NovaSeq Xシリーズのご購入
進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、卓越したシーケンシング速度とデータ品質、優れたスループットとスケーラビリティをお届けします。
Illumina DNA PCR-Free Prepは、ヒト全ゲノムシーケンス（WGS）、微生物ゲノムのde novoアセンブリ、腫瘍/正常バリアントコーリングなどの高感度全ゲノムシーケンスアプリケーションで使用するためのライブラリー調製のための迅速で柔軟なワークフローを提供します。
Illumina DNA PCR-Free Prep
高感度シーケンスアプリケーション用の高精度データが得られる、効率的で高速な統合ライブラリー調製ワークフロー。
～1.5時間
アッセイ時間
～45分
ハンズオンタイム
25 ng 〜 300 ng
インプット量
概要
ラボ業務の簡略化
Illumina DNA PCR-Free Prepのワークフローは、広範なDNAインプット量、複数のサンプルタイプおよび小規模ゲノムと大規模ゲノムの両方に対応できます。 ワークフローには、血液、唾液、または乾燥血液スポットからのDNA抽出も含まれます。
信頼できる結果の取得
PCRフリーのライブラリー調製と組み合わせたオンビーズタグメンテーションケミストリーは、PCRによるバイアスを排除し、エラーの可能性を減らし、高GCまたは-AT領域にわたって優れた均一なカバレッジを提供します。オンビーズタグメンテーションの詳細はこちら。
柔軟なスループットへのアクセス
Illumina DNA/RNA UD Indexes Setは、最大384のユニークデュアルインデックスを提供し、読み取りを精確に割り当て、フロー セルの有効に利用できるようにします。
Illumina DNA Prepプロダクトライン
幅広いアプリケーションで使用できる、高速で最適化されたシーケンスライブラリー調製ソリューションを見つけましょう。
高感度シーケンスアプリケーション用の高精度データが得られる、効率的で高速な統合ライブラリー調製ワークフロー。
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
Illumina DNA Prep with Enrichment
★幅広いアプリケーションに対応する完全なターゲットリシーケンスソリューションは、迅速な統合ワークフローとカスタムおよび固定エンリッチメントパネルの選択肢を取り揃えています。
仕様
| アッセイ時間 | ～1.5時間 |
|---|---|
| 自動化機能 | 自動液体分注システム |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る |
| 説明 | PCRフリーケミストリーとオンビーズタグメンテーションのユニークな組み合わせを使用して、高感度アプリケーション用のシーケンスライブラリーを調製します。これにより、PCRによるバイアスを排除すると同時に、ライブラリー調製の合計時間が90分に短縮されます。 |
| ハンズオンタイム | ～45分 |
| インプット量 | 25 ng 〜 300 ng |
| システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500システム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム |
| 手法 | 全ゲノムシーケンス, de novoシーケンス |
| マルチプレックス | 最大384プレックス |
| 核酸の種類 | DNA |
| 対応サンプルタイプ | 血液, FFPE非対応, 少量インプットサンプル, 唾液, FFPE非対応 |
| 生物種カテゴリー | すべて, ヒト |
| ターゲットインサートサイズ | 450 bp +/- 75 bp |
| テクノロジー | シーケンス |
| バリアントクラス | ショートタンデムリピート（STR）, 1塩基変異多型（SNP）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） |
必要な製品
NovaSeq 6000システムを除くすべての装置について、Illumina DNA PCR-Free Sequencing and Indexing Primer（カタログ番号：20041797）をご購入ください。
インデックスアダプターはオプションですが、マルチプレックスに推奨されます。サンプルのスループットに合わせて必要なインデックス数を選択してください。Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20091654, 20091656, 20091658, 20091660)を注文することをお勧めします。 IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D (20027213, 20027214, 20042666, 20042667)は販売終了となります。
Illumina Lysis Kitは、血液サンプルの処理にのみ必要です。
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件
アプリケーション
Illumina DNA PCR-Free Prepは、腫瘍/正常バリアントの同定やヒト全ゲノムシーケンス（WGS）などの高感度アプリケーションに、PCRフリーのシーケンス対応ライブラリーを約1.5時間で提供します。
ワークフローの例
ライブラリー調製
Illumina DNA PCR-Free Prep
プロジェクトの推奨事項
| 装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
|---|---|---|
| NovaSeq 6000システム | S1フローセル：3（607Mリード、40倍のカバレッジ、または合計160 Gb超のデータパスフィルターに基づく） S2フローセル：6（663Mリード、40倍のカバレッジ、または合計160 Gb超のデータパスフィルターに基づく） S4フローセル：16（669Mリード、40倍のカバレッジ、または合計160 Gb超のデータパスフィルターに基づく） |
2 x 150 bp |
関連するアプリケーションと手法
ヒト全ゲノムシーケンスは、私たちをユニークな存在にしている複雑な遺伝性バリアントを、最も詳しく知ることができるものです。
腫瘍と正常の研究では、腫瘍とマッチングした正常サンプルを比較して、がんドライバー変異として機能する体細胞バリアントを発見します。
集団ゲノミクスプログラムは、大規模なゲノムと臨床研究データを学習型医療システムに統合し、医療イノベーションを推進します。
本製品の用途例
比較する
| Illumina DNA PCR-Free Prep | Illumina DNA Prep | TruSeq DNA PCR-Free | TruSeq DNA Nano | |
|---|---|---|---|---|
| アッセイ時間 | ～1.5時間 | ～3-4時間 | 合計アッセイ時間5時間 | ～6時間 |
| 自動化機能 | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム | 自動液体分注システム |
| 自動化の詳細 | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る | 利用可能な自動化方法を見る |
| 説明 | PCRフリーケミストリーとオンビーズタグメンテーションのユニークな組み合わせを使用して、高感度アプリケーション用のシーケンスライブラリーを調製します。これにより、PCRによるバイアスを排除すると同時に、ライブラリー調製の合計時間が90分に短縮されます。 | さまざまなサンプルタイプとDNAインプット量に対応する迅速で柔軟なライブラリー調製ワークフローにより、ヒトから微生物の全ゲノムシーケンスまで、幅広いアプリケーションにアクセスできます。 | ゲノムの困難な領域を配列解析できる、全ゲノムシーケンスのためのシンプルで包括的なPCR-Free Prep。 | 高いゲノムカバレッジ品質とバイアスの低減を実現するローインプット研究法。 |
| ハンズオンタイム | ～45分 | 1〜1.5時間 | 4時間 | ～4時間 |
| インプット量 | 25 ng 〜 300 ng | 小さなゲノム（微生物など）の場合はDNA 1～500 ng、大きなゲノム（ヒトなど）の場合はDNA 100～500 ng。（血液および唾液については、リファレンスガイドを参照してください）。 | DNA 1 ug | 100 ng ゲノムDNA |
| システム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500システム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム | MiSeqシステム, iSeq 100システム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, MiniSeq System, NextSeq 550Dx システム研究（RUO）モード, NovaSeq Xシステム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム, MiSeq i100システム, MiSeq i100 Plusシステム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, NextSeq 1000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, MiniSeq System, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500システム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム | MiSeqシステム, NextSeq 550システム, NextSeq 2000システム, 研究（RUO）モードのMiSeqDx システム, MiniSeq System, NovaSeq Xシステム, NextSeq 500システム, NovaSeq 6000システム, NovaSeq X Plusシステム |
| 作用機序 | ビーズ結合トランスポソーム | ビーズ結合トランスポソーム | メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローはPCRフリー、ゲルフリー。 | メカニカルDNA断片化とアダプターライゲーション。ワークフローでは、低バイアスPCRを使用し、ゲルフリーです。 |
| 手法 | 全ゲノムシーケンス, de novoシーケンス | アンプリコンシーケンス, 全ゲノムシーケンス, de novoシーケンス, ショットガンシーケンス | シーケンスによるジェノタイピング, 全ゲノムシーケンス, ショットガンシーケンス | シーケンスによるジェノタイピング, 全ゲノムシーケンス, ショットガンシーケンス |
| マルチプレックス | 最大384プレックス | 最大384のユニークデュアル（UD）の組み合わせと96のコンビナトリアルデュアル（CD）の組み合わせ | 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル（CD）、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ | 最大24のシングル、96のコンビナトリアルデュアル（CD）、24のユニークデュアル、96のユニークデュアル（UD）の組み合わせ |
| 核酸の種類 | DNA | DNA | DNA | DNA |
| 対応サンプルタイプ | 血液, FFPE非対応, 少量インプットサンプル, 唾液, FFPE非対応 | 血液, FFPE非対応, 唾液 | FFPE非対応 | FFPE非対応, 少量インプットサンプル |
| 生物種カテゴリー | すべて, ヒト | ショウジョウバエ, すべて, 哺乳類, マウス, 酵母, ゼブラフィッシュ, ヒト, ラット, 植物, ウイルス, 線形動物, 細菌 | その他, 哺乳類, マウス, ヒト, ラット, 植物 | その他, 哺乳類, マウス, ヒト, ラット, 植物 |
| ターゲットインサートサイズ | 450 bp +/- 75 bp | ～ 350 bp | 350 bpまたは550 bp | 350 bpまたは550 bp |
| テクノロジー | シーケンス | シーケンス | シーケンス | シーケンス |
| バリアントクラス | ショートタンデムリピート（STR）, 1塩基変異多型（SNP）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） | 1塩基変異多型（SNP）, 融合遺伝子, ヘテロ接合性欠失（LOH）, 体細胞バリアント, 染色体変異, 生殖細胞系列バリアント, 構造バリアント, 挿入 欠失（Indel）, コピー数バリアント（CNV） |
選択ツール：
ニーズに応じたシーケンスライブラリー調製キットまたはマイクロアレイを見つけてください。手法、生物種などでフィルタリングでき、キットの比較や共有も可能です。
図
Illumina DNA PCR-Free Prepケミストリー
1回の迅速な反応で、PCRフリーのワークフローとオンビーズタグメンテーションのユニークな組み合わせ。
GCリッチ領域にわたるリードカバレッジの比較
Illumina DNA PCR-Free Prep Kitは、TruSeq DNA PCR-FreeおよびTruSeq DNA Nano Library Prep Kitsと比較して、ヒトRNPEPL1遺伝子のGCリッチプロモーター領域全体で優れたリードカバレッジを提供します。
Illumina DNA PCR-Free Prepカバレッジの均一性
Illumina DNA PCR-Free Prepは、ヒトゲノムのさまざまなGC含量にわたって均一なカバレッジを提供します。
幅広いDNAインプットに性能を発揮するIllumina DNA PCR-Free
さまざまなDNAインプットから調製されたIllumina DNA PCR-Free Prepライブラリーは、（A）すべてのDNAインプットの品質仕様に合格し、（B）同等のコール性能が実証されています。
追加のビーズ精製によるインサートサイズの増加
ビーズ精製をさらに行うと、未修飾プロトコール（青色とオレンジ色の線）と比較して、インサートサイズ（灰色と黄色の線）が増加します。
リソース
Illumina DNA PCR-Free Prep, タグメンテーション：はじめに
このウェビナーでは、ライブラリー調製ワークフローとシーケンスに関する考慮事項について説明し、次世代シーケンスプロジェクトを成功させるためのヒントを提供します。
ライブラリー調製 (2)
Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (24 Samples)
20041794
24ライブラリー調製用の試薬とイルミナ精製ビーズが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (96 Samples)
20041795
96ライブラリー調製用の試薬とイルミナ精製ビーズが含まれます。インデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
インデックスアダプター (8)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)には、96サンプルのラベリングに十分な96、10 bpのインデックスが含まれます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027213
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042666
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20042667
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027214
96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。
List Price:
Discounts:
サービス (1)
Illumina DNA PCR-Free Prep Training
20046010
アクセサリー製品 (2)
Illumina® DNA PCR-Free Sequencing and Indexing Primer
20041797
iSeq VP10、MiniSeq、NextSeq 500/550、NextSeq 1000/2000、およびHiSeq 3000/4000システムで使用するための、VP10カスタムリード1プライマーの7.5 mLチューブ2本と、VP14カスタムインデックス2プライマーの7.5 mLチューブ2本が含まれます。
List Price:
Discounts:
Illumina® Lysis Kit
20042221
Illumina DNA PCR-Free Prepで血液サンプルを処理するための溶解キットが1つ含まれています。ライブラリー調製アダプターとインデックスアダプターは別売りです。
List Price:
Discounts:
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よくある質問（FAQ）
PCRフリーライブラリー調製は、PCR増幅を使用せずにDNAライブラリーを構築するものです。イルミナDNA PCRフリーケミストリーは、PCRによるバイアスを排除し、高感度アプリケーションのための高精度なシーケンス情報を提供します。
PCRフリーのライブラリー調製では、ビーズ結合トランスポソーム複合体を使用して、アダプタータグシーケンスを断片化し、1回の迅速な反応ステップで追加することでゲノムDNAにタグ付けします。単一反応ステップはオンビーズタグメンテーションと呼ばれます。ビーズ結合トランスポソームがDNAで飽和した後、追加のタグメンテーションは発生せず、一貫したライブラリー収量（ng）とインサートサイズが得られます。 オンビーズタグメンテーションの詳細はこちら
PCRフリーシーケンスは、PCR増幅ステップを排除し、一般的なPCRによるバイアスや不均一な増幅を大幅に低減します。
Illumina DNA PCR-Free Prepワークフローは、オンビーズタグメンテーションを使用しており、1回の迅速な反応で、DNAインプット量やゲノムサイズに関係なく、一貫したインサートサイズ、均一なカバレッジ、性能の向上を実現します。オンビーズタグメンテーションはPCR増幅ステップの必要性をなくし、偏った塩基組成とエラーの可能性を最小限に抑え、このキットは高感度シーケンスアプリケーションに最適です。
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件
MiSeq Reagent Kit v3
以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。
TruSight Oncology 500
すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ（TMB、MSIおよびHRD）をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。
Illumina DNA Prep
幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを調製するための、高速で統合されたワークフロー。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
包括的で最新のエクソームエンリッチメントパネルを含む、高性能で高速かつ信頼性の高いヒト全エクソームシーケンスソリューションです。
NextSeq 1000/2000試薬
NextSeq 1000/2000システム用の試薬は、使いやすいカートリッジ形式で提供され、柔軟なシーケンス オプションを実現する複数のフローセル構成を備えています。
NovaSeq 6000試薬キット
すぐに使用できる充填された試薬カートリッジとフローセルからなるNovaSeq 6000システム用試薬キットです。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2
主要な免疫腫瘍学遺伝子シグネチャ（TMB、MSI）に加えて、血漿中のctDNAからすべての主要なバリアントクラスを検出できる腫瘍横断型パネルでCGPを可能にします。
NovaSeq 6000 Xpワークフロー
NovaSeq 6000 Xp Workflowは、フローセルごとに独立したレーンローディングと高いライブラリーマルチプレックスの柔軟性を提供し、1回のランでサンプルスループットを最大化します。
Illumina Human Comprehensive Panel
Illumina Complete Long Read with Enrichmentのライブラリー調製キットを使用して、タンパク質コード遺伝子内のマッピング困難な領域のカバレッジを強化するための最適化されたデザイン済みパネル。必要な30倍以上の標準的なショートリード全ゲノムと組み合わせて解析。
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