NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムの仕様

実績のあるロバストなベンチトップ型シーケンス

スケーラブルな出力、効率的なランタイム、高いデータ品質

NextSeq 2000 in lab setting

フローセルあたりのシーケンス出力^a

XLEAP-SBSケミストリーを用いたNextSeq 1000およびNextSeq 2000

フローセルタイプ	P1^b	P2^b	P3^b,c	P4^c
1 × 50 bp				90 Gb
2 × 50 bp	10 Gb	40 Gb	120 Gb	180 Gb
2 × 100 bp		80 Gb	240 Gb	360 Gb
2 x 150 bp	30 Gb	120 Gb	360 Gb	540 Gb
2 x 300 bp	60 Gb	240 Gb

a. 出力仕様は、サポート対象のクラスター密度でのイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づきます。
b. 標準SBS仕様はこちらをご覧ください。
c. P3およびP4試薬はNextSeq 2000システムでのみ使用できます。

保存期間

NextSeq 1000およびNextSeq 2000 システム

アイテム	保管温度	P1、P2、P3、P4の保存期間
カートリッジ	-25°C～-15°C	6か月
フローセル	2°C～8°C	6か月
RSB with Tween 20^a	2°C～8°C	6か月

a. 室温で発送します。

フローセル当たりのパスフィルターのリード数

XLEAP-SBSケミストリーを用いたNextSeq 1000およびNextSeq 2000

フローセルタイプ	P1^a	P2^a	P3^a,b	P4^b
シングルリード	1億	4億	12億	18億
ペアエンドリード	2億	8億	24億	36億

a. 標準SBS仕様はこちらをご覧ください。
b. P3およびP4試薬はNextSeq 2000システムでのみ使用できます。

クオリティスコアとランタイム

XLEAP-SBSケミストリーを用いたNextSeq 1000およびNextSeq 2000

フローセルタイプ	P1 ^a	P2 ^a	P3 ^a,b	P4 ^b
クオリティスコア^c
1 × 50 bp	Q30以上の塩基が90%以上
2 × 50 bp	Q30以上の塩基が90%以上
2 × 100 bp	Q30以上の塩基が90%以上
2 x 150 bp	Q30以上の塩基が90%以上
2 x 300 bp	Q30以上の塩基が85%以上
ランタイム^d
1 × 50 bp				12時間
2 × 50 bp	8時間	12時間	18時間	20時間
2 × 100 bp		19時間	31時間	34時間
2 x 150 bp	17時間	22時間	40時間	44時間
2 x 300 bp	34時間	42時間

a. 標準SBS仕様はこちらをご覧ください。
b. P3およびP4試薬はNextSeq 2000システムでのみ使用できます。
c. クオリティスコアはイルミナPhiXコントロールライブラリーを用いた条件に基づきます。性能はライブラリータイプやクオリティ、インサートサイズ、ローディング濃度、およびその他の実験要因に応じて変わることがあります。
d. ランタイムには、NextSeq 1000またはNextSeq 2000システムでのクラスター形成、シーケンス、およびベースコーリングが含まれます。

主要アプリケーションの予サンプルスループット予測^a

XLEAP-SBSケミストリーを用いたNextSeq 1000およびNextSeq 2000

アプリケーション	P1^b	P2^b	P3^b,c	P4^c
	サンプル数	サンプル数	サンプル数	サンプル数
小規模全ゲノムシーケンス（300サイクル） 130 Mbゲノム、30xを超えるカバレッジ	7	30	92	138
全エクソームシーケンス（200サイクル）エクソームあたり約8 Gb、90 ×平均カバレッジ	～2^d	10	30	45
トータルRNA-Seq（200サイクル）サンプルあたり5000万リードペア	2^d	8	24	36
mRNA-Seq（200サイクル）サンプルあたり25Mリードペア	4^d	16	48	72
シングルセルRNA-Seq（100サイクル） 5000セル、セルあたり2万リード	1^e	4	12	48
miRNA-SeqまたはSmall RNA解析（50サイクル）サンプルあたり1,100万リード。	9^f	36^f	108^f	163
16S RNAシーケンス（600サイクル）	384^g	384^g

a. 表の値は、ランあたりのサンプル数の目安を表します。推奨されるシーケンス深度は、サンプルの種類と実験の目的によって大きく異なり、それぞれ研究で最適化する必要があります。
b. 標準SBS仕様はこちらをご覧ください。
c. P3およびP4試薬はNextSeq 2000システムでのみ使用できます。
d. P1 300サイクルキットを使用してください。
e. P1試薬は、シングルセルの品質管理試験に適したオプションです。
F：100サイクルキットを使用してください。
g. イルミナでは、最大384のユニークデュアルインデックスを利用できます。

装置の仕様

NextSeq 1k / 2k instrument specifications

装置の構成

DRAGEN Bio-IT FPGAによる二次解析機能を搭載した自己完結型のドライ装置
レーザー
波長

449 nm、523 nm、820 nm
梱包寸法
W × D × H

92 cm × 120 cm × 118 cm
重量：232 kg
寸法
W × D × H

55 cm × 65 cm × 60 cm
(21.7インチ × 25.6インチ × 23.6インチ)
重量

141 kg（310.9ポンド）
梱包重量

232 kg（511.5ポンド）

詳細仕様書シートを見る（PDF）

主要なテクノロジー

XLEAP-SBSのケミストリー

NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムは、標準的なイルミナSBSケミストリーの実績の基盤の上に構築された、より高速かつ高品質で、よりロバストなSBSケミストリーであるXLEAP-SBSケミストリーを採用しています。XLEAP-SBSヌクレオチドは、最新式の色素と新規リンカーおよび耐熱性が向上したブロッキング剤を使用することで、加水分解が50分の1に抑えられ、ブロッキング切断が2.5倍速くなり、フェージングとプレフェージングを減少させることができます。XLEAP-SBSポリメラーゼは、これまで以上に高速かつ高精度でヌクレオチドを取り込むよう設計されています。

ロスレスゲノムデータ圧縮テクノロジー

ロスレスゲノム圧縮は、NextSeq 1000およびNextSeq 2000シーケンスシステムを搭載した装置で利用できます。この技術では、超高速マッピングスキームを使用して、読み取り値をリファレンスゲノムにマップし、それらの読み取り値の再現に必要なデータのみ（位置、差分リスト）を保存します。

パターン化フローセルテクノロジー

NextSeq 1000および2000システムは、革新的なパターン化フローセル技術を採用しており、多様なシーケンスアプリケーションにおいて卓越したレベルのスループットを提供します。パターンフローセルでは数十億ものナノウェルが固定された位置に存在するため、クラスター間隔が調整できます。これにより、シーケンスリード数と総アウトプットを飛躍的に向上させることができました。