小規模全ゲノムシーケンス
小規模全ゲノムシーケンスの紹介
小規模ゲノムシーケンス（≤ 5 Mb）では、細菌、ウイルス、またはその他の微生物のゲノム全体をシーケンスし、そのシーケンスを既知のリファレンスと比較します。小さな微生物ゲノムのシーケンスは、公衆衛生、感染症サーベイランス、分子疫学研究、環境メタゲノムにおける食品検査に有用です。
スモールゲノムシーケンスの利点
- 単一生物培養からすべての遺伝子を調査可能
- 何千もの生物を並行してシーケンス
- 微生物またはウイルスゲノムの包括的な解析を提供
- 相同染色体から明確な遺伝子情報を提供することで、微生物またはウイルスサンプル内の新しいバイオマーカーの発見を支援し、ハプロタイピングをサポートします
迅速で培養不要の微生物解析
従来のアプローチとは異なり、次世代シーケンサー（NGS）を用いた小規模全ゲノムシーケンス（WGS）研究では、手間のかかるクローニングステップに依存しません。また、NGSは、マルチプレックスを介して何百もの生物を同時にシーケンスすることを可能にします。NGSは、低頻度のバリアント、ゲノム再構成、およびその他の遺伝子変化を同定することができ、見逃されたり、他の手法で同定するにはコストがかかりすぎたりする可能性があります。小さなゲノムの場合、わずか2日間でDNAライブラリーを調製、シーケンス、解析できます。
小規模全ゲノムシーケンスの推奨ワークフロー
ライブラリー調製
シーケンス
データ解析
全ゲノムシーケンスと創薬
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イルミナのNGSは、感染症サーベイランスと感染拡大モデルにおいて独自の立場にあります。NGS法を比較し、SARS-CoV2の検出と特性評価、感染経路の追跡、同時感染の研究、ウイルスの進化を調べるためのソリューションを見つけます。
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包括的な小規模全ゲノムシーケンスワークフロー
イルミナのSequence by Synthesis（SBS）ケミストリーは、最も広く採用されている次世代シーケンサー（NGS）技術で、世界のシーケンスデータの約90%を生み出しています。*
イルミナは、業界をリードするデータ品質に加えて、ライブラリー調製からデータ解析まで、小さなゲノムシーケンスを簡素化する統合ワークフローを提供しています。
関連ソリューション
ショットガンメタゲノミクス
特定の複雑なサンプルに存在するすべての生物のすべての遺伝子を包括的に解析します。見落とされたり、他の方法で同定するには高価すぎる可能性がある、非常に少量の微生物を検出します。ショットガンメタゲノムシーケンスの詳細はこちら。
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*データ計算はファイルに保存しています。Illumina, Inc., 2015