Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment

低インプットサンプルをサポートする、高速で柔軟性があり、スケーラブルなヒト全エクソームシーケンスソリューション。

~10時間

アッセイ時間

~4時間

ハンズオンタイム

40 ng FFPE

インプット量

仕様タブで詳細を確認する

概要

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、FFPE(ホルマリン固定パラフィン包埋)サンプルから低頻度バリアントを検出するための腫瘍正常ワークフローを提供する高感度で包括的な全エクソームシーケンスソリューションです。

このワークフローには、エラー補正と偽陽性の減少のための固有の分子識別子(UMI)が含まれており、低頻度変異の正確な検出を可能にします。

主な特長

  • 腫瘍-ノーマルワークフローのための包括的なエクソームカバレッジ

  • 自動化しやすい充填量でサンプルから洞察までのワークフローを合理化

  • 低頻度変異の正確な検出

高性能ライブラリー調製

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、一塩基バリアント(SNV)、インデル、コピー数バリアント(CNV)などの低頻度バリアントを検出します。このキットは、わずか40 ngのFFPE DNAからわずか5%のアリル頻度で小さなバリアントを同定し、90%以上のバリアントを回収します。Twist Biosciences for Illumina Exome 2.5 Panelコンテンツには、腫瘍変異負荷(TMB)、マイクロサテライト不安定性(MSI)、相同組換え欠損症(HRD)のバイオマーカーが含まれます。

サンプルから洞察までのワークフローを合理化

このキットは、腫瘍およびマッチングしたノーマルサンプルのFFPE DNAから始まる統合ワークフローに属します。イルミナのシーケンシング後、DRAGEN Somaticアプリを使用して、高精度のバリアントコールを取得します。

高速でスケーラブル

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、わずか約4時間のハンズオンタイムにより、約10時間でシーケンス対応ライブラリーを調製するための高速なハイブリッドキャプチャーのワークフローを提供します。研究者は、FFPE DNAの抽出からシーケンシングまで1日で完了できます。推奨リード長は2 × 151 bpです。

重点的かつ包括的なカバレッジ

このキットはシーケンス結果を最大化し、焦点を絞った包括的で最新のパネルを使用してエクソームを完全にカバーします。

オプションのミトコンドリアおよびカスタム標準添加エンリッチメント

Illumina custom v2プローブは、最大10,000のプローブの標準添加パネルを使用して、ミトコンドリア ゲノムカバレッジまたは関心領域を簡単に追加できます。

cfDNAサンプルとFFPEサンプルのワークフローは同じ

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、Illumina Cell-Free DNA with Enrichmentと同じライブラリー調製および濃縮ケミストリーを特長としており、FFPEサンプルで卓越したパフォーマンスを実現します。

仕様

アプリケーション

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentは、FFPE DNAを含む低インプットサンプルをサポートする、合理化された包括的なサンプルから洞察までの全エクソームシーケンスソリューションです。

ワークフローの例

比較する

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment TruSight Oncology 500 Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment
Assay time ~10時間 6.5時間 サンプルから結果まで4~5日 約8.5~9.5時間
がんの種類 固形腫瘍 汎がん (Pan-cancer), 固形腫瘍
Description A fast and easy-to-use library prep with an enrichment tumor–normal workflow for accurate and comprehensive whole-exome sequencing and reliable detection of low-frequency mutations from FFPE samples. 費用対効果と信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスのための最新のエクソームコンテンツの集中エンリッチメントプローブパネルを備えた、エンリッチメントワークフローによる高速で使いやすいライブラリー調製。 FFPE組織からの包括的ゲノムプロファイリングを可能にし、NextSeq 550システムまたはNextSeq 550Dx システム(研究(RUO)モード)で実行し、一度に最大8サンプルをバッチ処理できるアッセイ。 A fast, flexible, and scalable cfDNA library preparation kit for highly sensitive mutation detection
Hands-on time ~4時間 ~2時間 自動ワークフロー約2.5時間。
手動ワークフロー約10.5時間。
約2.5〜3時間
Input quantity 40 ng FFPE DNA 50~1,000 ngの高品質ゲノムDNA(直接血液および唾液については、リファレンスガイドを参照) DNA 40 ngおよび/またはRNA 40 ng cfDNA 10~30 ng
システム NextSeq 2000システム, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NextSeq 550Dx システム研究(RUO)モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム NextSeq 550システム, NextSeq 550Dx システム研究(RUO)モード, NextSeq 500システム NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, NextSeq 550Dx システム研究(RUO)モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000Dx システム研究(RUO)モード, NovaSeq 6000システム
手法 エクソームシーケンス ターゲットDNAシーケンス, エクソームシーケンス, ターゲット濃縮 ターゲットDNAシーケンス, ターゲットRNAシーケンス, ターゲット濃縮 カスタムシーケンス, ターゲットDNAシーケンス, ターゲット濃縮
核酸の種類 DNA DNA DNA, RNA DNA
対応サンプルタイプ 少量インプットサンプル, FFPE組織 血液, 唾液 FFPE組織 セルフリーDNA
生物種カテゴリー ヒト ヒト ヒト ヒト
テクノロジー シーケンス シーケンス シーケンス シーケンス
バリアントクラス 1塩基変異多型(SNP), 体細胞バリアント, 1塩基変異(SNV), 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV) 1塩基変異多型(SNP), ヘテロ接合性欠失(LOH), 体細胞バリアント, 生殖細胞系列バリアント, 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV) 融合遺伝子, 転写産物バリアント, 1塩基変異(SNV), 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV), ヘテロ接合性欠失(LOH), 体細胞バリアント, 新規点転写産物, 1塩基変異多型(SNP), 構造バリアント 融合遺伝子, 体細胞バリアント, 1塩基変異(SNV), 挿入 欠失(Indel), コピー数バリアント(CNV)

選択ツール:

必要な製品

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichmentには、ライブラリー調製試薬と濃縮試薬が含まれています。エンリッチメントプローブパネルおよびインデックスアダプターは、イルミナで別途販売しています(下記参照)。

DRAGEN Enrichment and Somaticの二次データを解析するには、以下が必要です。

  • ローカル解析のためのDRAGENサーバーライセンス、または
  • クラウド解析のためのIllumina Connected AnalyticsとiCreditのサブスクリプション、または
  • クラウド解析のためのBaseSpace Sequence HubとiCreditのサブスクリプション
  • イルミナUMI DNA/RNA UD v3インデックスセットAおよびB

Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panelは、包括的で最新のエクソームパネルで、全エクソームシーケンスの均一なカバレッジを可能にします。

Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panelは、ミトコンドリアDNAバリアントのエンリッチメントとシーケンシングを可能にするオプションの固定コンテンツ標準添加パネルです。

Illumina Custom Enrichment Panel v2は、DesignStudioアッセイデザインツールを使用するか、またはIllumina Conciergeデザインチームと連携して、標準添加パネルとして使用できます。

/

ライブラリー調製 (5)

Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Ligation (16 Samples)

20104105

Includes ligation-based library prep for preparation of 16 libraries with Illumina Qualified Automation Methods, or 24 libraries manually. Enrichment reagents and enrichment panel not included. UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Please note regarding data analysis: Cell-Free DNA: Analyze data on DRAGEN for ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment App on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub at no additional charges. Basic subscription to Cloud platform required. Data storage not included. FFPE DNA: Analysis on DRAGEN Enrichment and Somatic not included.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Ligation (96 Samples)

20104106

Includes ligation-based library prep for preparation of 96 libraries with Illumina Qualified Automation Methods, or 120 libraries manually. Enrichment reagents and enrichment panel not included. UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Please note regarding data analysis: Cell-Free DNA: Analyze data on DRAGEN for ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment App on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub at no additional charges. Basic subscription to Cloud platform required. Data storage not included. FFPE DNA: Analysis on DRAGEN Enrichment and Somatic not included.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Enrichment (16 Reactions)

20104107

Includes fast enrichment reagents for enrichment of Illumina Cell-Free and FFPE DNA Prep libraries for a total of 16 reactions with Illumina Qualified Automation Methods, or 24 reactions manually. Library preparation reagents and enrichment panel not included. UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Cell-Free DNA: 1-4 samples per reaction during enrichment. Analyze data on DRAGEN for ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub at no additional charge. Basic subscription to Cloud platform required. Data storage not included. FFPE DNA: 4 samples per Whole Exome enrichment. Analysis on DRAGEN Enrichment and Somatic not included.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep with Enrichment, Ligation (192 Samples, 4-plex), Cloud Analysis

20104103

Includes ligation based library prep and fast enrichment reagents for preparation of 192 libraries using Illumina Qualified Automation Methods, or 240 libraries manually, using 4-plex enrichment (pooling of 4 libraries in a single enrichment reaction). UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Enrichment panel not included.  Please note regarding data analysis: Cell-Free DNA: Analyze data on DRAGEN for ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub at no additional charges. Basic subscription to Cloud platform required. Data storage not included. FFPE DNA: Analysis on DRAGEN Enrichment and Somatic not included.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep with Enrichment, Ligation (192 Samples, 4-plex), On-premises

20104104

Includes ligation based library prep and fast enrichment reagents for preparation of 192 libraries using Illumina Qualified Automation Methods, or 240 libraries manually, using 4-plex enrichment (pooling of 4 libraries in a single enrichment reaction). UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Enrichment panel not included.10,000 Gb, 1 yr DRAGEN Server License included. Illumina DRAGEN v4 Server required for Cell- free DNA analysis.

Sign in to add to cart or see pricing.

お問い合わせ

List Price:

Discounts:

パネル (5)

Twist Bioscience® for Illumina Exome 2.5 Panel (8 Reactions) Kit

20076914

Twist Bioscience® for Illumina Exome 2.5 Panel (8 Reactions) Kit

Sign in to add to cart or see pricing.

お問い合わせ

List Price:

Discounts:

Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel

20093180

Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel、96サンプル用の32 ulの試薬が含まれます(ハイブリダイゼーション反応8回、1反応あたり12サンプル)。このパネルは、Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus EnrichmentキットのExome 2.0 Plus Panelと併用でき、ヒトエクソームとミトコンドリアDNAの両方を全ゲノムライブラリーから混ぜ合わせて濃縮することができます。Mitochondrial Panelは、Exome 2.0 Plus Panel製品の付属製品として販売されています。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina Custom Enrichment Panel V2 (32 µl, 120 bp)

20073953

Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの2本ストランドカスタムパネル設計を可能にし、32 µl(Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると濃縮反応8回分に十分な量)の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。

Sign in to add to cart or see pricing.

カスタマイズ

List Price:

Discounts:

Illumina Custom Enrichment Panel V2 (384 µl, 120 bp)

20073952

Illumina Custom Enrichment Panel V2は、DesignStudioまたはConcierge Servicesを使用して、100から1,000,000プローブまでの120 bpの2本ストランドカスタムパネル設計を可能にし、384 µl(Illumina DNA Prep with Enrichmentと組み合わせて使用すると濃縮反応96回分に十分な量)の材料を提供します。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。

Sign in to add to cart or see pricing.

カスタマイズ

List Price:

Discounts:

Illumina Custom Enrichment Panel V2 (1536 µl, 120 bp)

20111339

Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 1536 µl of material (sufficient for 384 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.

Sign in to add to cart or see pricing.

カスタマイズ

List Price:

Discounts:

アクセサリー製品 (6)

IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034701

UMI DNA Index Anchors(プレート = 20031416、箱 = 20032620) + Nextera対応 Unique Dual Index A(販売キット = 20027213、プレート = 20025019、箱 = 20026121)

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034702

IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors Set B

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set A for Automation

20066404

96 IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set A for Automationの箱1箱が同梱されており、96サンプルにラベル表示でき、96 IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automationの箱1箱が同梱されています。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set B for Automation

20063213

イルミナの96 IDT - UMI DNA/RNA UD Indexes Set B for Automationの1箱入りで、イルミナの96 IDT - UMI DNA Index Anchors for Automationのラベルに十分な量です。

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina UMI DNA/RNA UD v3 indexes Set A, Ligation (96 indexes, 96 Samples)

20126235

Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set A sufficient for labeling 96 samples and one box of 96 IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina UMI DNA/RNA UD v3 indexes Set B, Ligation (96 indexes, 96 Samples)

20126237

Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set B sufficient for labeling 96 samples and one box of 96 IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors.

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

表示されている結果 : /

選択中の製品一覧

製品名

数量

単価

NovaSeq Xシリーズのご購入

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment

包括的で最新のエクソームエンリッチメントパネルを含む、高性能で高速かつ信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスソリューションです。

お問い合わせ

当社の製品・サービスに関する情報や、テクノロジーに関するご質問への回答をお求めの場合、お気軽にお問い合わせください。