
歴史的に、全ゲノムシーケンスは、相同染色体上のバリアントを区別することなく、単一のコンセンサス配列を生成してきました。フェージングシーケンス、すなわちゲノムフェージングは、母および父由来の染色体上のアリルを同定することで、この限界に挑みます。この情報は、遺伝性疾患研究における遺伝子発現パターンを理解する上でしばしば重要になります。
次世代シーケンサー(NGS)は、トリオ解析や統計的推論に頼ることなく全ゲノムフェージングを可能にします。フェージングシーケンスは、ハプロタイプ情報を同定することで、複数の遺伝子やアリル間の相互作用の影響を受けることが多い複雑な形質の研究のための情報を提供することができます。また、染色体上のシス位またはトランスの位置におけるアリルの破壊が遺伝性疾患を引き起こす可能性があるため、フェージングは、遺伝性疾患の研究に貴重な情報を提供します。
フェージングは研究者が以下を行うのに役立ちます。
マッピングされたリードテクノロジーは、低複雑性領域におけるマッピングの改善、遺伝的バリアントの超長期フェージング、構造的バリアントの検出の強化を提供します。
テクノロジーの詳細はこちらマップリードテクノロジーがNGSワークフローをどのように簡素化できるか、またこのテクノロジーが困難なゲノム領域や解析シナリオにおけるゲノムの洞察の改善にどのように役立つか、その例をご覧ください。
このアプローチは、ゲノムの困難な領域を解決し、複雑な構造多型を検出し、de novoアセンブルを容易にすることができます。
神経変性疾患、精神疾患、自己免疫疾患など、さまざまな複雑な疾患の研究を加速するために、高品質の結果を生み出すNGSアプリケーションをご覧ください。
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