ゲノムサイズが小さい(5 Mb未満)生物種では、細菌、ウイルス、その他の微生物の全ゲノムシーケンスを実施し、既知のリファレンスゲノムと比較します。微生物の全ゲノムシーケンスは、公衆衛生上の食品検査、感染症調査、分子疫学研究、環境メタゲノミクスに有用です。
従来の手法と異なり、次世代シーケンサー(NGS)によるゲノムシーケンス研究では手間のかかるクローニングステップが不要です。NGSでは、マルチプレックスにより、数百種の微生物の同時解析も可能です。NGSは、他の手法では見逃されるか、コストが膨大になり同定できない、低頻度の変異、ゲノム再編成、その他の遺伝的変化を同定できます。低分子ゲノムであれば、DNAライブラリーの調製、シーケンス、解析がわずか2日間で終了します。
イルミナの1塩基合成反応(SBS:sequencing by synthesis)ケミストリーは最も広く採用されているNGSテクノロジーであり、世界中のシーケンスデータの約90%以上がこのテクノロジーを利用して産出されています。*
イルミナは、業界をリードするデータ品質に加え、ライブラリー調製からデータ解析までの全ゲノムシーケンスを容易にする統合ワークフローを提供します。
下のをクリックしてワークフローの各ステップで利用できる製品をご覧ください。
微生物の全ゲノムシーケンスは、新規微生物のゲノムマッピング、既知微生物のゲノムフィニッシング、または複数のサンプルにおけるゲノム比較の重要な研究手法です。
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ショットガンメタゲノミクスは、採取した複雑なサンプル中に存在する微生物すべての全遺伝子の包括的な解析法です。他の手法では見逃されるか、コストが膨大になり同定できないような非常に少数の微生物の検出を可能にします。ショットガンメタゲノミクス >>
*Data calculations on file. Illumina, Inc., 2015