がん免疫研究

腫瘍微小環境と免疫組成

次世代シーケンサーは、がんゲノムの詳細な解析を提供できる強力なツールです。また、腫瘍増殖または治療に反応する免疫マーカー発現をモニタリングするために、高感度で腫瘍微小環境をリアルタイムで効率的に評価することもできます。NGSは、免疫細胞のレパートリーを特徴付け、微小環境内のさまざまな細胞集団を同定し、同時に数千のターゲットにおける遺伝子発現を包括的に定量することができます。

腫瘍変異負荷とネオアンチゲン予測

次世代シーケンサーは、研究者らがネオアンチゲンの同定、免疫反応を高める革新的な治療法の研究、および遺伝的変異がその効果に与える影響を解明するのにも役立ちます。NGSは、腫瘍特異的な反応を誘発するために適用できる新規の腫瘍抗原の予測的な選択も可能にします。

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腫瘍微小環境解析のための空間トランスクリプトミクス

空間トランスクリプトミクスは、組織切片にマッピングされた遺伝子発現パターンのトポグラフィー配置を提供し、構造と活性を関連付けます。この能力により、研究者は細胞レベルで生物学的相互作用を明確にし、腫瘍微小環境などの複雑な組織に対する新しい洞察を得ることができます。

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がんにおける腸内細菌の組成

宿主微生物相互作用ががんの発生、進行、治療効果に及ぼす影響を研究するために、NGSが使用できます。NGSによってさまざまな状況で微生物群をプロファイルでき、このプロファイリングは新たながん治療法の開発でターゲットとなりうる種や症状を同定する上で非常に重要です。

腫瘍微小環境におけるシングルセル解析

シングルセルRNAシーケンス（scRNA-Seq）は、シングルセル解像度で、がんや腫瘍微小環境のトランスクリプトームプロファイルを調べるためにますます使用されています。免疫細胞研究は、シングルセルトランスクリプトミクスと組み合わせて、がんの免疫サーベイランスと免疫療法に対する耐性における主要な要因を理解するために適用されています。

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