はじめに： 小さいゲノム生物種の全ゲノムシーケンス
ゲノムサイズが小さい（5 Mb未満）生物種では、細菌、ウイルス、その他の微生物の全ゲノムシーケンスを実施し、既知のリファレンスゲノムと比較します。微生物の全ゲノムシーケンスは、公衆衛生上の食品検査、感染症調査、分子疫学研究、環境メタゲノミクスに有用です。
小さいゲノム生物種の全ゲノムシーケンスの利点
- 単一の微生物培養物からすべての遺伝子を調査可能
- 数千種の微生物を同時にシーケンス
- 微生物やウイルスのゲノムを網羅的に解析
- 相同染色体から個々の遺伝子情報を得られるため、微生物やウイルスサンプルの新規バイオーマーカーの発見に役立ち、ハプロタイピングをサポート
迅速かつ培養を必要としない微生物解析
従来の手法と異なり、次世代シーケンサー（NGS）によるゲノムシーケンス研究では手間のかかるクローニングステップが不要です。NGSでは、マルチプレックスにより、数百種の微生物の同時解析も可能です。NGSは、他の手法では見逃されるか、コストが膨大になり同定できない、低頻度の変異、ゲノム再編成、その他の遺伝的変化を同定できます。低分子ゲノムであれば、DNAライブラリーの調製、シーケンス、解析がわずか2日間で終了します。
小さいゲノム生物種の全ゲノムシーケンスの推奨ワークフロー
ライブラリー調整
シーケンス
Data Analysis
シーケンス手法エクスプローラー
このベータ版の直観的なツールでは、科学論文からまとめられた次世代シーケンサー（NGS）ライブラリー調製手法を探すことができるツールです。このツールは、上記にあるシーケンス手法レビュー記事、およびポスターの手法が含まれています。新しい手法については、継続的に追加する予定です。
手法を探す
小さいゲノム生物種の全ゲノムシーケンスのワークフロー
イルミナの1塩基合成反応（SBS：sequencing by synthesis）ケミストリーは最も広く採用されているNGSテクノロジーであり、世界中のシーケンスデータの約90%以上がこのテクノロジーを利用して産出されています。*
イルミナは、業界をリードするデータ品質に加え、ライブラリー調製からデータ解析までの全ゲノムシーケンスを容易にする統合ワークフローを提供します。
下のをクリックしてワークフローの各ステップで利用できる製品をご覧ください。
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*Data calculations on file. Illumina, Inc., 2015