NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムは、集団遺伝学、遺伝性疾患研究、がん研究などのアプリケーション用の真のコーディングバリアントを特定するための高精度エクソームカバレッジを提供します。統合されたDNAから結果までのワークフローは、最小限のハンズオン時間でラボの効率を最大化します。
NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムのアプリケーションと方法
より多くのことを行う柔軟性
ターゲットパネルから全ゲノムシーケンスなど、幅広いアプリケーションに対応
主要なアプリケーションと手法
ライブラリー調製
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
ライブラリー調製とハイブリダイゼーション試薬、包括的なエクソームプローブパネル、クリーンアップとサイズ選択ビーズ、インデックスを含む、高性能で高速、かつ完全な全エクソームシーケンスキットです。
シーケンス
試薬カートリッジ、フローセル、および再懸濁バッファーを備えた統合試薬キット。複数のフローセル構成で利用可能で、プロジェクトのニーズに応じて出力を調整できます。
解析
FASTQ、BAM、またはCRAMファイルからバリアントをアライメントして呼び出し、BAMファイルとVCFファイルを出力します。
NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムは、遺伝子発現を定量化し、既知および新規の転写アイソフォーム、遺伝子融合などを特定するための高感度で正確なトランスクリプトーム解析を可能にします。
ライブラリー調製
わずか25 ngの標準（非分解）RNAインプットを使用してコーディングトランスクリプトームを解析するための、シンプルでスケーラブル、コスト効率の高い、1日当たりの迅速なソリューションです。
シーケンス
試薬カートリッジ、フローセル、およびTween 20による再懸濁バッファーを備えた統合試薬キットは、プロジェクトのニーズに応じて出力を調整できる複数のフローセル構成を提供します。
解析
アライメント、定量化、融合検出などのRNA転写産物の次世代シーケンス二次解析。
NextSeq 1000およびNextSeq 2000システムは、研究者がトランスクリプトームをプロファイリングすることで、複雑な組織における単一細胞の個々の寄与を評価することができます。
10x Genomics Chromium Single Cell Gene Expressionテクニカルノートを読む
ライブラリー調製
10x Genomics Chromium Single Cell Gene Expression
シングルセルトランスクリプトーム3’遺伝子発現とマルチオミクス能力により、数万の細胞のプロファイリングを可能にするソリューション。各細胞の遺伝子発現、表面タンパク質発現、CRISPR編集を組み合わせて、細胞の不均一性、新規ターゲット、バイオマーカーを探索します。
シーケンス
試薬カートリッジ、フローセル、およびTween 20による再懸濁バッファーを備えた統合試薬キットは、プロジェクトのニーズに応じて出力を調整できる複数のフローセル構成を提供します。
解析
統合解析パイプラインにより、ユーザーは単一のタッチポイントでベースコールを細胞ごとの遺伝子発現マトリックスに変えることができます。さまざまなサードパーティ製サンプル調製キットと互換性があります。NextSeq 2000システムおよびDRAGENサーバーで利用可能です。
Multiomics multiplies your discovery power
The P3 and P4 flow cells on the NextSeq 2000 System are an excellent fit for multiomics studies. Use multiomics to better connect genotype to phenotype and obtain a full cellular readout not found through single-application approaches.
その他のアプリケーションと方法
Spatial transcriptomics
Detect transcriptional activity to resolve mRNA expression at the cellular level in structurally preserved tissues.
Total RNA sequencing
Analyze coding plus multiple forms of noncoding RNA for a comprehensive picture of the transcriptome.
Immune repertoire analysis
Identify unique receptor variants to map the vast repertoire of immune cells capable of recognizing a seemingly boundless array of targets.
Small whole-genome sequencing
Sequence the entire genome of a bacterium, virus, or other microbe for applications in public health, infectious disease surveillance, molecular epidemiology studies, and environmental metagenomics.
Target enrichment
Use sequence-specific hybridization to analyze genomic regions of interest.
Targeted RNA sequencing
Select and sequence specific transcripts of interest for gene expression profiling studies.
Hear from fellow researchers
Hear how the NextSeq 2000 provides scientists with the precision, affordability and accessibility to make their research a reality.
NextSeq 2000: A range of applications
Learn how the NextSeq 2000 system delivers the flexibility to support your research needs including bulk RNA-Seq, target enrichment, single-cell RNA Seq and much more.