ゲノミクスで免疫疾患に関する洞察を得る

免疫ゲノミクス研究

ゲノミクス解析テクノロジーは、免疫細胞機能とシグナリングの解明を支え、免疫研究を前進させます。複雑な自己免疫疾患(ループス、関節リウマチ、多発性硬化症など)やその他の免疫疾患の原因はまだあまり解明されていません。

イルミナの免疫ゲノミクスソリューションは、免疫学研究者が潜在的な自己免疫疾患のメカニズム、免疫レパートリー、および免疫関連遺伝子変異の機能的影響に関する洞察を得るのに役立ちます。次世代シーケンサー(NGS)では、免疫反応の高解像度でのマッピングに必要なクオリティ、スループットおよびリード長が得られます。マイクロアレイは、ヒト免疫系における遺伝的変異の大規模研究のための高密度コンテンツを提供します。 

免疫学研究の論文要旨集
免疫学研究論文集

免疫学者がNGSを使用する多様な方法を示す査読済み出版物の要約をご覧ください。

レビューを読む

NGSは、一見無限のターゲットアレイを認識できる免疫細胞の膨大なレパートリーをマッピングする強力な免疫ゲノム研究ツールであることが証明されています。1 レパートリーシーケンスにより、研究者は自己免疫疾患、血液悪性腫瘍、その他の疾患にかかりやすい個人に見られるユニークな受容体バリアントを同定することができました。2  

T細胞受容体レパートリー解析

研究者は、T細胞受容体(TCR)レパートリーとミトコンドリアDNAおよびピウイ相互作用RNAのシーケンスにより、疾患のメカニズムを解明しています。

インタビューを読む
シングルセルレベルでの免疫学の発見
シングルセル

重症喘息における気道T細胞のシングルセル解析から反応性アストロサイト研究にいたるまで、シングルセルシーケンスアプローチを用いた免疫学研究についてお聞きください。

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免疫学におけるシーケンスベースの探索
蛍光細胞

オックスフォード大学、ハーバード大学医学部、ニューヨーク大学の教授陣が、NGSデータが非定型免疫細胞集団と組織特異的免疫反応の理解にどのように役立ったかについて語ります。

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シングルセルテクノロジーとマルチオミクスを使用した免疫探索の深化
シングルセル

シングルセルツールによるマルチオミクス解析により、希少な免疫細胞タイプの新しいバイオマーカーを探索し、高度な内容を持つフローサイトメトリーの特性解析実験につなげた方法をご覧ください。

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免疫ゲノミクスによる抗腫瘍T細胞レパートリーのデコード
T細胞と腫瘍細胞

ジョンズ・ホプキンス大学助教授であるKellie Smith博士が、がんネオアンチゲンと免疫応答の相互作用について説明します。

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免疫ゲノミクス研究論文

 
腫瘍特異的HLAリガンド
腫瘍特異的HLAリガンドを用いた高精度な免疫療法

RNA-Seqとヒト白血球抗原(HLA)タイピングは、ターゲットディスカバリープラットフォームの性能を向上させ、効率性を高めています。

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ターゲットDNA解析
HLA遺伝学と自己免疫疾患

研究者は、NGSおよびハイスループットのジェノタイピングを実行してゲノムを調べることにより、免疫介在性疾患のリスクとなる新たな遺伝子座位を同定しました。

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乳がん
NGSはバイオマーカー探索に有用であることが証明されました

研究者は、がん遺伝子発現解析、免疫学研究、免疫療法バイオマーカー研究にNGSを使用しています。

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AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel T細胞受容体(TCR)ベータ鎖の再配列をシーケンシングすることにより、T細胞の多様性とクローンの拡大を調査します。

AmpliSeq for Illumina TCR Beta-SR(Short Read)パネル:TCRベータ鎖再構成をシーケンシングすることにより、腫瘍サンプル内のT細胞の多様性とクローン増殖を測定するためのFFPE対応パネル。 

AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel : 腫瘍と免疫系の相互作用に関わる395遺伝子を対象とする、ターゲットRNA発現パネル。

NextSeq 1000システムとNextSeq 2000システム:これらのベンチトップシーケンスシステムは、免疫レパートリーの詳細なビューに必要なリードを提供し、広範なクロスアプリケーションに柔軟性を提供します。

Partek Flowソフトウェア:この使いやすいソフトウェアは、V(D)Jシーケンスデータを含むマルチオミクスデータの解析と視覚化をサポートします。

Infinium Immunoarray:単一のマイクロアレイで自己免疫疾患と免疫機能に関連する遺伝子変異を評価します。

Infinium Global Screening-24 Kit:HLAやKIR遺伝子バリアントなどの、スケーラブルで費用対効果の高い集団遺伝学研究と免疫関連バリアントの研究を行います。

シングルセルオミクスと細胞免疫研究

イルミナのゲノミクスポッドキャストのエピソード45で、Dr. Shalin Naikは、シングルセルゲノミクスを使用して免疫系を理解する方法について話しています。

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NextSeq 1000システムおよびNextSeq 2000システムにおける全長IR-Seq

NextSeq 1000システムおよびNextSeq 2000システムにより、全長V(D)Jシーケンスを含む複雑な免疫レパートリーシーケンス(IR-Seq)研究がどのように実現されるかをご覧ください。

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アプリケーションノート:NextSeq 1000および2000システムにおけるIR-Seq
腫瘍免疫原性研究
腫瘍およびT細胞

NGSは、腫瘍が免疫反応を回避できる変異や、T細胞性免疫を高めるネオアンチゲンを研究者が同定するのに役立ちます。免疫腫瘍学研究の詳細はこちら

複雑な疾患ゲノム
複雑な疾患ゲノム

イルミナシーケンスは、分子レベルでの自己免疫疾患、リウマチ性疾患、動脈硬化症、精神疾患を理解する新しい道を導入しています。複雑な疾患研究の詳細はこちら

COVID-19免疫応答研究

SARS-CoV-2ウイルスに対する個々の免疫系の応答を調べることで、疾患の感受性と重症度に対する理解を深めることができます。SARS-CoV-2ウイルスに対する免疫系の応答を研究して、遺伝的リスク因子を同定する方法を探ります。

免疫応答プロファイリングの詳細はこちら
免疫応答プロファイリング
統合ゲノミクスによるIBD探索の推進
免疫ゲノミクスによるIBD探索の推進

Dr. Carl Andersonが、炎症性腸疾患(IBD)研究における統合研究アプローチについて語ります。

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細胞と抗体
自己免疫の謎を解き明かす

Dr. Carola Vinuesaが、NGSが自己免疫を調節する細胞と分子の複雑な相互作用をどのように解明するかについて解説します。

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ポッドキャストを聴いている人
ゲノミクスと免疫疾患

Dr. Janna Saarelaが、一般的および希少な免疫疾患の背後にあるメカニズムを同定するためのゲノミクスの使用について説明します。

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シングルセルのがん特異的タンパク質パターン
シングルセルのがん特異的タンパク質パターン

膜タンパク質を定量化および空間的にマッピングし、免疫細胞の挙動メカニズムを発見します。

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参考文献
  1. Woodsworth D.J., Castellarin M., and Holt R.A. Sequence analysis of T-cell repertoires in health and disease. Genome Med. 2013; 5:98.
  2. Robins H. Immunosequencing: applications of immune repertoire deep sequencing. Curr Opin Immunol. 2013; 25: 646-652.