がんゲノミクスの専門家と共同で開発された、あらかじめ設計されたすぐに使えるオリゴにより、研究者は、がんの素因に以前は関連していたさまざまな遺伝子や一塩基多型(SNP)をシーケンスすることができます。
TruSightがんには、一般的ながん(乳がん、大腸がんなど)と希少がんの両方に関連する遺伝子が含まれます。さらに、このセットには、ゲノムワイド関連解析(GWAS)によってがんと相関することが見出された284のSNPが含まれます。コンテンツの選択は、科学文献およびその他の高品質なリソースの専門家によるキュレーションに基づいて行われました。
TruSight Cancerシーケンスパネルは、特定された関心領域をターゲットとするカスタムオリゴを提供します。4つの濃縮反応に十分な製品が提供されます。TruSight Cancerは、TruSight Rapid Capture と互換性があります。
TruSight Cancerシーケンスパネルを用いて、6つのヒトリファレンスサンプルを調製しました。これらのライブラリーは、デュアルインデックス付きの2 x 100 bpリード長構成の高出力キットを使用して、MiniSeqシステムシーケンスされました。総収量は5.2 Gbで、塩基の95.8%がQ30以上でした。
* このデータにアクセスするにはBaseSpace Sequence Hubのログインが必要です。
この製品はイルミナアドバンテージ(TG)製品として提供されています。Illumina Advantageの大規模なシーケンス製品は、ロット単位の出荷検査、より長い有効期間、そして事前製品変更通知の提供を特長とし、研究室の効率性を高めます。
装置 | 推奨サンプル数 | リード長 |
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MiniSeq System | ランあたりのサンプル数:中出力:12、高出力:24(ターゲットあたり>20xカバレッジに基づく) | 最大2 × 150 bp |
MiSeq System | ランごとのサンプル(試薬キットバージョン別):v2:12、v3:24(ターゲットあたりのカバレッジ>20倍に基づく) | 最大2 × 150 bp |
NextSeq 550 System | ランあたりのサンプル数:中出力:96、高出力:96(ターゲットあたり>20xカバレッジに基づく) | 最大2 × 150 bp |
TruSight Cancer | AmpliSeq for Illumina BRCA Panel | |
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アッセイ時間 | 1.5日未満 | 5時間(時間はライブラリー調製のみを表し、ライブラリー定量、ノーマライゼーション、プーリングは含まない) |
インプット量 | DNA 50 ng | |
コンテンツ仕様 | 一般的ながんおよびまれながんに関連する94の遺伝子と284のSNPを濃縮する固定プローブセット。 | BRCABRCA1BRCA2のエクソン領域と隣接イントロン配列 |
ハンズオンタイム | 5時間 | 1.5時間未満 |
バリアントクラス | 生殖細胞系列バリアント | 体細胞バリアント, 生殖細胞系列バリアント, 挿入・欠失(Indel), 一塩基多型(SNP) |
マルチプレックス | 最大96プレックス | 96のデュアルインデックスの組み合わせ |
生物種カテゴリー | ヒト | ヒト |
説明 | 一般的および稀ながんの生殖細胞変異検出研究。 | BRCA1およびBRCA2の生殖細胞系および体細胞解析研究。 |
Researchers from the MGZ Medical Genetic Center are using the Infinium CytoSNP-850K BeadChip and the TruSight Cancer Panel to analyze chromosomal abnormalities.
Read More製品の特定の用途に固有のバイオマーカー特許およびその他の特許に関する注記:
一部の核酸配列を含む一部のゲノムバリアント、および特定の用途におけるそれらの使用は、特許によって保護されている可能性があります。お客様固有の用途で製品を使用するため、当該特許を所有または管理する当事者からライセンスを取得する必要があるかどうかを判断することをお勧めします。