関心領域の高度にターゲット化されたリシーケンス

PCRアンプリコンのディープシーケンスにより、遺伝子ターゲットの効率的な特性評価が可能

アンプリコンシーケンス

アンプリコンシーケンスは、研究者が特定のゲノム領域における遺伝的変異を解析できる高度にターゲット化されたアプローチです。PCR産物(アンプリコン)の超ディープシーケンスにより、効率的なバリアントの同定と特性評価が可能になります。この方法では、関心領域をターゲットにして捕捉するように設計されたオリゴヌクレオチドプローブを使用し、次に次世代シーケンス(NGS)を行います。

アンプリコンシーケンスは、複雑なサンプル(生殖細胞系DNAと混合した腫瘍など)における希少な体細胞変異の発見に有用です。もう1つの一般的なアプリケーションは、特に多様なメタゲノミクスサンプルにおいて、フィロジーとタクソノミクス研究に広く使用されている手法である、複数の種にわたる細菌16S rRNA遺伝子のシーケンスです。

3つの簡単なステップでアンプリコンシーケンス

この包括的なワークフローソリューションによるディープシーケンスPCRアンプリコン。

推奨されるワークフローを見る  

  • 研究者は、高度にターゲットを絞ったアプローチを用いて、遺伝子バリアントを効率的に発見、検証、スクリーニングできます
  • 1反応あたり数百から数千のアンプリコンのマルチプレックスをサポートし、高いカバレッジを実現
  • GCが豊富な領域などシーケンスが難しい領域でも、高度にターゲットを絞ったリシーケンスを実現
  • 幅広い実験デザインに柔軟に対応
  • 全ゲノムシーケンス などのより広範なアプローチと比較して、シーケンスコストとターンアラウンドタイムを削減
アンプリコンシーケンスの利点

アンプリコンシーケンスにより、研究者は1回のランで数から数百の遺伝子のターゲットをシーケンスできます。この超高マルチプレックスPCRアプローチは、複数の遺伝子を同時に評価することで研究を促進します。ライブラリーはわずか5~7.5時間で調製でき、17~32時間でシーケンスできます。

アンプリコンシーケンスは、遺伝的バリアントの発見、検証、またはスクリーニングのための幅広い研究アプリケーションを可能にします。

高精度にターゲット化されたマルチプレックス分析

Michael Bunce博士が、MiSeqシステムアンプリコンシーケンスが環境DNAの研究に理想的な理由を説明します。

インタビューを読む
アンプリコンシーケンスと生物多様性
未知のものを探る:NGSが種の研究をサポート

NovaSeq 6000システムは、OIST研究者がさまざまな海洋種や陸地種のシーケンスと研究を行えるようにしています。

記事を読む
未知のものを探る:NGSが種の研究をサポート

イルミナのSequence by Synthesis(SBS)ケミストリーは、最も広く採用されている次世代シーケンサー(NGS)技術で、世界のシーケンスデータの約90%を生み出しています。*

イルミナは、ライブラリー調製からデータ解析、生物学的解釈まで、プロセス全体を簡素化する統合アンプリコンシーケンスワークフローを提供しています。

以下のをクリックしてワークフローの各ステップで使用する製品をご覧ください。

AmpliSeq for Illumina Sequencing Solution

シンプルで柔軟なターゲットリシーケンスのためのすぐに使えるカスタムパネルを幅広く提供し、信頼できる高品質のデータを提供します。

Illumina DNA Prep

ヒト全ゲノムシーケンスからアンプリコン、プラスミド、微生物まで、さまざまなアプリケーションに対応する高速な統合ワークフロー。

TruSight Tumor 15

1回のアッセイで固形腫瘍で一般的に変異する15の遺伝子を評価するフォーカスシーケンス研究パネル。シンプルで迅速なワークフロー。

Nextera XT DNAライブラリー調製キット

小さなゲノム(バクテリア、古細菌、ウイルス)、アンプリコン、およびプラスミドのライブラリー調製を、90分未満で行うことができます。

がん研究パネルポートフォリオ

イルミナのターゲットシーケンスパネルは、専門家が定義した遺伝子コンテンツに加えて、シンプルなデータ解析とレポート作成オプションを提供することで、臨床がん研究を促進します。

ライブラリー調製キットセレクター ライブラリー調製キットセレクター

プロジェクトタイプ、出発材料、および手法、またはアプリケーションに最適なキットを決定します。

DesignStudio Assay Designツール

プローブデザインを最適化するための動的なフィードバックを提供する使いやすいオンラインソフトウェアツールです。

iSeq 100システム

ターゲットを絞った、または小規模ゲノムシーケンスに向けた、お求めやすく、かつ高速でアクセスしやすいシーケンスパワーをあらゆる研究室に提供します。

MiniSeqシステム

単一の遺伝子またはパスウェイ全体を調べるための幅広いターゲットDNAおよびRNAアプリケーションをサポートします。

MiSeqシステム

ターゲットリシーケンスからメタゲノム、小規模ゲノムシーケンスなど、焦点を絞ったアプリケーションを可能にします。

NextSeq 550システム

全ゲノム、トランスクリプトーム、ターゲットリシーケンスに必要な柔軟なパワーを提供します。

イルミナシーケンスプラットフォーム

シーケンスプラットフォームを比較して、それぞれのラボやアプリケーションに最適なシステムを特定できます。

シーケンス試薬

イルミナのシーケンスシステムに適したシーケンス試薬、フローセル、バッファーが含まれるキットを検索できます。

BaseSpace Sequence Hub

NGSデータ解析と管理を行うイルミナのゲノミクスコンピューティング環境。

Local Run Manager

シーケンスランの作成、ランのステータス監視、データ解析のためのオンプレミス型ソフトウェアソリューションです。

DNA Ampliconアプリ

アンプリコンリードを使用して、特定のターゲットシーケンスにエンリッチされたNGSデータの解析を合理化。

16Sメタゲノミクスアプリ

原核生物の16S小サブユニットrRNA遺伝子のアンプリコンシーケンスからDNAを解析し、分類学的分類の視覚を提供します。

統合ゲノミクスビューアアプリ

Broad Institute of MIT and Harvardが開発した、複雑なバリアント解析のためのNGSデータを表示するゲノムブラウザ。

BaseSpace Variant Interpreter

業界をリードするアノテーションデータベースと強力なフィルタリングインターフェースを活用し、研究者が疾患関連バリアントを迅速に同定できるようにします。

BaseSpace Correlation Engine

疾患メカニズム、薬剤ターゲット、バイオマーカーの同定で研究者をサポートする、キュレーションされたゲノムデータの発展し続けるライブラリー。

MiniSeqベンチトップシーケンサーによるターゲットシーケンスパワー

小型で堅牢なMiniSeqシステムにより、ロースループットアプリケーション向けのイルミナNGSの実績あるパワーにアクセスできます。ベンチトップ、予算、ワークフローに適したシーケンスソリューションで、単一遺伝子またはパスウェイ全体を研究します。

システムを見る
MiniSeqデスクトップシーケンサー
がん遺伝子シーケンス
がん遺伝子シーケンス

ターゲットシーケンスにより、研究者はがんとの関連が知られている遺伝子やアンプリコンを選択することができます。事前に設計されたパネルとカスタムパネルの両方が利用可能です。ターゲットがんシーケンスの詳細はこちら

遺伝性疾患および希少疾患
状態スクリーニング

NGSテクノロジーは、希少および遺伝性の遺伝性疾患に関連する原因バリアントの迅速な同定に役立ちます。対照的に、従来の手法はコストがかかり、大規模なテストが必要になります。遺伝性疾患のNGSの詳細はこちら。

16S rRNAシーケンス
16S rRNAシーケンス

16SリボソームRNA(rRNA)シーケンスは、特定のサンプル内の細菌を同定して比較するために使用される一般的なアンプリコンシーケンス方法です。他の方法では検出できない可能性のある菌株を同定できます。16S rRNAシーケンスの詳細はこちら

動植物シーケンス
動物と植物のシーケンス

ターゲットリシーケンスは、動物や植物の遺伝的変異を明らかにすることができます。これらのバリアントは、育種の決定に役立つ有益な変異、または疾患感受性に関連する変異を表す可能性があります。動植物シーケンスの詳細はこちら

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実証済みの16S rRNAアンプリコンシーケンスプロトコール
実証済みの16S rRNAシーケンスプロトコール

イルミナは、16Sメタゲノムシーケンス用の実証済みのアンプリコンベースのライブラリー調製プロトコールを提供しています。

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iSeq 100システムでのAmpliSeq for Illumina
iSeq 100システムでのAmpliSeq for Illumina

iSeq 100システムでAmpliSeq for Illuminaパネルにワークフローを移行するために役立つステップバイステップのガイダンスをご覧いただけます。

ガイドを見る
TruSeq Custom Ampliconからの移行
TruSeq Custom Ampliconからの移行

詳細ガイドは、プロジェクトをTruSeq Custom AmpliconからAmpliSeq for Illumina Panelに移行するために設計されています。

ガイドを見る

*社内計算データ Illumina, Inc., 2015