| フローセルタイプ | P1b | P2b | P3b,c | P4c |
|---|---|---|---|---|
| 1 × 50 bp | 90 Gb | |||
| 2 × 50 bp | 10 Gb | 40 Gb | 120 Gb | 180 Gb |
| 2 × 100 bp | 80 Gb | 240 Gb | 360 Gb | |
| 2 × 150 bp | 30 Gb | 120 Gb | 360 Gb | 540 Gb |
| 2 × 300 bp | 60 Gb | 240 Gb |
NextSeq 1000およびNextSeq 2000シーケンスシステムの仕様
堅牢で実績のあるベンチトップシーケンス
スケーラブルな出力、効率的なランタイム、高いデータ品質
フローセルあたりのシーケンス出力a
XLEAP-SBSケミストリーを使用したNextSeq 1000およびNextSeq 2000
a. 出力仕様は、サポートされているクラスター密度のイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づいています。
b. P1, P2、P3フローセル用のXLEAP-SBS試薬は、2024年第Q2に入手可能です。 View standard SBS specifications here.
c. P3およびP4試薬は、NextSeq 2000システムでのみ使用できます。
有効期間
NextSeq 1000およびNextSeq 2000シーケンスシステム
| アイテム | 保管温度 | P1, P2, P3の有効期間a | P4 有効期間b |
|---|---|---|---|
| カートリッジ | -25°C～-15°C | 6カ月 | 3か月 |
| フローセル | 2°C～8°C | 6カ月 | 3か月 |
| Tween 20cによるRSB | 2°C～8°C | 6カ月 | 6カ月 |
a. XLEAP-SBSケミストリーを使用したP1, P2、 P3は、2024年Q22四半期に発売され、有効期間は6か月です。
b. 2024年1HのP4の有効期間は3か月になります。これは20242Hに6か月に延長されます。 View standard SBS specifications here.
c. 室温で発送。
フローセル当たりのパスフィルターリード
XLEAP-SBSケミストリーを使用したNextSeq 1000およびNextSeq 2000
| フローセルタイプ | P1a | P2a | P3a,b | P4b |
|---|---|---|---|---|
| シングルリード | 1億 | 400Mc | 12億 | 18億 |
| ペアエンドリード | 2億 | 800M日 | 24億 | 36億 |
a. P1, P2、P3フローセル用のXLEAP-SBS試薬は、2024年第Q2に入手可能です。
b. P3およびP4試薬は、NextSeq 2000システムでのみ使用できます。 View standard SBS specifications here.
c. 標準SBSケミストリーで2 × 3300M0 bpの3億シングルエンドリード。XLEAP-SBSケミストリーを用いた2 x 300 bpの400Mのシングルエンドリード。
d. 標準的なSBSケミストリーで2 × 300 bpの600Mペアエンドリード。XLEAP-SBSケミストリーで2 x 300 bpの800Mシングルエンドリード。
クオリティスコアとランタイム
XLEAP-SBSケミストリーを使用したNextSeq 1000およびNextSeq 2000
| フローセルタイプ | P1 a | P2 a | P3 a,b | P4 b |
|---|---|---|---|---|
| クオリティスコアc | ||||
| 1 × 50 bp | Q30以上の塩基が90%以上 | |||
| 2 × 50 bp | Q30以上の塩基が90%以上 | |||
| 2 × 100 bp | Q30以上の塩基が90%以上 | |||
| 2 × 150 bp | Q30以上の塩基が90%以上 | |||
| 2 × 300 bp | Q30以上の塩基が85%以上 | |||
| ランタイム | ||||
| 1 × 50 bp | 12時間 | |||
| 2 × 50 bp | 8時間 | 12時間 | 18時間 | 20時間 |
| 2 × 100 bp | 19時間 | 31時間 | 34時間 | |
| 2 × 150 bp | 17時間 | 22時間 | 40時間 | 44時間 |
| 2 × 300 bp | 34時間 | 42時間 | ||
a. P1, P2、P3フローセル用のXLEAP-SBS試薬は、2024年第Q2に入手可能です。
b. P3およびP4試薬は、NextSeq 2000システムでのみ使用できます。 View standard SBS specifications here.
c. クオリティスコアはイルミナPhiXコントロールライブラリーに基づきます。ライブラリーの種類と品質、インサートサイズ、ローディング濃度、その他の実験的要因によってパフォーマンスが異なる場合があります。
d. ランタイムには、NextSeq 1000またはNextSeq 2000システム上でのクラスター生成、シーケンス、およびベースコーリングが含まれます。
主要アプリケーションにおけるサンプルスループットの推定値a
XLEAP-SBSケミストリーを使用したNextSeq 1000およびNextSeq 2000
| アプリケーション | P1b | P2b | P3b,c | P4c |
|---|---|---|---|---|
| サンプル数 | サンプル数 | サンプル数 | サンプル数 | |
小規模全ゲノムシーケンス（300サイクル） 130 Mbゲノム、30×カバレッジ |
7 | 30 | 92 | 138 |
全エクソームシーケンス（200サイクル） エクソームあたり約8 Gb、平均カバレッジ90倍 |
～2日間 | 10 | 30 | 45 |
Total RNA-Seq（200サイクル）d サンプルあたり5000万リードペア |
2日間 | 8 | 24 | 36 |
mRNA-Seq（200サイクル）d サンプルあたり2500万リードペア |
4日間 | 16 | 48 | 72 |
シングルセルRNA-Seq（100サイクル）e 5Kセル、セルあたり20Kリード |
1e | 4 | 12 | 48 |
miRNA-Seqまたは低分子RNA解析（50サイクル） サンプルあたり11Mリード |
9f | 36f | 108f | 163 |
| 16S RNAシーケンス（600サイクル） | 384 g | 384 g | N/A |
a. 表の値は、ランあたりのサンプルの推定数を表します。推奨されるシーケンス深度は、サンプルタイプと実験目的に大きく依存し、各研究に対して最適化する必要があります。
b. P1, P2、P3フローセル用のXLEAP-SBS試薬は、2024年第Q2に入手可能です。 View standard SBS specifications here.
c. P3およびP4試薬は、NextSeq 2000システムでのみ使用できます。
d. P1 300サイクルキットを使用します。
e. P1試薬は、シングルセル品質管理実験に適したオプションです。
f. 100サイクルキットを使用します。
g. イルミナでは、最大384のユニークデュアルインデックスを入手できます。
装置の仕様
-
装置の構成
DRAGEN Bio-IT FPGA二次解析を内蔵した内蔵型乾燥装置
-
内蔵制御コンピューター
ベースユニット：装置内部に設置された2U Microserver
メモリー：288 GBハードドライブ：3.8 TB SSD
オペレーティングシステム：Linux CentOS 7.6
-
動作環境
屋内専用温度：15°C-30°C
湿度：相対湿度20%～80%、結露なし
高度：0～2,000メートル
-
レーザー
波長449 nm、523 nm、820 nm
-
梱包寸法
幅 × 奥行 × 高さ92 cm × 120 cm × 118 cm
体重：232 kg -
寸法
幅 × 奥行 × 高さ55 cm × 65 cm × 60 cm
（21.7インチ × 25.6インチ × 23.6インチ） -
重量
141 kg（310.9 lb）
-
木枠重量
232 kg（511.5 lb）
-
電源要件
装置入力電圧：100Vac～240Vac
装置入力周波数：50/60Hz
-
ネットワーク接続の帯域幅
装置1台につき200 Mb/s：内部ネットワークでのアップロード
装置1台につき200 Mb/s：BaseSpace Sequence Hubでのアップロード
装置1台につき5 Mb/s：装置のオペレーションデータのアップロード
-
製品の安全性とコンプライアンス
安全性：クラス1レーザー製品
NRTL認証IEC
61010-1 CEマーク
FCC/IC承認
主要なテクノロジー
NextSeq 1000システムおよびNextSeq 2000システムは、定評ある標準的なイルミナSBSケミストリー*の基盤の上に構築された、より高速で、より高品質で、より堅牢なSBSケミストリーであるXLEAP-SBSケミストリーを搭載しています。 XLEAP-SBSヌクレオチドは、最先端の色素と、熱に対する耐性が高く、加水分解が50倍減少し、フェージングとプレフェージングを減らすためのブロック切断が2.5倍速い新しいリンカーとブロックを使用します。XLEAP-SBSポリメラーゼは、ヌクレオチドをより速く、より高い忠実度で組み込むように設計されています。
*P1, P2, P3のXLEAP-SBSケミストリーは2024年第2Q2に利用可能になります。
Sequence by Synthesis（SBS）テクノロジー
NextSeq 1000および2000システムは、実証済みのSequence by Synthesis（SBS）テクノロジーを活用して、高精度のデータと堅牢な性能を実現します。このテクノロジーは、独自の蛍光標識可逆的ターミネーター法を用いて、超並列シーケンスをサポートします。P1, P2, P3のXLEAP-SBSケミストリーは、2024年第2Q2に利用可能になります。
NextSeq 1000および2000システムは、革新的なパターン化フローセルテクノロジーを使用しており、多様なシーケンスアプリケーションに卓越したレベルのスループットを提供します。パターンフローセルでは数十億ものナノウェルが固定された位置に存在するため、クラスター間隔が調整できます。これにより、シーケンスリード数と総アウトプットを飛躍的に向上させることができました。