Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx
Infinium Global Diversity Array (GDA) with Enhanced PGxは、ファーマコゲノミクス研究のための市場で最も包括的なジェノタイピングマイクロアレイです。
DRAGEN Array は、Infiniumマイクロアレイのための正確で包括的かつ効率的な二次解析を提供します。
DRAGEN(Dynamic Read Analysis for GENomics)Array二次解析は、Infiniumアレイベースのアッセイのための強力なバイオインフォマティクスソフトウェアです。DRAGEN Arrayは、最先端のデータ解析ツールを使用して、ゲノムに関する洞察を最大化して研究ニーズに応えるために、正確かつ包括的で非常に効率的な二次解析を提供します。
ジェノタイピング、ファーマコゲノミクス(PGx)解析、メチル化QCなど、複数のアプリケーションに対応する高品質で迅速な結果。
DRAGEN Arrayは、包括的なInfiniumマイクロアレイソリューションの一部です。専門的に設計されたコンテンツを備えたカスタム、セミカスタム、またはすぐに使えるマイクロアレイから選んで、迅速なDNAからデータへのワークフローでデータを処理、スキャン、解析します。
DRAGEN Arrayは、ローカルのコマンドラインパッケージ(特殊なフィールドプログラマブルゲートアレイ(FPGA)サーバーやハードウェアは不要です)と、直感的なグラフィカルユーザーインターフェース(GUI)を備えたクラウドベースのパッケージを提供します。
DRAGEN Arrayは、ローカルのコマンドラインパッケージ(特殊なフィールドプログラマブルゲートアレイ(FPGA)サーバーやハードウェアは不要です)と、直感的なグラフィカルユーザーインターフェース(GUI)を備えたクラウドベースのパッケージを提供します。
システム | iScan |
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手法 | Methylation array, High-throughput genotyping array, Genome-wide genotyping array, Targeted genotyping array |
Nucleic acid type | DNA |
Software format | Cloud, On-premises |
Species category | ヒト |
テクノロジー | Microarray |
バリアントクラス | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
DRAGEN Array は、Infiniumマイクロアレイのための正確で包括的かつ効率的な二次解析を提供します。
説明 | 検出されたバリアントタイプ | ローカル解析 | クラウド解析 | |
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ジェノタイピング | ヒトのInfiniumジェノタイピングアレイ1に99.5%を超えるジェノタイピング精度を提供します。 | SNV Indel |
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PGx – CNVコール | 95%を超えるPGx CNV精度を提供します2。9つのターゲット領域にわたる6つのターゲット遺伝子のPGx CNVカバレッジ。 | SNV Indel コピー数バリアント(CNV) |
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PGx – 星型アリルアノテーション | 1700以上のターゲットで50以上の遺伝子のPGxスターアリルとバリアントカバレッジを提供します。コールレートが98%を超える、CYP2D6がほとんど見られないなど、識別が困難なPGx遺伝子を評価します3。 | SNV Indel コピー数バリアント(CNV) 星アレルのディプロタイプ |
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メチル化QC | ハイスループットで定量的なメチル化品質管理を提供します。 | メチル化メトリクス | チェックマーク
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詳細については、https://help.dragenarray.illumina.com/overview/our-featuresをご覧ください。
DRAGEN Array
Pharmacogenomics, the study of how variations in the human genome affect our response to medications, may help reduce adverse drug reactions and medical costs.
ポリジェニックリスクスコアは、ある個人が持つ、特定疾患の発症リスクを高めるすべての遺伝子バリアントの数を表しています。
メチル化アレイにより、1塩基の解像度でゲノム全体のメチル化部位をハイスループットで定量化できるようになります。
DRAGEN Arrayクラウド解析、ステップ1:
「ラン – マイクロアレイ解析のセットアップ」に移動して解析を開始します
DRAGEN Arrayクラウド解析、ステップ2:
解析構成を設定します。
DRAGEN Arrayクラウド解析、ステップ3:
サンプルシートのインポート、BeadChipの選択、またはIDATファイルのインポートで解析するサンプルを選択します
DRAGEN Arrayクラウド解析、ステップ4:
結果を見る。
効率的な解析
ジェノタイピング、PGx CNVコーリング、スターアリルアノテーションを1つのプラットフォームで実現し、複数の出力オプションを生成します。
スターアリルアノテーション
ダウンストリーム処理で使用するスターアリルアノテーションJSONファイルの例。試験されたサポートバリアント、欠損バリアント、およびアリルを提供します。
閾値調整可能なメチル化QC
21のコントロールメトリクスが出力の品質 を評価します。調整 可能な合否閾値は、 スキャナーの違い、 サンプルタイプの違い、または 研究デザインの設定に対応します。
DRAGEN Array Local – star allele annotation
20109885
解析費用はサンプルごとに計算されます。
List Price:
Discounts:
DRAGEN Array Cloud – star allele annotation
20109886
解析費用はサンプルごとに計算されます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 1 iCredit
20042038
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics Starter Pack - 1,000 iCredits
20042039
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 5,000 iCredits
20042040
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 50,000 iCredits
20042041
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 100,000 iCredits
20042042
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
ICA Basic Annual Subscription
20044874
Illumina Connected Analytics (ICA) Basic Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、パッケージ化されたツールへのアクセスなど、TSO500をご使用のお客様を対象としたICAへの一年間のアクセスが含まれています。
ICA Professional Annual Subscription
20044876
Illumina Connected Analytics (ICA) Professional Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、パッケージ化されたツールへのアクセス、およびツール、パイプライン、データウェアハウス、ノートブックで構成されるカスタマイズされたワークフローの作成機能を含むICAへの一年間のアクセスが含まれます。
ICA Enterprise Annual Subscription
20038994
Illumina Connected Analytics (ICA) Enterprise Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、カスタムおよびパッケージ化された解析ツール、データ保管およびマイニング用のベースモジュールなどを含むICA Enterpriseへの一年間のアクセスが含まれます。ICA Enterpriseには、オプションとしてHIPPAA BAA(米国のみ)、シングルサインオン(SSO)、およびサービスレベル契約(SLA)も含まれます。
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製品名
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参考文献
1,2,3 - イルミナ社内データ、2023年。続きを読む
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