TruSight Cancer

専門家が選定したシーケンスパネルは、多様ながんを発生する素因と関連する94の遺伝子と284のSNPをターゲットにします。

1.5日

アッセイ時間

5時間

ハンズオンタイム

DNA 50 ng

インプット量

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概要

がんゲノミクスの専門家と共同で開発された設計済みの、すぐに利用できるオリゴにより、研究者は、過去にがんの素因に関連付けられたさまざまな遺伝子や一塩基多型(SNP)をシーケンスすることができます。

  • がんの素因と関連付けられた94の遺伝子と284のSNPをターゲットにします。

TruSight Cancerには、一般的ながん(乳がん、結腸がんなど)と希少がんの両方に関連する遺伝子が含まれます。さらに、このセットには、ゲノムワイド関連解析(GWAS)によってがんと相関することが見出された284のSNPが含まれます。コンテンツの選択は、科学文献およびその他の高品質なリソースの専門家によるキュレーションに基づいて行われました。

TruSight Cancerシーケンスパネルは、特定された関心領域をターゲットとするカスタムオリゴを提供します。4回の濃縮反応に十分な製品が提供されます。TruSight Cancerは、TruSight Rapid Captureと互換性があります。

TruSight Cancerサンプルデータセット

TruSight Cancerシーケンスパネルを使用して、6つのヒトリファレンスサンプルを調製しました。これらのライブラリーは、デュアルインデックス付きの2 x 100 bpリード長構成の高出力キットを使用してMiniSeqシステムでシーケンスされました。総収量(ng)は5.2 Gbで、塩基の95.8%がQ30以上でした。

仕様

必要な製品

必要なアクセサリー製品

また、以下の濃縮製品も1つ以上必要です。

/

アプリケーション

ワークフローの例

プロジェクトの推奨事項

装置 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System

Samples per run: mid output: 12, high output: 24 (based on > 20x coverage per target)

最大2 × 150 bp

MiSeq System

Samples per run (by reagent kit version): v2: 12, v3: 24 (based on > 20x coverage per target)

最大2 × 150 bp

NextSeq 550 System

Samples per run: mid output: 96, high output: 96 (based on > 20x coverage per target)

最大2 × 150 bp

関連するアプリケーションと手法

本製品の用途例

MGZ Medical Genetic Centerの研究者は、Infinium CytoSNP-850K BeadChipとTruSight Cancerパネルを使用して染色体異常を解析しています。

ドキュメント

製品資料

比較する

TruSight Cancer TruSight Hereditary Cancer Panel AmpliSeq for Illumina BRCA Panel
アッセイ時間 1.5日 DNAからデータまで約48時間 5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない)
Cancer type Pan-cancer Pan-cancer, Solid tumor Solid tumor
コンテンツ仕様 一般的ながんおよびまれながんに関連する94の遺伝子と284のSNPを濃縮する固定プローブセット。 113のがんリスク関連遺伝子をターゲットとする BRCA1および BRCA2のエクソン領域と隣接するイントロン配列
説明 一般的および稀ながんの生殖細胞変異検出研究。 TruSight Hereditary Cancer Panelは、113の遺伝子と125の一塩基多型(SNP)の生殖系列変異を評価し、同定とポリジェニックリスクスコアリングを目的とするターゲットシーケンスパネルです。  BRCA1および BRCA2の生殖細胞系および体細胞解析研究。
ハンズオンタイム 5時間 約2時間 <1.5時間
インプット量 DNA 50 ng DNA 50~1,000 ng  1~100 ng、プールあたり10 ngを推奨
システム MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム, NextSeq 500 Desktop Sequencer MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiniSeqシステム, NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 500 Desktop Sequencer MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeqシステム
手法 Targeted DNA sequencing, Target enrichment Targeted DNA sequencing, Target enrichment Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing
マルチプレックス 最大96プレックス 96のデュアルインデックスの組み合わせ
Nucleic acid type DNA DNA DNA
Specialized sample types Not FFPE-compatible, Not FFPE-compatible Blood, Saliva Blood, FFPE tissue
Species category ヒト ヒト ヒト
テクノロジー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー イルミナシーケンサー
バリアントクラス Germline variants Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels)

エンリッチメントパネル (12)

TruSight Cancer – Enrichment Oligos only (4 or 8 Enrichment Reactions)

FC-121-0202

TruSight Cancerは、さまざまながんの素因に関連する94の遺伝子と284のSNPをターゲットとしており、シングルハイブリダイゼーションワークフローによりNextera Flex for Enrichmentと組み合わせた場合は8回の濃縮反応に十分な量、TruSight Rapid Captureと組み合わせた場合は4回の濃縮反応に十分な量が含まれています。別途、ライブラリー調製、濃縮、インデックスアダプター試薬を注文する必要があります。

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025524

96ライブラリー(8、12プレックスエンリッチメント反応)を調製および濃縮するための試薬が含まれます。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025523

16のライブラリー(16、1プレックスエンリッチメント反応)を調製および濃縮するための試薬が含まれます。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025520

96ライブラリー調製用の試薬が含まれます。濃縮試薬は含まれていません。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。濃縮試薬は、ライブラリー調製試薬[(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 samples)]でのみ注文が可能です。

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025519

16ライブラリー調製用試薬が入っています。濃縮試薬は含まれていません。エンリッチメントプローブパネル、イルミナ精製ビーズ、インデックスアダプターは別売りです。濃縮試薬は、ライブラリー調製試薬[Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 samples)]でのみ注文が可能です。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96サンプルにラベル付けするのに十分な96、10 bpのインデックスを含みます。ライブラリー調製試薬と濃縮試薬およびプローブパネルは別売りです。

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TruSight Rapid Capture (1 index, 8 samples, 8 enrichments)

FC-140-1101

8つの1プレックスエンリッチメントで最大8つのライブラリーを調製するための試薬が含まれています。1つのユニークなインデックスの組み合わせを含みます。

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TruSight Rapid Capture (2 indexes, 8 samples, 4 enrichments)

FC-140-1102

4つの2プレックスエンリッチメントで最大8つのライブラリーを調製するための試薬が含まれています。2種類のインデックスの組み合わせがあります。

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TruSight Rapid Capture (4 indexes, 16 samples, 4 enrichments)

FC-140-1103

4つの4プレックスエンリッチメントで最大16のライブラリーを調製するための試薬が含まれています。4種類のインデックスの組み合わせがあります。

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TruSight Rapid Capture (24 indexes, 48 samples, 4 enrichments)

FC-140-1104

4つの12プレックスエンリッチメントを通して最大48のライブラリーを調製するための試薬が含まれています。24種類のインデックスの組み合わせがあります。

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TruSight Rapid Capture (24 indexes, 96 samples, 8 enrichments)

FC-140-1105

8つの12プレックスエンリッチメントで最大96のライブラリーを調製するための試薬が含まれています。24種類のインデックスの組み合わせがあります。

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TruSight Rapid Capture (96 indexes, 288 samples, 24 enrichments)

FC-140-1106

24の12プレックスエンリッチメントで最大288のライブラリーを調製するための試薬が含まれています。96種類のインデックスの組み合わせがあります。

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選択中の製品一覧

製品名

数量

Unit Price

NovaSeq Xシリーズの注文

進化したケミストリー、光学、インフォマティクスを融合させ、非常に優れたスピードとデータ品質、卓越したスループットとスケーラビリティをお届けします。

MiSeq Reagent Kit v3

以前のバージョンと比較して、クラスター密度とリード長が増加し、シーケンスのクオリティスコアが改善、最適化された試薬キット。

TruSight Oncology 500

すべての主要なバリアントクラスとFFPE組織からの遺伝子シグネチャ(TMB、MSIおよびHRD)をカバーする大規模な腫瘍横断型パネルでCGPを実現。

Illumina DNA Prep

幅広いシーケンス アプリケーションに対応するライブラリーを準備するための、高速で統合されたワークフロー。

製品の特定の用途に固有のバイオマーカー特許およびその他の特許に関する注記:
一部の核酸配列を含む一部のゲノムバリアント、および特定のアプリケーションにおけるそれらの使用は、特許によって保護されている可能性があります。お客様は、お客様の特定の用途で製品を使用するために、かかる特許を所有または管理する当事者からライセンスを取得する必要があるかどうかを判断することをお勧めします。

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