DRAGEN Array

DRAGEN Arrayは、Infiniumマイクロアレイ用の正確で包括的かつ効率的なジェノタイピング、PGx CNVコーリング、および星型アリルアノテーションを提供します。

概要

DRAGEN(Dynamic Read Analysis for GENomics)Array二次解析は、Infiniumアレイベースのアッセイのための強力なバイオインフォマティクスソフトウェアです。DRAGEN Arrayは、最先端のデータ解析ツールを使用して、ゲノムに関する洞察を最大化して研究ニーズに応えるために、正確かつ包括的で非常に効率的な二次解析を提供します。

正確な結果

99.5%を超えるジェノタイピング精度と95%のPGx CNV精度1。さらに、いくつかの簡単なコマンドで、CYP2D6のような識別困難なファーマコゲノミクス(PGx)遺伝子を、98%を超えるコールレートで正確に同定します。2

包括的なカバレッジ

9つのターゲット領域にわたる6つのターゲット遺伝子のPGx CNVカバレッジ。50を超える遺伝子の1,700を超えるターゲットにわたるPGxスターアリルとバリアントカバレッジ – ハイブリッドおよびアリル固有のコピー数を検出します。

効率的な解析

ジェノタイピング、PGx CNVコーリング、スターアリルコーリングを1つのプラットフォームで実現。サンプルあたりわずか35秒でバリアントコールフォーマット(VCF)ファイルをジェノタイピングし3、大規模な実験の時間を節約します。

クラウドとローカルの展開

DRAGEN Arrayは、ローカルのコマンドラインパッケージ(特殊なフィールドプログラマブルゲートアレイ(FPGA)サーバーやハードウェアは不要です)と、直感的なグラフィカルユーザーインターフェース(GUI)を備えたクラウドベースのパッケージを提供します。


仕様


ソフトウェアアップデート

DRAGEN Array v1.0の機能:

  • あらゆるヒトInfiniumマイクロアレイからの一塩基バリアント(SNV)ジェノタイピング解析

  • ファーマコゲノミクス(PGx)解析パイプライン

  • Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx BeadChipsのPGxコピー数バリアント(CNV)コール、星型アリルコール、およびメタボライザーステータス

  • 詳細については、 リリースノート と機能の全リストを参照してください。

アプリケーション

ワークフローの例

2
処理とスキャン
3
追跡、分析、およびレポート

関連するアプリケーションとメソッド

ドキュメント

製品資料

効率的な解析

ジェノタイピング、PGx CNVコーリング、スターアリルアノテーションを1つのプラットフォームで実現し、複数の出力オプションを生成します。

DRAGEN Arrayクラウド解析、ステップ1

'Runs – Microarray Analysis Setup'に移動して、解析を開始します。

DRAGEN Array Cloud Analysis、ステップ2

解析構成を設定します。

DRAGEN Arrayクラウド解析、ステップ3

サンプルシートのインポート、BeadChipsの選択、またはIDATファイルのインポートで解析するサンプルを選択します。

DRAGEN Arrayクラウド解析、ステップ4

結果を見る。

スターアリルアノテーション

下流処理で使用される星アリルアノテーションJSONファイルの例。試験されたサポートバリアント、欠損バリアント、およびアリルを提供します。

ソフトウェアオプション (2)

DRAGEN Array Local – star allele annotation

20109885

解析費用はサンプルごとに計算されます。

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DRAGEN Array Cloud – star allele annotation

20109886

解析費用はサンプルごとに計算されます。

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データ解析および保存 (8)

Illumina Analytics - 1 iCredit

20042038

iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。

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Illumina Analytics  Starter Pack - 1,000 iCredits

20042039

iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。

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Illumina Analytics  - 5,000 iCredits

20042040

iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。

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Illumina Analytics  - 50,000 iCredits

20042041

iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。

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Illumina Analytics - 100,000 iCredits

20042042

iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。

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ICA Basic Annual Subscription

20044874

Illumina Connected Analytics (ICA) Basic Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、パッケージ化されたツールへのアクセスなど、TSO500をご使用のお客様を対象としたICAへの一年間のアクセスが含まれています。

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ICA Professional Annual Subscription

20044876

Illumina Connected Analytics (ICA) Professional Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、パッケージ化されたツールへのアクセス、およびツール、パイプライン、データウェアハウス、ノートブックで構成されるカスタマイズされたワークフローの作成機能を含むICAへの一年間のアクセスが含まれます。

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ICA Enterprise Annual Subscription

20038994

Illumina Connected Analytics (ICA) Enterprise Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、カスタムおよびパッケージ化された解析ツール、データ保管およびマイニング用のベースモジュールなどを含むICA Enterpriseへの一年間のアクセスが含まれます。ICA Enterpriseには、オプションとしてHIPPAA BAA(米国のみ)、シングルサインオン(SSO)、およびサービスレベル契約(SLA)も含まれます。

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選択中の製品一覧

製品名

数量

Unit Price

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。

参考文献

1,2,3 - イルミナ社内データ、2023年。

製品情報のリクエスト

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