.94Mb panel size.
• Guideline Coverage: Broad coverage of key guidelines for multiple solid tumor types
• Immuno-oncology Biomarker Coverage: TMB and MSI*
Targeted selection of DNA from 523 genes of interest, and RNA from 55 genes, for a total of 1.94Mb panel size.
• Guideline Coverage: Broad coverage of key guidelines for multiple solid tumor types
• Clinical Trials Coverage: Over 1,000 clinical trials
• Immuno-oncology Biomarker Coverage: Biomarkers TMB and MSI included; also inclusive of HLA regions, POLE1 and POLD1*.
Targeted selection of DNA from 523 genes of interest, and RNA from 55 genes, for a total of 1.94Mb panel size.
• Guideline Coverage: Broad coverage of key guidelines for multiple solid tumor types
• Clinical Trials Coverage: Over 1,000 clinical trials
• Immuno-oncology Biomarker Coverage: Biomarkers TMB and MSI included; also inclusive of HLA regions, POLE1 and POLD1*.
Hands-On Time ~10.5 hours Manual: ~10.5 hrs
Automated: ~2.5 hrs
~10.5 hours
Input Quantity 30 ng cfDNA (8-10 ml of plasma) 40 ng DNA, 40 ng RNA 40 ng DNA, 40-80 ng RNA (need at least 2 mm3 FFPE tissue)
Method Target Enrichment , Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing Target Enrichment , Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing , Targeted RNA Sequencing Target Enrichment , Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing , Targeted RNA Sequencing
Nucleic Acid Type DNA DNA, RNA DNA, RNA
Specialized Sample Types Blood, Cell-Free DNA, Circulating Tumor DNA FFPE Tissue FFPE Tissue
Species Category Human Human Human
System Compatibility NovaSeq 6000 NextSeq 500 , NextSeq 550 , NextSeq 550Dx in Research Mode NovaSeq 6000
Technology Sequencing Sequencing Sequencing
Variant Class Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Somatic Variants Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Transcript Variants Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Transcript Variants
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Supporting Data and Figures

 

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