T細胞受容体ベータ鎖の再構成シーケンスにより、腫瘍サンプル中のT細胞多様性とクローン増殖を測定するFFPE互換パネル。
アッセイ時間
ハンズオンタイム
インプット量
AmpliSeq for Illumina TCR Beta-SR（Short Read）パネルは、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）腫瘍サンプルなど、複数のサンプルタイプで使用するための高度にマルチプレックス化されたターゲットリシーケンスパネルです。これは、T細胞受容体（TCR）ベータ鎖再配列のシーケンスにより、T細胞の多様性とクローン増殖を測定するように設計されています。マルチプレックスPCRプライマー、ライブラリー試薬、およびサンプルバーコードの単一プールを使用して、FFPE、全血、新鮮凍結組織、または蛍光活性化細胞ソーティング（FACS）ソーティング細胞から抽出されたDNA/RNAからライブラリーを生成できます。
AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panelは、AmpliSeq for Illumina polymerase chain reaction（PCR）ベースのライブラリー調製、イルミナのSequencing by Synthesis（SBS）ケミストリーおよび次世代シーケンサー（NGS）テクノロジー、自動解析を含む統合ワークフローの一部です。
このすぐに使えるパネルは、ターゲットの同定、プライマーの設計、パネルの最適化の時間と労力を節約します。これにより、TCRベータ鎖の超可変相補的決定領域3（CDR3）の特性評価が可能になります。この情報は、免疫学研究者が免疫機能、自己免疫疾患、免疫介在性の有害作用を理解するのに役立ちます。
| Automation capability | Liquid Handling Robots |
|---|---|
| Cancer type | Solid Tumor |
| Method | Targeted RNA Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Amplicon Sequencing |
| Specialized sample types | Blood, FFPE Tissue |
| Variant class | Transcript variants |
| アッセイ時間 | 5.5～7.5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） |
| アンプリコン数 | 異なる |
| インプット量 | 1 ng |
| コンテンツ仕様 | 最大リード長80 bpのアンプリコンでTCRβ鎖再構成をシーケンスして、3つのCDRすべてを特性評価します。 |
| システム | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeqシステム |
| ターゲットインサートサイズ | 80 bp |
| テクノロジー | イルミナシーケンサー |
| ハンズオンタイム | <1.5時間 |
| 作用機序 | マルチプレックスPCR法 |
| 核酸の種類 | DNA, RNA |
| 生物種 | ヒト |
AmpliSeq for Illuminaライブラリー調製ワークフローには、パネル、ライブラリー調製試薬（Library PLUS）、インデックスが必要です。以下の製品は、cDNA合成、サンプル同定、FFPEサンプル調製に使用できます。
AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panel
AmpliSeq for Illumina Library PLUS
AmpliSeq for Illumina CD Indexes
AmpliSeq for Illumina cDNA合成
| 装置 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| MiniSeq System | Samples per run will depend on sample type. |
2 × 151 bp |
| MiSeq System | Samples per run will depend on sample type. |
2 × 151 bp |
| NextSeq 550 System | Samples per run will depend on sample type. |
2 × 151 bp |
PCRアンプリコンの超ディープシーケンスにより、目的のゲノム領域を特定した解析が可能です。アンプリコンシーケンスの詳細と包括的なソリューションをご覧ください。
イルミナのシーケンステクノロジーとマイクロアレイテクノロジーは、DNAからRNA解析、エピジェネティクスなど、がんゲノム研究の応用分野を幅広くサポートしています。
NGSとアレイソリューションにより、免疫レパートリー、疾患メカニズム、免疫関連遺伝子変異の機能的影響に関する洞察を得ることができます。
| AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panel | AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel | |
|---|---|---|
| アッセイ時間 | 5.5～7.5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） | 5.5～7.5時間（時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない） |
| アンプリコン数 | 異なる | |
| インプット量 | 1 ng | 10～1,000 ng |
| コンテンツ仕様 | 最大リード長80 bpのアンプリコンでTCRβ鎖再構成をシーケンスして、3つのCDRすべてを特性評価します。 | CDR1、CDR2、CDR3を含むTCRβ鎖再構成のRNA評価（最大400 bpのリード長アンプリコンを使用） |
| ターゲットインサートサイズ | 80 bp | |
| ハンズオンタイム | <1.5時間 | <1.5時間 |
| 作用機序 | マルチプレックスPCR法 | マルチプレックスPCR法 |
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングします。キットを比較、共有、注文します。
AmpliSeq™ for Illumina® TCR beta-SR Panel
20031675
AmpliSeq Library PLUS for Illuminaと組み合わせると、24のDNAまたはRNAサンプルに十分です。AmpliSeq dNTP Mix for Illuminaが含まれます。ライブラリー調製、インデックスアダプター、アクセサリー製品は別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®
20019101
24ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®
20019102
96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®
20019103
384ライブラリー調製用の試薬が含まれます。AmpliSeq for Illuminaパネルとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)
20019104
24サンプルのラベル付けに十分な24インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®
20019105
96サンプルにラベル表示できる96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®
20019106
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®
20019107
96サンプルのラベルに十分な96インデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®
20019167
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、8 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬とプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)
20031676
イルミナ、セットA、セットB、セットCおよびセットDの4セットのAmpliSeq CDインデックスが含まれます。各セットには96サンプルにラベルを付けるのに十分な96、8 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製パネルとプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Ampliseq™ cDNA Synthesis for Illumina®
20022654
AmpliSeq for Illumina RNA Panels（AmpliSeq for Illumina Immune Response、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panel、Myeloid、Transcriptome Human Gene Expression、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom RNA PanelまたはCommunity RNA Panelsなど）で作業する場合、全RNAをcDNAに変換するための反応ミックスと酵素ブレンドが含まれます。反応の数はパネルによって異なります（例：AmpliSeq for Illumina Immune Response、Focus、Comprehensive Panel v3、Custom Panelについては1キットあたり100反応、AmpliSeq for Illumina Transcriptome Human Gene Expression、Myeloid、Immune Repertoire Plus、TCR Beta Panelについては1キットあたり200反応）。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®
20019171
AmpliSeq for Illuminaライブラリーをシーケンス用に調製する場合のライブラリーノーマライゼーション用のビーズと試薬が含まれます。
List Price:
Discounts:
AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA
20023378
AmpliSeq for Illuminaプロトコールを使用したライブラリー構築のために、非染色スライドマウントFFPE組織からDNAを調製するための24の反応を含み、脱パラフィンやDNA精製は必要ありません。
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単価
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。
クラスター密度とリード長が向上する最適化された試薬キットで、以前のバージョンと比較してシーケンス品質スコアが向上します。
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
幅広いシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための高速で統合されたワークフロー。
腫瘍と免疫系の相互作用に関わる395遺伝子を対象とした標的RNA発現パネル。
遺伝的がんリスク素因に関連する113の遺伝子および125のSNPにわたる生殖系列変異を評価するターゲットシーケンスパネル。
iSeq 100システム用の試薬は、1チャンネルSBSケミストリーとCMOSテクノロジーを備えたすぐに使えるカートリッジで、シンプルかつ低コストのシーケンスを実現します。
5,000を超えるプレテスト済み遺伝子のカタログから選択することで、ヒト疾患研究のためのパネルデザインを効率的かつ便利にカスタマイズできます。
シーケンス固有のターゲットまたは興味のあるゲノムコンテンツにに最適化されたターゲットカスタムリサーチパネル。
広範囲のがん型との関連が判明している161種のバリアントを調べるためのターゲットDNA／RNA研究パネル。
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