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NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムの仕様

NextSeq 1000およびNextSeq 2000システム
仕様

装置の構成
  • DRAGEN Bio-IT FPGAによる二次解析機能を搭載した自己完結型のドライ装置
    装置コントロールコンピューター
    • 本体:2Uマイクロサーバー搭載
    • メモリー:288 GB
    • ハードドライブ: 3.8 TB SSD
    • オペレーティングシステム: Linux CentOS 7.6
    動作環境
    • 温度:15℃~30℃
    • 湿度:20%~80%、結露なきこと
    • 高度:0メートル~2,000メートル
    • 屋内で使用のこと
    レーザー
    • 波長:449 nm、523 nm、820 nm
    • 安全性:クラス1レーザー製品
    寸法
    • 幅×奥行×高さ:60 cm × 65 cm × 60 cm
    • 重量:141 kg
    梱包寸法
    • 幅×奥行×高さ:92 cm × 120 cm × 118 cm
    • 梱包重量:232 kg
    電源要件
    • 装置入力電圧:100 Vac~240 Vac
    • 装置入力周波数:50/60 Hz
    ネットワーク接続の帯域幅
    • 内部ネットワークでのアップロードの場合:200 Mb/s/装置
    • BaseSpace Sequence Hubへのアップロードの場合:200 Mb/s/装置
    • 装置稼働データのアップロードの場合:5 Mb/s/装置
    製品安全性および準拠
    • NRTL認証IEC
    • 61010-1 CEマーク取得
    • FCC/IC認証
  • スペックシートを見る
NextSeq 2000システムの図

NextSeq 1000およびNextSeq 2000システム
カートリッジ

使いやすいカートリッジベースのプラットフォーム

NextSeq 1000およびNextSeq 2000シーケンスシステムのカートリッジは、試薬、流路系、廃液ホルダーが一体化されています。そのため、ライブラリーのローディングと装置の操作は簡単で、まず試薬カートリッジを融解してから、フローセルをカートリッジに挿入し、ライブラリーをカートリッジにローディングします。あとはそのカートリッジを装置にセットするだけです。

NextSeq 1000およびNextSeq 2000システム
フローセル

増強された出力性能

この高密度のフローセルを最大限に活用するため、NextSeq 1000およびNextSeq 2000シーケンスシステムにはまったく新しい超高解像度の光学システムが搭載されています。そのため、従来のベンチトップ型システムより解像度と感度の高い非常に精確なイメージングデータが得られます。この小型化により、NextSeq 550システムと同レベルの高いデータ品質基準を維持したまま、さまざまな出力量に対応できる適応性が生まれました。

NextSeq 2000システムカートリッジ
NextSeq 2000システムフローセル

NextSeq 1000およびNextSeq 2000システム
フローセル

増強された出力性能

この高密度のフローセルを最大限に活用するため、NextSeq 1000およびNextSeq 2000シーケンスシステムにはまったく新しい超高解像度の光学システムが搭載されています。そのため、従来のベンチトップ型システムより解像度と感度が高い非常に精確なイメージングデータが得られます。この小型化により、NextSeq 550システムと同レベルの高いデータ品質基準を維持したまま、さまざまな出力量に対応できる適応性が生まれました。

 

 

 

40 Gb
4億リード

フローセルあたりの出力

50 × 2 bp

クオリティスコア

Q30以上の塩基が85%以上

ランタイム

~13時間

80 Gb
4億リード

フローセルあたりの出力

100 × 2 bp

クオリティスコア

Q30以上の塩基が80%以上

ランタイム

~21時間

120 Gb
4億リード

フローセルあたりの出力

150 × 2 bp

クオリティスコア

Q30以上の塩基が75%以上

ランタイム

~29時間

対応アプリケーション


小さなサイズの全ゲノムシーケンス
(300サイクル)

130 Mbゲノム、
30×以上のカバレッジ

サンプル数

30

ランタイム

~29時間

全エクソームシーケンス
(200サイクル)

50xの平均ターゲットカバレッジ、
ターゲットの90%が20xのカバレッジ

サンプル数

16

ランタイム

~21時間

シングルセルRNA-Seq
(100サイクル)

4,000細胞、
細胞あたり12,500リード

サンプル数

8

ランタイム

~13時間

55 Gb
11億リード

フローセルあたりの出力

50 x 1 bp

クオリティスコア

Q30以上の塩基が85%以上

ランタイム

~11時間

110 Gb
11億リード

フローセルあたりの出力

50 × 2 bp

クオリティスコア

Q30以上の塩基が85%以上

ランタイム

~19時間

220 Gb
11億リード

フローセルあたりの出力

100 × 2 bp

クオリティスコア

Q30以上の塩基が80%以上

ランタイム

~33時間

330 Gb
11億リード

フローセルあたりの出力

150 × 2 bp

クオリティスコア

Q30以上の塩基が75%以上

ランタイム

~48時間

対応アプリケーション


小さなサイズの全ゲノムシーケンス
(300サイクル)

130 Mbゲノム、
30x以上のカバレッジ

サンプル数

75

ランタイム

~48時間

全エクソームシーケンス
(200サイクル)

50xの平均ターゲットカバレッジ、
ターゲットの90%が20xのカバレッジ

サンプル数

40

ランタイム

~33時間

シングルセルRNA-Seq
(100サイクル)

4,000細胞、
細胞あたり12,500リード

サンプル数

20

ランタイム

~19時間

仕様は、イルミナPhiXコントロールライブラリーを使い、サポート範囲内でのクラスター密度を基にしています。