低インプットサンプルをサポートする、高速で柔軟性があり、スケーラブルなヒト全エクソームシーケンスソリューション。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、FFPE（ホルマリン固定パラフィン包埋）サンプルから低頻度バリアントを検出するための腫瘍-ノーマルワークフローを提供する、高感度で包括的な全エクソームシーケンスソリューションです。
このワークフローには、エラー補正と偽陽性の減少のための固有の分子識別子（UMI）が含まれており、低頻度変異の正確な検出を可能にします。
Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、1塩基変異（SNV）、Indel、コピー数バリアント（CNV）などの低頻度バリアントを検出します。このキットは、わずか40ngのFFPE DNAから、90%を超えるバリアントコール率で、わずか5%の低アレル頻度の小さなバリアントを同定します。Twist Biosciences for Illumina Exome 2.5 Panelのコンテンツには、腫瘍変異負荷（TMB）、マイクロサテライト不安定性（MSI）、相同組換え修復欠損（HRD）のバイオマーカーが含まれます。
このキットは、腫瘍およびマッチングしたノーマルサンプルのFFPE DNAから始まる統合ワークフローに属します。イルミナのシーケンシング後、DRAGEN Somaticアプリを使用して、高精度のバリアントコールを取得します。
Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、わずか約4時間のハンズオンタイムにより、約10時間でシーケンス対応ライブラリーを調製するための高速なハイブリッドキャプチャーのワークフローを提供します。研究者は、FFPE DNAの抽出からシーケンシングまで1日で完了できます。推奨リード長は2 × 151 bpです。
このキットは、重点的かつ包括的な、最新のパネルを使用してエクソームを徹底的にカバーできるようにすることで、シーケンス結果を最大化します。
Illumina custom v2プローブは、最大10,000のプローブの標準添加パネルを使用して、ミトコンドリア ゲノムカバレッジまたは関心領域を簡単に追加できます。
Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、Illumina Cell-Free DNA with Enrichmentと同じライブラリー調製および濃縮ケミストリーを特長としており、FFPEサンプルで卓越したパフォーマンスを実現します。
| アッセイ時間 | ～10時間 |
|---|---|
| がんの種類 | 固形腫瘍 |
| 説明 | 正確かつ包括的な全エクソームシーケンスを実行してFFPEサンプルから低頻度変異を確実に検出するための腫瘍-正常細胞濃縮ワークフローによる、迅速で使いやすいライブラリー調製。 |
| ハンズオンタイム | 約4時間 |
| インプット量 | FFPE DNA 40 ng |
| システム | NextSeq 2000 System, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 手法 | エクソームシーケンス |
| 核酸の種類 | DNA |
| 対応サンプルタイプ | 少量インプットサンプル, FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 体細胞バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） |
Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、FFPE DNAなどの低インプットサンプルをサポートする、サンプルから洞察までの合理化された包括的な全エクソームシーケンスソリューションです。
| Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | TruSight Oncology 500 v2 | Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment | ||
|---|---|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | ～10時間 | 6.5時間 | サンプルインプットから最終結果まで3～4日 | 約8.5～9.5時間 | |
| がんの種類 | 固形腫瘍 | 汎がん (Pan-cancer), 固形腫瘍 | |||
| 説明 | 正確かつ包括的な全エクソームシーケンスを実行してFFPEサンプルから低頻度変異を確実に検出するための腫瘍-正常細胞濃縮ワークフローによる、迅速で使いやすいライブラリー調製。 | 費用対効果と信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスのための最新のエクソームコンテンツの集中エンリッチメントプローブパネルを備えた、エンリッチメントワークフローによる高速で使いやすいライブラリー調製。 | FFPE組織のDNAとRNAを使用して、固形腫瘍の包括的なゲノムプロファイリングを可能にします。1つのサンプルからバリアント検出とバイオマーカー評価を行い、幅広い腫瘍特性を解析します。 | 高精度変異検出のための迅速で柔軟、かつスケーラブルなcfDNAライブラリー調製キット | |
| ハンズオンタイム | 約4時間 | 約2時間 |
~3.25 hrs for automated workflow ~5-7 hrs for manual workflow |
約2.5〜3時間 | |
| インプット量 | FFPE DNA 40 ng | 50～1,000 ngの高品質ゲノムDNA（直接血液および唾液については、リファレンスガイドを参照） | 30 ng DNA (as low as 10 ng), 40 ng RNA (as low as 20 ng) | 10～30 ng cfDNA | |
| システム | NextSeq 2000 System, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq 6000 System | |
| 手法 | エクソームシーケンス | ターゲットDNAシーケンス, エクソームシーケンス, ターゲット濃縮 | ターゲットDNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 | カスタムシーケンス, ターゲットDNAシーケンス, ターゲット濃縮 | |
| 核酸の種類 | DNA | DNA | DNA, RNA | DNA | |
| 対応サンプルタイプ | 少量インプットサンプル, FFPE組織 | 血液, 唾液 | FFPE組織 | セルフリーDNA | |
| 生物種カテゴリー | ヒト | ヒト | ヒト | ヒト | |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス | シーケンス | |
| バリアントクラス | 1塩基変異多型（SNP）, 体細胞バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | 1塩基変異多型（SNP）, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 生殖細胞系列バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 転写産物バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV）, Tumor mutational burden (TMB), Genomic instability score (GIS), Microsatellite instability (MSI), 新規点転写産物, 1塩基変異多型（SNP）, 構造バリアント | 融合遺伝子, 体細胞バリアント, 1塩基変異（SNV）, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） |
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentには、ライブラリー調製試薬と濃縮試薬が含まれています。エンリッチメントプローブパネルおよびインデックスアダプターは、イルミナで別途販売しています（下記参照）。
DRAGEN EnrichmentおよびSomaticの二次データを解析するには、以下が必要です。
Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panelは、包括的な最新のエクソームパネルで、全エクソームシーケンスの均一なカバレッジを可能にします。
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panelは、ミトコンドリアDNAバリアントのエンリッチメントとシーケンシングを可能にするオプションの固定コンテンツ標準添加パネルです。
Illumina Custom Enrichment Panel v2は、DesignStudioアッセイデザインツールを使用するか、またはIllumina Conciergeデザインチームと連携して、標準添加パネルとして使用できます。
Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Ligation (16 Samples)
20104105
Illumina認定の自動化メソッドを使用した16のライブラリー、または手動による24のライブラリーの調製のためのライゲーションベースのライブラリー調製が含まれます。濃縮試薬およびエンリッチメントパネルは含まれません。UMIインデックスアダプターは別売りで、ライブラリー調製に必要です。調製方法に基づいて選択してください。データ解析に関する注意：Cell-Free DNA：ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment Appのデータを、Illumina Connected AnalyticsまたはBaseSpace Sequence HubでDRAGENにより追加料金なしで解析できます。クラウドプラットフォームの基本契約が必要です。データストレージは含まれません。FFPE DNA：DRAGEN EnrichmentおよびDRAGEN Somaticでの解析は含まれません。
List Price:
Discounts:
Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Ligation (96 Samples)
20104106
Illumina認定の自動化メソッドを使用した96のライブラリー、または手動による120のライブラリーの調製のためのライゲーションベースのライブラリー調製が含まれます。エンリッチメント試薬およびエンリッチメントパネルは含まれません。UMIインデックスアダプターは別売りで、ライブラリー調製に必要です。調製方法に基づいて選択してください。データ解析に関する注意：Cell-Free DNA：ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment Appのデータを、Illumina Connected AnalyticsまたはBaseSpace Sequence HubでDRAGENにより追加料金なしで解析できます。クラウドプラットフォームの基本契約が必要です。データストレージは含まれません。FFPE DNA：DRAGEN EnrichmentおよびDRAGEN Somaticでの解析は含まれません。
List Price:
Discounts:
Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Enrichment (16 Reactions)
20104107
Illumina認定の自動化メソッドを使用した合計16の反応、または手動による24の反応で使用可能な、Illumina Cell-FreeおよびFFPE DNA Prepライブラリーの濃縮用高速濃縮試薬が含まれます。ライブラリー調製試薬およびエンリッチメントパネルは含まれません。UMIインデックスアダプターは別売りで、ライブラリー調製に必要です。調製方法に基づいて選択してください。Cell-Free DNA：濃縮時の反応ごとに1～4サンプル。ILMN Cell-Free DNA Prep with EnrichmentのデータをIllumina Connected AnalyticsまたはBaseSpace Sequence HubでDRAGENにより追加料金なしで解析できます。クラウドプラットフォームの基本契約が必要です。データストレージは含まれません。FFPE DNA：全エクソームエンリッチメントあたり4サンプル。DRAGEN EnrichmentおよびDRAGEN Somaticでの解析は含まれません。
List Price:
Discounts:
Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep with Enrichment, Ligation (192 Samples, 4-plex), Cloud Analysis
20104103
4プレックス濃縮（1回の濃縮反応に4つのライブラリーをプーリング）を使用して、Illumina認定の自動化メソッドを使用した192のライブラリー、または手動による240のライブラリーの調製のためのライゲーションベースのライブラリー調製および高速濃縮試薬が含まれます。UMIインデックスアダプターは別売りで、ライブラリー調製に必要です。調製方法に基づいて選択してください。エンリッチメントパネルは含まれていません。データ解析に関する注意：Cell-Free DNA：ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichmentのデータを、Illumina Connected AnalyticsまたはBaseSpace Sequence HubでDRAGENにより追加料金なしで解析できます。クラウドプラットフォームの基本契約が必要です。データストレージは含まれません。FFPE DNA：DRAGEN EnrichmentおよびDRAGEN Somaticでの解析は含まれません。
List Price:
Discounts:
Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep with Enrichment, Ligation (192 Samples, 4-plex), On-premises
20104104
4プレックス濃縮（1回の濃縮反応に4つのライブラリーをプーリング）を使用して、Illumina認定の自動化メソッドを使用した192のライブラリー、または手動による240のライブラリーの調製のためのライゲーションベースのライブラリー調製および高速濃縮試薬が含まれます。UMIインデックスアダプターは別売りで、ライブラリー調製に必要です。調製方法に基づいて選択してください。エンリッチメントパネルは含まれていません。10,000 Gb、1年間のDRAGENサーバーライセンスが含まれています。セルフリーDNA解析にはIllumina DRAGEN v4 Serverが必要です。
Twist Bioscience® for Illumina Exome 2.5 Panel (8 Reactions) Kit
20076914
Twist Bioscience® for Illumina Exome 2.5 Panel (8 Reactions) Kit
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel
20093180
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel、96サンプル用の32 ulの試薬が含まれます（ハイブリダイゼーション反応8回、1反応あたり12サンプル）。このパネルは、Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus EnrichmentキットのExome 2.0 Plus Panelと併用でき、ヒトエクソームとミトコンドリアDNAの両方を全ゲノムライブラリーから混ぜ合わせて濃縮することができます。Mitochondrial Panelは、Exome 2.0 Plus Panel製品の付属製品として販売されています。
List Price:
Discounts:
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (32 µl, 120 bp)
20073953
Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの二本鎖カスタムパネルデザインを可能にし、32 µl（Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると8濃縮反応に十分な量）の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (384 µl, 120 bp)
20073952
Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの二本鎖カスタムパネルのデザインを可能にし、384 µl（Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると96濃縮反応に十分な量）の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。
Illumina Custom Enrichment Panel V2 (1536 µl, 120 bp)
20111339
Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの2本ストランドカスタムパネル設計を可能にし、1,536 µl（Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると濃縮反応384回分に十分な量）の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20034701
UMI DNA Index Anchors（プレート = 20031416、箱 = 20032620） + Nextera対応 Unique Dual Index A（販売キット = 20027213、プレート = 20025019、箱 = 20026121）
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20034702
IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors Set B
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set A for Automation
20066404
96 IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set A for Automationの箱1箱が同梱されており、96サンプルにラベル表示でき、96 IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automationの箱1箱が同梱されています。
List Price:
Discounts:
IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set B for Automation
20063213
イルミナの96 IDT - UMI DNA/RNA UD Indexes Set B for Automationの1箱入りで、イルミナの96 IDT - UMI DNA Index Anchors for Automationのラベルに十分な量です。
List Price:
Discounts:
Illumina UMI DNA/RNA UD v3 indexes Set A, Ligation (96 indexes, 96 Samples)
20126235
Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set A sufficient for labeling 96 samples and one box of 96 IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors.
List Price:
Discounts:
Illumina UMI DNA/RNA UD v3 indexes Set B, Ligation (96 indexes, 96 Samples)
20126237
Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set B sufficient for labeling 96 samples and one box of 96 IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors.
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これらのシーケンスシステムは、幅広いアプリケーション、運用の簡素化、高い柔軟性と拡張性、実績のある性能を提供します。
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。
高精度変異検出のための迅速で柔軟、かつスケーラブルなcfDNAライブラリー調製キットです。
包括的で最新のエクソームエンリッチメントパネルを含む、高性能で高速かつ信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスソリューションです。
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジ形式で提供され、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフローセル構成を備えています。
Reagent v2.5 Kitは、初期の蛍光強度を維持する耐久性のあるフローセルを使用しており、以前のバージョンと比較して安定性と性能が向上しています。
高精度変異検出のための迅速で柔軟、かつスケーラブルなcfDNAライブラリー調製キットです。
主要な免疫腫瘍学遺伝子シグネチャ（TMB、MSI）に加えて、血漿中のctDNAからすべての主要なバリアントクラスを検出できる汎がん（Pan-Cancer）パネルでCGPを可能にします。
すぐに使用できる充填された試薬カートリッジとフローセルからなるNovaSeq 6000システム用試薬キットです。
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