Reagent and Library Prep Kit Bundles Available for the MiniSeq System

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TruSight Cancer

専門家が精選したこのシーケンスパネルでは、さまざまながんの罹患素因と関連付けられている94個の遺伝子と284個のSNPをターゲットとしています。Read More...
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TruSight Cancer – Enrichment Oligos only (4 or 8 Enrichment Reactions)

FC-121-0202

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TruSight Cancer MiniSeq Kit

20005612

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アクセサリー製品
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Product Highlights

過去にがんの素因と関連付けられた遺伝子をターゲットにしています。

  • がん素因に関連する94遺伝子と284のSNPをターゲットとしています。

TruSight Cancerには、一般的ながん(乳がんや大腸がんなど)と稀ながんの両方に関連する遺伝子群が含まれています。さらに、このセットには全ゲノム関連解析(GWAS)によりがんとの関連が確認された284のSNPも含まれています。コンテンツは、科学文献およびその他の高品質の情報源からの専門家のキュレーションに基づき選択されました。

TruSight Cancerシーケンスパネルには、選択された目的の領域をターゲットとするカスタムオリゴで構成されています。4回の濃縮反応に必要な量が入っています。TruSight Cancerは、TruSight Rapid Captureと併用できます。

TruSight Cancerサンプルデータセット

TruSight Cancerシーケンスパネルを使って6つのヒトリファレンスサンプルを調製しました。得られたライブラリーはMiniSeqシステムで、高出力キットを用い、デュアルインデックスの2 x 100 bpリード長の条件でシーケンスを行いました。トータルデータ量は5.2 Gbで、Q30以上の塩基は全体の95.8%でした。

BaseSpace Sequence Hubのデータを閲覧できます:

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Frequently Purchased Together

仕様

推奨プロジェクト

装置 推奨サンプル数 リード長
MiniSeq System Samples per run: mid output: 12, high output: 24 (based on > 20x coverage per target) Up to 2 × 150 bp
MiSeq System Samples per run (by reagent kit version): v2: 12, v3: 24 (based on > 20x coverage per target) Up to 2 × 150 bp
NextSeq 550 System Samples per run: mid output: 96, high output: 96 (based on > 20x coverage per target) Up to 2 × 150 bp

製品比較

TruSight Cancer AmpliSeq for Illumina BRCA Panel
Assay Time 1.5 days 5 hours (library prep only; doesn't include library quantification, normalization, or pooling time)
Cancer Type Pan-Cancer Solid Tumor
Content Specifications Fixed set of probes that enrich for 94 genes and 284 SNPs associated with common and rare cancers. Exonic regions and the flanking intronic sequences of the BRCA1 and BRCA2
Description Germline mutation detection research for common and rare cancers. Germline and somatic analysis studies of BRCA1 and BRCA2 .
Hands-On Time 5 hours < 1.5 hours
Input Quantity 50 ng DNA 1–100 ng (10 ng recommended per pool)
Method Target Enrichment , Target Enrichment, Targeted DNA Sequencing Amplicon Sequencing , Targeted DNA Sequencing
Multiplexing Up to 96-plex 96 dual index combinations
Specialized Sample Types Not FFPE-Compatible FFPE Tissue
Species Category Human Human
Variant Class Germline Variants Germline Variants, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Somatic Variants

Method-Specific Workflow Example

 

Customer Stories

From Arrays to NGS: How Chromosomal Genetics Evolved From Structure to Disease

Researchers from the MGZ Medical Genetic Center are using the Infinium CytoSNP-850K BeadChip and the TruSight Cancer Panel to analyze chromosomal abnormalities.

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製品に関する文献

TruSight Cancer Gene List

product_file | EXCEL< 1 MB

TruSight Cancer

Data Sheet | PDF< 1 MB

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Note regarding biomarker patents and other patents unique to specific uses of products:
Some genomic variants, including some nucleic acid sequences, and their use in specific applications may be protected by patents. Customers are advised to determine whether they are required to obtain licenses from the party that owns or controls such patents in order to use the product in customer's specific application.