NextSeq 1000およびNextSeq 2000 システム仕様

堅牢で実績のあるベンチトップシーケンス

スケーラブルな出力、効率的なランタイム、高いデータ品質

NextSeq 2000 in lab setting

フローセルあたりのシーケンス出力^a

XLEAP-SBSケミストリーを使用したNextSeq 1000およびNextSeq 2000

フローセルタイプ	P1^b	P2^b	P3^b,c	P4^c
1 × 50 bp				90 Gb
2 × 50 bp	10 Gb	40 Gb	120 Gb	180 Gb
2 × 100 bp		80 Gb	240 Gb	360 Gb
2 × 150 bp	30 Gb	120 Gb	360 Gb	540 Gb
2 × 300 bp	60 Gb	240 Gb

a. 出力仕様は、サポートされているクラスター密度のイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づいています。
b. 標準SBS仕様はこちら。
c. P3およびP4試薬は、NextSeq 2000システムでのみ使用できます。

有効期間

NextSeq 1000およびNextSeq 2000シーケンスシステム

アイテム	保管温度	P1, P2, P3, P4の有効期間
カートリッジ	-25°C～-15°C	6カ月
フローセル	2°C～8°C	6カ月
Tween 20^aによるRSB	2°C～8°C	6カ月

a. 室温で発送。

フローセル当たりのパスフィルターリード

XLEAP-SBSケミストリーを使用したNextSeq 1000およびNextSeq 2000

フローセルタイプ	P1^a	P2^a	P3^a,b	P4^b
シングルリード	1億	400M	12億	1.8B
ペアエンドリード	2億	800M	24億	36億

a. 標準SBS仕様はこちら。
b. P3およびP4試薬は、NextSeq 2000システムでのみ使用できます。

クオリティスコアとランタイム

XLEAP-SBSケミストリーを使用したNextSeq 1000およびNextSeq 2000

フローセルタイプ	P1 ^a	P2 ^a	P3 ^a,b	P4 ^b
クオリティスコア^c
1 × 50 bp	Q30以上の塩基が90%以上
2 × 50 bp	Q30以上の塩基が90%以上
2 × 100 bp	Q30以上の塩基が90%以上
2 × 150 bp	Q30以上の塩基が90%以上
2 × 300 bp	Q30以上の塩基が85%以上
ランタイム
1 × 50 bp				12時間
2 × 50 bp	8時間	12時間	18時間	20時間
2 × 100 bp		19時間	31時間	34時間
2 × 150 bp	17時間	22時間	40時間	44時間
2 × 300 bp	34時間	42時間

a. 標準SBS仕様はこちら。
b. P3およびP4試薬は、NextSeq 2000システムでのみ使用できます。
c. クオリティスコアはイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づいています。ライブラリーの種類と品質、インサートサイズ、ローディング濃度、その他の実験的要因によってパフォーマンスが異なる場合があります。
d. ランタイムには、NextSeq 1000またはNextSeq 2000システム上でのクラスター生成、シーケンス、およびベースコーリングが含まれます。

主要なアプリケーションにおけるサンプルスループットの推定値^a

XLEAP-SBSケミストリーを使用したNextSeq 1000およびNextSeq 2000

アプリケーション	P1^b	P2^b	P3^b,c	P4^c
	サンプル数	サンプル数	サンプル数	サンプル数
小規模全ゲノムシーケンス（300サイクル） 130 Mbゲノム、30×カバレッジ	7	30	92	138
全エクソームシーケンス（200サイクル）エクソームあたり約8 Gb、平均カバレッジ90倍	～2^日間	10	30	45
全RNA-Seq（200サイクル）サンプルあたり5000万リードペア	2^日間	8	24	36
mRNA-Seq（200サイクル）サンプルあたり2500万リードペア	4^日間	16	48	72
シングルセルRNA-Seq（100サイクル） 5Kセル、1セルあたり20Kリード	1^e	4	12	48
miRNA-Seqまたは低分子RNA解析（50サイクル）サンプルあたり11Mリード	9^f	36^f	108^f	163
16S RNAシーケンス（600サイクル）	384 ^g	384 ^g

a. 表の値は、ランあたりのサンプルの推定数を表します。推奨されるシーケンス深度は、サンプルタイプと実験目的に大きく依存し、各研究に対して最適化する必要があります。
b. 標準SBS仕様はこちら。
c. P3およびP4試薬は、NextSeq 2000システムでのみ使用できます。
d. P1 300サイクルキットを使用します。
e. P1試薬は、シングルセル品質管理実験に適したオプションです。
f. 100サイクルキットを使用します。
g. イルミナでは、最大384のユニークデュアルインデックスを入手できます。

装置の仕様

NextSeq 1k / 2k instrument specifications

装置の構成

DRAGEN Bio-IT FPGA二次解析を内蔵した内蔵型乾燥装置
レーザー
波長

449 nm、523 nm、820 nm
梱包寸法
幅 × 奥行 × 高さ

92 cm × 120 cm × 118 cm
体重：232 kg
寸法
幅 × 奥行 × 高さ

55 cm × 65 cm × 60 cm
（21.7インチ × 25.6インチ × 23.6インチ）
重量

141 kg（310.9 lb）
木枠重量

232 kg（511.5 lb）

詳細仕様書シートを見る（PDF）

主要なテクノロジー

XLEAP-SBSケミストリー

NextSeq 1000システムおよびNextSeq 2000システムは、定評のある標準的なイルミナSBSケミストリーの基盤の上に構築された、より高速で、より高品質で、より堅牢なSBSケミストリーであるXLEAP-SBSケミストリーを搭載しています。XLEAP-SBSヌクレオチドは、最先端の染料と、熱に対する耐性が高く、加水分解が50倍減少し、フェージングとプレフェージングを減らすためのブロック切断が2.5倍高速な新しいリンカーとブロックを使用します。XLEAP-SBSポリメラーゼは、ヌクレオチドをより速く、より高い忠実度で組み込むように設計されています。

ロスレスゲノムデータ圧縮テクノロジー

ロスレスゲノム圧縮は、NextSeq 1000およびNextSeq 2000シーケンスシステムを搭載した装置で利用できます。この技術では、超高速マッピングスキームを使用して、読み取り値をリファレンスゲノムにマップし、それらの読み取り値の再現に必要なデータのみ（位置、差分リスト）を保存します。

パターン化フローセルテクノロジー

NextSeq 1000および2000システムは、革新的なパターン化フローセルテクノロジーを使用しており、多様なシーケンスアプリケーションに卓越したレベルのスループットを提供します。パターンフローセルでは数十億ものナノウェルが固定された位置に存在するため、クラスター間隔が調整できます。これにより、シーケンスリード数と総アウトプットを飛躍的に向上させることができました。