T細胞受容体β鎖の再配列のシーケンスにより、T細胞多様性とクローン増殖を調査するターゲットRNA研究パネル。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panelは、T細胞受容体（TCR）ベータ鎖の再構成をシーケンスすることで、T細胞の多様性とクローン増殖を測定するための、高度にマルチプレックス化されたターゲットリシーケンスパネルです。このパネルにより、マルチプレックスPCR法プライマー、ライブラリー試薬、およびサンプルバーコードの単一プールを使用して、全血、新鮮凍結組織、または蛍光活性化セルソーティング（FACS）で分別された細胞から抽出されたRNAからライブラリーを生成できます。
Immune Repertoire Plus, TCR beta Panelは、AmpliSeq for Illuminaポリメラーゼ連鎖反応（PCR）に基づくライブラリー調製、イルミナのSequence by Synthesis（SBS）NGSテクノロジー、および自動化解析を含む、統合されたワークフローの一部です。
このパネルはそのまますぐに使い始めることができるため、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化にかかる時間と労力を節約できます。
| アッセイ時間 | 5.5～7.5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） |
|---|---|
| コンテンツ仕様 | CDR1、CDR2、CDR3を含むTCRβ鎖再構成のRNA評価（最大400 bpのリード長アンプリコンを使用） |
| ハンズオンタイム | <1.5時間 |
| インプット量 | 10～1,000 ng |
| システム | MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System |
| 作用機序 | マルチプレックスPCR法 |
| 手法 | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス |
| マルチプレックス | 96のデュアルインデックスの組み合わせ |
| 核酸の種類 | RNA |
| サンプルタイプの詳細 | ライブラリーは、全血、新鮮/凍結組織、または蛍光活性化セルソーティング（FACS）で分別された細胞から抽出されたRNAから生成できます。 |
| 対応サンプルタイプ | 血液 |
| 生物種カテゴリー | ヒト |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | 転写産物バリアント |
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panelワークフローには、Immune Response Panelオリゴ、AmpliSeq Library PLUSキットのいずれか1つ、AmpliSeq cDNA合成キット、および少なくとも1つのAmpliSeqインデックスキットが必要です。
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| MiniSeqシステム | 1ランあたりのサンプル数はサンプルタイプによって異なります。 |
2 x 150 bp |
| MiSeq System | 1ランあたりのサンプル数はサンプルタイプによって異なります。 |
2 x 300 bp |
| NextSeq 550 System | 1ランあたりのサンプル数はサンプルタイプによって異なります。 |
2 x 150 bp |
ターゲットシーケンスまたはリシーケンスでは、遺伝子のサブセットまたは関心のあるゲノム領域が単離され、シーケンスされるため、ラボのリソースを節約できます。
イルミナのがん研究向けNGSとマイクロアレイテクノロジーが、がんゲノム分野における革新を牽引します。
NGSとアレイソリューションにより、免疫関連遺伝子変異の機能的影響および潜在的な免疫疾患メカニズムに関する洞察を得ることが可能となります。
| AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel | AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panel | |
|---|---|---|
| アッセイ時間 | 5.5～7.5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） | 5.5～7.5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） |
| コンテンツ仕様 | CDR1、CDR2、CDR3を含むTCRβ鎖再構成のRNA評価（最大400 bpのリード長アンプリコンを使用） | 最大リード長80 bpのアンプリコンでTCRβ鎖再構成をシーケンスして、3つのCDRすべてを特性評価します。 |
| ハンズオンタイム | <1.5時間 | <1.5時間 |
| インプット量 | 10～1,000 ng | 1 ng |
| システム | MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System | MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System |
| 作用機序 | マルチプレックスPCR法 | マルチプレックスPCR法 |
| 手法 | アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス | ターゲットDNAシーケンス, アンプリコンシーケンス, ターゲットRNAシーケンス |
| マルチプレックス | 96のデュアルインデックスの組み合わせ | |
| 核酸の種類 | RNA | DNA, RNA |
| サンプルタイプの詳細 | ライブラリーは、全血、新鮮/凍結組織、または蛍光活性化セルソーティング（FACS）で分別された細胞から抽出されたRNAから生成できます。 | |
| 対応サンプルタイプ | 血液 | 血液, FFPE組織 |
| 生物種カテゴリー | ヒト | ヒト |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | 転写産物バリアント | 転写産物バリアント |
AmpliSeq™ for Illumina® Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel
20024479
AmpliSeq Library PLUS for Illuminaと組み合わせると、24反応に十分です。ライブラリー調製、インデックスアダプター、アクセサリー製品は別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®
20019101
24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®
20019102
96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®
20019103
384ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)
20019104
24サンプルのラベル付けに十分な24インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
96サンプルにラベル表示できる96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬とプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)
20031676
イルミナ、セットA、セットB、セットCおよびセットDの4セットのAmpliSeq CDインデックスが含まれます。各セットには96サンプルにラベルを付けるのに十分な96、8 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®
20022654
AmpliSeq for Illumina RNA Panels（AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom RNA PanelまたはCommunity RNA Panelsなど）で作業する場合、全RNAをcDNAに変換するための反応ミックスと酵素ブレンドが含まれます。反応の数はパネルによって異なります（例：AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom Panelについては1キットあたり100反応、AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panelについては1キットあたり200反応）。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
AmpliSeq for Illuminaライブラリーをシーケンス用に調製する場合のライブラリーノーマライゼーション用のビーズと試薬が含まれます。
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進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
FFPE組織から、すべての主要バリアントクラスに加え、重要なバイオマーカー（TMB、MSI、HRD）を網羅する大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現します。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
腫瘍と免疫系の相互作用に関わる395遺伝子を対象とした標的RNA発現パネル。
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
iSeq 100システム用の試薬は、1チャンネルSBSケミストリーとCMOSテクノロジーを備えたすぐに使えるカートリッジで、シンプルかつ低コストのシーケンスを実現します。
最大1200の関心ゲノムターゲットのシーケンスに最適化されたターゲット化されたカスタムRNA研究パネル。
広範囲のがん型との関連が判明している161種のバリアントを調べるためのターゲットDNA／RNA研究パネル。
小児および若年成人のがんに関連する203の遺伝子を調べるためのターゲットパネル。
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