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このマイクロアレイは、ハイスループットなファーマコゲノミクス（PGx）研究および大規模ジェノタイピング研究向けに設計されています。24サンプルサイズ対応の仕様により、バリアントカバレッジとスケーラビリティの優れたバランスを実現するとともに、以下の特長を備えています。
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24 v1.0 Kit
高速かつスケーラビリティの高い自動ワークフローを備えたこのマイクロアレイは、ゲノムワイドなファーマコゲノミクス（PGx）マーカーの包括的なカバレッジを提供します。
1週間に5,760サンプル
サンプルスループット
24サンプル （１アレイあたり）
サンプル数
1,185,155 マーカー、カスタムアドオン容量10,000
マーカー数
概要
グローバルコンテンツ
疾患との関連性が確立されたバリアント、関連するPGxマーカー、およびClinVar、NHGRI、PharmGKB、ExACデータベースから収集されたキュレーション済みのエクソン領域のコンテンツを含むゲノムワイドカバレッジを提供します。
スケーラブルなスループット
Infinium EXフォーマットは、Infinium Amplification SystemおよびInfinium Automated Pipetting System with ILASSと互換性があり、スケーラブルな2.5日間のワークフローを実現します。
直感的な解析
DRAGEN Array二次解析により、正確で包括的かつ効率的なCNVコーリングおよびスターアリルアノテーションを実現します。
仕様
| アッセイの種類 | Infinium EX |
|---|---|
| 自動化機能 | 自動液体分注システム |
| インプット量 | 200 ng |
| システム | iScan |
| 手法 | ハイスループットジェノタイピングアレイ, ゲノムワイドジェノタイピングアレイ |
| 核酸の種類 | DNA |
| マーカー数 | 1,185,155 マーカー、カスタムアドオン容量10,000 |
| サンプル数 | 24サンプル （１アレイあたり） |
| サンプルスループット | 1週間に5,760サンプル |
| 対応サンプルタイプ | 血液 |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| テクノロジー | マイクロアレイ |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 構造バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） |
必要な製品
各IInfinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24 Kitの主な違いは、提供された試薬でサポートされるサンプル数です。アレイにカスタムコンテンツが必要な場合、“+” の指定があるキットから選択します。
iScanシステム、Infinium Automated Pipetting System with ILASS、Infinium EX/XT Starter Kit 220VまたはInfinium EX/XT Starter Kit 110Vが必要です。
Infinium Amplification Systemはオプションですが、ワークフローの増幅前ステップの自動化を可能にするために追加できます。
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件
アプリケーション
ゲノムワイドなファーマコゲノミクスマーカーのための強力なアレイ。このツールは、多様で少数の集団を対象とした臨床研究および分子血液型研究もサポートします。
ワークフローの例
ライブラリー調製
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx
DesignStudioは、研究者がカスタムジェノタイピングのマイクロアレイプローブやカスタムシーケンシングアッセイを設計・注文するためのウェブベースのアッセイ設計ツールです。
プロセス
iScanマイクロアレイスキャナーは、ハイスループットのBeadChip処理をサポートし、数百から数千に及ぶサンプルを迅速かつ正確にスキャンします。
Automation options with robot control software for Infinium assays streamline sample preparation workflows and reduce errors.
Automation options with robot control software for Infinium assays streamline sample preparation workflows and reduce errors.
解析
DRAGEN Array は、Infiniumマイクロアレイのための正確で包括的かつ効率的な二次解析を提供します。
関連するアプリケーションと手法
ヒトゲノムの変異が薬剤応答性にどのように影響するのかを理解する
Pharmacogenomics, the study of how variations in the human genome affect our response to medications, may help reduce adverse drug reactions and medical costs.
比較する
| Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24 v1.0 Kit | Infinium Global Clinical Research Array-24 v1.0 Kit | Infinium Global Screening Array with Enhanced PGx-48 v4.0 Kit | Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx | |
|---|---|---|---|---|
| アッセイの種類 | Infinium EX | Infinium EX | Infinium EX | Infinium LCG |
| 自動化機能 | 自動液体分注システム | 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム | 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム | 自動化アレイローダー, 自動液体分注システム |
| インプット量 | 200 ng | 100 ng | 200 ng | 200 ng DNA |
| システム | iScan | iScan | iScan | iScan |
| 手法 | ハイスループットジェノタイピングアレイ, ゲノムワイドジェノタイピングアレイ | ハイスループットジェノタイピングアレイ, ゲノムワイドジェノタイピングアレイ | ゲノムワイドジェノタイピングアレイ | |
| 核酸の種類 | DNA | DNA | DNA | DNA |
| マーカー数 | 1,185,155 マーカー、カスタムアドオン容量10,000 | 固定マーカー：1,157,992, カスタムマーカーアドオン容量：最大50,000 | 656,275マーカー 内、カスタムアドオン容量10,000 | 合計1,933,117マーカー、カスタムアドオン容量175,000 |
| サンプル数 | 24サンプル （１アレイあたり） | 24サンプル （１アレイあたり） | アレイあたり48サンプル | アレイあたり8サンプル |
| サンプルスループット | 1週間に5,760サンプル | 1週間に約5,760サンプル | 1週間に11,520サンプル | 1週間に約1,728サンプル |
| 対応サンプルタイプ | 血液 | 血液 | 血液 | 血液 |
| 生物種カテゴリー | ヒト | ヒト | ヒト | ヒト |
| テクノロジー | マイクロアレイ | マイクロアレイ | マイクロアレイ | マイクロアレイ |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
図
幅広いファーマコゲノミクスマーカー
臨床研究コンテンツは、CPICガイドラインおよびPharmGKBデータベースに基づいて選定された、幅広いファーマコゲノミクスマーカーリストを用いて開発。1,2本コンテンツには、PharmGKBで注釈付けされたバリアント、ゲノムワイドPGxカバレッジ、拡張ADME遺伝子、3CPICレベルAの遺伝子、およびターゲットインピュテーションタグSNPが含まれます。
多様な人々を対象とした疾患研究コンテンツ
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24 v1.0には、NHGRI GWASデータベースカテゴリーに基づく表現型および疾患分類の広範なカバレッジが含まれています。
ClinVarおよびACMGアノテーションによるバリアント病理分類の分布。
バリアントは、病原性および非病原性に関するさまざまなエビデンスをカバーしています。
臨床研究コンテンツ
主要なデータベースから専門家によって選択された臨床研究コンテンツは、幅広いアプリケーションに対応します。
カテゴリー別のQCコンテンツ
Infinium Global Clinical Research Array with enhanced PGx-24 v1.0には、性判定、大陸系統解析、ヒト連鎖解析など、さまざまなサンプルトラッキング機能を実現する約9,000のマーカーが搭載されています。
- カウントには、複数のQCカテゴリーに属するいくつかのマーカーが含まれます。
参考文献
- Whirl-Carrillo M, Huddart R, Gong L, et al. An Evidence-Based Framework for Evaluating Pharmacogenomics Knowledge for Personalized Medicine. Clin Pharmacol Ther. 2021;110(3):563572. doi:10.1002/cpt.2350
- Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC). cpicpgx.org. 2024年9月13日にアクセス。
- Gaedigk A, Casey ST, Whirl-Carrillo M, Miller NA, Klein TE. Pharmacogene Variation Consortium: A Global Resource and Repository for Pharmacogene Variation. Clin Pharmacol Ther. 2021;110(3):542-545. doi:10.1002/cpt.2321.
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24 v1.0 Kit (24 samples)
20065216
24サンプルのBeadChipと、24のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が1つ含まれています。インプットには200 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。
List Price:
Discounts:
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24 v1.0 Kit (96 samples)
20068339
4つの24サンプルBeadChipと、96のDNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の試薬が含まれます。インプットには200 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。
List Price:
Discounts:
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24 v1.0 Kit (1152 samples)
20068340
1152 DNAサンプルの増幅、断片化、ハイブリダイズ、ラベリング、検出用の48、24サンプルBeadChipおよび試薬が含まれます。インプットには200 ngのDNAが必要です。各キットは1つのバッチとして処理されます。
List Price:
Discounts:
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24+ v1.0 Kit (24 samples)
20068354
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24+ v1.0 Kit (24 samples)
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24+ v1.0 Kit (96 samples)
20068355
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24+ v1.0 Kit (96 samples)
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24+ v1.0 Kit (1152 samples)
20068356
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24+ v1.0 Kit (1152 samples)
ソフトウェアオプション (2)
DRAGEN Array Local – star allele annotation
20109885
解析費用はサンプルごとに計算されます。
List Price:
Discounts:
DRAGEN Array Cloud – star allele annotation
20109886
解析費用はサンプルごとに計算されます。
List Price:
Discounts:
データ解析および保存 (8)
Illumina Analytics - 1 iCredit
20042038
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics Starter Pack - 1,000 iCredits
20042039
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 5,000 iCredits
20042040
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 50,000 iCredits
20042041
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
Illumina Analytics - 100,000 iCredits
20042042
iCreditは、BaseSpace Sequence HubまたはIllumina Connected Analyticsのデータ保存や解析に使われます。
List Price:
Discounts:
ICA Basic Annual Subscription
20044874
Illumina Connected Analytics (ICA) Basic Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、パッケージ化されたツールへのアクセスなど、TSO500をご使用のお客様を対象としたICAへの一年間のアクセスが含まれています。
ICA Professional Annual Subscription
20044876
Illumina Connected Analytics (ICA) Professional Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、パッケージ化されたツールへのアクセス、およびツール、パイプライン、データウェアハウス、ノートブックで構成されるカスタマイズされたワークフローの作成機能を含むICAへの一年間のアクセスが含まれます。
ICA Enterprise Annual Subscription
20038994
Illumina Connected Analytics (ICA) Enterprise Annual Subscription。本製品には、シーケンス装置との接続、データ管理機能、カスタムおよびパッケージ化された解析ツール、データ保管およびマイニング用のベースモジュールなどを含むICA Enterpriseへの一年間のアクセスが含まれます。ICA Enterpriseには、オプションとしてHIPPAA BAA（米国のみ）、シングルサインオン（SSO）、およびサービスレベル契約（SLA）も含まれます。
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よくある質問（FAQ）
- Infinium EXでは、全ゲノム増幅ステップが3時間で完了し、従来のワークフロー（24時間）より大幅に短縮されています
- 偽遺伝子の識別を目的としたターゲット遺伝子増幅（TGA）ステップが追加されています
- キットには、ホルムアミドフリーで環境・健康・安全（EH&S）対応の最新試薬が含まれています
- ILASSにより、UI（ユーザーインターフェース）が改善され、よりスムーズなサポートを受けられるようになっています
Infinium Automated Pipetting System with ILASS（IAPS with ILASS）：
増幅後のステップに必要。
Infinium Amplification System（IAS）：
プレPCRのステップ（全ゲノム増幅およびターゲット遺伝子増幅）にオプションとして使用できます。
これらの自動化装置には以下の特長があります。
- ハイスループット機能：IASは25分で4枚のプレートを処理でき、IAPS with ILASSは25分で1枚のプレートを処理できます
- 効率性：8チップおよび96チップのヘッドに対応（使い捨てチップはお客様にご用意いただきます）
- 自動化ソフトウェア：ILASSは、ホステッドClarity LIMSソフトウェアとすぐに統合できます
Infinium Global Clinical Research Array with Enhanced PGx-24は、PGxおよびゲノムワイドコンテンツ、スループット、ならびに多様な集団に対するカバレッジの最適なバランスを実現します。Infinium Global Screening Array with Enhanced PGx-48 v4.0と比較すると、本アレイには疾患リスクおよび臨床研究に関連するバリアントが追加されています。また、その他のベンダーのスクリーニングアレイソリューションと比較して、マイナーアリル頻度でも優れたインピュテーションカバレッジを実現しています。
Infinium Global Clinical Research Arrayと比較すると、Enhanced PGxコンテンツが追加されており、PharmGKB、PharmVar、CPIC、ClinVarといった著名なPGxデータベースに基づくCPIC優先レベルAおよびBの遺伝子とバリアントを100%カバーしています。
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件
Infinium自動化オプションパッケージ
Infiniumアッセイ用のロボット制御ソフトウェアによる自動化オプションは、サンプル調製ワークフローを合理化し、エラーを削減します。
AutoLoader 2.x
この装置は、BeadChipマイクロアレイキャリアをスキャンシステムに自動ロードします。
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx
Infinium Global Diversity Array (GDA) with Enhanced PGxは、ファーマコゲノミクス研究のための市場で最も包括的なジェノタイピングマイクロアレイです。
Infinium Global Screening Array with Enhanced PGx-48 v4.0 Kit
このマイクロアレイは、ファーマコゲノミクス（PGx）研究および大規模ジェノタイピング研究のための費用対効果の高いハイスループットツールです。
Infinium Global Clinical Research Array-24 v1.0 Kit
Global Clinical Research Arrayは、拡張性に優れたワークフローで、ゲノムワイドの主要なクリニカルコンテンツに卓越したカバレッジを提供します。
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